Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 1,211,614 | C→T | 11.3% | intergenic (+37/+66) | icdC → / ← iraM | protein IcdC/anti‑adaptor protein IraM, inhibitor of sigma(S) proteolysis |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 1,211,614 | 0 | C | T | 11.3% | 374.3 / 27.6 | 133 | intergenic (+37/+66) | icdC/iraM | protein IcdC/anti‑adaptor protein IraM, inhibitor of sigma(S) proteolysis |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (68/49); new base T (10/5); total (79/54) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.89e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.78e-01 |
Only 100 of 143 total aligned reads displayed.
GGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAACTATTATGTAAACATTTATTTGTTATTTTGCTTTCTCCTGGAGGACA > NC_000913/1211466‑1211763 | gAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAacac < 1:1327326/150‑1 (MQ=255) ggCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGcc > 1:475563/1‑150 (MQ=255) ggCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACAAGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAAAACGcc > 1:769187/1‑150 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |