| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 238,141 | G→A | 10.0% | intergenic (+21/+116) | yafT → / ← ykfM | lipoprotein YafT/uncharacterized protein YkfM |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 238,141 | 0 | G | A | 10.0% | 454.5 / 30.4 | 160 | intergenic (+21/+116) | yafT/ykfM | lipoprotein YafT/uncharacterized protein YkfM |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (91/51); new base A (13/3); total (105/55) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.66e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.29e-01 | |||||||||||
Only 100 of 167 total aligned reads displayed.
AAAGTGCTTCCACCATTGCCCGACAAGAATGAAGCCAGTACGACTGATATGACAGAGCAGCAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATATTTAATTATTTAACTGCTGAATCTTCCTTGCGAGAAATA > NC_000913/237992‑238290 | aaaGTGCTTCCACCATTGCCCGACAAGAATGAAGCCAGTACGACTGATATGACAGAGCAGCAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAgg > 2:1208541/1‑150 (MQ=255) cTTCCACCATTGCCCGACAAGAATGAAGCCAGTACGACTGATATGACAGAGCAGCAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTc > 1:703373/1‑150 (MQ=255) ttCCACCATTGCCCGACAAGAATGAAGCCAGTACGACTGATATGACAGAGCAGCAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCt < 2:537086/150‑1 (MQ=255) ccaccaTTGCCCGACAAGAATGAAGCCAGTACGACTGATATGACAGAGCAGCAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTgg > 1:1267689/1‑150 (MQ=255) caccaTTGCCCGACAAGAATGAAGCCAGTACGACTGATATGACAGAGCAGCAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTggc < 1:389933/150‑1 (MQ=255) caTTGCCCGACAAGAATGAAGCCAGTACGACTGATATGACAGAGCAGCAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTggcggc < 1:15034/150‑1 (MQ=255) caTTGCCCGACAAGAATGAAGCCAGTACGACTGATATGACAGAGCAGCAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGAAATTCCTggcggc < 1:1458465/150‑1 (MQ=255) caTTGCCCGACAAGAATGAAGCCAGTACGACTGATATGACAGAGCAGCAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGAAATTCCTggcggc < 2:272584/150‑1 (MQ=255) gCCCGACAAGAATGAAGCCAGTACGACTGATATGACAGAGCAGCAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCaata < 1:1122485/150‑1 (MQ=255) gCCCGACAAGAATGAAGCCAGTACGACTGATATGACAGAGCAGCAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCaata < 2:345559/150‑1 (MQ=255) cccGACAAGAATGAAGCCAGTACGACTGATATGACAGAGCAGCAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCaataa > 1:1090567/1‑150 (MQ=255) cGACAAGAATGAAGCCAGTACGACTGATATGACAGAGCAGCAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAataata > 2:135307/1‑150 (MQ=255) gACAAGAATGAAGCCAGTACGACTGATATGACAGAGCAGCAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATAc > 2:545653/1‑150 (MQ=255) cAAGAATGAAGCCAGTACGACTGATATGACAGAGCAGCAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACaa > 2:151778/1‑150 (MQ=255) aGAATGAAGCCAGTACGACTGATATGACAGAGCAGCAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACaaaa > 2:1126936/1‑150 (MQ=255) gAATGAAGCCAGTACGACTGATATGACAGAGCAGCAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAAt > 1:865170/1‑150 (MQ=255) gAATGAAGCCAGTACGACTGATATGACAGAGCAGCAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAAt < 1:778907/150‑1 (MQ=255) aTGAAGCCAGTACGACTGATATGACAGAGCAGCAGATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTc < 1:1051003/150‑1 (MQ=255) gAAGCCAGTACGACTGATATGACAGAGCAGCAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCtt > 2:124055/1‑150 (MQ=255) aaGCCAGTACGACTGATATGACAGAGCAGCAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCtt‑t < 1:1087096/150‑1 (MQ=255) gCCAGTACGACTGATATGACAGAGCAGCAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGc < 1:466977/150‑1 (MQ=255) cAGTACGACTGATATGACAGAGCAGCAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAACACAAAATTCTT‑TGCAt > 1:1531763/1‑150 (MQ=255) aGTACGACTGATATGACAGAGCAGCAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTggc < 2:183461/124‑1 (MQ=255) aGTACGACTGATATGACAGAGCAGCAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATa < 1:1208541/150‑1 (MQ=255) cTGATATGACAGAGCAGCAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATAAGAAAtt > 2:386809/1‑150 (MQ=255) cTGATATGACAGAGCAGCAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATAAGAAAtt > 1:273017/1‑150 (MQ=255) tGATATGACAGAGCAGCAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATAAGAAAttt > 1:230720/1‑150 (MQ=255) tatatGACAGAGCAGCAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATAAGAAAtttt < 1:650382/149‑1 (MQ=255) gATATGACAGAGCAGCAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATAAGAAAtttt < 1:10369/150‑1 (MQ=255) atatGACAGAGCAGCAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTTATGCA‑AAGAAttttgt < 1:1331320/150‑3 (MQ=255) tatGACAGAGCAGCAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGTATAAGAAATTTTTc > 1:317177/1‑150 (MQ=255) tatGACAGAGCAGCAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATAAGAAAttttta > 2:544986/1‑149 (MQ=255) tGACAGAGCAGCAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATAAGAAATTTTTCtt > 2:712304/1‑150 (MQ=255) tGACAGAGCAGCAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGGTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATAAGAAATTTTTCtt > 2:1107761/1‑150 (MQ=255) gACAGAGCAGCAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATAAGAAATTTTTCTTg < 2:1370843/150‑1 (MQ=255) gACAGAGCAGCAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATAAGAAATTTTTCTTg > 2:101023/1‑150 (MQ=255) cAGAGCAGCAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACATATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGATATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATAAGAAATTTTTCTTGAc > 2:1134595/1‑150 (MQ=255) agagCAGCAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATaa < 2:259998/134‑1 (MQ=255) agagCAGCAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATAAGAAATTTTTCTTGACa > 1:937050/1‑150 (MQ=255) agcaAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGAc > 1:512213/1‑150 (MQ=255) gcaAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACa > 1:1065983/1‑150 (MQ=255) tCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCa < 1:1126936/150‑1 (MQ=255) aTGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATTGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAg < 1:381351/150‑1 (MQ=255) aTGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAg < 1:124055/150‑1 (MQ=255) aCTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATTGTAAAAGATTTGGGTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCAGCCATGAATTTCTGGCGGCAATAATAAAAAATTATT‑TGCATAAGAAATTTTTCTTTACAAAGACATTTAAAGaaatg < 2:843358/150‑3 (MQ=255) aCTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAgg > 1:84053/1‑150 (MQ=255) cTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGa < 2:3066/150‑1 (MQ=255) ttAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGAc < 1:545653/150‑1 (MQ=255) aGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATg > 1:899948/1‑150 (MQ=255) aGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATcc < 2:1267689/150‑1 (MQ=255) tataAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGt > 1:281981/1‑150 (MQ=255) ataAAGCGATGGTAAAAGTTTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAg < 2:141655/148‑1 (MQ=255) ataAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGtt > 1:237109/1‑150 (MQ=255) ataAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGtt > 1:1478914/1‑150 (MQ=255) gCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTaaaaa > 2:1039312/1‑150 (MQ=255) gATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACt > 2:1513973/1‑150 (MQ=255) tGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACtgt > 1:485611/1‑150 (MQ=255) tAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACtgtttg > 2:310801/1‑150 (MQ=255) tAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACtgtttg > 2:610645/1‑150 (MQ=255) tAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACtgtttg > 2:1263650/1‑150 (MQ=255) aGATTTTGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTTCCGCCAGTAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACATTGCAAGAAAGGACATCTAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGtttt < 1:600331/150‑1 (MQ=255) aGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGtttt < 2:528934/150‑1 (MQ=255) aGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGtttt < 1:416693/150‑1 (MQ=255) aGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGtttt > 1:80435/1‑150 (MQ=255) aGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGtttt > 1:919362/1‑150 (MQ=255) tGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAat < 2:62140/150‑1 (MQ=255) ggTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAata > 1:768543/1‑150 (MQ=255) gTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTCTTTTAGAatat > 1:1294068/1‑150 (MQ=255) aaCCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATATTTa < 1:828548/150‑1 (MQ=255) aaCCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGCAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATATTTa > 1:120165/1‑150 (MQ=255) aCCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATATTaaa > 1:197165/1‑150 (MQ=255) aCCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATATTTaa > 1:866357/1‑150 (MQ=255) ccGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATATTTAat > 1:1184400/1‑150 (MQ=255) gCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATATTTAatta > 1:1508862/1‑150 (MQ=255) gCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATATTTAatta < 2:609391/150‑1 (MQ=255) cTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATATTTAattat < 2:880312/150‑1 (MQ=255) tCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATATTTAATTATTTa < 2:382453/150‑1 (MQ=255) aataatAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATATTTAATTATTTAAc > 1:21288/1‑150 (MQ=255) ataataAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATATTTAATTATTTAAct > 2:540407/1‑150 (MQ=255) aaTTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATATTTAATTATTTAACTGCTGaa > 1:882180/1‑150 (MQ=255) aTTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATATTTAATTATTTAACTGCTGAAt > 1:1031948/1‑150 (MQ=255) tataTCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATATTTAATTATTTAACTGCTGAATCt < 2:230720/150‑1 (MQ=255) ttattGCCGCCAGAAATTCCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATATTTAATTATTTAACTGCTGAATCTTc > 1:1469425/5‑150 (MQ=255) tattGCCGCCAGAAATTCCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATATTTAATTATTTAACTGCTGAATCTTcc > 2:464299/4‑150 (MQ=255) atCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGAAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATATTTAATTATTTAACTGGTGAATCTTcc > 2:720543/1‑150 (MQ=255) tCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATATTTAATTATTTAACTGCTGAATCTTCCt > 1:184595/1‑150 (MQ=255) tGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATATTTAATTATTTAACTGCTGAATCTTCCTTg > 1:757377/1‑150 (MQ=255) tGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATATTTAATTATTTAACTGCTGAATCTTCCTTg > 2:851843/1‑150 (MQ=255) tGCCGCCAGAAATTCCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATATTTAATTATTTAACTGCTGAATCTTCCTTg > 1:324147/1‑150 (MQ=255) gccgccAGAAATTCCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGCCAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAAATGTTTGTTTTAGAATATTTAATTATTTAACTGCTGAATCTTCCTTGc > 1:1119590/1‑150 (MQ=255) gccgccAGAAATTCCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATATTTAATTATTTAACTGCTGAATCTTCCTTgg > 1:1363783/1‑149 (MQ=255) gccgccAGAAATTCCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATATTTAATTATTTAACTGCTGAATCTTCCTTGc > 1:747353/1‑150 (MQ=255) gccgccAGAAATTCCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATATTTAATTATTTAACTGCTGAATCTTCCTTGc > 1:262134/1‑150 (MQ=255) gccgccAGAAATTCCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATATTTAATTATTTAACTGCTGAATCTTCCTTGc < 2:754766/150‑1 (MQ=255) ccgccAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTCAAAAACTGTTTGTTTTAGAATATTTAATTATTTAACTGCTGAATCTTCCTTGCg < 2:953975/150‑1 (MQ=255) cgccAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATATTTAATTATTTAACTGCTGAATCTTcc < 2:840369/144‑1 (MQ=255) cgccAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATATTTAATTATTTAACTGCTGAATCTTCCTTGCga > 1:1411512/1‑150 (MQ=255) ggAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATATTTAATTATTTAACTGCTGAATCTTCCTTGCGAGAAat > 1:306135/1‑150 (MQ=255) ggAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATATTTAATTATTTAACTGCTGAATCTTCCTTGCGAGAAat > 1:695572/1‑150 (MQ=255) gAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATATTTAATTATTTAACTGCTGAATCTTCCTTGCGAGAAata > 1:705954/1‑150 (MQ=255) | AAAGTGCTTCCACCATTGCCCGACAAGAATGAAGCCAGTACGACTGATATGACAGAGCAGCAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTT‑TGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATATTTAATTATTTAACTGCTGAATCTTCCTTGCGAGAAATA > NC_000913/237992‑238290 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |