Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,482,227 | C→A | 8.7% | intergenic (+26/+28) | ynbD → / ← azoR | putative phosphatase/FMN dependent NADH:quinone oxidoreductase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,482,227 | 0 | C | A | 8.7% | 301.6 / 13.5 | 92 | intergenic (+26/+28) | ynbD/azoR | putative phosphatase/FMN dependent NADH:quinone oxidoreductase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (45/39); new base A (3/5); total (48/44) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.73e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.28e-01 |
TTGTTATGTTACGGACACTGTAAAACCGTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCGGCGAAGACAAATTTCACATCGGTAATGCCGATAAAG > NC_000913/1482079‑1482375 | ttgttATGTTACGGACACTGTAAAACCGTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCt < 1:374802/150‑1 (MQ=255) tgttatgttaCGGACACTGTAAAACCGTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTa < 2:286777/150‑1 (MQ=255) gttatgttaCGGACACTGTAAAACCGTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTAc > 1:1192172/1‑150 (MQ=255) gttatgttaCGGACACTGTAAAACCGTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTAc > 1:1259337/1‑150 (MQ=255) tatgttaCGGACACTGTAAAACCGTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAg < 2:1101301/150‑1 (MQ=255) gttaCGGACACTGTAAAACCGTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTcc > 2:1424178/1‑150 (MQ=255) aCGGACACTGTAAAACCGTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCcaca > 2:941859/1‑150 (MQ=255) cGGACACTGTAAAACCGTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACAt > 1:1441855/1‑150 (MQ=255) gACACTGTAAAACCGTTAATGAAGCTATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCATTTTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATTCTGACATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGTAGATATTCAGTCCACATct < 2:1281287/150‑2 (MQ=255) gACACTGTAAAACCGTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCa < 2:1441855/150‑1 (MQ=255) gACACTGTAAAACCGTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCa < 2:1165267/150‑1 (MQ=255) gACACTGTAAAACCGTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCa < 1:1430552/150‑1 (MQ=255) acacTGTAAAACCGTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGTAGATATTCAGTCCACATctc < 1:1102539/150‑3 (MQ=255) cacTGTAAAACCGTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGTAGATATTCAGTCCACATctca < 2:1271081/150‑4 (MQ=255) cTGTAAAACCGTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGAATGAATATCTACAGTCAACATCAAgcc > 2:793024/1‑148 (MQ=255) tGTAAAACCGTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGAcc > 2:263848/1‑150 (MQ=255) gTAAAACCGTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCg > 1:146970/1‑150 (MQ=255) aaaaCCGTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCgtg < 2:1191318/150‑1 (MQ=255) cGTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGTAGATATTCAGTCCACATc > 2:645095/1‑136 (MQ=255) cGTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGTAGATATTCAGTCCACATc < 1:645095/136‑1 (MQ=255) cGTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCgg < 2:91738/150‑1 (MQ=255) gTTAATGTAGCTATTAGCTATATTCTAGCCAGACGCCCGCAGTTTGTGCTGAGAGACGAGCTCAAAGCGATGCTGAGTTTATGGGAAATCAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGt < 2:439565/150‑1 (MQ=255) gTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGt > 2:1427946/1‑150 (MQ=255) tAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACCTCAAGACCGTGTCCGGTTa > 2:727885/1‑150 (MQ=255) gAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCa > 2:1423353/1‑150 (MQ=255) aGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGTAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGa < 2:181366/150‑1 (MQ=255) gCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGGGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGaa < 2:1185562/150‑1 (MQ=255) gATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAAc < 1:800006/150‑1 (MQ=255) aGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTAc > 1:949530/1‑110 (MQ=255) aGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTAc < 2:949530/110‑1 (MQ=255) aGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATg > 1:747643/1‑150 (MQ=255) gCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGc > 2:1039226/1‑150 (MQ=255) gCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGc > 2:1284722/1‑150 (MQ=255) gCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACGGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGc > 1:35368/1‑150 (MQ=255) cTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAATACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATggt > 2:347541/1‑148 (MQ=255) tataTTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCCCAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTg > 2:934979/1‑150 (MQ=255) cGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATg > 2:475488/1‑150 (MQ=255) gAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATgg > 2:1130154/1‑150 (MQ=255) gCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGgct > 1:706583/1‑150 (MQ=255) gCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGgct > 1:501561/1‑150 (MQ=255) gCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGgct > 2:1452182/1‑150 (MQ=255) gCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGgct > 1:384880/1‑150 (MQ=255) cAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGgctgc > 2:5571/1‑150 (MQ=255) cAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCC‑GTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGgctgct > 1:1042901/1‑150 (MQ=255) aGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGgctgct < 2:1047657/150‑1 (MQ=255) gCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGta > 2:1439603/1‑149 (MQ=255) gCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCC‑GTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCa < 2:1042901/150‑1 (MQ=255) aGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAg < 1:654801/150‑1 (MQ=255) cTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGAGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCt > 1:1245022/1‑150 (MQ=255) tGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCtt > 1:900322/1‑150 (MQ=255) aCAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTc < 1:784127/150‑1 (MQ=255) aCAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATGGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGGTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGGCAGACTGTGCTTTc < 1:784129/150‑1 (MQ=255) gAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGTGTCAGACTGTGCTTTCGCTGcc < 1:475488/150‑1 (MQ=255) caAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTc < 1:793024/150‑1 (MQ=255) aaGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCg < 1:1284722/150‑1 (MQ=255) aGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCgg < 1:1509628/150‑1 (MQ=255) gagaTTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGc < 1:1423353/150‑1 (MQ=255) ttATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATc < 1:263848/150‑1 (MQ=255) aTGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATccc > 2:388446/1‑150 (MQ=255) aTGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATccc < 1:1130154/150‑1 (MQ=255) tGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCt > 2:386108/1‑150 (MQ=255) tGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCt > 1:582556/1‑150 (MQ=255) gggAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCtt > 1:1381728/1‑150 (MQ=255) aaCAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCGGCg < 2:146970/150‑1 (MQ=255) aaCAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCGGCg < 2:1259337/150‑1 (MQ=255) aGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCGGCGAAg < 2:747643/150‑1 (MQ=255) aGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCGGCGAAg < 1:1460567/150‑1 (MQ=255) aGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCGGCGAAg < 2:1192172/150‑1 (MQ=255) ggTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCGGCGAAGa > 1:378662/1‑150 (MQ=255) ggATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCGGCGAAGACAAAttt > 1:1289999/1‑150 (MQ=255) aTTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCGGCGAAGACAAATTTca < 1:712357/150‑1 (MQ=255) ttGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGTTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCGGCGAAGACAAATTTcac < 1:316919/150‑1 (MQ=255) ttGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCGGCGAAGACAAATTTcac < 1:941859/150‑1 (MQ=255) gagaTGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCGGCGAAGACAAATTTCACAt > 1:1406905/1‑150 (MQ=255) agaTGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCGGCGAAGACAAATTTCACATc > 2:969161/1‑150 (MQ=255) tgtgGACTGTAGATATTCAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCGGCGAAGACAAATTTCACATCGGt > 2:288306/1‑150 (MQ=255) tgtgGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCGGCGAAGACAAATTTCACATCGGt < 2:1289999/150‑1 (MQ=255) gtgGACTGTAGATATTCAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCgg < 2:583372/127‑1 (MQ=255) gtgGACTGTAGATATTCAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCgg > 1:583372/1‑127 (MQ=255) tgGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCGGCGAAGACAAATTTCACATCGGTaa > 1:1198039/1‑150 (MQ=255) aCTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCGGCGAAGACAAATTTCACATCGGTAATGc < 1:1452182/150‑1 (MQ=255) cTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCGGCGAAGACAAATTTCACATCGGTAATGcc > 1:797147/1‑150 (MQ=255) gAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCGGCGAAGACAAATTTca > 1:1038990/1‑135 (MQ=255) gAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCGGCGAAGACAAATTTca < 2:1038990/135‑1 (MQ=255) gAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCGGCGAAGACAAATTTCACATCGGTAATGCCGa > 2:558161/1‑150 (MQ=255) gAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCGGCGAAGACAAATTTCACATCGGTAATGCCGa < 2:384880/150‑1 (MQ=255) gAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCGGCGAAGACAAATTTCACATCGGTAATGCCGa > 2:100008/1‑150 (MQ=255) aaTATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCGGCGAAGACAAATTTCACATCGGTAATGCCGAt > 2:1309680/1‑150 (MQ=255) atatCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTTTGCGATCCCTTCGGCGAAGACAAATTTCACATCGGTAATGCCGATa < 2:365640/150‑1 (MQ=255) atCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCGGCGAAGACAAATTTCACATCGGTAACGCCGATaaa > 2:32631/1‑150 (MQ=255) tCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCGGCGAAGACAAGTTTCACATCGGTTATGCCGATAAAg > 2:864742/1‑150 (MQ=255) tCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCGGCGAAGACAAATTTCACATCGGCATTACCGAtgtga < 2:94173/150‑5 (MQ=255) | TTGTTATGTTACGGACACTGTAAAACCGTTAATGAAGCGATTAGCTATATTCGAGCCAGACGCCCGCAGATTGTGCTGACAGACGAGCACAAAGCGATGCTGAGATTATGGGAAAACAGGTAAGTGGATTGAGATGTGGACTGAATATCTACAGTCCACATCAAGACCGTGTCCGGTTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCAGACTGTGCTTTCGCTGCCATTTCCGGACCGTATGCGATCCCTTCGGCGAAGACAAATTTCACATCGGTAATGCCGATAAAG > NC_000913/1482079‑1482375 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |