New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 157673 | 67 (0.730) | 5 (0.060) | 4/262 | NT | 7.0% | coding (60/480 nt) | folK | 2‑amino‑4‑hydroxy‑6‑ hydroxymethyldihydropteridine diphosphokinase |
? | NC_000913 | = 157701 | 69 (0.790) | coding (32/480 nt) | folK | 2‑amino‑4‑hydroxy‑6‑ hydroxymethyldihydropteridine diphosphokinase |
CTTCAGGTGCAAGAGAGGTTTCCAGCGCCACGGCTGCGTTTAAGTAATCGGGTTGATCTTGCGGCCCCAGCGGTGGGGTGCGGTAAAACGAAGAAACGGTAAGAATGTGGCTTTCAGGGATATCGCCTAATGCTTTCAGGGCAGCATTGACCTGCTCCAGCGGAGAGGCCAGATTGCTGCCTATGGCAATATACGCCACTGTCATGCGGTACCCTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTACGACGACGCGGTGACGGTTCTTCATCCAGCTCGTTGAGCATCCC > NC_000913/157528‑157821 | ctTCAGGTGCAAGAGAGGTTTCCAGCGCCACGGCTGCGTTTAAGTAATCGGGTTGATCTTGCGGCCCCAGCGGTGGGGTGCGGTAAAACGAAGAAACGGTAAGAATGTGGCTTTCAGGGATATCGCCTAATGCTTTCAGGGCAGCATTGa > 2:170926/1‑150 (MQ=255) ttCAGGTGAAAGATAGGTATACAGAGACACCGATTCGTTTAAGAAATCGGCTAGATCTTCCTCCCCCAAAGATGGGTTGAGGTAAAAAGAAGAAACGGTAAGAATGTGGCTTTCAGGGATATCGCCTAATGCTTTCAGGGCAGCATTGAc > 2:571130/1‑150 (MQ=255) gCAAGAGAGGTTTCCAGCGCCACGGCTGCGTTTAAGTAATCGGGTTGATCTTGCGGCCCCAGCGGTGGGGTGCGGTAAAACGAAGAAACGGTAAGAATGTGGCTTTCAGGGATATCGCCTAATGCTTTCAGGGCAGCATTGACCTGCTcc > 2:281290/1‑150 (MQ=255) agagGTTTCCAGCGCCACGGCTGCGTTTAAGTAATCGGGTTGATCTTGCGGCCCCAGCGGTGGGGTGCGGTAAAACGAAGAAACGGTAAGAATGTGGCTTTCAGGGATATCGCCTAATGCTTTCAGGGCAGCATTGACCTGCTCCAGCgg < 2:970691/150‑1 (MQ=255) ggTTTCCAGCGCCACGGCTGCGTTTAAGTAATCGGGTTGATCTTGCGGCCCCAGCGGTGGGGTGCGGTAAAACGAAGAAACGGTAAGAATGTGGCTTTCAGGGATATCGCCTAATGCTTTCAGGGCAGCATTGACCTGCTCCAGCGgaga > 2:216933/1‑150 (MQ=255) ccAGCGCCACGGCTGCGTTTAAGTAATCGGGTTGATCTTGCGGCCCCAGCGGTGGGGTGCGGTAAAACGAAGAAACGGTAAGAATGTGGCTTTCAGGGATATCGCCTAATGCTTTCAGGGCAGCATTGACCTGCTCCAGCGGAGAGGCCa < 1:117898/150‑1 (MQ=255) ccAGCGCCACGGCTGCGTTTAAGTAATCGGGTTGATCTTGCGGCCCCAGCGGTGGGGTGCGGTAAAACGAAGAAACGGTAAGAATGTGGCTTTCAGGGATATCGCCTAATGCTTTCAGGGCAGCATTGACCTGCTCCAGCGGAGAGGCCa < 1:529164/150‑1 (MQ=255) cAGCGCCACGGCTGCGTTTAAGTAATCGGGTTGATCTTGCGGCCCCAGCGGTGGGGTGCGGTAAAACGAAGAAACGGTAAGAATGTGGCTTTCAGGGATATCGCCTAATGCTTTCAGGGCAGCATTGACCTGCTCCAGCGGAGAGGCCAg > 2:1061297/1‑150 (MQ=255) 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atCGCCTAATGCTTTCAGGGCAGCATTGACCTGCTCCAGCGGAGAGGCCAGATTGCTGCCTATGGCAATATACGCCACTGTCATGCGGTACCCTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTACGACGACGCGGTGACGGttct > 1:1554822/1‑150 (MQ=255) gCCTAATGCTTTCAGGGCAGCATTGACCTGCTCCAGCGGAGAGGCCAGATTGCTGCCTATGGCAATATACGCCACTGTCATGCGGTACCCTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTACGACGACGCGGTGACGGTTCTTCa > 2:151697/1‑150 (MQ=255) aaTGCTTTCAGGGCAGCATTGACCTGCTACAGCGGAGAGGCCAGATtgctgccctgaaagcattaggcgatatccctgaaagccacattcttaccgtttcttcgttttaccgcaccccacagctggggccgcaagatcaacccgattact < 1:410896‑M2/150‑105 (MQ=255) tGCTTTCAGGGCAGCATTGACCTGCTCAAGCGGAGAGGCCAGATTGCTGCCTATGGCAATATACGCCACTGTCATGCGGTACCCTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTACGACGACGCGGTGACGGTTCTTCATCCAGc < 1:571130/150‑1 (MQ=255) cTTTCAGGGCAGCATTGACCTGCTCCAGCGGAGAGGCCAGATtgctgccctgaaagcattaggcgatatccctgaaagccacattcttaccgtttcttcgttttaccgcaccccaccgctggggccgcaagatcaacccgattacttaaa < 1:1195094‑M2/150‑109 (MQ=255) cTTTCAGGGCAGCATTGACCTGCTCCAGCGGAGAGGCCAGATtgctgccctgaaagcattaggcgatatccctgaaagccacattcttaccgtttcttcgttttaccgcaccccaccgctggggccgcaagatcaacccgattacttaaa < 1:1333277‑M2/150‑109 (MQ=255) cTTTCAGGGCAGCATTGACCTGCTCCAGCGGAGAGGCCAGATTGCTGCCTATGGCAATATACGCCACTGTCATGCGGTACCCTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTACGACGACGCGGTGACGGTTCTTCATCCAGCTc > 1:1367208/1‑150 (MQ=255) cTTTCAGGGCAGCATTGACCTGCTCCAGCGGAGAGGCCAGATTGCTGCCTATGGCAATATACGCCACTGTCATGCGGTACCCTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTACGACGACGCGGTGACGGTTCTTCATCCAGCTc > 1:517174/1‑150 (MQ=255) tttCAGGGCAGCATTGACCTGCTCCAGCGGAGAGGCCAGATtgctgccctgaaagcattaggcgatatccctgaaagccacattcttaccgtttcttcgttttaccgcaccccaccgctggggccgcaagatcaacccgattacttaaac < 1:1176069‑M2/150‑110 (MQ=255) tttCAGGGCAGCATTGACCTGCTCCAGCGGAGAGGCCAGATTGCTGCCTATGGCAATATACGCCACTGTCATGCGGTACCCTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTACGACGACGCGGTGACGGTTCTTCATCCAGCTCg > 2:1243430/1‑150 (MQ=255) cAGGGCAGCATTGACCTGCTCCAGCGGAGAGGCCAGATTGCTGCCTATGGCAATATACGCCACTGTCATGCGGTACCCTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGATGACGAGTACGACGACGCGGTGACGGTTCTTCATCCAGCTCGTTg < 2:1334417/150‑1 (MQ=255) aGGGCAGCATTGACCTGCTCCAGCGGAGAGGCCAGATtgctgccctgaaagcattaggcgatatccctgaaagccacattcttaccgtttcttcgttttaccgcaccccaccgctggggccgcaagatcaacccgattacttaaacgcag < 2:49502‑M2/150‑114 (MQ=255) gggCAGCATTGACCTGCTCCAGCGGAGAGGCCAGATTGCTGCCTATGGCAATATACGCCACTGTCATGCGGTACCCTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTACGACGACGCGGTGACGGTTCTTCATCCAGCTCGTTGAg < 2:1021626/150‑1 (MQ=255) gggCAGCATTGACCTGCTCCAGCGGAGAGGCCAGATTGCTGCCTATGGCAATATACGCCACTGTCATGCGGTACCCTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTACGACGACGCGGTGACGGTTCTTCATCCAGCTCGTTGAg > 1:279173/1‑150 (MQ=255) GGCAGCATTGACCTGCTCCAGCGGAGAGGCCAGATTGCTGCCTATGGCAATATACGCCACTGTCATGCGGTACCCTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTACGACGACGCGGTGACGGTTCTTCATCCAGCTCGTTGAGc < 1:161455‑M1/150‑1 (MQ=255) gcagcaatctggcctctccgctggagcaggtcaatgctgccctgaaagcattaggcgatatccctgaaagccacattcttaccgtttcttcgttttaccgcaccccaccgctggggccgcaagatcaacccgattacttaaacgc < 1:1568514‑M1/145‑140 (MQ=255) gcagcaatctggcctctccgctggagcaggtcaatgctgccctgaaagcattaggcgatatccctgaaagccacattcttaccgtttcttcgttttaccgcaccccaccgctggggccgcaagatcaacccgattacttaaacgc > 2:1568514‑M1/1‑6 (MQ=255) gcagcaaactggcctctccgctggagcaggtcaatgctgccctgaaagcataaggcgatatccctgaaagccacattcttaccgtttcttcgatttaccgcaccccaccgctggggccgcaagatcaacccgattacttaaacgcacccg > 2:854397‑M1/1‑6 (MQ=255) GCAGCATTGACCTGCTCCAGCGGAGAGGCCAGATTGCTGCCTATGGCAATATACGCCACTGTCATGCGGTACCCTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTACGACGACGCGGTGACGGTTCTTCCTCCAGCTCGTTGAGCa < 2:1165007‑M1/150‑1 (MQ=255) GCAGCATTGACCTGCTCCAGCGGAGAGGCCAGATTGCTGCCTATGGCAATATACGCCACTGTCATGCGGTACCCTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTACGACGACGCGGTGACGGTTCTTCATCCAGCTCGTTGAGCa > 1:216933‑M1/1‑150 (MQ=255) GCAGCATTGACCTGCTCCAGCGGAGAGGCCAGATTGCTGCCTATGGCAATATACGCCACTGTCATGCGGTACCCTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTACGACGACGCGGTGACGGTTCTTCATCCAGCTCGTTGAGCa > 2:13436‑M1/1‑150 (MQ=255) gcaatctggcctctccgctggagcaggtcaatgctgccctgaaagcattaggcgatatccctgaaagccacattcttaccgtttcttcgttttaccgcaccccaccgctggggccgcaagatcaacccgattacttaaacgcagccgtgg < 2:133437‑M1/150‑148 (MQ=255) caatctggcctctccgctggagcaggtcaatgctgccctgaaagcattaggcgatatccctgaaagccacattcttaccgtttcttcgttttaccgcaccccaccgctggggccgcaagatcaacccgattacttaaacgcagccgtggc > 1:170926‑M1/1‑2 (MQ=255) CATTGACCTGCTCCAGCGGAGAGGCCAGATTGCTGCCTATGGCAATATACGCCACTGTCATGCGGTACCCTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTACGACGACGCGGTGACGGTTCTTCATCCAGCTCGTTGAGCATccc < 2:5222‑M1/150‑1 (MQ=255) | CTTCAGGTGCAAGAGAGGTTTCCAGCGCCACGGCTGCGTTTAAGTAATCGGGTTGATCTTGCGGCCCCAGCGGTGGGGTGCGGTAAAACGAAGAAACGGTAAGAATGTGGCTTTCAGGGATATCGCCTAATGCTTTCAGGGCAGCATTGACCTGCTCCAGCGGAGAGGCCAGATTGCTGCCTATGGCAATATACGCCACTGTCATGCGGTACCCTCACGACGTGGTGCGCGTTTGCGTGGACGACGAGTACGACGACGCGGTGACGGTTCTTCATCCAGCTCGTTGAGCATCCC > NC_000913/157528‑157821 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |