| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,625,312:1 | +G | 6.5% | intergenic (+21/+23) | ydeJ → / ← dcp | conserved protein YdeJ/peptidyl‑dipeptidase Dcp |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,625,312 | 1 | . | G | 6.5% | 369.8 / 21.5 | 92 | intergenic (+21/+23) | ydeJ/dcp | conserved protein YdeJ/peptidyl‑dipeptidase Dcp |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (42/44); new base G (2/4); total (44/48) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.79e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.07e-01 | |||||||||||
TTTGCGTGGCATATTAAAGGCCAGAACTACACTGCGGTTATGCATTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCACGATGTTGCAGCATCGGCATAATCTTAGGTGCCTTACCGCGCCATTGTCGATACAGGCGTTCCAGATCTTCGCTGTTACCTCTGGAAAGGATCGCCTCGCGAAAACGCAGC > NC_000913/1625169‑1625461 | tttGCGTGGCATATTAAAGGCCAGAACTACACTGCGGTTATGCATTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGgc < 1:540313/150‑1 (MQ=255) ttGCGTGGCATATTAAAGGCCAGAACTACACTGCGGTTATGCATTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTCTTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGgcc < 2:1027991/150‑1 (MQ=255) gCGTGGCATATTAAAGGCCAGAACTACACTGCGGTTATGCATTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCT‑GAGATATCGccaggccag < 1:567990/150‑1 (MQ=255) gTGGCATATTAAAGGCCAGAACTACACTGCGGTTATGCATTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCT‑GAGATATCGCCAGgccagcc < 1:393889/150‑1 (MQ=255) tGGCATATTAAAGGCCAGAACTACACTGCGGTTATGCATTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGgccagcca < 2:590081/150‑1 (MQ=255) ggCATATTAAAGGCCAGAACTACACTGCGGTTATGCATTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCT‑GAGATATCGCCAGgccagcctg < 1:432579/150‑3 (MQ=255) cATATTAAAGGCCAGAACTACACTGCGGTTATGCATTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATtg > 1:760939/1‑150 (MQ=255) ttAAAGGCCAGAACTACACTGCGGTTATGCATTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATtggtgg > 1:970540/1‑150 (MQ=255) ttAAAGGCCAGAACTACACTGCGGTTATGCATTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATtggtgg < 1:1608101/150‑1 (MQ=255) ggCCAGAACTACACTGCGGTTATGCATTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCATTTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGttt > 2:974081/1‑150 (MQ=255) ggCCAGAACTACACTGCGGTTATGCATTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGttt > 1:804867/1‑150 (MQ=255) gCCAGAACTACACTGCGGTTATGCATTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTta > 1:993117/1‑150 (MQ=255) cAGAACTACACTGCGGTTATGCATTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTtata < 1:108390/150‑1 (MQ=255) cAGAACTACACTGCGGTTATGCATTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTtata > 1:109136/1‑150 (MQ=255) cAGAACTACACTGCGGTTATGCATTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTtata < 1:1574177/150‑1 (MQ=255) cAGAACTACACTGCGGTTATGCATTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTtata > 2:911712/1‑150 (MQ=255) aGAACTACACTGCGGTTATGCATTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTatat < 1:729215/150‑1 (MQ=255) aCTACACTGCGGTTATGCATTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGtt < 2:557938/150‑1 (MQ=255) atACACTGCGGTTACGCATTTTGCTGGCGACTGCGAAACGTTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTTCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTc < 2:1380860/149‑1 (MQ=255) cacTGCGGTTATGCATTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAg < 2:54899/150‑1 (MQ=255) cacTGCGGTTATGCATTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAg < 1:1117437/150‑1 (MQ=255) acTGCGGTTATGCATTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGc < 1:60246/150‑1 (MQ=255) cTGCGGTTATGCATTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGcc > 1:223351/1‑150 (MQ=255) cTGCGGTTATGCATTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGcc > 1:903294/1‑150 (MQ=255) cTGCGGTTATGCATTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGcc > 1:1079031/1‑150 (MQ=255) cTGCGGTTATGCATTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTACAAGcc > 1:312321/1‑150 (MQ=255) cGGTTATGCATTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCACg < 2:1067515/150‑1 (MQ=255) gTTATGCATTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCACGAt > 2:1524357/1‑150 (MQ=255) gTTATGCATTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCACGAt > 1:97575/1‑150 (MQ=255) tATGCATTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCACGATGt > 1:351101/1‑150 (MQ=255) tATGCATTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCACGATGt > 1:1158671/1‑150 (MQ=255) gCATTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCACGATGTTgc > 1:599800/1‑150 (MQ=255) gCATTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCACGATGTTgc > 1:1553681/1‑150 (MQ=255) gCATTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCACGATGTTgc < 1:804548/150‑1 (MQ=255) gCATTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGGGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCACGATGTTgc < 2:960297/150‑1 (MQ=255) cATTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCACGATGTTgca > 2:278112/1‑150 (MQ=255) cATTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCACGATGTTgca > 1:230974/1‑150 (MQ=255) aTTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCACGATGTTgcag < 1:672630/150‑1 (MQ=255) aTTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCACGATGTTgcag < 1:1184949/150‑1 (MQ=255) gCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCACGATGTTGCAGCATCg < 2:416573/150‑1 (MQ=255) gCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCACGATGTTGCAGCATCg > 2:774898/1‑150 (MQ=255) cGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCACGATGTTGCAGCATAGGCATa > 2:695400/1‑150 (MQ=255) cGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCACGATGCTGCAACATCgtggct < 1:45054/150‑6 (MQ=255) gACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCACGATGCTGCAACATCgtggctt < 2:1429307/150‑7 (MQ=255) cTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCACGATGTTGCAGCATCGGCATAATc > 2:1511632/1‑150 (MQ=255) tGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACAAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCACGATGTTGCAGCATCGGCATAATCt < 1:1572461/150‑1 (MQ=255) gCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTtata < 1:532187/113‑1 (MQ=255) gCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTtata > 2:532187/1‑113 (MQ=255) gCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCACGATGTTGCAGCATCGGCATAATCtt > 2:18041/1‑150 (MQ=255) 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tataACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCACGATGTTGCAGCATCGGCATAATCTTAGGTGCCTTACCGCGCCATTGTCGATACAGGCGTTCCAGATCTTCGCTGTTACCTCTGGa < 2:357240/150‑1 (MQ=255) aaCCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCACGATGTTGCAGCATCGGCATAATCTTAGGTGCCTTACCGCGCCATTGTCGATACAGGCGTTCCAGATCTTCGCTGTTACCTCTGGATAg < 1:1261808/150‑1 (MQ=255) aaCCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCACGATGTTGCAGCATCGGCATAATCTTAGGTGCCTTACCGCGCCATTGTCGATACAGGCGTTCCAGATATTCGCTGTTACATCTGGAAAg > 2:856775/1‑150 (MQ=255) acgaGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCACGATGTTGCAGCATCGGCATAATCTTAGGTGCCTTACCGCGCCATTGTCGATACAGGCGTTCCAGATCTTCGCTGTTACCTCTGGAAAgg < 2:804867/147‑1 (MQ=255) aCCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCACGATGTTGCAGCATCGGCATAATCTTAGGTGCCTTACCGCGCCATTGTCGATACAGGCGTTCCAGATCTTCGCTGTTACCTCTGGAAAgg > 1:113143/1‑150 (MQ=255) cAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCACGATGTTGCAGCATCGGCATAATCTTAGGTGCCTTACCGCGCCATTGTCGATACAGGCGTTCCAGATCTTCGCTGTTACCTCTGGAAAGGAt < 2:590179/150‑1 (MQ=255) gCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCACGATGTTGCAGCATCGGCATAATCTTAGGTGCCTTACCGCGCCATTGTCGATACAGGCGTTCCAGATCTTCGCTGTTACCTCTGGAAAGGATCGc > 1:891330/1‑150 (MQ=255) gCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCACGATGTTGCAGCATCGGCATAATCTTAGGTGCCTTACCGCGCCATTGTCGATACAGGCGTTCCAGATCTTCGCTGTTACCTCTGGAAAGGATCGc < 1:1059683/150‑1 (MQ=255) gCTGGCCT‑GAGATATCGCCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCACGATGTTGCAGCATCGGCATAATCTTAGGTGCCTTACCGCGCCATTGTCGATACAGGCGTTCCAGATCTTCGCTGTTACCTCTGGAAAGGATc > 2:781983/1‑148 (MQ=255) gCTGGCCT‑GAGATATCGCCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCACGATGTTGCAGCATCGGCATAATCTTAGGTGCCTTACCGCGCCATTGTCGATACAGGCGTTCCAGATCTTCGCTGTTACCTCTGGAAAGGATc < 1:781983/148‑1 (MQ=255) gCTGGCCT‑GAGATATCGCCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCACGATGTTGCAGCATCGGCATAATCTTAGGTGCCTTACCGCGCCATTGTCGATACAGGCGTTCCAGATCTTCGCTGTTACCTCTGGAAAGGATCGc > 1:197447/1‑150 (MQ=255) tatC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCACGATGTTGCAGCATCGGCATAATCTTAGGTGCCTTACCGCGCCATTGTCGATACAGGCGTTCCAGATCTTCGCTGTTACCTCTGGAAAGGATCGCCTCGCGAAAACGc > 1:83427/1‑150 (MQ=255) tc‑tcAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCACGATGTTGCAGCATCGGCATAATCTTAGGTGCCTTACCGCGCCATTGTCGATACAGGCGTTCCAGATCTTCGCTGTTACCTCTGGAAAGGATCGCCTCGCGAAAACGCAg < 2:351101/150‑1 (MQ=255) tc‑tcAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCACGATGTTGCAGCATCGGCATAATCTTAGGTGCATTACCGCGCCATTGTCGATACAGGCGTTCCAGATCTTCGCTGTTACCTCTGGAAAGGATCGCCTCGCGAAAACGCAg > 2:1270185/1‑150 (MQ=255) c‑tcAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCACGATGTTGCAGCATCGGCATAATCTTAGGTGCCTTACCGCGCCATTGTCGATACAGGCGTTCCAGATCTTCGCTGTTACCTCTGGAAAg < 1:260220/128‑1 (MQ=255) c‑tcAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCACGATGTTGCAGCATCGGCATAATCTTAGGTGCCTTACCGCGCCATTGTCGATACAGGCGTTCCAGATCTTCGCTGTTACCTCTGGAAAg > 2:260220/1‑128 (MQ=255) c‑tcAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCACGATGTTGCAGCATCGGCATAATCTTAGGTGCCTTACCGCGCCATTGTCGATACAGGCGTTCCAGATCTTCGCTGTTACCTCTGGAAAGGATCGCCTCGCGAAAACGCAGc > 2:305110/1‑150 (MQ=255) c‑tcAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCACGATGTTGCAGCATCGGCATAATCTTAGGTGCCTTACCGCGCCATTGTCGATACAGGCGTTCCAGATCTTCGCTGTTACCTCTGGAAAGGATCGCCTCGCGAAAACGCAGc < 2:97575/150‑1 (MQ=255) | TTTGCGTGGCATATTAAAGGCCAGAACTACACTGCGGTTATGCATTTTGCTGGCGACTGCGAAACGGTATTAGCTTTAGCGGTGAGGTTTGCCCTCGCCCAGCTGCTGCAATTACTGCTATAACCAGGCTGGCCTGGCGATATC‑TCAGGCCAGCCATTGGTGGTGTTTATATGTTCAAGCCACGATGTTGCAGCATCGGCATAATCTTAGGTGCCTTACCGCGCCATTGTCGATACAGGCGTTCCAGATCTTCGCTGTTACCTCTGGAAAGGATCGCCTCGCGAAAACGCAGC > NC_000913/1625169‑1625461 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |