| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 181,274 | C→G | 7.2% | H131D (CAC→GAC) ‡ | degP → | periplasmic serine endoprotease DegP |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 181,274 | 0 | C | G | 7.2% | 305.2 / 10.1 | 92 | H131D (CAC→GAC) ‡ | degP | periplasmic serine endoprotease DegP |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (33/52); new base G (4/3); total (37/55) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.33e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.85e-01 | |||||||||||
TCTGCCAGGAAGGTTCTCCGTTCCAGAGCTCTCCGTTCTGCCAGGGTGGCCAGGGCGGTAATGGTGGCGGCCAGCAACAGAAATTCATGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCCGCGCTCTGATATCGCGCTGATCCAAATCCAGAACCCGAAAAACCTGACCGCAATTAAGATGGCGGAT > NC_000913/181128‑181423 | tCTGCCAGGAAGGTTCTCCGTTCCAGAGCTCTCCGTTCTGCCAGGGTGGCCAGGGCGGTAATGGTGGCGGCCAGCAACAGAAATTCATGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAAGAACCACg < 2:921759/150‑1 (MQ=255)tCTGCCAGGAAGGTTCTCCGTTCCAGAGCTCTCCGTTCTGCCAGGGTGGCCAGGGCGGTAATGGTGGCGGCCAGCAACAGAAATTCATGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACg > 2:820529/1‑150 (MQ=255) cTGCCAGGAAGGTTCTCCGTTCCAGAGCTCTCCGTTCTGCCAGGGTGGCCAGGGCGGTAATGGTGGCGGCCAGCAACAGAAATTCATGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACgt > 1:1251490/1‑150 (MQ=255) gCCAGGAAGGTTCTCCGTTCCAGAGCTCTCCGTTCTGCCAGGGTGGCCAGGGCGGTAATGGTGGCGGCCAGCAACAGAAATTCATGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACgttg > 1:1235509/1‑150 (MQ=255) gCCAGGAAGGTTCTCCGTTCCAGAGCTCTCCGTTCTGCCAGGGTGGCCAGGGCGGTAATGGTGGCGGCCAGCAACAGAAATTCATGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACgttg > 2:976961/1‑150 (MQ=255) gCCAGGAAGGTTCTCCGTTCCAGAGCTCTCCGTTCTGCCAGGGTGGCCAGGGCGGTAATGGTGGCGGCCAGCAACAGAAATTCATGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACgttg < 1:482683/150‑1 (MQ=255) cAGGAAGGTTCTCCGTTCCAGAGCTCTCCGTTCTGCCAGGGTGGCCAGGGCGGTAATGGTGGCGGCCAGCAACAGAAATTCATGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACgttgtt < 1:820529/150‑1 (MQ=255) cAGGAAGGTTCTCCGTTCCAGAGCTCTCCGTTCTGCCAGGGTGGCCAGGGCGGTAATGGTGGCGGCCAGCAACAGAAATTCATGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACgttgtt < 1:1345407/150‑1 (MQ=255) gAAGGTTCTCCGTTCCAGAGCTCTCCGTTCTGCCAGGGTGGCCAGGGCGGTAATGGTGGCGGCCAGCAACAGAAATTCATGGCGCTGGGCTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGGCACCAACAACGGGGttgttggt < 2:967078/150‑3 (MQ=255) aaGGTTCTCCGTTCCAGAGCTCTCCGTTCTGCCAGGGTGGCCAGGGCGGTAATGGTGGCGGCCAGCAACAGAAATTCATGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATa < 1:1277312/150‑1 (MQ=255) ggTTCTCCGTTCCAGAGCTCTCCGTTCTGCCAGGGTGGCCAGGGCGGTAATGGTGGCGGCCAGCAACAGAAATTCATGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACGTGGttgttggtgac < 1:1498363/150‑6 (MQ=255) gTTCTCCGTTCCAGAGCTCTCCGTTCTGCCAGGGTGGCCAGGGCGGTAATGGTGGCGGCCAGCAACAGAAATTCATGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAAcg > 1:707411/1‑150 (MQ=255) gTTCTCCGTTCCAGAGCTCTCCGTTCTGCCAGGGTGGCCAGGGCGGTAATGGTGGCGGCCAGCAACAGAAATTCATGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAAcg > 1:683054/1‑150 (MQ=255) ctcCGTTCCAGAGCTCTCCGTTCTGCCAGGGTGGCCAGGGCGGTAATGGTGGCGGCCAGCAACAGAAATTCATGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGa > 2:1370719/1‑150 (MQ=255) ccGTTCCAGAGCTCTCCGTTCTGCCAGGGTGGCCAGGGCGGTAATGGTGGCGGCCAGCAACAGAAATTCATGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACg > 2:219997/1‑150 (MQ=255) gTTCCAGAGCTCTCCGTTCTGCCAGGGTGGCCAGGGCGGTAATGGTGGCGGCCAGCAACAGAAATTCATGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGt < 2:590385/150‑1 (MQ=255) tCCAGAGCTCTCCGTTCTGCCAGGGTGGCCAGGGCGGTAATGGTGGCGGCCAGCAACAGAAATTCATGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCa < 2:659355/150‑1 (MQ=255) tCCAGAGCTCTCCGTTCTGCCAGGGTGGCCAGGGCGGTAATGGTGGCGGCCAGCAACAGAAATTCATGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTATTGATAACGCGAGGGTCa < 2:898103/150‑1 (MQ=255) 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tcCGTTCTGCCAGGGTGGCCAGGGCGGTAATGGTGGCGGCCAGCAACAGAAATTCATGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCa < 1:1472585/150‑1 (MQ=255) tcCGTTCTGCCAGGGTGGCCAGGGCGGTAATGGTGGCGGCCAGCAACAGAAATTCATGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCa > 2:919383/1‑150 (MQ=255) ttCTGCCAGGGTGGCCAGGGCGGTAATGGTGGCGGCCAGCAACAGAAATTCATGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTg < 1:645202/150‑1 (MQ=255) tCTGCCAGGGTGGCCAGGGCGGTAATGGTGGCGGCCAGCAACAGAAATTCATGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGa > 1:215563/1‑150 (MQ=255) tGCCATGGTGGCCAGGGGGGTAATGGTGGCGGACAGCAACAGAAATTCATGGCGCTGGGTTCCGGCGGCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGatc < 2:1493220/150‑3 (MQ=255) tGCCAGGGTGGCCAGGGCGGTAATGGTGGCGGCCAGCAACAGAAATTCATGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGc > 2:671596/1‑150 (MQ=255) ccAGGGTGGCCAGGGCGGTAATGGTGGCGGCCAGCAACAGAAATTCATGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGa > 1:559004/1‑150 (MQ=255) aGGGTGGCCAGGGCGGTAATGGTGGCGGCCAGCAACAGAAATTCATGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATg > 2:962585/1‑150 (MQ=255) gggTGGCCAGGGCGGTAATGGTGGCGGCCAGCAACAGAAATTCATGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATgg < 1:1139246/150‑1 (MQ=255) ggTGGCCAGGGCGGTAATGGTGGCTGCCAGCAACAGAAATTCATGTCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTCGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGc < 1:733023/150‑1 (MQ=255) ggTGGCCAGGGCGGTAATGGTGGCGGCCAGCAACAGAAATTCATGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGc < 2:639329/150‑1 (MQ=255) gTGGCCAGGGCGGTAATGGTGGCGGCCAGCAACAGAAATTCATGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGcc > 1:1161422/1‑150 (MQ=255) tGGCCAGGGCGGTAATGGTGGCGGCCAGCAACAGAAATTCATGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCg < 1:45724/150‑1 (MQ=255) tGGCCAGGGCGGTAATGGTGGCGGCCAGCAACAGAAATTCATGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCg < 2:865313/150‑1 (MQ=255) ggCCAGGGCGGTAATGGTGGCGGCCAGCAACAGAAATTCATGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGt > 1:265609/1‑150 (MQ=255) ggCCAGGGCGGTAATGGTGGCGGCCAGCAACAGAAATTCATGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGACGGCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGt < 2:1024493/150‑1 (MQ=255) gCCAGGGCGGTAATGGTGGCGGCCAGCAACAGAAATTCATGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCTGTa < 1:1370719/150‑1 (MQ=255) ccAGGGCGGTAATGGTGGCGGCCAGCAACAGAAATTCATGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTaa < 1:739878/150‑1 (MQ=255) cAGGGCGGTAATGGTGGCGGCCAGCAACAGAAATTCATGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAg < 2:955874/150‑1 (MQ=255) ggCGGTAATGGTGGCGGCCAGCAACAGAAATTCATGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTc < 1:1301912/150‑1 (MQ=255) 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aaTTCATGGCGCGGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCcgc < 1:502245/150‑1 (MQ=255) cATGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCCGCGctc < 2:1235509/150‑1 (MQ=255) aTGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCCGCGctct < 2:129262/150‑1 (MQ=255) tGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCCGCGCTCTg < 1:9241/150‑1 (MQ=255) cgcTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGttgttg < 1:803252/66‑1 (MQ=255) cgcTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGttgttg > 2:803252/1‑66 (MQ=255) 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catTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCCGCGCTCTGATATCGCGCTGATCCAAATCCa < 1:624888/150‑1 (MQ=255) atTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCCGCGCTCTGATATCGCGCTGATCCAAATCCAg < 1:800233/150‑1 (MQ=255) ttGATGCCGATAAAGGGTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCCGCGCTCTGATATCGCGCTGATCCAAATCCAGa > 1:917616/1‑150 (MQ=255) gATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCCGCGCTCTGATATCGCGCTGATCCAAATCCAGAAc < 1:976961/150‑1 (MQ=255) cGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCCGCGCTCTGATATCGCGCTGATCCAAATCCAGAACCCGaa < 1:664657/150‑1 (MQ=255) 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aTGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCCGCGCTCTGATATCGCGCTGATCCAAATCCAGAACCCGAAAAACCTGACCg < 2:1314920/150‑1 (MQ=255) tGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCCGCGCTCTGATATCGCGCTGATCCAAATCCAGAACCCGAAAAACCTGACCGc < 1:96088/150‑1 (MQ=255) gcgttatcaacaaCGTGGTTGTTGGTGACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCCGCGCTCTGATATCGCGCTGATCCAAATCCAGAACCCGAAAAACCTGACCGCaa > 2:246771/8‑150 (MQ=255) cgttatcaacaaCGTGGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCCGCGCTCTGATATCGCGCTGATCCAAATCCAGAACCCGAAAAACCTGACCGCAAt > 1:1503950/7‑150 (MQ=255) cgtcACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACAGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCCGCGCTCTGATATCGCGCTGATCCAAATCCAGAACCCGAAAAACCTGACCGCAAt < 2:693361/150‑1 (MQ=255) gttatcaacaaCGTGGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCCGCGCTCTGATATCGCGCTGATCCAAATCCAGCACCCGAAAAACCTGCCCGCAAtt > 1:1255585/6‑150 (MQ=255) ttatcaacaaCGTGGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCCGCGCTCTGATATCGCGCTGATCCAAATCCAGAACCCGAAAAACCTGACCGCAATTa > 1:1432481/5‑150 (MQ=255) tcACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCCGCGCTCTGATATCGCGCTGATCCAAATCCAGAACCCGAAAAACCTGACCGCAATTa < 2:566745/150‑1 (MQ=255) ccAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCCGCGCTCTGATATCGCGCTGATCCAAATCCAGAACCCGAAAAACCTGACCGCAATTAAGa > 1:790348/1‑150 (MQ=255) caacaaCCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCCGCGCTCTGATATCGCGCTGATCCAAATCCAGAACCCGAAAAACCTGACCGCAATTAAGAt < 1:784260/150‑1 (MQ=255) aacaacCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCCGCGCTCTGATATCGCGCTGATCCAAATCCAGAACCCGAAAAACCTGACCGCAATTAAGATg > 2:1394587/1‑150 (MQ=255) acaacCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCCGCGCTCTGATATCGCGCTGATCCAAATCCAGAACCCGAAAAACCTGACCGCAATTAAGATgg < 1:105737/150‑1 (MQ=255) acCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCCGCGCTCTGATATCGCGCTGATCCAAATCCAGAACCCGAAAAACCTGACCGCAATTAAGATGGCgg < 1:636925/150‑1 (MQ=255) cACGTTGTTGATAACGTGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCCGCGCTCTGATATCGCGCTGATCCAAATCCAGAACCCGAAAAACCTGACCGCAATTAAGATGGCGGAt > 2:893363/1‑150 (MQ=255) cACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCCGCGCTCTGATATCGCGCTGATCCAAATCCAGAACCCGAAAAACCTGACCGCAATTAAGATGGCGGAt > 2:327947/1‑150 (MQ=255) cACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCCGCGCTCTGATATCGCGCTGATCCAAATCCAGAACCCGAAAAACCTGACCGCAATTAAGATGGCGGAt < 1:990976/150‑1 (MQ=255) cACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCCGCGCTCTGATATCGCGCTGATCCAAATCCAGAACCCGAAAAACCTGACCGCAATTAAGATGGCGGAt < 1:962585/150‑1 (MQ=255) | TCTGCCAGGAAGGTTCTCCGTTCCAGAGCTCTCCGTTCTGCCAGGGTGGCCAGGGCGGTAATGGTGGCGGCCAGCAACAGAAATTCATGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCCGCGCTCTGATATCGCGCTGATCCAAATCCAGAACCCGAAAAACCTGACCGCAATTAAGATGGCGGAT > NC_000913/181128‑181423 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |