Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 1,357,227 | 0 | A | G | 10.3% | 213.3 / 13.3 | 79 | intergenic (‑117/+196) | sapA/ymjA | putative periplasmic binding protein SapA/DUF2543 domain‑containing protein YmjA |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (31/39); new base G (3/5); total (34/45) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.90e-01 |
AATCACCAAAAGAGACGATAATACCTGGCGCATAATATTAAGGGATTTTATGTAAAGAGGCTATCTTACTAATATTTAATGACATTTGCCATTACCGTTTGTGTTCAGGGGTCGTAATGAGGGCCGTGTGGTTGGTCGTTGAACAGGTGACGTCGCCATCTGTTCAACATTCGTACCCGTGATTTCTCTATAACTATAACTCACAGAACAACTTAGCGAGGAGCAGAGCGGTACGATCGTGAGAAACCCATTAAAGCACGCTGCAGTGCGTGTCATTGTTAGCCAGATGCGGCGTGAA > NC_000913/1357078‑1357375 | aaTCACCAAAAGAGACGATAATACCTGGCTCATAATATTAAGTGATTTTATGTAAAGAGGCTATCTTACTAATATTTAATGACATTTGCCATTACCGTTTGTGTTCAGGGGTCGTAATGAGGGCCGTGTGGTTGGTCGTTGAACAGGTGa < 1:1081292/150‑1 (MQ=255) aTCACCAAAAGAGACGATAATACCTGGCGCATATTATTAAGGGATTTTATGTAAAGAGGCTATCTTACTAATATTTAATGACATTTGCCATTACCGTTTGTGTTCAGGGGTCGTAATGAGGGCCGTGTGGTTGGTCGTTGAACAGGTGAc < 1:42205/150‑1 (MQ=255) aCCAAAAGAGACGATAATACCTGGCGCATAATATTAAGGGATTTTATGTAAAGAGGCTATCTTACTAATATTTAATGACATTTGCCATTACCGTTTGTGTTCAGGGGTCGTAATGAGGGCCGTGTGGTTGGTCGTTGAACAGGTGACGTc > 2:1276563/1‑150 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |