Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC JC | NC_000913 | 1,293,032 | IS1 (–) +8 bp | intergenic (‑110/‑488) | hns ← / → tdk | DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine/deoxyuridine kinase |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 1050545 | NA (NA) | 203 (1.050) | 110/186 | 0.2 | 97.9% | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
? | NC_000913 | = 1293039 | 4 (0.020) | intergenic (‑117/‑488) | hns/tdk | DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine/deoxyuridine kinase | |||||
* | ? | NC_000913 | 1293032 = | 4 (0.020) | 211 (1.090) | 103/186 | 0.5 | 98.0% | intergenic (‑110/‑495) | hns/tdk | DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine/deoxyuridine kinase |
? | NC_000913 | = 1979270 | NA (NA) | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
Only 100 of 211 total aligned reads displayed.
TTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/1293129‑1293032 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGA < NC_000913/1979270‑1979172 TTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGT > 1:471701/1‑100 TTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTG > 1:1216266/1‑100 AACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGAT < 1:374774/100‑1 CCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGn < 1:3577393/100‑2 CTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCT < 1:1272225/100‑1 GTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGT < 2:375448/89‑1 TGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAAC < 1:3637880/100‑1 TGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTG < 2:2651148/89‑1 GCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGA > 2:1342787/1‑89 CTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTT < 1:1718382/100‑1 TGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATG < 2:506561/89‑1 TGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATG < 2:4802449/89‑1 CGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACT < 1:2793648/100‑1 AATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGATGATGCTGCC < 2:729895/89‑1 TCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT < 1:3316079/100‑1 TCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT < 1:1994102/100‑1 CATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTA > 1:3109912/1‑100 CATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAAC < 2:3089076/89‑1 CATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAAC > 2:288288/1‑89 ATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAG > 1:933115/1‑100 ATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACT < 2:1150985/89‑1 GTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGA < 2:1026946/89‑1 TAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGn < 1:43716/100‑2 AAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATT < 2:4574041/89‑1 AATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATG < 1:2384063/100‑1 GGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGT > 1:3890038/1‑100 GGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTG > 2:2139954/1‑89 GGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTG > 2:2708250/1‑89 GGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTG < 2:3320460/89‑1 GGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGT > 2:492634/1‑89 GCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTT < 1:4711099/100‑1 GCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTA < 2:3630251/89‑1 CTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTT < 1:3513872/100‑1 nTATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTG > 1:2524467/2‑100 ATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTG < 1:2197040/100‑1 TATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGA < 1:4145542/100‑1 ATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAG < 1:123476/100‑1 TGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGG < 1:2318428/100‑1 TGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGG < 2:2768714/89‑1 GCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGT > 2:3956576/1‑89 CCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTG > 1:1815218/1‑100 CCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTG > 1:1051774/1‑100 CGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTT > 2:1504663/1‑89 CGTCTTTTCTGGCGAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTT < 2:184240/89‑1 GTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCC < 1:4528810/100‑1 GTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCC < 1:416393/100‑1 GTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCC < 1:1625824/100‑1 CTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCATAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTG < 2:4398365/89‑1 CTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAG < 1:2123046/100‑1 CTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTG < 2:2537572/89‑1 TTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGA < 2:3884160/89‑1 TTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAG < 2:3543073/89‑1 TTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAG < 2:2119914/89‑1 TCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGT < 2:4748067/89‑1 GGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTTAGTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCT > 2:1182148/1‑89 GGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTC > 1:3910677/1‑100 GGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTC > 1:1547019/1‑100 GGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCT > 2:878073/1‑89 CTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCC > 2:2288324/1‑89 ATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTT < 1:1342787/100‑1 TTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTA < 1:2646150/100‑1 TTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTA > 1:217920/1‑100 TATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGTCTTCTGTTTCTAT > 1:749797/1‑100 TGAAAAGATATTTATTGGCGGCCCAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTC > 2:2192125/1‑89 TGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTC < 2:2764465/89‑1 GAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAG > 1:2106728/1‑100 GAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCT > 2:1495715/1‑89 AAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGC < 1:2422840/100‑1 AAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTG < 2:4190423/89‑1 AAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGT > 2:3444533/1‑89 AGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTT < 2:3109912/89‑1 GATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTC < 1:1884653/100‑1 GATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTC < 2:2785648/89‑1 GATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTC < 2:337520/89‑1 TATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCC < 1:396634/100‑1 TATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTA < 2:2342572/89‑1 TTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTC < 1:59608/100‑1 TTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTC < 1:4254281/100‑1 TTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATC > 2:3638094/1‑89 TTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCC < 1:4056259/100‑1 TTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCC < 1:98443/100‑1 TATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAG > 2:3113233/1‑89 ATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGC < 2:1574658/89‑1 ATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGC < 2:2448048/89‑1 TGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTG > 2:4527470/1‑89 GGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTC < 1:1488948/100‑1 GGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTC > 1:346894/1‑100 GGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGT > 2:3681483/1‑89 GGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGT > 2:3773589/1‑89 GGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCACCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTC < 1:4889940/100‑1 GCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCA < 1:4427537/100‑1 GCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTC < 2:2363669/89‑1 GGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGC < 1:1913003/100‑1 GGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCC < 2:4080957/89‑1 GCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCT > 1:3058838/1‑100 CAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACT < 1:277226/100‑1 CAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCT < 2:1725772/89‑1 AAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTG > 2:2151808/1‑89 AGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGA < 1:173719/100‑1 AGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGA > 1:1000733/1‑100 TTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/1293129‑1293032 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGA < NC_000913/1979270‑1979172 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |