Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,320,875 | T→A | 5.3% | I278N (ATT→AAT) | atoS → | sensory histidine kinase AtoS |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,320,875 | 0 | T | A | 5.3% | 241.3 / 3.1 | 75 | I278N (ATT→AAT) | atoS | sensory histidine kinase AtoS |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (34/37); new base A (2/2); total (36/39) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.61e-01 |
ACAAAATATTCCCACTCGATTACCACAATTGCCCGGTGAAATGGGGCAAATCAGTCAGAGTGTTAATAACCTCGCCCAGGCACTGCGTGAAACGCGGACACTTAACGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGC‑GTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGTAACCACCATGAACCCAGCAGCAGAAGTTATCACTGGCTATCAACGCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGACAATACTCAGTTCTACAGTCCAGTACTGGATACGCTGGAACATG > NC_000913/2320729‑2321021 | acaAAATATTCCCACTCGATTACCACAATTGCCCGGTGAAATGGGGCAAATCAGTCAGAGTGTTAATAACCTCGCCCAGGCACTGCGTGAAACGCGGACACTTAACGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGC‑GTCATTGCCATTGa < 2:1152558/150‑1 (MQ=255) caAAATATTCCCCCTCGATTACCACAATTGCCCGGGGAAATGGGGCAAATCAGTCAGAGTGTTAATAACCTCGCCCAGGCACTGCGTGAAACGCGGACACTTAACGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGC‑GTCATTGCCATTGAc < 1:1022690/150‑1 (MQ=255) aaaTATTCCCACTCGATTACCACAATTGCCCGGTGAAATGGGGCAAATCAGTCAGAGTGTTAATAACCTCGCCCAGGCACTGCGTGAAACGCGGACACTTAACGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGC‑GTCATTGCCATTGACCg < 1:926268/150‑1 (MQ=255) tatTCCCACTCGATTACCACAATTGCCCGGTGAAATGGGGCAAATCAGTCAGAGTGTTAATAACCTCGCCCAGGCACTGCGTGAAACGCGGACACTTAACGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGCGGTCAATGGCAATGAcgcca < 1:114176/150‑5 (MQ=255) atTCCCACTCGATTACCACAATTGCCCGGTGAAATGGGGCAAATCAGTCAGAGTGTTAATAACCTCGCCCAGGCACTGCGTGAAACGCGGACACTTAACGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGC‑GTCATTGCCATTGACCGCCAg < 1:1374079/150‑1 (MQ=255) ttCCCACTCGATTACCACAATTGCCCGGTGAAATGGGGCAAATCAGTCAGAGTGTTAATAACCTCGCCCAGGCACTGCGTGAAACGCGGACACTTAAAGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGC‑GTCATTGCCATTGACCGCCAgg > 1:1176946/1‑150 (MQ=255) tCCCACTCGATTACCACAATTGCCCGGTGAAATGGGGCAAATCAGTCAGAGTGTTAATAACCTCGCCCAGGCACTGCGTGAAACGCGGACACTTAACGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGCGGTCAATGGCAATGAcgccatcg < 2:23120/150‑8 (MQ=255) tCCCACTCGATTACCACAATTGCCCGGTGAAATGGGGCAAATCAGTCAGAGTGTTAATAACCTCGCCCAGGCACTGCGTGAAACGCGGACACTTAACGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGC‑GTCATTGCCATTGACCGCCAggg > 2:1466779/1‑150 (MQ=255) tCCCACTCGATTACCACAATTGCCCGGTGAAATGGGGCAAATCAGTCAGAGTGTTAATAACCTCGCCCAGGCACTGCGTGAAACGCGGACACTTAACGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGC‑GTCATTGCCATTGACCGCCAggg > 2:401779/1‑150 (MQ=255) ccACTCGATTACCACAATTTCCCTGTTAAATTTGTAAAATCATTCATAGTTTTAATATCCTCGCCCAGGGACTTCGTGAAACGCGTACACTTAACGATCTTATTATTTAAAACGCTTAAGATGGC‑GTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTg < 2:173580/150‑1 (MQ=255) ccACTCGATTACCACAATTGCCCGGTGAAATGGGGCAAATCAGTCAGAGTGTTAATAACCTCGCCCAGGCACTGCGTGAAACGCGGACACTTAACGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGTC‑GTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTg < 2:1123479/150‑1 (MQ=255) cACTCGATTACCACAATTGCCCGGTGAAATGGGGCAAATCAGTCAGAGTGTTAATAACCTCGCCCAGGCACTGCGTGAAACGCGGACACTTAACGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGC‑GTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGa > 2:1267843/1‑150 (MQ=255) tCGATTACCACAATTGCCCGGTGAAATGGGGCAAATCAGTCAGAGTGTTAATAACCTCGCCCAGGCACTGCGTGAAACGCGGACACTTAACGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGC‑GTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGt < 1:913427/150‑1 (MQ=255) tCGATTACCACAATTGCCCGGTGAAATGGGGCAAATCAGTCAGAGTGTTAATAACCTCGCCCAGGCACTGCGTGAAACGCGGACACTTAACGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGC‑GTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGt < 1:719458/150‑1 (MQ=255) ccACAATTGCCCGGTGAAATGGGGCAAATCAGTCAGAGTGTTAATAACCTCGCCCAGGCACTGCGTGAAACGCGGACACTTAACGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGC‑GTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGTAaccacc > 2:1142592/1‑150 (MQ=255) ccACAATTGCCCGGTGAAATGGGGCAAATCAGTCAGAGTGTTAATAACCTCGCCCAGGCACTGCGTGAAACGCGGACACTTAACGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGC‑GTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGTAaccacc > 1:258869/1‑150 (MQ=255) cacaATTGCCCGGTGAAATGGGGCAAATCAGTCAGAGTGTTAATAACCTCGCCCAGGCACTGCGTGAAACGCGGACACTTAACGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGC‑GTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGTAAccacca > 2:1090984/1‑150 (MQ=255) acaATTGCCCGGTGAAATGGGGCAAATCAGTCAGAGTGTTAATAACCTCGCCCAGGCACTGCGTGAAACGCGGACACTTAACGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGC‑GTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGTAACCACCAt < 1:851866/150‑1 (MQ=255) 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gCCCGGTGAAATGGGGCAAATCAGTCAGAGTGTTAATAACCTCGCCCAGGCACTGCGTGAAACGCGGACACTTAACGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGC‑GTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGTAaccacc > 1:545502/1‑142 (MQ=255) gCCCGGTGAAATGGGGCAAATCAGTCAGAGTGTTAATAACCTCGCCCAGGCACTGCGTGAAACGCGGACACTTAACGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGC‑GTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGTAACCACCATGAAccc < 1:326784/150‑1 (MQ=255) ggggCAAATCAGTCAGAGTGTTAATAACCTCGCCCAGGCACTGCGTGAAACGCGGACACTTAACGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGC‑GTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGTAACCACCATGAACCCAGCAGCAGAAGt > 1:505128/1‑150 (MQ=255) gggCAAATCAGTCAGAGTGTTAATAACCTCGCCCAGGCACTGCGTGAAACGCGGACACTTAACGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGC‑GTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGTAACCACCATGAACCCAGCAGCAGAAGtt < 1:1359802/150‑1 (MQ=255) ggCAAATCAGTCAGAGTGTTAATAACCTCGCCCAGGCACTGCGTGAAACGCGGACACTTAACGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGC‑GTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGTAACCACCATGAACCCAGCAGCAGAAGTTa < 1:369904/150‑1 (MQ=255) ggCAAATCAGTCAGAGTGTTAATAACCTCGCACAGGCACTGCGTGAAACGAGGACACTTAACGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGA‑GTCAATGCCATTGCCCGCCAGGGTGATGTAACAACCATGAACCCAGCATCAGAACTTa > 1:509811/1‑150 (MQ=255) aaTCAGTCAGAGTGTTAATAACCTCGCCCAGGCACTGCGTGAAACGCGGACACTTAACGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGC‑GTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGTAACCACCATGAACCCAGCAGCAGAAGTTATCAc < 2:517658/150‑1 (MQ=255) tgtTAATAACCTCGCCCAGGCACTGCGTGAAACGCGGACACTTAACGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGC‑GTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGTAACCACCATGAACCCAGCAGCAGAAGTTATCACTGGCTATCAACg < 1:275529/150‑1 (MQ=255) gataataaCCTCGCCCAGGCACTGCGTGAAACGCGGACACTTAACGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGC‑GTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGTAACCACCATGAACCCAGCAGCAGAAGTTATCACTGGCTATCAACGc > 1:1121070/3‑150 (MQ=255) taataaCCTCGCCCAGGCACTGCGTGAAACGCGGACACTTAACGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGC‑GTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGTAACCACCATGAACCCAGCAGCAGAAGTTATCACTGGCTATCAACGCCa > 2:689373/1‑150 (MQ=255) aataaCCTCGCCCAGGCACTGCGTGAAACGCGGACACTTAACGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGC‑GTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGTAACCACCATGAACCCAGCAGCAGAAGTTATCACTGGCTATCAACg < 2:1058529/146‑1 (MQ=255) aataaCCTCGCCCAGGCACTGCGTGAAACGCGGACACTTAACGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGC‑GTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGTAACCACCATGAACCCAGCAGCAGAAGTTATCACTGGCTATCAACg > 1:1058529/1‑146 (MQ=255) aataaCCTCGCCCAGGCACTGCGTGAAACGCGGACACTTAACGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGC‑GTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGTAACCACCATGAACCCAGCAGCAGAAGTTATCACTGGCTATCAACGCCAt < 1:794030/150‑1 (MQ=255) aataaCCTCGCCCAGGCACTGCGTGAAACGCGGACACTTAACGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGC‑GTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGTAACCACCATGAACCCAGCAGCAGAAGTTATCACTGGCTATCAACGCCAt > 2:803651/1‑150 (MQ=255) ataaCCTCGCCCAGGCACTGCGTGAAACGCGGACACTTAACGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGC‑GTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGTAACCACCATGAACCCAGCAGCAGAAGTTATCACTGGCTATCAACGCCATg > 2:1204542/1‑150 (MQ=255) taaCCTCGCCCAGGCACTGCGTGAAACGCGGACACTTAACGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGC‑GTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGTAACCACCATGAACCCAGCAGCAGAAGTTATCACTGGCTATCAACGCCATGa > 2:1019482/1‑150 (MQ=255) aCCTCGCCCAGGCACTGCGTGAAACGCGGACACTTAACGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGC‑GTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGTAACCACCATGAACCCAGCAGCAGAAGTTATCACTGGCTATCAACGCCATGAAc < 2:548592/150‑1 (MQ=255) aCCTCGCCCAGGCACTGCGTGAAACGCGGACACTTAACGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGC‑GTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGTAACCACCATGAACCCAGCAGCAGAAGTTATCACTGGCTATCAACGCCATGAAc > 1:1074902/1‑150 (MQ=255) gCCCAGGCACTGCGTGAAACGCGGACACTTAACGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATTGC‑GTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGTAACCACCATGAACCCAGCAGCAGAAGTTATCACTGGCTATCAACGCCATGAACTGGTa < 1:1028206/150‑1 (MQ=255) aCTGCGTGAAACGCGGACACTTAACGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGC‑GTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGTAACCACCATGAACCCAGCAGCAGAAGTTATCACTGGCTATCAACGCCATGAACTGGTAGGGCAGcc > 1:1046139/1‑150 (MQ=255) aCTGCGTGAAACGCGGACACTTAACGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGC‑GTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGTAACCACCATGAACCCAGCAGCAGAAGTTATCACTGGCTATCAACGCCATGAACTGGTAGGGCAGcc > 1:464699/1‑150 (MQ=255) aCTGCGTGAAACGCGGACACTTAACGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGC‑GTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGTAACCACCATGAACCCAGCAGCAGAAGTTATCACTGGCTATCAACGCCATGAACTGGTAGGGCAGcc < 1:306898/150‑1 (MQ=255) cTGCGTGAAACGCGGACACTTAACGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGC‑GTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGTAACCACCATGAACCCAGCAGCAGAAGTTATCACTGGCTATCAACGCCATGAACTGGTAGGGCAGCCt > 1:507280/1‑150 (MQ=255) aaaCGCGGACACTTAACGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGC‑GTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGTAACCACCATGAACCCAGCAGCAGAAGTTATCACTGGCTATCAACGCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCa > 1:1502077/1‑150 (MQ=255) aCGCGGACACTTAACGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGC‑GTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGTAACCACCATGAACCCAGCAGCAGAAGTTATCACTGGCTATCAACGCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCAtg < 1:1466779/150‑1 (MQ=255) aCGCGGACACTTAACGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGC‑GTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGTAACCACCATGAACCCAGCAGCAGAAGTTATCACTGGCTATCAACGCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCAtg < 2:1095528/150‑1 (MQ=255) aCGCGGACACTTAACGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGC‑GTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGTAACCACCATGAACCCAGCAGCAGAAGTTATCACTGGCTATCAACGCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCAtg < 2:1100909/150‑1 (MQ=255) cacTTAACGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGC‑GTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGTAACCACCATGAACCCAGCAGCAGAAGTTATCACTGGCTATCAACGCCATGAACTGGTAGGGCAGCCtt > 1:664782/1‑135 (MQ=255) cacTTAACGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGC‑GTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGTAACCACCATGAACCCAGCAGCAGAAGTTATCACTGGCTATCAACGCCATGAACTGGTAGGGCAGCCtt < 2:664782/135‑1 (MQ=255) cacTTAACGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGC‑GTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGTAACCACCATGAACCCAGCAGCAGAAGTTATCACTGGCTATCAACGCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCg < 1:1173701/150‑1 (MQ=255) cTTAACGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGC‑GTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGTAACCACCATGAACCCAGCAGCAGAAGTTATCACTGGCTATCAACGCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGAc > 1:618335/1‑150 (MQ=255) cTTAACGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGC‑GTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGTAACCACCATGAACCCAGCAGCAGAAGTTATCACTGGCTATCAACGCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGAc > 1:1446323/1‑150 (MQ=255) cTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGC‑GTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGTAACCACCATGAACCCAGCAGCAGAAGTTATCACTGGCTATCAACGCCTTGAAGTGTTAGGGCAGCCTTACTCCTTGTTGTTCGACAATACTCAg < 2:1121070/150‑1 (MQ=255) tGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGC‑GTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGTAACCACCATGAACCCAGCAGCAGAAGTTATCACTGGCTATCAACGCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGACAATACTCAGt > 1:991901/1‑150 (MQ=255) attattGAAAACGCTGCCGATGGC‑GTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGTAACCACCATGAACCCAGCAGCAGAAGTTATCACTGGCTATCAACGCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGACAATACTCAGTTc < 1:490480/150‑1 (MQ=255) ttGAAAACGCTGCCGATGGC‑GTCATTGCCATAGCCCGCCAGGGAGATGTAACCACCATGAACCCAGCAGCAGAAGTAATCACTGGCTATCAACGCCATGAACAGGTAGGGCAGCCTTACTCCATCAAGTTCGACAAAACTCACTTCTACa > 2:123736/1‑150 (MQ=255) tGAAAACGCTGCCGATGGC‑GTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGTAACCACCATGAACCCAGCAGCAGAAGTTATCACTGGCTATCAACGCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGACAATACTCAGTTCTACAg > 2:1293482/1‑150 (MQ=255) tGAAAACGCTGCCGATGGC‑GTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGTAACCACCATGAACCCAGCAGCAGAAGTTATCACTGGCTATCAACGCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGACAATACTCAGTTCTACAg > 2:109280/1‑150 (MQ=255) tGAAAACGCTGCAGATGTC‑GTCATTGCCATTGACCGCAAGGGTGATGTAACCACCATGAACCCAGCAGCAGAAGTTATCACTGGCTATCAACGCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGACAATACTCAGTTCTACAg > 2:24115/1‑150 (MQ=255) aaaCGCTGCCGATGGC‑GTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGTAACCACCATGAACCCAGCAGCAGAAGTTATCACTGGCTATCAACGCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGACAATACTCAGTTCTACAGTcc < 1:1090984/150‑1 (MQ=255) cTGCCGATGGC‑GTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGTAACCACCATGAACCCAGCAGCAGAAGTTATCACTGGCTATCAACGCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGACAATACTCAGTTCTACAGTCCAGTAc < 1:578818/150‑1 (MQ=255) cTGCCGATGGC‑GTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGTAACCACCATGAACCCAGCACCAGAAGTTATCACTGGCTATCAACGCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGACAATACTCAGTTCTACAGTCCAGTAc < 1:1142592/150‑1 (MQ=255) tGCCGATGGC‑GTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGTAACCACCATGAACCCAGCAGCAGAAGTTATCACTGGCTATCAACGCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGACAATACTCAGTTCTACAGTCCAGTACt > 1:921268/1‑150 (MQ=255) gCCGATGGC‑GTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGTAACCACCATGAACCCAGCAGCAGAAGTTATCACTGGCTATCAACGCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGACAATACTCAGTTCTACAGTCCAGTACTg > 1:840747/1‑150 (MQ=255) cctggcggTCAATGGCAATGA‑CGCCAGGGTGATGTAACCACCATGAACCCAGCAGCAGAAGTTATCACTGGCTATCAACGCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGACAATACTCAGTTCTACAGTCCAGTACTGGAt > 1:206980/8‑150 (MQ=255) ctggcggTCAATGGCAATGA‑CGCCAGGGTGATGTAACCACCATGAACCCAGCAGCAGAAGTTATCACTGGCTATCAACGCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGACAATACTCAGTTCTACAGTCCAGTACTGGATa > 1:980952/7‑150 (MQ=255) aTGGC‑GTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGTAACCACCATGAACCCAGCAGCAGAAGTTATCACTGGCTATCAACGCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGACAATACTCAGTTCTACAGTCCAGTACTGGATa < 2:991901/150‑1 (MQ=255) aTGGC‑GTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGTAACCACCATGAACCCAGCAGCAGAAGTTATCACTGGCTATCAACGCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGACAATACTCAGTTCTACAGTCCAGTACTGGATa < 1:17692/150‑1 (MQ=255) tGGC‑GTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGTAACCACCATGAACCCAGCAGCAGAAGTTATCACTGGCTATCAACGCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGACAATACTCAGTTCTACAGTCCAGTACTGGATAc < 2:507280/150‑1 (MQ=255) gTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGTAACCACCATGAACCCAGCAGCAGAAGTTATCACTGGCTATCAACGCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGACAATACTCAGTTCTACAGTCCAGTACTGGATACGCTg < 2:1502077/150‑1 (MQ=255) gCCATTGACCGCCAGGGTGATGTAACCACCATGAACCCAGCAGCAGAAGTTATCACTGGCTATCAACGCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGACAATACTCAGTTCTACAGTCCAGTACTGGATACGCTGGAACAt > 1:414834/1‑150 (MQ=255) ccATTGACCGCCAGGGTGATGTAACCACCATGAACCCAGCAGCAGAAGTTATCACTGGCTATCAACGCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGACAATACTCAGTTCTACAGTCCAGTACTGGATACGCTGGAACATg > 2:50647/1‑150 (MQ=255) | ACAAAATATTCCCACTCGATTACCACAATTGCCCGGTGAAATGGGGCAAATCAGTCAGAGTGTTAATAACCTCGCCCAGGCACTGCGTGAAACGCGGACACTTAACGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGC‑GTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGTAACCACCATGAACCCAGCAGCAGAAGTTATCACTGGCTATCAACGCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGACAATACTCAGTTCTACAGTCCAGTACTGGATACGCTGGAACATG > NC_000913/2320729‑2321021 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |