| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,226,119 | C→G | 6.0% | intergenic (‑39/‑481) | minC ← / → ycgJ | Z‑ring positioning protein MinC/PF05666 family protein YcgJ |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,226,119 | 0 | C | G | 6.0% | 330.6 / 7.2 | 97 | intergenic (‑39/‑481) | minC/ycgJ | Z‑ring positioning protein MinC/PF05666 family protein YcgJ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (55/36); new base G (4/2); total (59/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.20e-01 | |||||||||||
CGATTTTGTCTTCCAGCGCCTGATGGATAACCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAAGCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATACCCTTGTCAATCAACCCA > NC_000913/1225972‑1226265 | cGATTTTGTCTTCCAGCGCCTGATGGATAACCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAAGCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAgcgcgc > 2:36959/1‑150 (MQ=255) ttGTCTTCCAGCGCCTGATGGATAACCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAAGCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCgatga < 2:383975/150‑1 (MQ=255) tGTCTTCCAGCGCCTGATGGATAACCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAAGCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAAATAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCgatgat < 1:1522040/150‑1 (MQ=255) gTCTTCCAGCGCCTGATGGATAACCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAAGCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCGCGCTGGCgatgatt < 2:192886/150‑2 (MQ=255) gTCTTCCAGCGCCTGATGGATAACCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAAGCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCGCGCTGGCgatgatt < 2:1243843/150‑2 (MQ=255) tCTTCCAGCGCCTGATGGATAACCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAAGCTCGATTGGCGTGTTTGCCATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGt > 2:998440/1‑150 (MQ=255) tCTTCCAGCGCCTGATGGATAACCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAAGCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGt < 2:1257805/150‑1 (MQ=255) tCTTCCAGCGCCTGATGGATAACCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAAGCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGt > 1:530289/1‑150 (MQ=255) cTTCCAGCGCCTGATGGATAACCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAAGCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGtt > 1:1113306/1‑150 (MQ=255) cTTCCAGCCCCTGATGGATAACCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAAGCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGtt > 2:742289/1‑150 (MQ=255) ttCCAGCGCCTGATGGATAACCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAAGCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTc < 2:316697/150‑1 (MQ=255) gATGGATAACCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAAGCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACtata > 2:1192067/1‑150 (MQ=255) gATGGATAACCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAAGCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATATTCCGAAGACtata > 2:249895/1‑150 (MQ=255) tGGATAACCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAAGCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAg < 2:1221869/150‑1 (MQ=255) ggATAACCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAAGCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAgg < 2:530289/150‑1 (MQ=255) gATAACCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAAGCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGc > 2:788823/1‑150 (MQ=255) gATAACCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAAGCTCGATTGGCGCGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGc > 1:581825/1‑150 (MQ=255) tAACCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAAGCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCAt > 2:86882/1‑150 (MQ=255) aCCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAAGCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGt > 2:211180/1‑150 (MQ=255) aCCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAAGCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGt < 2:540089/150‑1 (MQ=255) aCCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAAGCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGt > 1:882131/1‑150 (MQ=255) ccTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAAGCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGtt < 1:1491220/150‑1 (MQ=255) aGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAAGCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAg > 2:333472/1‑150 (MQ=255) tCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAAGCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTg > 2:383407/1‑150 (MQ=255) cTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAAGCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTgg < 1:1096255/150‑1 (MQ=255) cTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAAGCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATta < 2:1106690/150‑1 (MQ=255) cTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAAGCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATta > 1:600079/1‑150 (MQ=255) cATGCAGATGAACCACAGATAAAGTTAAGCTACTGCCTTTAAGCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATtata > 2:248866/1‑150 (MQ=255) tGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAAGCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATAtt > 1:1402474/1‑150 (MQ=255) gATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAAGCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAgg < 2:1184148/150‑1 (MQ=255) aaCCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAAGCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAg < 1:997829/150‑1 (MQ=255) aaCCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAAGCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAg > 2:182942/1‑150 (MQ=255) aaCCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAAGCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAg > 2:950268/1‑150 (MQ=255) 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tACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCt > 2:84954/1‑150 (MQ=255) tCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCAAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTaa < 2:1048686/150‑1 (MQ=255) cAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTaaa > 2:91754/1‑150 (MQ=255) cAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTaaa < 1:1516430/150‑1 (MQ=255) cAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTaaa > 1:82512/1‑150 (MQ=255) aTTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTaaaaa < 2:1184839/150‑1 (MQ=255) aGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATa > 1:204897/1‑150 (MQ=255) aGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATa > 1:299244/1‑150 (MQ=255) tATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATAccc < 2:882131/150‑1 (MQ=255) tATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATAccc < 1:84428/150‑1 (MQ=255) ggaacatcatcGCGCGCTGGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATAccc > 2:659727/6‑150 (MQ=255) ggaacatcatcGCGCGCTGGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATAccc > 1:843543/6‑150 (MQ=255) tAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATACCCTTg < 2:966093/150‑1 (MQ=255) catcatcGCGCGCTGGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATACCCTTGt > 1:1211796/2‑150 (MQ=255) aaTCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATACCCTTGt > 1:671953/1‑150 (MQ=255) atcatcGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATACCCTTGtc > 1:803089/1‑150 (MQ=255) tcatcGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATACCCTTGtca > 2:1392383/1‑150 (MQ=255) catcgccatcgcGCGATGATTTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCACAATTATTAAGAGTAAAATTATATTCTGTGATAAATGGCTCTGATTAATAGCTTAAAAAAAACACTTGtcaa > 2:1437252/1‑150 (MQ=255) catcGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATACCCTTGtcaa < 1:89278/150‑1 (MQ=255) atcGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATACCCTTGtcaat < 1:235071/150‑1 (MQ=255) cGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATCCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATACCCTTGtcaatca > 2:928109/1‑150 (MQ=255) gCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATACCCTTGtcaatcaa > 1:1227662/1‑150 (MQ=255) gCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATACCCTTGtcaatcaa > 1:15865/1‑150 (MQ=255) cAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATACCCTTGTCAATCAAcc > 1:231134/1‑150 (MQ=255) cAGCGCGCGATGATGGTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTCGATTATATTGAGGAAAGTCACCCTCCCATTTATACAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATGAATAGATTAAAAAATACCATTGTCAATCAAcc > 2:277725/1‑150 (MQ=255) gcgcgcGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATACCCTTGTCAATCAACCCa < 1:998440/150‑1 (MQ=255) | CGATTTTGTCTTCCAGCGCCTGATGGATAACCTTAGGTTCTGCCTCATGCAGATGAACCACAGATAAAGTGAAGCTACTGCCTTTAAGCTCGATTGGCGTGTTTGACATCCTGGCCTTACTCAATTAGCTATTAATCATCGCCAGCGCGCGATGATGTTCCGAAGACTATAAGGCATGTTATAGTCTGGATTATATTGAGGCAAGTCACCCTCCCATTTATTCAGAGTAAAAGTCTATTCTGTGATAAATGGCGCTGATTCATAGCTTAAAAAATACCCTTGTCAATCAACCCA > NC_000913/1225972‑1226265 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |