| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,990,932 | C→T | 9.3% | intergenic (+40/+22) | tyrP → / ← yecA | tyrosine:H(+) symporter/UPF0149 family protein YecA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,990,932 | 0 | C | T | 9.3% | 281.4 / 14.0 | 97 | intergenic (+40/+22) | tyrP/yecA | tyrosine:H(+) symporter/UPF0149 family protein YecA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (46/42); new base T (4/5); total (50/47) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.36e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.30e-01 | |||||||||||
ACCGGGTCAAAGGTGGTCGTCCGGCGCTGGTGGTGGTGTTTCTCTGTGGTATTGCTGTGATTGGCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCTTTGATCGGTTGCTGAACAGCTTTTTCCTGCGGATGCGCCATCCAGTACG > NC_000913/1990783‑1991081 | aCCGGGTCAAAGGTGGTCGTCCGGCTCTGGTGGTGGTGTTTCTCTGTGGTATTGCTGTGATTGGCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTAATGGGTGCCAGAATTAAc < 2:976500/150‑1 (MQ=255) ccGGGTCAAAGGTGGTCGTCCGGCGCTGGTGGTGGGGTTTCTCTGTGGTATTGCTGTGATTGGCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGTGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACg < 2:920598/150‑1 (MQ=255) gggTCAAAGGTGGTCGTCCGGCGCTGGTGGTGGTGTTTCTCTGTGGTATTGCTGTGATTGGCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCt > 2:941598/1‑150 (MQ=255) aaGGTGGTCGTCCGGCGCTGGTGGTGGTGTTTCTCTGTGGTATTGCTGTGATTGGCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGTCAGCGTTAATTCTGGCAcc < 1:429482/150‑1 (MQ=255) aaGGTGGTCGTCCGGCGCTGGTGGTGGTGTTTCTCTGTGGTATTGCTCTGATTGGCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACAcc > 2:1202700/1‑150 (MQ=255) ggtggtCGTCCGGCGCTGGTGGTGGTGTTTCTCTGTGGTATTGCTGTGATTGGCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCa > 1:913647/1‑150 (MQ=255) gtcgtcCGGCGCTGGTGGTGGTGTTTCTCTGTGGTATTGCTGTGATTGGTGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGTCAGCGTTAATTCTGGCACCCAAtaa < 1:651981/150‑3 (MQ=255) cgtcCGGCGCTGGTGGTGGTGTTTCTCTGTGGTATTGCTGTGATTGGCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTgg < 2:1377358/150‑1 (MQ=255) cgtcCGGCGCTGGTGGTGGTGTTTCTCTGTGGTATTGCTGTGATTGGCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGCTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTgg > 1:690006/1‑150 (MQ=255) cgtcCGGCGCTGGTGGTGGTGCTTCTCTGTGGTATTGCTGTGATTGGCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGTCAGCGTTAATTCTGGCACCCAAtaagg < 2:1226986/150‑5 (MQ=38) cggccGGGGCGGGTGGGGGTGGTTCTCTGTGGTATTGCTGGGATTGGCGTGCAATTTTTGATGGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGTCAGCGTTAATTCTGGCACCCAAtaagg < 2:776560/147‑5 (MQ=37) gtcCGGCGCTGGTGGTGGTGTTTCTCTGTGGTATTGCTGTGATTGGCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGc < 2:138706/150‑1 (MQ=255) ccGGCGCTGGTGGTGGTGTTTCTCTGTGGTATTGCTGTGATTGGCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCct > 1:342317/1‑150 (MQ=255) ccGGCGCTGGTGGTGGTGTTTCTCTGTGGTATTGCTGTGATTGGCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCct > 1:1276162/1‑150 (MQ=255) ccGGCGCTGGTGGTGGGGTTTCTCTGTGGTATTGCTGTGATTGGCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGTCAGCGTTAATTCTGGCACCCAAtaaggaat < 2:922653/150‑8 (MQ=38) ggCGCGGGTGGGGGTGTTGCTCTGTGGTATTGCTGTGATTGGCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGGGATCAGCTAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAAATAACGCTGACACCCAATTTGGCctct < 1:1378519/150‑1 (MQ=255) gcgcTGGTGGTGGTGTTTCTCTGTGGTATTGCTGTGATTGGCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCtt > 2:835454/1‑150 (MQ=255) cTGGTGGTGGTGTTTCTCTGTGGTATTGCTGTGATTGGCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAAt < 1:1011724/150‑1 (MQ=255) tggtggtgTTTCTCTGTGGTATTGCTGTGATTGGCGTGCAATTTTTGATTGCGGAAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGAAACCCAATTTGGCATCTTAATgaag > 2:135738/1‑150 (MQ=255) tggtgTTTCTCTGTGGTATTGCTGTGATTGGCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATgcaggca > 1:519184/1‑150 (MQ=255) ggtgTTTCTCTGTGGTATTGCTGTGATTGGCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATgcaggcag > 1:1153407/1‑150 (MQ=255) ggtgTTTATCTGTGGTATTGCTGTGATTGGCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATgcaggcag > 2:337798/1‑150 (MQ=255) gtgtTTCTCTGTGGTATTGCTGTGATTGGCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGgcagc < 2:843723/150‑1 (MQ=255) tgtTTCTCTGTGGTATTGCTGTGATTGGCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGgcagca > 1:1312528/1‑150 (MQ=255) gtTTCTCTGTGGTATTGCTGTGATTGGCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCAc > 1:1436800/1‑150 (MQ=255) gtTTCTCTGTGGTATTGCTGTGATTGGCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCAc < 1:1082783/150‑1 (MQ=255) tctcTGTGGTATTGCTGTGATTGGCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGc > 1:348394/1‑150 (MQ=255) tctGTGGTATTGCTGTGATTGGCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCtt > 1:221020/1‑150 (MQ=255) tctGTGGTATTGCTGTGATTGGCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCtt > 1:1290293/1‑150 (MQ=255) gtgGTATTGCTGTGATTGTCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTaaa < 1:135738/150‑1 (MQ=255) gtgGTATTGCTGTGATTGGCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTaaa < 2:507380/150‑1 (MQ=255) ggTATTGCTGTGATTGGCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAAtt < 2:763305/150‑1 (MQ=255) gTATTGCTGTGATTGGCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAAttt > 2:112447/1‑150 (MQ=255) aTTGCGGTGATTGGCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCt < 2:497474/150‑1 (MQ=255) ttGCTGTGATTGGCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCtt < 1:134756/150‑1 (MQ=255) tGCTGTGATTGGCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTa > 2:486966/1‑150 (MQ=255) gCTGTGATTGGCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTAc > 1:857825/1‑150 (MQ=255) cTGTGATTGGCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTAcc > 1:827840/1‑150 (MQ=255) gATTGGCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTa > 1:358303/1‑150 (MQ=255) gATTGGCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTa > 2:507901/1‑150 (MQ=255) aTTGGCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTAc > 2:1245325/1‑150 (MQ=255) ggCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGc < 1:989376/150‑1 (MQ=255) gCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCa > 1:15924/1‑150 (MQ=255) gCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACggg < 2:221020/150‑1 (MQ=255) gCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACggg > 1:961258/1‑150 (MQ=255) tttGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGa > 2:1033907/1‑150 (MQ=255) gATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCg > 1:250364/1‑150 (MQ=255) gATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCg > 2:948878/1‑150 (MQ=255) gggCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACg < 2:992708/149‑1 (MQ=255) cGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACg > 2:397722/1‑150 (MQ=255) gCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGcc < 1:507901/150‑1 (MQ=255) cAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGccc > 2:153266/1‑150 (MQ=255) aGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGcccc < 2:961345/150‑1 (MQ=255) aGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGcccc < 2:1087418/150‑1 (MQ=255) aCCTGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCTAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTctct < 1:219893/150‑1 (MQ=255) aCCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTctct > 1:257047/1‑150 (MQ=255) cAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCtcttc < 1:1202700/150‑1 (MQ=255) gTGGGGTGATCAGATAGGCTCAATTTCCTTATTGGGTGGCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGACGCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCAGTACCGGACGGGGAAGGATCTTTACGTCCCGTTTTCTCTGCTGCtt < 2:690006/150‑1 (MQ=255) gTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCtt < 2:348394/150‑1 (MQ=255) tGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCTTTGATCg < 2:358303/150‑1 (MQ=255) gATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCTTTGATCgg > 2:225388/1‑150 (MQ=255) aGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCTTTGATCGGTTGc < 1:486966/150‑1 (MQ=255) gATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCTTTGATCGGTTGCt < 1:835454/150‑1 (MQ=255) aTAGCCTCAACTTCCATATGGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCTTTGATCGGTTGCTg < 2:809624/150‑1 (MQ=255) aTAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCTTTGATCGGTTGCTg < 1:1207775/150‑1 (MQ=255) tAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCTTTGATCGGTTGCTGa > 1:1521234/1‑150 (MQ=255) gCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTCACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTCATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCCCTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCTTTGATCGGGTGCTGAAc < 2:290391/150‑1 (MQ=255) gCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCTTTGATCGGTTGCTGAAc > 2:339688/1‑150 (MQ=255) gCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGATTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGATACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCTTTGATCGGTTGCTGAAc > 2:706404/1‑150 (MQ=255) ccTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTAACGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCTTTGATCGGTTGCTGAACa > 1:482047/1‑150 (MQ=255) cTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCTTTGATCGGTTGCTGAACAg < 2:1366223/150‑1 (MQ=255) tCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCTTTGATCGGTTGCTGAACAGc > 1:1076041/1‑150 (MQ=255) cAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCTTTGATCGGTTGCTGAACAGCt > 1:845575/1‑150 (MQ=255) aaaTTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCTTTGATCGGTTGCTGAACAGCtt > 1:1334852/1‑150 (MQ=255) aTTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCGCGGTTTCTCTTCTGCTTTGATCGGTTGCTGAACAGCtttt < 2:1230488/150‑1 (MQ=255) gccaaaTTGGGTGTCAGCGTTAATTCTGGCACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCTTTGATCGGTTGCTGAACAGCTTTTTc > 2:1283210/6‑150 (MQ=38) ccaaaTTGGGTGTCAGCGTTAATTCTGGCACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCTTTGATCGGTTGCTGAACAGCTTTTTcc > 2:1225639/5‑150 (MQ=39) ccTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCTTTGATCGGTTGCTGAACAGCTTTTTcc > 2:330764/1‑150 (MQ=255) ttATTGGGGGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCTTTGATCGGTTGCTGAACAGCTTTTTCCTg < 2:1382911/150‑1 (MQ=255) aTTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCTTTGATCGGTTGCTGAACAGCTTTTTCCTGCg < 1:821370/150‑1 (MQ=255) ttGGGTGCCATAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCATATTAATGCAGTCAGCACTGATTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCTTTGATCGGTTGCTGAACAGCTTTTTCCTGCgg < 2:482047/150‑1 (MQ=255) ttGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCTTTGATCGGTTGCTGAACAGCTTTTTCCTGCgg < 2:1290293/150‑1 (MQ=255) gagatgaccAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCTTTGATCGGTTGCTGAACAGCTTTTTCCTGCgg < 1:1344873/143‑1 (MQ=255) tGGGTGTCAGCGTTAATTCTGGCACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCTTTGATCGGTTGCTGAACAGCTTTTTCCTGCGGa > 2:375719/1‑150 (MQ=255) tGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCTTTGATCGGTTGCTGAACAGCTTTTTCCTGCGGa < 1:1033907/150‑1 (MQ=255) gggTGTCAGCGTTAATTCTGGCACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCTTTGATCGGTTGCTGAACAGCTTTTTCCTGCGGAt > 2:8967/1‑150 (MQ=255) gTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCTTTGATCGGTTGCTGAACAGCTTTTTCCTGCGGATgc > 1:842286/1‑150 (MQ=255) gTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCTTTGATCGGTTGCTGAACAGCTTTTTCCTGCGGATgc > 1:88709/1‑150 (MQ=255) gTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCTTTGATCGGTTGCTGAACAGCTTTTTCCTGCGGATgc > 1:1114429/1‑150 (MQ=255) gCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCTTTGATCGGTTGCTGAACAGCTTTTTCCTGCGGATgcgc > 2:220822/1‑150 (MQ=255) cAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCTTTGATCGGTTGCTGAACAGCTTTTTCCTGCGGATGCGCCa > 2:433367/1‑150 (MQ=255) aaTTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCTTTGATCGGTTGCTGAACAGCTTTTTCCTGCGGATGCGCCATcc < 1:220822/150‑1 (MQ=255) aaTTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCTTTGATCGGTTGCTGAACAGCTTTTTCCTGCGGATGCGCCATcc < 1:1245325/150‑1 (MQ=255) aaTTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCTTTGATCGGTTGCTGAACAGCTTTTTCCTGCGGATGCGCCATcc < 1:112447/150‑1 (MQ=255) aaTTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCTTTGATCGGTTGCTGAACAGCTTTTTCCTGCGGATGCGCCATcc < 2:1312528/150‑1 (MQ=255) ttAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCTAGGATCGTTACGCCCCTGTTTCTCTTCTGCTTTGATCGGTTGCTGAACAGCTTTTTCCTGCGGATGCGCCATCCAg < 2:961258/150‑1 (MQ=255) aCGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCTTTGATCGGTTGCTGAACAGCTTTTTCCTGCGGATGCGCCATcc < 2:1067165/145‑1 (MQ=255) aCGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCTTTGATCGGTTGCTGAACAGCTTTTTCCTGCGGATGCGCCATcc > 1:1067165/1‑145 (MQ=255) cGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCTTTGATCGGTTGCTGAACAGCTTTTTCCTGCGGATGCGCCATCCAGTACg > 2:515480/1‑150 (MQ=255) | ACCGGGTCAAAGGTGGTCGTCCGGCGCTGGTGGTGGTGTTTCTCTGTGGTATTGCTGTGATTGGCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCTTTGATCGGTTGCTGAACAGCTTTTTCCTGCGGATGCGCCATCCAGTACG > NC_000913/1990783‑1991081 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |