Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 2,057,597 | 0 | T | G | 8.4% | 484.2 / 33.1 | 168 | intergenic (+23/+430) | yeeN/asnW | putative transcriptional regulator YeeN/tRNA‑Asn |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (64/90); new base G (2/12); total (66/102) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.99e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.53e-01 |
Only 100 of 170 total aligned reads displayed.
AGAAATGATTGCTCAATCTGAAGTTGAGCTTTCCCCAGAAGATTTAGAAATCTTTGAAGGGCTTGTTGATGCCCTTGAAGATGACGACGATGTACAAAAAGTTTATCATAACGTCGCAAATCTCTAATTATCTTTTAAAGAAATCTGTCTTTACGGCAGATTTCTTTAATCTCATATAATTCTTATAAAAAATATAATATTCAACTCGTCATATTGATTATACCCCCCCGTTCCCAGAGAAATAATATTTATTAAAATTCCAGTTCTTCTTTTTCTGATTACAGAAGGCAAAGTGGCA > NC_000913/2057448‑2057745 | tGATTGCTCAATCTGAAGTTGATCTTTCCCCAGAAGATTTAGAAATCTTTGAAGGGCTTGTTGATGCCCTTGAAGATGACGACGATGTACAAAAAGTTTATCATAACGTCGCAAATCTCTAATTATCTTTTAAAGAAATCTGTCTTTACg < 1:1136141/150‑1 (MQ=255) tGCTCAATCTGAAGTTGAGCTTTCCCCAGAAGATTTAGAAATCTTTGAAGGGCTTGTTGATGCCCTTGAAGATGACGACGATGTACAAAAAGTTTATCATAACGTCGCAAATCTCTAATTATCTTTTAAAGAAATCTGTCTTTACGGCAg < 2:1251595/150‑1 (MQ=255) tGCTCAATCTGAAGATGAGCTTTCCCCAGAAGATTTAGAAATCTTTGAAGGGCTTGTTGATGCCCTTGAAGATGACGACGATGTACAAAAAGTTTATCATAACGTCGCAAATCTCTAATTATCTTTTAAAGAAATCTGTCTTTACGGCAg < 1:704851/150‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |