Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 203,393 | A→T | 6.2% | T16S (ACC→TCC) ‡ | lpxB → | lipid A disaccharide synthase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 203,393 | 0 | A | T | 6.2% | 245.2 / 5.0 | 80 | T16S (ACC→TCC) ‡ | lpxB | lipid A disaccharide synthase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (34/41); new base T (2/3); total (36/44) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.22e-01 |
GATGAAGTGAAACCGGAAATTGCTGAACTGGCGGAAACATATCCGGAAGTGAAAGCCTTTACCGATTTCTTTGCACGCTCAACGCGCGGTCTGATTCGTTAATGACTGAACAGCGTCCATTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTGGGGGCCGGTTTAATCCGCGCTCTGAAAGAACATGTGCCCAACGCCCGCTTTGTTGGTGTTGCCGGGCCACGAATGCAGGCTGAAGGCTGCGAAGCCTGGTACGAAATGGAAGAACTGGCGGTGATGGGC > NC_000913/203247‑203539 | gATGAAGTGAAACCGGAAATTGCTGAACTGGCGGAAACATATCCGGAAGTGAAAGCCTTTACCGATTTCTTTGCACGCTCAACGCGCGGTCTGATTCGTTAATGACTGAACAGCGTCTATTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCt > 1:763234/1‑150 (MQ=255) gAAGTGAAACCGGAAATTGCTGAACTGGCGGAAACATATCCGGAAGTGAAAGCCTTTACCGATTTCTTTGCACGCTCAACGCGCGGTCTGATTCGTTAATGACTGAACAGCGTCCATTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACATCCg > 1:1234058/1‑150 (MQ=255) aaGTGAAACCGGAAATTGCTGAACTGGCGGAAACATATCCGGAAGTGAAAGCCTTTACCGATTTCTTTGCACGCTCAACGCGCGGTCTGATTCGTTAATGACTGAACAGCGTCCATTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCgg < 1:89193/150‑1 (MQ=255) aaGTGAAACCGGAAATTGCTGAACTGGCGGAAACATATCCGGAAGTGAAAGCCTTTACCGATTTCTTTGCACGCTCAACGCGCGGTCTGATTCGTTAATGACTGAACAGCGTCCATTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCgg < 2:1232872/150‑1 (MQ=255) gTGAAACCGGAAATTGCTGAACTGGCGGAAACATATCCGGAAGTGAAAGCCTTTACCGATTTCTTTGCACGCTCAACGCGCGGTCTGATTCGTTAATGACTGAACAGCGTCCATTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGGTTTCTCCGGCg < 1:794879/150‑1 (MQ=255) gTGAAACCGGAAATTGCTGAACTGGCGGAAACATATCCGGAAGTGAAAGCCTTTACCGATTTCTTTGCACGCTCAACGCGCGGTCTGATTCGTTAATGACTGAACAGCGTCCATTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCg < 2:1300844/150‑1 (MQ=255) gTGAAACCGGAAATTGCTGAACTGGCGGAAACATATCCGGAAGTGAAAGCCTTTACCGATTTCTTTGCACGCTCAACGCGCGGTCTGATTCGTTAATGACTGAACAGCGTCCATTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCg > 1:443852/1‑150 (MQ=255) tGAAACCGGAAATTGCTGAACTGGCGGAAACATATCCGGAAGTGAAAGCCTTTACCGATTTCTTTGCACGCTCAACGCGCGGTCTGATTCGTTAATGACTGAACAGCGTCCATTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGGTTTCTCCGGCGa < 2:1306300/150‑1 (MQ=255) tGAAACCGGAAATTGCTGAACTGGCGGAAACATATCCGGAAGTGAAAGCCTTTACCGATTTCTTTGCACGCTCAACGCGCGGTCTGATTCGTTAATGACTGAACAGCGTCCATTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGGTTTCTCCGGCGa < 2:1483399/150‑1 (MQ=255) aaaCCGGAAATTGCTGAACTGGCGGAAACATATCCGGAAGTGAAAGCCTTTACCGATTTCTTTGCACGCTCAACGCGCGGTCTGATTCGTTAATGACTGAACAGCGTCCATTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGata > 1:1104148/1‑150 (MQ=255) aaaCCGGAAATTGCTGAACTGGCGGAAACATATCCGGAAGTGAAAGCCTTTACCGATTTCTTTGCACGCTCAACGCGCGGTCTGATTCGTTAATGACTGAACAGCGTCCATTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGata < 2:453489/150‑1 (MQ=255) aTTGCTGAACTGGCGGAAACATATCCGGAAGTGAAAGCCTTTACCGATTTCTTTGCACGCTCAACGCGCGGTCTGATTCGTTAATGACTGAACAGCGTCCATTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTggggg < 2:511292/150‑1 (MQ=255) cTGAACTGGCGGAAACATATCCGGAAGTGAAAGCCTTTACCGATTTCTTTGCACGCTCAACGCGCGGTCTGATTCGTTAATGACTGAACAGCGTCCATTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTGGGGGCCgg < 1:1499830/150‑1 (MQ=255) aaCTGGCGGAAACATATCCGGAAGTGAAAGCCTTTACCGATTTCTTTGCACGCTCAACGCGCGGTCTGATTCGTTAATGACTGAACAGCGTCTATTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTGGGGGCCGGttt < 2:763234/150‑1 (MQ=255) cTGGCGGAAACATATCCGGAAGTGAAAGCCTTTACCGATTTCTTTGCACGCTCAACGCGCGGTCTGATTCGTTAATGACTGAACAGCGTCCATTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTGGGGGCCGGTTTaa < 2:325221/150‑1 (MQ=255) cGGAAACATATCCGGAAGTGAAAGCCTTTACCGATTTCTTTGCACGCTCAACGCGCGGTCTGATTCGTTAATGACTGAACAGCGTCCATTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTGGGGGCCGGTTTAATCcg < 2:205885/150‑1 (MQ=255) cGGAAACATATCCGGAAGTGAAAGCCTTTACCGATTTCTTTGCACGCTCAACGCGCGGTCTGATTCGTTAATGACTGAACAGCGTCCATTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTGGGGGCCGGTTTAATCcg < 1:912331/150‑1 (MQ=255) cATATCCGGAAGCGAAAGCCTTTACCGATTTCTTTGCACGCTCAACGCGCGGTCTGATTCGTTAATGACTGAACAGCGTCCATTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTGGGGGCCGGTTTAATCCGCGctct < 1:1382824/150‑1 (MQ=255) atatCCGGAAGTGAAAGCCTTTACCGATTTCTTTGCACGCTCAACGCGCGGTCTGATTCGTTAATGACTGAACAGCGTCCATTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTGGGGGCCGGTTTAATCCGCGCTCTg > 2:392420/1‑150 (MQ=255) tatCCGGAAGTGAAAGCCTTTACCGATTTCTTTGCACGCTCAACGCGCGGTCTGATTCGTTAATGACTGAACAGCGTCCATTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTGGGGGCCGGTTTAATCCGCGCTCTGa < 1:648198/150‑1 (MQ=255) ccGGAAGTGAAAGCCTTTACCGATTTCTTTGCACGCTCAACGCGCGGTCTGATTCGTTAATGTCTGAACAGCGTCCATTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTGGGGGCCGGTTTAATCCGCGCTCTGAAAg < 2:791937/150‑1 (MQ=255) ccGGAAGTGAAAGCCTTTACCGATTTCTTTGCACGCTCAACGCGCGGTCTGATTCGTTAATGACTGAACAGCGTCCATTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTGGGGGCCGGTTTAATCCGCGCTCTGAAAg < 1:835073/150‑1 (MQ=255) cGGAAGTGAAAGCCTTTACCGATTTCTTTGCACGCTCAACGCGCGGTCTGATTCGTTAATGACTGAACAGCGTCCATTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTGGGGGCCGGTTTAATCCGCGCTCTGAAAGa > 2:1257559/1‑150 (MQ=255) gAAGTGAAAGCCTTTACCGATTTCTTTGCACGCTCAACGCGCGGTCTGATTCGTTAATGACTGAACAGCGTCCATTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTGGGGGCCGGTTTAATCCGCGCTCTGAAAGAAc > 2:1120172/1‑150 (MQ=255) gAAGTGAAAGCCTTTACCGATTTCTTTGCACGCTCAACGCGCGGTCTGATTCGCTAATGACTGAACAGCGTCCATTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTGGGGGCCGGTTTAATCCGCGCTCTGAAAGAAc < 1:609112/150‑1 (MQ=255) aGTGAAAGCCTTTACCGATTTCTTTGCACGCTCAACGCGCGGTCTGATTCGTTAATGACTGAACAGCGTCCATTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTGGGGGCCGGTTTAATCCGCGCTCTGAAAGAACAt < 1:682991/150‑1 (MQ=255) ccTTTACCGATTTCTTTGCACGCTCAACGCGCGGTCTGATTCGTTAATGACTGAACAGCGTCCATTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTGGGGGCCGGTTTAATCCGCGCTCTGAAAGAACATGTGCCCaa > 1:894676/1‑150 (MQ=255) ccTTTACCGATTTCTTTGCACGCTCAACGCGCGGTCTGATTCGTTAATGACTGAACAGCGTCCATTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTGGGGGCCGGTTTAATCCGCGCTCTGAAAGAACATGTGCCCaa > 2:1216727/1‑150 (MQ=255) ccGATTTCTTTGCACGCTCAACGCGCGGTCTGATTCGTTAATGACTGAACAGCGTCCATTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTGGGGGCCGGTTTAATCCGCGCTCTGAAAGAACATGTGCCCAACGCCCg > 1:125714/1‑150 (MQ=255) ccGATTTATTTGCACGCTCAACGCGCGGTCTGATTCGTTAATGACTGAACAGCGTCCATTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTGGGGGCCGGTTTAATCCGCGCTCTGAAAGAACATGTGCCCAACGCCCg > 2:434560/1‑150 (MQ=255) aTTTCTTTGCACGCTCAACGCGCGGTCTGATTCGTTAATGACTGAACAGCGTCCATTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTGGGGGCCGGTTTAATCCGCGCTCTGAAAGAACATGTGCCCAACGCCCGCtt < 2:1485381/150‑1 (MQ=255) tttCTTTGCACGCTCAACGCGCGGTCTGATTCGTTAATGACTGAACAGCGTCCATTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTGGGGGCCGGTTTAATCCGCGCTCTGAAAGAACATGTGCCCAACGCCCGCttt < 1:1376901/150‑1 (MQ=255) tCTTTGCACGCTCAACGCGCGGTCTGATTCGTTAATGACTGAACAGCGTCCATTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTGGGGGCCGGTTTAATCCGCGCTCTGAAAGAACATGTGCCCAACGCCCGc < 2:1437514/145‑1 (MQ=255) tCTTTGCACGCTCAACGCGCGGTCTGATTCGTTAATGACTGAACAGCGTCCATTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTGGGGGCCGGTTTAATCCGCGCTCTGAAAGAACATGTGCCCAACGCCCGc > 1:1437514/1‑145 (MQ=255) cTTTGCACGCTCAACGCGCGGTCTGATTCGTTAATGACTGAACAGCGTCCATTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTGGGGGCCGGTTTAATCCGCGCTCTGAAAGAACATGTGCCCAACGCCCGCTttgtt > 1:561709/1‑150 (MQ=255) gCACGCTCAACGCGCGGTCTGATTCGTTAATGACTGAACAGCGTCCATTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGCAACCTCCGGCCATATCCTGGGGGCCGGTTTAATCCGCGCTCTGAAACAACATGTGCCCAACGCCAGCTTTGTAGgtg > 2:595193/1‑150 (MQ=255) gCACGCTCAACGCGCGGTCTGATTCGTTAATGACTGAACAGCGTCCATTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTGGGGGCCGGTTTAATCCGCGCTCTGAAAGAACATGTGCCCAACGCCCGCTTTGTTGgtg > 1:494685/1‑150 (MQ=255) gCACGCTCAACGCGCGGTCTGATTCGTTAATGACTGAACAGCGTCCATTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTGGGGGCCGGTTTAATCCGCGCTCTGAAAGAACATGTGCCCAACGCCCGCTTTGTTGgtg > 1:1220783/1‑150 (MQ=255) cACGCTCAACGCGCGGTCTGATTCGTTAATGACTGAACAGCGTCCATTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTGGGGGCCGGTTTAATCCGCGCTCTGAAAGAACATGTGCCCAACGCCCGCTTTGTTGgtgt > 2:968295/1‑150 (MQ=255) aCGCTCAACGCGCGGTCTGATTCGTTAATGACTGAACAGCGTCCATTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCT‑GGGGCCGGTTTAATCCGCGCTCTGAAAGAACATGTGCCCAACGCCCGCTTTGTTGGTGTTg < 1:1081887/150‑1 (MQ=255) cGCTCAACGCGCGGTCTGATTCGTTAATGACTGAACAGCGTCCATTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTGGGGGCCGGTTTAATCCGCGCTCTGAAAGAACATGTGCCCAACGCCCGCTTTGTTGGTGTTg > 1:1297748/1‑150 (MQ=255) cGCTCAACGCGCGGTCTGATTCGTTAATGACTGAACAGCGTCCATTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTGGGGGCCGGTTTAATCCGCGCTCTGAAAGAACATGTGCCCAACGCCCGCTTTGTTGGTGTTg < 2:561709/150‑1 (MQ=255) cGCTCAACGCGCGGTCTGATTCGTTAATGACTGAACAGCGTCCATTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTGGGGGCCGGTTTAATCCGCGCTCTGAAAGAACATGTGCCCAACGCCCGCTTTGTTGGTGTTg > 1:892633/1‑150 (MQ=255) cTCAACGCGCGGTCTGATTCGTTAATGACTGAACAGCGTCCATTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTGGGGGCCGGTTTAATCCGCGCTCTGAAAGAACATGTGCCCAACGCCCGCTTTGTTGGTGTTGcc < 2:1104148/150‑1 (MQ=255) aaCGCGCGGTCTGATTCGTTAATGACTGAACAGCGTCCATTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTGGGGGCCGGTTTAATCCGCGCTCTGAAAGAACATGTGCCCAACGCCCGCTTTGTTGGTGTTGCCggg < 1:17701/150‑1 (MQ=255) cgcgcgGTCTGATTCGTTAATGACTGAACAGCGTCCATTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTGGGGGCCGGTTTAATCCGCGCTCTGAAAGAACATGTGCCCAACGCCCGCTTTGTTGGTGTTGccagttc > 1:395849/1‑145 (MQ=255) gcgcgGTCTGATTCGTTAATGACTGAACAGCGTCCATTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTGGGGGCCGGTTTAATCCGCGCTCTGAAAGAACATGTGCCCAACGCCCGCTTTGTTGGTGTTGCCGGGCCa < 1:1027961/150‑1 (MQ=255) gcgcgGTCTGATTCGTTAATGACTGAACAGCGTCCATTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTGGGGGCCGGTTTAATCCGCGCTCTGAAAGAACATGTGCCCAACGCCCGCTTTGTTGGTGTTGCCGGGCCa < 1:1092992/150‑1 (MQ=255) tGATTCGTTAATGACTGAACAGCGTCCATTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTGGGGGCCGGTTTAATCCGCGCTCTGAAAGAACATGTGCCCAACGCCCGCTTTGTTGGTGTTGCCGGGCCACGAATGCa < 2:663658/150‑1 (MQ=255) aTTCGTTAATGACTGAACAGCGTCCATTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTGGGGGCCGGTTTAATCCGCGCTCTGAAAGAACATGTGCCCAACGCCCGCTTTGTTGGTGTTGCCGGGCCACGAATGCAgg < 1:1021036/150‑1 (MQ=255) ttCGTTAATGACTGAACAGCGTCCATTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTGGGGGCCGGTTTAATCCGCGCTCTGAAAGAACATGTGCCCAACGCCCGCTTTGTTGGTGTTGCCGGGCCACGAATGCAGGc < 1:806798/150‑1 (MQ=255) ttAATGACTGAACAGCGTCCATTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTGGGGGCCGGTTTAATCCGCGCTCTGAAAGAACATGTGCCCAACGCCCGCTTTGTTGGTGTTGCCGGGCCACGAATGCa < 1:703616/143‑1 (MQ=255) ttAATGACTGAACAGCGTCCATTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTGGGGGCCGGTTTAATCCGCGCTCTGAAAGAACATGTGCCCAACGCCCGCTTTGTTGGTGTTGCCGGGCCACGAATGCa > 2:703616/1‑143 (MQ=255) tAATGACTGAACAGCGTCCATTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTGGGGGCCGGTTTAATCCGCGCTCTGAAAGAACATGTGCCCAACGCCCGCTTTGTTGGTGTTGCCGGGCCACGAATGCAGGCTGAAg < 1:1071458/150‑1 (MQ=255) tGAACAGCGTCCATTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTGGGGGCCGGTTTAATCCGCGCTCTGAAAGAACATGTGCCCAACGCCCGCTTTGTTGGTGTTGCCGGGCCACGAATGCAGGCTGAAGGCTGCGa < 2:494685/150‑1 (MQ=255) gAACAGCGTCCATTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTGGGGGCCGGTTTAATCCGCGCTCTGAAAGAACATGTGCCCAACGCCCGCTTTGTTGGTGTTGCCGGGCCACGAATGCAGGCTGAAGGCTGCGaa > 1:1213774/1‑150 (MQ=255) aCAGCGTCCATTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTGGGGGCCGGTTTAATCCGCGCTCTGAAAGAACATGTGCCCAACGCCCGCTTTGTTGGTGTTGCCGGGCCACGAATGCAGGCTGAAGGCTGCGAAGc > 1:819254/1‑150 (MQ=255) aCAGCGTCCATTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTGGGGGCCGGTTTAATCCGCGCTCTGAAAGAACATGTGCCCAACGCCCGCTTTGTTGGTGTTGCCGGGCCACGAATGCAGCCTTCAGCCTGcattcg < 2:464549/150‑6 (MQ=255) cAGCGTCCATTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTGGGGGCCGGTTTAATCCGCGCTCTGAAAGAACATGTGCCCAACGCCCGCTTTGTTGGTGTTGCCGGGCCACGAATGCAGGCTGAAGGCTGCGAAGcc > 2:232244/1‑150 (MQ=255) aGCGTCCATTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTGGGGGCCGGTTTAATCCGCGCTCTGAAAGAACATGTGCCCAACGCCCGCTTTGTTGGTGTTGCCGGGCCACGAATGCAGGCTGAAGGCTGCGAAGCCt < 1:968295/150‑1 (MQ=255) gCGTCCATTAACGTTTGCCCTGGTCGCCGGTGAAACCTCCGGCGTTATCCTGGGGGCCGGTTTAATCCGCGGTCTGAATGAAAATTTTTCTAAATGATTCTTTGTTGGTGTTGCAGGTCAAAGAATGCATGTTGTAGGCTTCGATTCCTg < 2:992791/150‑1 (MQ=255) tCCATTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTGGGGGCCGGTTTAATCCGCGCTCTGAAAGAACATGTGCCCAACGCCCGCTTTGTTGGTGTTGCCGGGCCACGAATGCAGGCTGAAGGCTGCGAAGCCTGGTa < 1:439744/150‑1 (MQ=255) ccATTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTGGGGGCCGGTTTAATCCGCGCTCTGAAAGAACATGTGCCCAACGCCCGCTTTGTTGGTGTTGCCGGGCCACGAATGCAGGCTGAAGGCTTCGCAGCCttcagc < 1:1216727/150‑6 (MQ=255) 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ttGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTGGGGGCCGGTTTAATCCGCGCTCTGAAAGAACATGTGCCCAACGCCCGCTTTGTTGGTGTTGCCGGGCCACGAATGCAGGCTGAAGGCTGCGAAGCCTGGTACGAAATGgaag < 2:1039509/150‑1 (MQ=255) ttGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTGGGGGCCGGTTTAATCCGCGCTCTGAAAGAACATGTGCCCAACGCCCGCTTTGTTGGTGTTGCCGGGCCACGAATGCAGGCTGAAGGCTGCGAAGCCTGGTACGAAATGgaag < 1:1257559/150‑1 (MQ=255) gCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTGGGGGCCGGTTTAATCCGCGCTCTGAAAGAACATGTGCCCAACGCCCGCTTTGTTGGTGTTGCCGGGCCACGAATGCAGGCTGAAGGCTGCGAAGCCTGGTACGAAATGgaagaa > 1:1470374/1‑150 (MQ=255) accTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTGGGGGCCGGTTTAATCCGCGCTCTGAAAGAACATGTGCCCAACGCCCGCTTTGTTGGTGTTGCCGGGCCACGAATGCAGGCTGAAGGCTGCGAAGCCTGGTACGAAATGGAAGAAc > 1:157607/2‑150 (MQ=255) tatCGCCGGAGGTTTCTCCGGCGATATCCTGGGGGCCGGTTTAATCCGCGCTCTGAAAGAACATGTGCCCAACGCCCGCTTTGTTGGTGTTGCCGGGCCACGAATGCAGGCTGAAGGCTGCGAAGCCTGGTACGAAATGGAAGAACTGGc > 1:1078632/3‑150 (MQ=255) 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gaAACCTCCGGCGATATCCTGGGGGCCGGTTTAATCCGCGCTCTGAAAGAACATGTGCCCAACGCCCGCTTTGTTGGTGTTGCCGGGCCACGAATGCAGGCTGAAGGCTGCGAAGCCTGGTACGAAATGGAAGAACTGGCGGTGATGGGc > 2:1060036/1‑150 (MQ=255) gaAAACTCCGGCGATATCCTTGGGGCCGGTTTAATCCGCGCTCTGAAAGAACATGTGCCCAACGCCCGCTTTGTTGGTGTTGCCGGGCCACGAATGCAGGCTGAAGGCTGCGAAGCCTGGTACGAAATGGAAGAACTGGCGGTGATGGGc < 2:702532/150‑1 (MQ=255) | GATGAAGTGAAACCGGAAATTGCTGAACTGGCGGAAACATATCCGGAAGTGAAAGCCTTTACCGATTTCTTTGCACGCTCAACGCGCGGTCTGATTCGTTAATGACTGAACAGCGTCCATTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTGGGGGCCGGTTTAATCCGCGCTCTGAAAGAACATGTGCCCAACGCCCGCTTTGTTGGTGTTGCCGGGCCACGAATGCAGGCTGAAGGCTGCGAAGCCTGGTACGAAATGGAAGAACTGGCGGTGATGGGC > NC_000913/203247‑203539 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |