Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 2,057,595 | 0 | T | C | 8.2% | 490.1 / 24.3 | 169 | intergenic (+21/+432) | yeeN/asnW | putative transcriptional regulator YeeN/tRNA‑Asn |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (64/91); new base C (2/12); total (66/103) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.26e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
Only 100 of 171 total aligned reads displayed.
TTAGAAATGATTGCTCAATCTGAAGTTGAGCTTTCCCCAGAAGATTTAGAAATCTTTGAAGGGCTTGTTGATGCCCTTGAAGATGACGACGATGTACAAAAAGTTTATCATAACGTCGCAAATCTCTAATTATCTTTTAAAGAAATCTGTCTTTACGGCAGATTTCTTTAATCTCATATAATTCTTATAAAAAATATAATATTCAACTCGTCATATTGATTATACCCCCCCGTTCCCAGAGAAATAATATTTATTAAAATTCCAGTTCTTCTTTTTCTGATTACAGAAGGCAAAGTGGC > NC_000913/2057446‑2057744 | ttAGAAATGATTGCTCAATCTGAAGTTGAGCTTTCCCCAGAAGATTTAGAAATCTTTGAAGGGCTTGTTGATGCCCTTGAAGATGACGACGATGTACAAAAAGTTTATCATAACGTCGCAAATCTCTAATTATCTTTTAAAGAAATCTGt < 1:397527/150‑1 (MQ=255) tAGAAATGATTGCTCAATCTGAAGTTGAGCTTTCCCCAGAAGATTTAGAAATCTTTGAAGGGCTTGTTGATGCCCTTGAAGATGACGACGATGTACAAAAAGTTTATCATAACGTCGCAAATCTCTAATTATCTTTTAAAGAAATCTGTc < 1:673959/150‑1 (MQ=255) tGATTGCTCAATCTGAAGTTGATCTTTCCCCAGAAGATTTAGAAATCTTTGAAGGGCTTGTTGATGCCCTTGAAGATGACGACGATGTACAAAAAGTTTATCATAACGTCGCAAATCTCTAATTATCTTTTAAAGAAATCTGTCTTTACg < 1:1136141/150‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |