New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 4374122 = | 86 (0.930) | 7 (0.080) | 7/260 | NT | 7.9% | coding (113/870 nt) | yjeJ | protein YjeJ |
? | NC_000913 | 4374144 = | 82 (0.940) | coding (91/870 nt) | yjeJ | protein YjeJ |
AAAATTAATTATTTAATTGAGAAATGGTTAGGGAGAACCTACATGGCCATAAGCATCAAGGGTGTTAATACCGGTGTTATTCGCAAGAGTAATAATTTCATTGCACTGGCGCTGAAAATTAAAGAACCTCGCAATAAAGAATCGTTGTTCTTTAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/4374276‑4374122 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttctttatTGCGAGGTTCTTTAATTTTCAGCGCCAGTGCAATGAAATTATTACTCTTGCGAATAACACCGGTATTAACACCCTTGATGCTTATGGCCATGTAGGTTCTCCCTAACCATTTCTCAATTAAATAATTAATTTTAATTTATAAGCCAGAT > NC_000913/4374144‑4374292 AAAATTAATTATTTAATTGTGAAATGTTTAGTGAGAACCTACATGGCCATAAGCATCAAGTGTGTTAATACCGGTGTTATTCGCAAGAGTAATAATTTCATTGCACTGGCGCTGAAAATTAAAGAACCTCGCAATAAAGAATCGTTGTTC < 1:1228795/150‑1 TTAATTATTTAATTGAGAAATGGTTAGGGAGAACCTACATGGCCATAAGCATCAAGGGTGTTAATACCGGTGTTATTCGCAAGAGTAATAATTTCATTGCACTGGCGCTGAAAATTAAAGAACCTCGCAATAAAGAATCGTTGTTCTTTA < 1:1380876/150‑1 TTAATTATTTAATTGAGAAATGGTTAGGGAGAACCTACATGGCCATAAGCATCAAGGGTGTTAATACCGGTGTTATTCGCAAGAGTAATAATTTCATTGCACTGGCGCTGAAAATTAAAGAACCTCGCAATAAAGAATCGTTGTTCTTTA < 2:192128/150‑1 GGTTAGGGAGAACCTACATCGCCATAAGCATCAAGGGTGCTAATACCGGTGTTATTCGCAAGAGTAATAATTTCATTGCACTGGCGCTGAAAATTAAAGAACCTCGCAATAAAGAATCGTTGTTCTTTATTGCGAGGTTCTTTAATTTTC < 1:809473/150‑1 ACATGGCCATAAGCATCAAGGGTGTTAATACCGGTGTTATTCGCAAGAGTAATAATTTCATTGCACTGGCGCTGAAAATTAAAGAACCTCGCAATAAAGAATCGTTGTTCTT > 2:855932/1‑112 ACATGGCCATAAGCATCAAGGGTGTTAATACCGGTGTTATTCGCAAGAGTAATAATTTCATTGCACTGGCGCTGAAAATTAAAGAACCTCGCAATAAAGAATCGTTGTTCTT < 1:855932/112‑1 AATAATTTCATTGCACTGGCGCTGAAAATTAAAGAACCTCGCAATAAAGAATAGTTGTTATTTATTGCGAGGTTGTTTAATTTTAAGCGCCAGTGCAATGAAATTATTAATATTTCGAAAAACACCGGTATTAACACCCGTGATGCTTAT > 2:427080/1‑150 CTGAAAATTAAAGAACCTCGCAATAAAGAATCGTTGTTCTTTATTGCGAGGTTCTTTAATTTTCAGCGCCAGTGCAATGAAATTATTACTCTTGCGAATAACACCGGTATTAACACCCTTGATGCTTATGGCCATGTAGGTTCTCCCTAA > 1:767236/1‑150 AAATTAAAGAACCTCGCAATAAAGAATCGTTGTTCTTTATTGCGAGGTTCTTTAATTTTCAGCGCCAGTGCAATGAAATTATTACTCTTGCGAATAACACCGGTATTAACACCCTTGATGCTTATGGCCATGTAGGTTCTCCCTAACCAT > 2:875779/1‑150 GCAATAAAGAATCGTTGTTCTTTATTGCGAGGTTCTTTAATTTTCAGCGCCAGTGCAATGAAATTATTACTCTTGCGAATAACACCGGTATTAACACCCTTGATGCTTATGGCCATGTAGGTTCTCCCTAACCATTTCTCAATTAAATAA > 2:133639/1‑150 TAAAGAATCGTTGTTCTTTATTGCGAGGTTCTTTAATTTTCAGCGCCAGTGCAATGAAATTATTACTCTTGCGAATAACACCGGTATTAACACCCTTGATGCTTATGGCCATGTAGGTTCTCCCTAACCATTTCTCAATTAAATAATTAA > 1:446854/1‑150 AGAATCGTTGTTCTTTATTGCGAGGTTCTTTAATTTTCAGCGCCAGTGCAATGAAATTATTACTCTTGCGAATAACACCGGTATTAACACCCTTGATGCTTATGGCCATGTAGGTTCTCCCTAACCATTTCTCAATTAAATAATTAATTT > 1:1220331/1‑150 CTTTATTGCGAGGTTCTTTAATTTTCAGCGCCAGTGCAATGAAATTATTACTCTTGCGAATAACACCGGTATTAACACCCTTGATGCTTATGGCCATGTAGGTTCTCCCTAACCATTTCTCAATTAAATAATTAATTTTAATTTATAAGC > 2:475705/1‑150 CTTTATTGCGAGGTTCTTTAATTTTCAGCGCCAGTGCAATGAAATTATTACTCTTGCGAATAACACCGGTATTAACACCCTTGATGCTTATGGCCATGTAGGTTCTCCCTAACCATTTCTCAATTAAATAATTAATTTTAATTTATAAGC > 2:522399/1‑150 CTTTATTGCGAGGTTCTTTAATTTTCAGCGCCAGTGCAATGAAATTATTACTCTTGCGAATAACACCGGTATTAACACCCTTGATGCTTATGGCCATGTAGGTTCTCCCTAACCATTTCTCAATTAAATAATTAATTTTAATTTATAAGC > 2:684290/1‑150 CTTTATTGCGAGGTTCTTTAATTTTCAGCGCCAGTGCAATGAAATTATTACTCTTGCGAATAACACCGGTATTAACACCCTTGATGCTTATGGCCATGTAGGTTCTCCCTAACCATTTCTCAATTAAATAATTAATTTTAATTTATAAGC > 1:1496160/1‑150 TTTATTGCGAGGTTCTTTAATTTTCAGCGCCAGTGCAATGAAATTATTACTCTTGCGAATAACACCGGTATTAACACCCTTGATGCTTATGGCCATGTAGGTTCTCCCTAACCATTTCTCAATTAAATAATTAATTTTAATTTATAAGCC < 1:742617/150‑1 TTTATTGCGAGGTTCTTTAATTTTCAGCGCCAGTGCAATGAAATTATTACTCTTGCGAATAACACCGGTATTAACACCCTTGATGCTTATGGCCATGTAGGTTCTCCCTAACCATTTCTCAATTAAATAATTAATTTTAATTTATAAGCC < 2:728215/150‑1 ATTGCGAGGTTCTTTAATTTTCAGCGCCAGTGCAATGAAATTATTACTCTTGCGAATAACACCGGTATTAACACCCTTGATGCTTATGGCCATGTAGGTTCTCCCTAACCATTTCTCAATTAAATAATTAATTTTAATTTATAAGCCAGA > 1:635160/1‑150 ATTGCGAGGTTCTTTAATTTTCAGCGCCAGTGCAATGAAATTATTACTCTTGCGAATAACACCGGTATTAACACCCTTGATGCTTATGGCCATGTAGGTTCTCCCTAACCATTTCTCAATTAAATAATTAATTTTAATTTATAAGCCAGA > 2:229129/1‑150 TTGCGAGGTTCTTTAATTTTCAGCGCCAGTGCAATGAAATTATTACTCTTGCGAATAACACCGGTATTAACACCCTTGATGCTTATGGCCATGTAGGTTCTCCCTAACCATTTCTCAATTAAATAATTAATTTTAATTTATAAGCCAGAT < 2:446854/150‑1 AAAATTAATTATTTAATTGAGAAATGGTTAGGGAGAACCTACATGGCCATAAGCATCAAGGGTGTTAATACCGGTGTTATTCGCAAGAGTAATAATTTCATTGCACTGGCGCTGAAAATTAAAGAACCTCGCAATAAAGAATCGTTGTTCTTTAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/4374276‑4374122 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttctttatTGCGAGGTTCTTTAATTTTCAGCGCCAGTGCAATGAAATTATTACTCTTGCGAATAACACCGGTATTAACACCCTTGATGCTTATGGCCATGTAGGTTCTCCCTAACCATTTCTCAATTAAATAATTAATTTTAATTTATAAGCCAGAT > NC_000913/4374144‑4374292 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |