| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1465092 = | 116 (1.260) | 15 (0.180) | 10/254 | NT | 12.1% | intergenic (+31/+73) | paaY/ynbG | 2‑hydroxycyclohepta‑1,4,6‑triene‑1‑carboxyl‑CoA thioesterase/uncharacterized protein YnbG |
| ? | NC_000913 | 1465125 = | 111 (1.310) | intergenic (+64/+40) | paaY/ynbG | 2‑hydroxycyclohepta‑1,4,6‑triene‑1‑carboxyl‑CoA thioesterase/uncharacterized protein YnbG | |||||
TCAGGTGAATAAAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGAAAAAACGGTATGAATTAATACTCAAATAAATAAAGCAGAGCTTAAACATAACTCTGCTTTAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/1465251‑1465092‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ctctgctttatTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGTCTTTTTTTATTCACCTGAATTATAATTGTGAATTATAGG > NC_000913/1465125‑1465272 TCAGGTGAATAAAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGAAAAAACGGTATGAATTAATACTCAAATAAATAAAGCAGAGCTTAAACATAAC < 2:312627/150‑1 CAGGTGAATAAAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGAAAAAACGGTATGAATTAATACTCAAATAAATAAAGCAGAGCTTAAACATAACT < 1:93164/150‑1 GGTGAATAAAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGAAAAAACGGTATGAATTAATACTCAAATAAATAAAGCAGAGCTTAAACATAACTCT > 1:737361/1‑150 GAATAAAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGAAAAAACGGTATGAATTAATACTCAAATAAATAAAGCAGAGCTTAAACATAACTCTGCT < 2:255032/150‑1 GAATAAAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGAAAAAACGGTATGAATTAATACTCAAATAAATAAAGCAGAGCTTAAACATAACTCTGCT < 1:972259/150‑1 ATAAAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGAAAAAACGGTATGAATTAATACTCAAATAAATAAAGCAGAGGTTAAACATAACTCTGGTTT > 1:1137941/1‑150 aAAAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGAAAAAACGGTATGAATTAATACTCAAATAAATAAAGCAGAGCTTAAACATAACTCTGCTTTA < 1:101877/149‑1 TATGAATTAATACTCAAATAAATAAAGCAGAGCTTAAACATAACTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTA > 2:1005301/1‑150 ACTCAAATAAATAAAGCAGAGCTTAAACATAACTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATG > 2:1122264/1‑150 CTCAAATAAATAAAGCAGAGCTTAAACATAACTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGG > 2:963284/1‑150 CTCAAATAAATAAAGCAGAGCTTAAACATAACTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGG > 2:969430/1‑150 CTCAAATAAATAAAGCAGAGCTTAAACATAACTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCAT > 2:574576/1‑148 CTCAAATAAATAAAGCAGAGCTTAAACATAACTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCAT < 1:574576/148‑1 CAAATAAATAAAGCAGAGCTTAAACATAACTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGTa > 2:308487/1‑149 AATAAATAAAGCAGAGCTTAAACATAACTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTAATGGTCTT > 2:386783/1‑150 TAAATAAAGCAGAGCTTAAACATAACTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGTCTTTT > 1:1538932/1‑150 AAATAAAGCAGAGCTTAAACATAACTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGTCTTTTT > 2:1057699/1‑150 AAAGCAGAGCTTAAACATAACTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGTCTTTTTTTAT > 1:1566062/1‑150 AAAGCAGAGCTTAAACATAACTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGTCTTTTTTTAT > 2:1339628/1‑150 AAGCAGAGCTTAAACATAACTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGTCTTTTTTTATT > 2:1229541/1‑150 AAGCAGAGCTTAAACATAACTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGCCTTTTTTTATT > 2:9364/1‑150 AAGCAGAGCTTAAACATAACTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGGTATTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGAGGTTTTAATTAGTAATTTATATTTTATACAAGATTTATATATTTCATGGTCTGTTTTTATT > 2:1453167/1‑150 agcgCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGGCTTTTTTTATTCACCTGAATTATAATTG < 1:340522/146‑1 CTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGTCTTTTTTTATTCACCTGAATTATAATTGTG < 2:1092686/150‑1 CTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCAAATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGTCTTTTTTTATTCACCTGAATTATAATTGTG < 2:1519175/150‑1 GCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGTCTTTTTTTATTCACCTGAATTATAATTGTGAATT > 1:108829/1‑150 GCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGTCTTTTTTTATTCACCTGAATTATAATTGTGAATT > 1:809330/1‑150 GCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGTCTTTTTTTATTCACCTGAATTATAATTGTGAATT > 1:1504939/1‑150 GCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGTCTTTTTTTATTCAACTGAATTATAATTGTGAATT > 2:730221/1‑150 CTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGTCTTTTTTTATTCACCTGAATTATAATTGTGAATTA > 1:153630/1‑150 CTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGTCTTTTTTTATTCACCTGAATTATAATTGTGAATTA > 1:147878/1‑150 TTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGTCTTTTTTTATTCACCTGAATTATAATTGTGAATTAT > 1:848564/1‑150 TATTTATTTTATTATTAATTCATACCTTTTTTTCATAATATAATTATTTATAATGATAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGTCTTTTTTTATTCACCTGAATTATAATTGTGAATTATAG < 1:706348/150‑1 TATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGTCTTTTTTTATTCACCTGAATTATAATTGTGAATTATAG > 2:1218508/1‑150 TATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGTCTTTTTTTATTCACCTGAATTATAATTGTGAATTATAG < 2:364645/150‑1 TATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGTCTTTTTTTATTCACCTGAATTATAATTGTGAATTATAG < 2:413839/150‑1 TATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGTCTTTTTTTATTCACCTGAATTATAATTGTGAATTATAG < 2:809330/150‑1 TATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGTCTTTTTTTATTCACCTGAATTATAAT > 2:523933/1‑138 TATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGTCTTTTTTTATTCACCTGAATTATAAT < 1:523933/138‑1 TATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTATCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGTCTTTTTTTATTCACCTGAATTATAATTGTGAATTATAG < 2:580412/150‑1 ATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGTCTTTTTTTATTCACCTGAATTATAATTGTGAATTATAGG < 2:1504939/150‑1 ATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGTCTTTTTTTATTCACCTGAATTATAATTGTGAATTATAGG > 2:1316763/1‑150 TCAGGTGAATAAAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGAAAAAACGGTATGAATTAATACTCAAATAAATAAAGCAGAGCTTAAACATAACTCTGCTTTAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/1465251‑1465092‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ctctgctttatTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGTCTTTTTTTATTCACCTGAATTATAATTGTGAATTATAGG > NC_000913/1465125‑1465272 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |