New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 226398 = | NA (NA) | 12 (0.140) | 9/264 | NT | NA | noncoding (640/2904 nt) | rrlH | 23S ribosomal RNA |
? | NC_000913 | 226415 = | NA (NA) | noncoding (657/2904 nt) | rrlH | 23S ribosomal RNA |
TTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/226552‑226398 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gttaagTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTGGGTAACACTAACTGGAGGACCGAACCGACTAATGTTGAAAAATTAGCGGATGACTTGTGGCTGGGGGTGAAAGGCCAATCAAACCGGGAGATAG > NC_000913/226415‑226563 TTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAG < 1:1227960/150‑1 TTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAG < 1:17826/150‑1 TTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAG > 2:507200/1‑150 TTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGT > 1:829413/1‑150 TTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGT < 1:864645/150‑1 TTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGT < 2:89080/150‑1 TGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTGCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGTT < 2:972112/150‑1 TGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGTT < 1:1000716/150‑1 TGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGTT > 1:1169416/1‑150 TGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGTT > 2:1617333/1‑150 GATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGTTA > 1:1014613/1‑150 GATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGTTA > 1:522766/1‑150 GATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGTTA < 1:230234/150‑1 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1:224140/150‑1 ATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAA < 1:1097326/150‑1 ATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAA > 2:1564133/1‑150 ATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAA < 2:1205731/150‑1 TTGGCCTTTCACCCCCATGCACAAGTCATCCTCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTTCCCATGTCTAGATGAGCGGGTTTCGTGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCGAGTTAtg < 2:1253665/150‑3 TTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGGTAGATCACCTGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAAGTTATCGCCCAGTTAAG < 2:1443068/150‑1 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2:1105976/1‑147 GGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAA < 1:1105976/147‑1 CCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGTTA > 2:921308/1‑136 CCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGTTA < 1:921308/136‑1 AATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAAG > 2:31886/1‑116 AATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAAG < 1:31886/116‑1 GTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGGTAAGTTGCAGGGTATTGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTGGGTAACACTAACTGGAGGACCGAGCCGACTAATGTTGAAAAATTAGCGGATGACTT > 1:1537051/1‑150 ATACCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTGGGTAACACTAACTGGAGGACCGAACCGACTAATGTTGAAAAATTAGCGGATGACTTGTGGCTGGGGG > 2:217173/1‑150 cCCCTGCAACTAAACCCCCCGTTAATTTGCTGGTTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTGGGTAACACTAACTGGAGGACCGAACCGACTAATGTTGAAAAATTAGCGGATGACTTGTGGCTGGGGGTG < 2:1537051/149‑1 CCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTGGGTAACACTAACTGGAGGACCGAACCGACTAATGTTGAAAAATTAGCGGATGACTTGTGGCTGGGGGTGA > 1:530603/1‑150 CCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTGGGTAACACTAACTGG < 2:261122/95‑1 CCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTGGGTAACACTAACTGG > 1:261122/1‑95 CTGCAACTTAACGCCCAGTTAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTGGGTAACACTAACTGGAGGACCGAACCGACTAATGTTGAAAAATTAGCGGATGACTTGTGGCTGGGGGTGAAA > 2:996671/1‑150 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2:806997/149‑1 GTTAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTGGGTAACACTAACTGGAGGACCGAACCGACTAATGTTGAAAAATTAGCGGATGACTTGTGGCTGGGGGTGAAAGGCCAATCAAACCGGGA < 2:146045/150‑1 GTTAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTGGGTAACACTAACTGGAGGACCGAACCGACTAATGTTGAAAAATTAGCGGATGACTTGTGGCTGGGGGTGAAAGGCCAATCAAACCGGGA < 2:4994/150‑1 GTTAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTGGGTAACACTAACTGGAGGACCGAACCGACTAATGTTGAAAAATTAGCGGATGACTTGTGGCTGGGGGTGAAAGGCCAATCAAACCGGGA > 2:1060411/1‑150 TTAAGTTGCAGGGTATAGAGGCGATACCCGGTGATGTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTGGGTAACACTAACTGGAGGACCGATCGGACTATTGTTGAAAAATTAGCGGATGACTTGTGGCTGGGGGTGAATGGCGAATCAAACCGGGAG < 2:42808/150‑1 TTAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTCGCCATTTGCAGGTGGTTGGTTGGGTTACACTAACTGGAGGACCGAACCGACTAATGTTTAAAAAATAGGGGATGACTTGTGGCTGGGGGTGAAAGGCCAATCAAACCGGGAG < 2:13075/150‑1 TTAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTGGGTAACACTAACTGGAGGACCGAACCGACTAATGTTGAAAAATTAGCGGATGACTTGTGGCTGGGGGTGAAAGGCCAATCAAACCGGGAG < 1:794590/150‑1 TTAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTGGGTAACACTAACTGGAGGACCGAACCGACTAATGTTGAAAAATTAGCGGATGACTTGTGGCTGGGGGTGAAAGGCCAATCAAACCGGGAG < 2:281629/150‑1 TTAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTGGGTAACACTAACTGGAGGACCGAACCGACTAATGTTGAAAAATTAGCGGATGACTTGTGGCTGGGGGTGAAAGGCCAATCAAACCGGGAG > 1:180422/1‑150 TTAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTGGGTAACACTAACTGGAGGACCGAACCGACTAATGTTGAAAAATTAGCGGATGACTTGTGGCTGGGGGTGAAAGGCCAATCAAACCGGGAG < 2:1069390/150‑1 TTAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTGGGTAACACTAACTGGAGGACCAAACCGACTAATGTTGAAAAATTAGCGGATGACTTGTGGCTGGGGGTGAAAGGCCAATCAAACCGGGAG < 2:846239/150‑1 TAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTGGGTAACACTAACTGGAGGACCGAACCGACTAATGTTGAAAAATTAGCGGATGACTTGTGGCTGGGGGTGAAAGGCCAATCAAACCGGGAGA > 1:245600/1‑150 AAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTGGGTAACACTAACTGGAGGACCGAACCGACTAATGTTGAAAAATTAGCGGATGACTTGTGGCTGGGGGTGAAAGGCCAATCAAACCGGGAGAT < 2:420975/150‑1 AAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTGGGTAACACTAACTGGAGGACCGAACCGACTAATGTTGAAAAATTAGCGGATGACTTGTGGCTGGGGGTGAAAGGCCAATCAAACCGGGAGAT < 1:1096748/150‑1 AAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTGGGTAACACTAACTGGAGGACCGAACCGACTAATGTTGAAAAATTAGCGGATGACTTGTGGCTGGGGGTGAAAGGCCAATCAAACCGCGAGAT > 2:1046197/1‑150 AGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTGGGTAACACTAACTGGAGGACCGAACCGACTAATGTTGAAAAATTAGCGGATGACTTGTGGCTGGGGGTGAAAGGCCAATCAAACCGGGAGATA > 2:121064/1‑150 AGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTGGGTAACACTAACTGGAGGACCGAACCGACTAATGTTGAAAAATTAGCGGATGACTTGTGGCTGGGGGTGAAAGGCCAATCAAACCGGGAGATA < 1:599789/150‑1 AGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTGGGTAACACTAACTGGAGGACCGAACCGACTAATGTTGAAAAATTAGCGGATGACTTGTGGCTGGGGGTGAAAGGCCAATCAAACCGGGAGATA < 1:1126950/150‑1 AGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTGGGTAACACTAACTGGAGGACCGAACCGACTAATGTTGAAAAATTAGCGGATGACTTGTGGCTGGGGGTGAAAGGCCAATCAAACCGGGAGATA < 1:402073/150‑1 AGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTGGGTAACACTAACTGGAGGACCGAACCGACTAATGTTGAAAAATTAGCGGATGACTTGTGGCTGGGGGTGAAAGGCCAATCAAACCGGGAGATA > 1:405462/1‑150 AGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTGGGTAACACTAACTGGAGGACCGAACCGACTAATGTTGAAAAATTAGCGGATGACTTGTGGCTGGGGGTGAAAGGCCAATCAAACCGGGAGATA < 2:1097991/150‑1 AGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTGGGTAACACTAACTGGAGGACCGAACCGACTAATGTTGAAAAATTAGCGGATGACTTGTGGCTGGGGGTGAAAGGCCAATCAAACCGGGAGATA < 1:407621/150‑1 GTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTGGGTAACACTAACTGGAGGACCGAACCGACTAATGTTGAAAAATTAGCGGATGACTTGTGGCTGGGGGTGAAAGGCCAATCAAACCGGGAGATAG > 2:654894/1‑150 GTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTGGGTAACACTAACTGGAGGACCGAACCGACTAATGTTGAAAAATTAGCGGATGACTTGTGGCTGGGGGTGAAAGGCCAATCAAACCGGGAGATAG > 1:1359368/1‑150 GTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTGGGTAACACTAACTGGAGGACCGAACCGACTAATGTTGAAAAATTAGCGGATGACTTGTGGCTGGGGGTGAAAGGCCAATCAAACCGGGAGATAG > 1:1408009/1‑150 GTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTGGGTAACACTAACTGGAGGACCGAACCGACTAATGTTGAAAAAATAGCGGATGACTTGTGGCTGGGGGTGAAAGGCCAATCAAACCGGGAGATAG > 2:1610736/1‑150 TTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/226552‑226398 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gttaagTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTGGGTAACACTAACTGGAGGACCGAACCGACTAATGTTGAAAAATTAGCGGATGACTTGTGGCTGGGGGTGAAAGGCCAATCAAACCGGGAGATAG > NC_000913/226415‑226563 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |