| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 570701 | 5236 (56.770) | 296 (3.380) | 38/262 | NT | 5.7% | intergenic (+273/‑192) | ybcK/ybcL | DLP12 prophage; putative recombinase/DLP12 prophage; periplasmic protein YbcL |
| ? | NC_000913 | = 570711 | 4871 (55.660) | intergenic (+283/‑182) | ybcK/ybcL | DLP12 prophage; putative recombinase/DLP12 prophage; periplasmic protein YbcL | |||||
Only 100 of 1010 total aligned reads displayed.
GGCTGTATTGGGGTAGTAAATGAGCTATACAATCTTAATCATTTGTTAGGTGAGAACTCTTGGTCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/570546‑570701‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑taacaccTACGAAAGTCGGTGTTATTTTTTAACCTACCATTCAAAATACGTGACATACACCATTTTGCTCATAATAATTTGTCACGTATTTTCAGTATTTGAATCTGCGACCAAGAGTTCTCACCTAACAAATGATTAAGATTGTATAGCTCATTT < NC_000913/570711‑570563 GGCTGTATTGGGGTAGTAAATGAGCTATACAATCTTAATCATTTGTTAGGTGAGAACTCTTGGTCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAAT > 1:1042273/1‑150GGCTGTATTGGGGTAGTAAATGAGCTATACAATCTTAATCATTTGTTAGGTGAGAACTCTTGGTCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAAT > 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2:1551357/1‑150 aaCTACGAAAGTCTTTGTTATTTTTTAACCTACCATTCAAAATACGTGACATAGACCATTTTGCTCATAATAATTTGTCACGTATTTTCAGTATTTGAATCTGCGACCAAGAGTTCTCACCTAACAAATGATTAAGATTGTATAGCTCAT < 1:715965/148‑1 ACCTACGAAAGTCGGTGTTATTTTTTAACCTACCATTCAAAATACGTGACATACACCATTTTGCTCATAATAATTTGTCACGTATTTTCAGTATTTGAATCTGCGACCAAGAGTTCTCACCTAACAAATGATTAAGATTGTATAGCTCAT > 2:611806/1‑150 CCTACGAAAGTCGGTGTTATTTTTTAACCTACCATTCAAAATACGTGACATACACCATTTTGCTCATAATAATTTGTCACGTATTTTCAGTATTTGAATCTGCGACCAAGAGTTCTCACCTAACAAATGATTAAGATTGTATAGCTCATT > 1:1091101/1‑150 CCTACGAAAGTCGGTGTTATTTTTTAACCTACCATTCAAAATACGTGACATACACCATTTTGCTCATAATAATTTGTCACGTATTTTCAGTATTTGAATCTGCGACCAAGAGTTCTCACCTAACAAATGATTAAGATTGTATAGCTCATT < 2:336597/150‑1 CCTACGAAAGTCGGTGTTATTTTTTAACCTACCATTCAAAATACGTGACATACACCATTTTGCTCATAATAATTTGTCACGTATTTTCAGTATTTGAATCTGCGACCAAGAGTTCTCACCTAACAAATGATTAAGATTGTATAGCTCATT < 2:1478089/150‑1 CTACGAAAGTCGGTGTTATTTTTTAACCTACCATTCAAAATACGTGACATACACCATTTTGCTCATAATAATTTGTCACGTATTTTCAGTATTTGAATCTGCGACCAAGAGTTCTCACCTAACAAATGATTAAGATTGTATAGCTCATTT < 1:638269/150‑1 CTACGAAAGTCGGTGTTATTTTTTAACCTACCATTCAAAATACGTGACATACACCATTTTGCTCATAATAATTTGTCACGTATTTTCAGTATTTGAATCTGCGACCAAGAGTTCTCACCTAACAAATGATTAAGATTGTATAGCTCATTT < 1:816214/150‑1 CTACGAAAGTCGGTGTTATTTTTTAACCTACCATTCAAAATACGTGACATACACCATTTTGCTCATAATAATTTGTCACGTATTTTCAGTATTTGAATCTGCGACCAAGAGTTCTCACCTAACAAATGATTAAGATTGTATAGCTCATTT < 1:85093/150‑1 CTACGAAAGTCGGTGTTATTTTTTAACCTACCATTCAAAATACGTGACATACACCATTTTGCTCATAATAATTTGTCACGTATTTTCAGTATTTGAATCTGCGACCAAGAGTTCTCACCTAACAAATGATTAAGATTGTATAGCTCATTT > 1:1308236/1‑150 CTACGAAAGTCGGTGTTATTTTTTAACCTACCATTCAAAATACGTGACATACACCATTTTGCTCATAATAATTTGTCACGTATTTTCAGTATTTGAATCTGCGACCAAGAGTTCTCACCTAACAAATGATTAAGATTGTATAGCTCATTT < 1:1189799/150‑1 GGCTGTATTGGGGTAGTAAATGAGCTATACAATCTTAATCATTTGTTAGGTGAGAACTCTTGGTCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/570546‑570701‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑taacaccTACGAAAGTCGGTGTTATTTTTTAACCTACCATTCAAAATACGTGACATACACCATTTTGCTCATAATAATTTGTCACGTATTTTCAGTATTTGAATCTGCGACCAAGAGTTCTCACCTAACAAATGATTAAGATTGTATAGCTCATTT < NC_000913/570711‑570563 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |