Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 248,868 | C→G | 11.8% | pseudogene (1203/1713 nt) | lfhA ← | flagellar system protein, promoterless fragment |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 248,868 | 0 | C | G | 11.8% | 242.9 / 21.7 | 85 | pseudogene (1203/1713 nt) | lfhA | flagellar system protein, promoterless fragment |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (38/35); new base G (6/4); total (46/39) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.43e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.36e-01 |
CACATCGGCCGCCAGCAGAATATGATCTTTCGTCACCGTGCTACTGGCGACCAGCACGGTGGCGATGGTGACGATATCGCGCAGGGAAACGCCTTCGGTCAGCAGCGCCCGGTACACTTTCAGCAACTGGCTGTAATTGAGCGCCGCGCTCAAATCTTCCGCCAGACGCGGTGCCGTCGACGATAAACGGTTATGCAACTGCGTAATATCATCATAGTTAAACAAATCAGGAATATAGCTGCGCACAATCTTATTTACATGGGTAGCGATCACGCTGGCGCTGTCGATCACCTG > NC_000913/248724‑249017 | cacaTCGGCCGCCAGCAGAATATGATCTTTCGTCACCGTGCTACTGGCGACCAGCACGGTGGCGATGGTGACGATATCGCGCAGGGAAACGCCTTCGGTCAGCAGCGCCCGGTACACTTTCAGCAACTGGCTGTAATTGAGCGCCGCGCt > 2:877771/1‑150 (MQ=255) caTCGGCCGCCAGCAGAATATGATCTTTCGTCACCGTGCTACTGGCGACCAGCACGGTGGCGATGGTGACGATATCGCGCAGGGAAACGCCTTCGGTCAGCAGCGCCCGGTACACTTTCAGCAACTGGCTGTAATTGAGCGCGGCGCTCa > 1:461716/1‑150 (MQ=255) aTCGGCCGCCAGCAGAATATGATCTTTCGTCACCGTGCTACTGGCGACCAGCACGGTGGCGATGGTGACGATATCGCGCAGGGAAACGCCTTCGGTCAGCAGCGCCCGGTACACTTTCAGCAACTGGCTGTAATTGAGCGCCGCGCTCaa > 1:497412/1‑150 (MQ=255) cGGCCGCCAGCAGAATATGATCTTTCGTCACCGTGCTACTGGCGACCAGCACGGTGGCGATGGTGACGATATCGCGCAGGGAAACGCCTTCGGTCAGCAGCGCCCGGTACACTTTCAGCAACTGGCTGTAATTGAGCGCGGCGCTCaatt < 2:461716/150‑3 (MQ=255) cGGCCGCCAGCAGAATATGATCTTTCGTCACCGTGCTACTGGCGACCAGCACGGTGGCGATGGTGACGATATCGCGCAGGGAAACGCCTTCGGTCAGCAGCGCCCGGTACACTTTCAGCAACTGGCTGTAATTGAGCGCGGCGCTCaatt < 2:718906/150‑3 (MQ=255) ccgccAGCAGAATATGATCTTTCGTCACCGTGCTACTGGCGACCAGCACGGTGGCGATGGTGACGATATCGCGCAGGGAAACGCCTTCGGTCAGCAGCGCCCGGTCCACTTTCAGCAACTGGCTGTAATTGAGCGCGGCGCTCaattaca < 1:977745/150‑6 (MQ=255) cagAATATGATCTTTCGTCACCGTGCTACTGGCGACCAGCACGGTGGCGATGGTGACGATATCGCGCAGGGAAACGCCTTCGGTCAGCAGCGCCCGGTACACTTTCAGCAACTGGCTGTAATTGAGCGCAGCGCTCAAATCTTCCGCCAg > 2:1483881/1‑150 (MQ=255) atatGATCTTTCGTCACCGTGCTACTGGCGACCAGCACGGTGGCGATGGTGACGATATCGCGCAGGGAAACGCCTTCGGTCAGCAGCGCCCGGTACACTTTCAGCAACTGGCTGTAATTGAGCGCCGCGCTCAAATCTTCCGCCAGAcgc > 1:1078096/1‑150 (MQ=255) atGATCTTTCGTCACCGTGCTACTGGCGACCAGCACGGTGGCGATGGTGACGATATCGCGCAGGGAAACGCCTTCGGTCAGCAGCGCCCGGTACACTTTCAGCAACTGGCTGTAATTGAGCGCCGCGCTCAAATCTTCCGCCAGACGCgg < 2:686100/150‑1 (MQ=255) atGATCTTTCGTCACCGTGCTACTGGCGACCAGCACGGTGGCGATGGTGACGATATCGCGCAGGGAAACCCCTTCGGTCAGCAGCGCCCGGTACACTTTCAGCAACTGGCTGTAATTGAGCGCCGCGCTCAAATCTTCCGCCAGACGCgg > 2:1269945/1‑150 (MQ=255) tGATCTTTCGTCACCGTGCTACTGGCGACCAGCACGGTGGCGATGGTGACGATATCGCGCAGGGAAACGCCTTCGGTCAGCAGCGCCCGGTACACTTTCAGCAACTGGCTGTAATTGAGCGCCGCGCTCAAATCTTCCGCCAGACGCGGt > 2:1381146/1‑150 (MQ=255) tGATCTTTCGTCACCGTGCTACTGGCGACCAGCACGGTGGCGATGGTGACGATATCGCGCAGGGAAACGCCTTCGGTCAGCAGCGCCCGGTACACTTTCAGCAACTGGCTGTAATTGAGCGCCGCGCTCAAATCTTCCGCCAGACGCGGt > 1:263456/1‑150 (MQ=255) tGATCTTTCGTCACCGTGCTACTGGCGACCAGCACGGTGGCGATGGTGACGATATCGCGCAGGGAAACGCCTTCGGTCAGCAGCGCCCGGTACACTTTCAGCAACTGGCTGTAATTGAGCGCCGCGCTCAAATCTTCCGCCAGACGCGGt > 2:314165/1‑150 (MQ=255) tGATCTTTCGTCACCGTGCTACTGGCGACCAGCACGGTGGCGATGGTGACGATATCGCGCAGGGAAACGCCTTCGGTCAGCAGCGCCCGGTACACTTTCAGCAACTGGCTGTAATTGAGCGCCGCGCTCAAATCTTCCGCCAGACGCGGt < 1:957305/150‑1 (MQ=255) tGATCTTTCGTCACCGTGCTACTGGCGACCAGCACGGTGGCGATGGTGACGATATCGCGCAGGGAAACGCCTTCGGTCAGCAGCGCCCGGTACACTTTCAGCAACTGGCTGTAATTGAGCGCCGCGCTCAAATCTTCCGCCAGACGCGGt > 1:1095711/1‑150 (MQ=255) gATCTTTCGTCACCGTGCTACTGGCGACCAGCACGGTGGCGATGGTGACGATATCGCGCAGGGAAACGCCTTCGGTCAGCAGCGCCCGGTACACTTTCAGCAACTGGCTGTAATTGAGCGCCGCGCTCAAATCTTCCGCCAGACGCGGTg > 2:95110/1‑150 (MQ=255) aTCTTTCGTCACCGTGCTACTGGCGACCAGCACGGTGGCGATGGTGACGATATCGCGCAGGGAAACGCCTTCGGTCAGCAGCGCCCGGTACACTTTCAGCAACTGGCTGTAATTGAGCGCCGCGCTCAAATCTTCCGCCAGACGCGGTGc < 2:397714/150‑1 (MQ=255) aTCTTTCGTCACCGTGCTACTGGCGACCAGCACGGTGGCGATGGTGACGATATCGCGCAGGGAAACGCCTTCGGTCAGCAGCGCCCGGTACACGTTCAGCAACTGGCTGTAATTGAGCGCCGCGCTCAAATCTTCCGCCAGACGCGGTGc > 2:631083/1‑150 (MQ=255) cTTTCGTCACCGTGCTACTGGCGACCAGCACGGTGGCGATGGTGACGATATCGCGCAGGGAAACGCCTTCGGTCAGCAGCGCCCGGTACACTTTCAGCAACTGGCTGTAATTGAGCGCCGCGCTCAAATCTTCCGCCAGACGCGGTGCCg < 2:1078096/150‑1 (MQ=255) cTTTCGTCACCGTGCTACTGGCGACCAGCACGGTGGCGATGGTGACGATATCGCGCAGGGAAACGCCTTCGGTCAGCAGCGCCCGGTACACTTTCAGCAACTGGCTGTAATTGAGCGCCGCGCTCAAATCTTCCGCCAGACGCGGTGCCg < 2:1120879/150‑1 (MQ=255) cTTTCGTCACCGTGCTACTGGCGACCAGCACGGTGGCGATGGTGACGATATCGCGCAGGGAAACGCCTTCGGTCAGCAGCGCCCGGTACACTTTCAGCAACTGGCTGTAATTGAGCGCCGCGCTCAAATCTTCCGCCAGACGCGGTGCCg < 2:1115492/150‑1 (MQ=255) catCGCCACCGTGCTGGTCGCCAGTAGCACGGTGACGATGGTGACGATATCGCGCAGGGAAACGCCTTCGGTCAGCAGCGCCCGGTACACTTTCAGCAACTGGCTGTAATTGAGCGCCGCGCTCAAATCTTCCGCCAGACGCGGTGCCGt > 1:1007595/3‑150 (MQ=38) ttCGTCACCGTGCTACTGGCGACCAGCACGGTGGCGATGGTGACGATATCGCGCAGGGAAACGCCTTCGGTCAGCAGCGCCCGGTACACTTTCAGCAACTGGCTGTAATTGAGCGCCGCGCTCAAATCTTCCGCCAGACGCGGTGCCGTc < 1:415420/150‑1 (MQ=255) cGTCACCGTGCTACTGGCGACCAGCACGGTGGCGATGGTGACGATATCGCGCAGGGAAACGACTTCGGTCAGCAGCGCCCGGTACACTTTCAGCAACTGGCTGTAATTGAGCGCCGCGCTCAAATCTTCCGCCAGACGCGGTGCCGTcga > 2:1373977/1‑150 (MQ=255) gTCACCGTGCTACTGGCGACCAGCACGGTGGCGATGGTGACGATATCGCGCAGGGAAACGCCTTCGGTCAGCAGCGCCCGGTACACTTTCAGCAACTGGCTGTAATTGAGCGCCGCGCTCAAATCTTCCGCCAGACGCGGTGCCGTcgac > 1:983156/1‑150 (MQ=255) gTCACCGTGCTACTGGCGACCAGCACGGTGGCGATGGTGACGATATCGCGCAGGGAAACGCCTTCGGTCAGCAGCGCCCGGTACACTTTCAGCAACTGGCTGTAATTGAGCGCCGCGCTCAAATCTTCCGCCAGACGCGGTGCCGTcgac < 1:23529/150‑1 (MQ=255) ccGTGCTACTGGCGACCAGCACGGTGGCGATGGTGACGATATCGCGCCGGGAAACGCCTTCGGTCAGCAGCGCCCGGTACACTTTCAGCAACTGGCTGTAATTGAGCGCCGCGCTCAAATCTTCCGCCAGACGCGGTGCCGTCGACGATa > 2:1151767/1‑150 (MQ=255) cGTGCTACTGGCGACCAGCACGGTGGCGATGGTGACGATATCGCGCAGGGAAACGCCTTCGGTCAGCAGCGCCCGGTACACTTTCAGCAACTGGCTGTAATTGAGCGCCGCGCTCAAATCTTCCGCCAGACGCGGTGCCGTCGACGATaa < 1:435942/150‑1 (MQ=255) cTACTGGCGACCAGCACGGTGGCGATGGTGACGATATCGCGCAGGGAAACGCCTTCGGTCAGCAGCGCCCGGTACACTTTCAGCAACTGGCTGTAATTGAGCGCCGCGCTCAAATCTTCCGCCAGACGCGGTGCCGTCGACGATAAACgg > 1:568390/1‑150 (MQ=255) tACTGGCGACCAGCACGGTGGCGATGGTGACGATATCGCGAAGGGAAACGCCTTCGGTCAGCAGCGCCCGTTACACTTTCAGCAACTGGCTGTAATTGAGCGCCGCGCTCAAATCTTCCGCCAGACGCGGTGCCGTCGACGATAAACGGt < 1:1354273/150‑1 (MQ=255) aCTGGCGACCAGCACGGTGGCGATGGTGACGATATCGCGCAGGGAAACGCCTTCGGTCAGCAGCGCCCGGTACACTTTCAGCAACTGGCTGTAATTGAGCGCCGCGCTCAAATCTTCCGCCAGACGCGGTGCCGTCGACGATAAACGGtt < 2:478273/150‑1 (MQ=255) gCACGGTGGCGATGGTGACGATATCGCGCAGGGAAACGCCTTCGGTCAGCAGCGCCCGGTACACTTTCAGCAACTGGCTGTAATTGAGCGCCGCGCTCAAATCTTCCGCCAGACGCGGTGCCGTCGACGATAAACGGTTATGCAACTGCg > 1:127988/1‑150 (MQ=255) gCACGGTGGCGATGGTGACGATATCGCGCAGGGAAACGCCTTCGGTCAGCAGCGCCCGGTACACTTTCAGCAACTGGCTGTAATTGAGCGCAGCGCTCAAATCTTCCGCCAGACGCGGTGCCGTCGACGATAAACGGTTATGCAACTGCg > 2:1487113/1‑150 (MQ=255) aCGGTGGCGATGGTGACGATATCGCGCAGGGAAACGCCTTCGGTCAGCAGCGCCCGGTACACTTTCAGCAACTGGCTGTAATTGAGCGCCGCGCTCAAATCTTCCGCCAGACGCGGTGCCGTCGACGATAAACGGTTATGCAACTGCGTa < 2:418278/150‑1 (MQ=255) ggTGGCGATGGTGACGATATCGCGCAGGGAAACGCCTTCGGTCAGCAGCGCCCGGTACACTTTCAGCAACTGGCTGTAATTGAGCGCCGCGCTCAAATCTTCCGCCAGACGCGGTGCCGTCGACGAAAAACGGTTATGCAACTGCGTAat < 2:972287/150‑1 (MQ=255) tGGCGATGGTGACGATATCGCGCAGGGAAACGCCTTCGGTCAGCAGCGCCCGGTACACTTTCAGCAACTGGCTGTAATTGAGCGCCGCGCTCAAATCTTCCGCCAGACGCGGTGCCGTCGACGATAAACGGTTATGCAACTGCGTAatat < 2:788961/150‑1 (MQ=255) gATGGTGACGATATCGCGCAGGGAAACGCCTTCGGTCAGCAGCGCCCGGTACACTTTCAGCAACTGGCTGTAATTGAGCGCCGCGCTCAAATCTTCCGCCAGACGCGGTGCCGTCGACGATAAACGGTTATGCAACTGCGTAATatcatc < 1:298464/150‑1 (MQ=255) tGGTGACGATATCGCGCAGGGAAACGCCTTCGGTCAGCAGCGCCCGGTACACTTTCAGCAACTGGCTGTAATTGAGCGCCGCGCTCAAATCTTCCGCCAGACGCGGTGCCGTCGACGATAAACGGTTATGCAACTGCGTAATATcatcat < 1:1483881/150‑1 (MQ=255) ggTGACGATATCGCGCAGGGAAACGCCTTCGGTCAGCAGCGCCCGGTACACTTTCAGCAACTGGCTGTAATTGAGCGCCGCGCTCAAATCTTCCGCCAGACGCGGTGCCGTCGACGATAAACGGTTATGCAACTGCGTAATATCATCATa > 1:848302/1‑150 (MQ=255) tGACGATATCGCGCAGGGAAACGCCTTCGGTCAGCAGCGCCCGGTACACTTTCAGCAACTGGCTGTAATTGAGCGCCGCGCTCAAATCTTCCGCCAGACGCGGTGCCGTCGACGATAAACGGTTATGCAACTGCGTAATATCATCATAGt > 2:804956/1‑150 (MQ=255) tGACGATATCGCGCAGGGAAACGCCTTCGGTCAGCAGCGCCCGGTACACTTTCAGCAACTGGCTGTAATTGAGCGCCGCGCTCAAATCTTCCGCCAGACGCGGTGCCGTCGACGATAAACGGTTATGCAACTGCGTAATATCATCATAGt > 1:11896/1‑150 (MQ=255) aCGATATCGCGCAGGGAAACGCCTTCGGTCAGCAGCGCCCGGTACACTTTCAGCAACTGGCTGTAATTGAGCGCCGCGCTCAAATCTTCCGCCAGGCGCGGTGCCGTCGACGATAAACGGTTATGCAACTGCGTAATATCATCATAGTTa > 1:1020843/1‑150 (MQ=255) cGATATCGCGCAGGGAAACGCCTTCGGTCAGCAGCGCCCGGTACACTTTCAGCAACTGGCTGTAATTGAGCGCCGCGCTCAAATCTTCCGCCAGACGCGGTGCCGTCGACGATAAACGGTTATGCAACTGCGTAATATCATCATAGTTaa < 1:877771/150‑1 (MQ=255) cGATATCGCGCAGGGAAACGCCTTCGGTCAGCAGCGCCCGGTACACTTTCAGCAACTGGCTGTAATTGAGCGCCGCGCTCAAATCTTCCGCCAGACGCGGTGCCGTCGACGATAAACGGTTATGCAACTGCGTAATATCATCATAGTTaa < 1:744388/150‑1 (MQ=255) atatCGCGCAGGGAAACGCCTTCGGTCAGCAGCGCCCGGTACACTTTCAGCAACTGGCTGTAATTGAGCGCCGCGCTCAAATCTTCCGCCAGACGCGGTGCCGTCGACGATAAACGGTTATGCAACTGCGTAATATCATCATAGTTAAAc < 2:160412/150‑1 (MQ=255) cgcgCAGGGAAACGCCTTCGGTCAGCAGCGCCCGGTACACTTTCAGCAACTGGCTGTAATTGAGCGCCGCGCTCAAATCTTCCGCCAGACGCGGTGCCGTCGACGATAAACGGTTATGCAACTGCGTAATATCATCATAGTTAAACAAAt > 2:870679/1‑150 (MQ=255) cgcgCAGGGAAACGCCTTCGGTCAGCAGCGCCCGGTACACTTTCAGCAACTGGCTGTAATTGAGCGCCGCGCTCAAATCTTCCGCCAGACGCGGTGCCGTCGACGATAAACGGTTATGCAACTGCGTAATATCATCATAGTTAAACAAAt > 2:1418978/1‑150 (MQ=255) ggAAACGCCTTCGGTCAGCAGCGCCCGGTACACTTTCAGCAACTGGCTGTAATTGAGCGCCGCGCTCAAATCTTCCGCCAGACGCGGTGCCGTCGACGATAAACGGTTATGCAACTGCGTAATATCATCATAGTTAAACAAATCAGGAat > 2:510778/1‑150 (MQ=255) ggAAACGCCTTCGGTCAGCAGCGCCCGGTACACTTTCAGCAACTGGCTGTAATTGAGCGCCGCGCTCAAATCTTCCGCCAGACGCGGTGCCGTCGACGATAAACGGTTATGCAACTGCGTAATATCATCATAGTTAAACAAATCAGGAat < 2:378740/150‑1 (MQ=255) gAAACGCCTTCGGTCAGCAGCGCCCGGTACACTTTCAGCAACTGGCTGTAATTGAGCGCCGCGCTCAAATCTTCCGCCAGACGCGGTGCCGTCGACGATAAACGGTTATGCAACTGCGTAATATCATCATAGTTAAACAAATCAGGAata > 2:528449/1‑150 (MQ=255) cGCCTTCGGTCAGCAGCGCCCGGTACACCTTCAGCAACTGGCTGTAATTGAGCGCCGCGCTCAAATCTTCCGCCAGACGCGGTGCCGTCGACGATAAACGGTTATGCAACTGCGTAATATCATCATAGTTAAACAAATCAGGAATATAGc > 2:1271455/1‑150 (MQ=255) ccTTCGGTCAGCAGCGCCCGGTACACTTTCAGCAACTGGCTGTAATTGAGCGCCGCGCTCAAATCTTCCGCCAGACGCGGTGCCGTCGACGATAAACGGTTATGCAACTGCGTAATATCATCATAGTTAAACAAATCAGGAATATAGCTg > 2:508990/1‑150 (MQ=255) ttCGGTCAGCAGCGCCCGGTACACTTTCAGCAACTGGCTGTAATTGAGCGCCGCGCTCAAATCTTCCGCCAGACGCGGTGCCGTCGACGATAAACGGTTATGCAACTGCGTAATATCATCATAGTTAAACAAATCAGGAATATAGCTgcg < 1:1202428/150‑1 (MQ=255) 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cgcCCGGTACACTTTCAGCAACTGGCTGTAATTGAGCGCCGCGCTCAAATCTTCCGCCAGACGCGGTGCCGTCGACGATAAACGGTTATGCAACTGCGTAATATCATCATAGTTAAACAAATCAGGAATATAGCTGCGCACAATCTTAtt < 1:528449/150‑1 (MQ=255) cgcCCGCTACACTTTCAGCAACTGGCTGTAATTGAGCGCCGGGCTCAAATCTTCCGCCAGACGCGGTGCCGTCGACGATAAACGGTTATGCAACTGCGTAATATCATCAAAGTTAAACAAATCAGGAATATAGCTGCGCAGAATCtgagt > 2:680914/1‑146 (MQ=255) gcCCGGTACACTTTCAGCAACTGGCTGTAATTGAGCGCCGCGCTCAAATCTTCCGCCAGGCGCGGTGCCGTCGACGATAAACGGTTATGCAACTGCGTAATATCATCATAGTTAAACAAATCAGGAATATAGCTGCGCACAATCTTAttt < 2:1020843/150‑1 (MQ=255) gcCCGGTACACTTTCAGCAACTGGCTGTAATTGAGCGCCGCGCTCAAATCTTCCGCCAGACGCGGTGCCGTCGACGATAAACGGTTATGCAACTGCGTAATATCATCATAGTTAAACAAATCAGGAATATAGCTGCGCACAATCTTAttt < 1:1093579/150‑1 (MQ=255) cccGGTACACTTTCAGCAACTGGCTGTAATTGAGCGCCGCGCTCAAATCTTCCGCCAGACGCGGTGCCGTCGACGATAAACGGTTATGCAACTGCGTAATATCATCATAGTTAAACAAATCAGGAATATAGCTGCGCACAATCTTATTTa > 2:1215661/1‑150 (MQ=255) cccGGTACACTTTCAGCAACTGGCTGTAATTGAGCGCCGCGCTCAAATCTTCCGCCAGACGCGGTGCCGTCGACGATAAACGGTTATGCAACTGCGTAATATCATCATAGTTAAACAAATCAGGAATATAGCTGCGCACAATCTTATTTa < 2:127988/150‑1 (MQ=255) gTACACTTTCAGCAACTGGCTGTAATTGAGCGCCGCGCTCAAATCTTCCGCCAGACGCGGTGCCGTCTACGATAAACGGTTATGCAACTGCGTAATATCATCATAGTTAAACAAATCAGGAATATAGCTGCGCACAATCTTATTTACATg < 1:1151767/150‑1 (MQ=255) cacTTTCAGCAACTGGCTGTAATTGAGCGCCGCGCTCAAATCTTCCGCCAGACGCGGTGCCGTCGACGATAAACGGTTATGCAACTGCGTAATATCATCATAGTTAAACAAATCAGGAATATAGCTGCGCACAATCTTATTTACATGGGt > 2:998569/1‑150 (MQ=255) cacTTTCAGCAACTGGCTGTAATTGAGCGCCGCGCTCAAATCTTCCGCCAGACGCGGTGCCGTCGACGATAAACGGTTATGCAACTGCGTAATATCATCATAGTTAAACAAATCAGGAATATAGCTGCGCACAATCTTATTTACATGGGt < 2:760348/150‑1 (MQ=255) cTTTCAGCAACTGGCTGTAATTGAGCGCCGCGCTCAAATCTTCCGCCAGACGCGGTGCCGTCGACGATAAACGGTTATGCAACTGCGTAATATCATCATAGTTAAACAAATCAGGAATATAGCTGCGCACAATCTTATTTACATGGGTAg > 1:420168/1‑150 (MQ=255) 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atttGAGCGCGGCGCTCAAATCTTCCGCCAGACGCGGTGCCGTCGACGATAAACGGTTATGCAACTGCGTAATATCATCATAGTTAAACAAATCAGGAATATAGCTGCGCACAATCTTATTTACATGGGTAGCGATCACGCTGGCGCTGt < 2:1283774/148‑1 (MQ=255) atttGAGCGCGGCGCTCAAATCTTCCGCCAGACGCGGTGCCGTCGACGATAAACGGTTATGCAACTGCGTAATATCATCATAGTTAAACAAATCAGGAATATAGCTGCGCACAATCTTATTTACATGGGTAGCGATCACGCTGGCGCTGt > 1:807109/3‑150 (MQ=255) atttGAGCGCGGCGCTCAAATCTTCCGCCAGACGCGGTGCCGTCGACGATAAACGGTTATGCAACTGCGTAATATCATCATAGTTAAACAAATCAGGAATATAGCTGCGCACAATCTTATTTACATGGGTAGCGATCACGCTGGCGCTGt > 2:573768/3‑150 (MQ=255) tGAGCGCGGCGCTCAAATCTTCCGCCAGACGCGGTGCCGTCGACGATAAACGGTTATGCAACTGCGTAATATCATCATAGTTAAACAAATCAGGAATATAGCTGCGCACAATCTTATTTACATGGGTAGCGATCACGCTGGCGCTGTCGa > 1:1523239/1‑150 (MQ=255) gAGCGCCGCGCTCAAATCTTCCGCCAGACGCGGTGCCGTCGACGATAAACGGTTATGCAACTGCGTAATATCATCATAGTTAAACAAATCAGGAATATAGCTGCGCACAATCTTATTTACATGGGTAGCGATCACGCTGGCGCTGTCGAt > 1:846866/1‑150 (MQ=255) aGCGCCGCGCTCAAATCTTCCGCCAGACGCGGTGCCGTCGACGATAAACGGTTATGCAACTGCGTAATATCATCATAGTTAAACAAATCAGGAATATAGCTGCGCACAATCTTATTTACATGGGTAGCGATCACGCTGGCGCTGTCGATc < 2:1368883/150‑1 (MQ=255) gcgcCGCGCTCAAATCTTCCGCCAGACGCGGTGCCGTCGACGATAAACGGTTATGCAACTGCGTAATATCATCATAGTTAAACAAATCAGGAATATAGCTGCGCACAATCTTATTTACATGGGTAGCGATCACGCTGGCGCTGTCGATCa > 2:1512592/1‑150 (MQ=255) ccgcGCTCAAATCTTCCGCCAGACGCGGTGCCGTCGACGATAAACGGTTATGCAACTGCGTAATATCATCATAGTTAAACAAATCAGGAATATAGCTGCGCACAATCTTATTTACATGGGTAGCGATCACGCTGGCGCTGTCGATCACCt > 2:905946/1‑150 (MQ=255) cgcgCTCAAATCTTCCGCCAGACGCGGTGCCGTCGACGATAAACGGTTATGCAACTGCGTAATATCATCATAGTTAAACAAATCAGGAATATAGCTGCGCACAATCTTATTTACATGGGTAGCGATCACGCTGGCGCTGTCGATCACCTg > 1:1174488/1‑150 (MQ=255) | CACATCGGCCGCCAGCAGAATATGATCTTTCGTCACCGTGCTACTGGCGACCAGCACGGTGGCGATGGTGACGATATCGCGCAGGGAAACGCCTTCGGTCAGCAGCGCCCGGTACACTTTCAGCAACTGGCTGTAATTGAGCGCCGCGCTCAAATCTTCCGCCAGACGCGGTGCCGTCGACGATAAACGGTTATGCAACTGCGTAATATCATCATAGTTAAACAAATCAGGAATATAGCTGCGCACAATCTTATTTACATGGGTAGCGATCACGCTGGCGCTGTCGATCACCTG > NC_000913/248724‑249017 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |