New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | 1203942 = | 70 (0.760) | 5 (0.060) | 5/258 | NT | 7.3% | coding (121/339 nt) | ymfM | e14 prophage; protein YmfM |
? | NC_000913 | 1203972 = | 62 (0.720) | coding (151/339 nt) | ymfM | e14 prophage; protein YmfM |
ATTGCTTCTGGTTGTGGAGAAACTAACGCATGAACAGTTTAACAACACACTACCGTCGCTCGCAACTGATTGCGCTTCCTGTACCGGGTGGAAAAGCGAAGGTGGAATATTGCTATGCAGTGAATGTACCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGGCTGTGGGTGATTTCAACCGGCAGAAGGAGACAGTCCTTTGCGACAAGTTAACCGCTGGTTCAAAGATCACTACGGAGTGCCCGTCAGAGTCATTCGTTGGGAGCCGGAAACACAACGGGTTATCTAC > NC_000913/1203793‑1204090 | gaagcattcatgctcataaccttcgcggaggtagataacccgttgtgtttccggctcccaacgaatgactctgacgggcactccgtagtgatctttgaaccagcggttaacttgtcgcaaaggactgtctccttctgccggttgaaatca < 2:1386919‑M1/1‑1 (MQ=255) tGCTTCTGGTTGTGGAGAAACTAACGCATGAACAGTTTAACAACACACTACCGTCGCTCGCAACTGATTGCGCTTCCTGTACCGGGTGGAAAAGCGAAGGTGGAATATTGCTATGCAGTGAATGTACCAGGTGACAGGGAAATTGTAAcc < 2:443684/150‑1 (MQ=255) cTTCTGGTTGTGGAGAAACTAACGCATGAACAGTTTAACAACACACTACCGTCGCTCGCAACTGATTGCGCTTCCTGTACCGGGTGGAAAAGCGAAGGTGGAATATTGCTATGCAGTGAATGTACCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCca > 2:829717/1‑150 (MQ=255) attcatgctcataaccttcgcggaggtagataacccgttgtgtttccggctcccaacgaatgactctgacgggcactccgtagtgatctttgaaccagcggttaacttgtcgcaaaggactgtctccttctgccggttgaaatcACCcac < 1:892109‑M1/6‑1 (MQ=255) attcatgctcataaccttcgcggaggtagataacccgttgtgtttccggctcccaacgaatgactctgacgggcactccgtagtgatctttgaaccagcggttaacttgtcgcaaaggactgtctccttctgccggttgaaatcACCcac > 1:481820‑M1/145‑150 (MQ=255) tCTGGTTGTGGAGAAACTAACGCATGAACAGTTTAACAACACACTACCGTCGCTCGCAACTGATTGCGCTTCCTGTACCGGGTGGAAAAGCGAAGGTGGAATATTGCTATGCAGTGAATGTACCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCcaca > 2:531353/1‑150 (MQ=255) catgctcataaccttcgcggaggtagataacccgttgtgtttccggctcccaacgaatgactctgacgggcactccgtagtgatctttgaaccagcggttaacttgtcgcaaaggactgtctccttctgccggttgaaatcACCCACAGc > 2:1201565‑M1/142‑150 (MQ=255) catgctcataaccttcgcggaggtagataacccgttgtgtttccgactcccaacgaatgactctgacgggcactccgtagtgatctttgaaccagcggttaacttgtcgcaaaggactgtctccttctgccggttgaaatcACCCACAGc > 1:1475424‑M1/142‑150 (MQ=255) ggTTGTGGAGAAACTAACGCATGAACAGTTTAACAACACACTACCGTCGCTCGCAACTGATTGCGCTTCCTGTACCGGGTGGAAAAGCGAAGGTGGAATATTGCTATGCAGTGAATGTACCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCCACAGCt > 1:1016555/1‑150 (MQ=255) tgtgGAGAAACTAACGCATGAACAGTTTAACAACACACTACCGTCGCTCGCAACTGATTGCGCTTCCTGTACCGGGTGGAAAAGCGAAGGTGGAATATTGCTATGCAGTGAATGTACCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCCACAGCTTTg > 2:594138/1‑150 (MQ=255) gagaAACTAACGCATGAACAGTTTAACAACACACTACCGTCGCTCGCAACTGATTGCGCTTCCTGTACCGGGTGGAAAAGCGAAGGTGGAATATTGCTATGCAGTGAATGTACCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCCACAGCTTTGCaga > 1:506557/1‑150 (MQ=255) cTAACGCATGAACAGTTTAACAACACACTACCGTCGCTCGCAACTGATTGCGCTTCCTGTACCGGGTGGAAAAGCGAAGGTGGAATATTGCTATGCAGTGAATGTACCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGGc < 1:528527/150‑1 (MQ=255) cTAACGCATGAACAGTTTAACAACACACTACCGTCGCTCGCAACTGATTGCGCTTCCTGTACCGGGTGGAAAAGCGAAGGTGGAATATTGCTATGCAGTGAATGTACCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGGc < 1:432454/150‑1 (MQ=255) cTAACGCATGAACAGTTTAACAACACACTACCGTCGCTCGCAACTGATTGCGCTTCCTGTACCGGGTGGAAAAGCGAAGGTGGAATATTGCTATGCAGTGAATGTACCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGGc < 2:973499/150‑1 (MQ=255) cTAACGCATGAACAGTTTAACAACACACTACCGTCGCTCGCAACTGATTGCGCTTCCTGTACCGGGTGGAAAAGCGAAGGTGGAATATTGCTATGCAGTGAATGTACCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGGc < 2:59516/150‑1 (MQ=255) aaCGCATGAACAGTTTAACAACACACTACCGTCGCTCGCAACTGATTGCGCTTCCTGTACCGGGTGGAAAAGCGAAGGTGGAATATTGCTATGCAGTGAATGTACCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGGCtg > 2:118608/1‑150 (MQ=255) aCGCATGAACAGTTTAACAACACACTACCGTCGCTCGCAACTGATTGCGCTTCCTGTACCGGGTGGAAAAGCGAAGGTGGAATATTGCTATGCAGTGAATGAACCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGGCtgt < 2:1238463/150‑1 (MQ=255) cGCATGAACAGTTTAACAACACACTACCGTCGCTCGCAACTGATTGCGCTTCCTGTACCGGGTGGAAAAGCGAAGGTGGAATATTGCTATGCAGTGAATGTACCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGGCtgtg > 1:106931/1‑150 (MQ=255) 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tAACAACACACTACCGTCGCTCGCAACTGATTGCGCTTCCTGTACCGGGTGGAAAAGCGAAGGTGGAATATTGCTATGCAGTGAATGTACCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGGCTGTGGGTGATTTCAAcc > 1:1342731/1‑150 (MQ=255) tAACAACACACTACCGTCGCTCGCAACTGATTGCGCTTCCTGTACCGGGTGGAAAAGCGAAGGTGGAATATTGCTATGCAGTGAATGTACCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGGCTGTGGGTGATTTCAAcc < 1:1628304/150‑1 (MQ=255) tAACAACACACTACCGTCGCTCGCAACTGATTGCGCTTCCTGTACCGGGTGGAAAAGCGAAGGTGGAATATTGCTATGCAGTGAATGTACCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGGCTGTGGGTGATTTCAAcc > 1:1305742/1‑150 (MQ=255) aacaacACACTACCGTCGCTCGCAACTGATTGCGCTTCCTGTACCGGGTGGAAAAGCGAAGGTGGAATATTGCTATGCAGTGAATGTACCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGGCTGTGGGTGAt > 1:139573/1‑142 (MQ=255) aacaacACACTACCGTCGCTCGCAACTGATTGCGCTTCCTGTACCGGGTGGAAAAGCGAAGGTGGAATATTGCTATGCAGTGAATGTACCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGGCTGTGGGTGAt < 2:139573/142‑1 (MQ=255) aacaacACACTACCGTCGCTCGCAACTGATTGCGCTTCCTGTACCGGGTGGAAAAGCGAAGGTGGAATATTGCTATGCAGTGAATGTACCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGGCTGTGGGTGATTTCCACCg > 2:1271956/1‑150 (MQ=255) aacaacACACTACCGTCGCTCGCAACTGATTGCGCTTCCTGTACCGGGTGGAAAAGCGAAGGTGGAATATTGCTATGCAGTGAATGTACCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGGCTGTGGGTGATTTCAACCg < 2:1002621/150‑1 (MQ=255) caacaCACTACCGTCGCTCGCAACTGATTGCGCTTCCTGTACCGGGTGGAAAAGCGAAGGTGGAATATTGCTATGCAGTGAATGTACCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGGCTGTGGGTGATTTCAACCGGc < 1:137065/150‑1 (MQ=255) aacaCACTACCGTCGCTCGCAACTGATTGCGCTTCCTGTACCGGGTGGAAAAGCGAAGGTGGAATATTGCTATGCAGTGAATGTACCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGGCTGTGGGTGATTTCAACCGGCa < 2:1305742/150‑1 (MQ=255) acacacTACCGTCGCTCGCAACTGATTGCGCTTCCTGTACCGGGTGGAAAAGCGAAGGTGGAATATTGCTATGCAGTGAATGTACCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGGCTGTGGGTGATTTCAACCGGCAg < 2:1342731/150‑1 (MQ=255) 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gTGACAGGGAAATTGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGGCTGTGGGTGATTTCAACCGGCAGAAGGAGACAGTCCTTTGCGACAAGTTAACCGCTGGTTCAAAGATCACTACGGAGTGCCCGTCAGAGTCATTCGTTGGGAGCCGGAAac > 1:1217215/1‑150 (MQ=255) cAGGGAAATTGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGGCTGTGGGTGATTTCAACCGGCAGAAGGAGACAGTCCTTTGCGACAAGTTAACCGCTGGTTCAAAGATCACTACGGAGTGCCCGTCAGAGTCATTCGTTGGGAGCCGGAAACACaa > 1:1306969/1‑150 (MQ=255) aaaTTGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGGCTGTGGGTGATTTCAACCGGCAGAAGGAGACAGTCCTTTGCGACAAGTTAACCGCTGGTTCAAAGATCACTACGGAGTGCCCGTCAGAGTCATTCGTTGGGAGCCGGAAACACAACGGGt > 2:682251/1‑150 (MQ=255) aaTTGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGGCTGTGGGTGATTTCAACCGGCAGAAGGAGACAGTCCTTTGCGACAAGTTAACCGCTGGTTCAAAGATCACTACGGAGTGCCCGTCAGAGTCATTCGTTGGGAGCCGGAAACACAACGGGtt < 2:510069/150‑1 (MQ=255) ttGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGGCTGTGGGTGATTTCAACCGGCAGAAGGAGACAGTCCTTTGCGACAAGTTAACCGCTGGTTCAAAGATCACTACGGGGTGCCCGTCAGAGTCATTCGTTGGGAGCCGGAAACACAACGGGTTAt > 1:190422/1‑150 (MQ=255) ttGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGGCTGTGGGTGATTTCAACCGGCAGAAGGAGACAGTCCTTTGCGACAAGTTAACCGCTGGTTCAAAGATCACTACGGAGTGCCCGTCAGAGTCATTCGTTGGGAGCCGGAAACACAACGGGTTAt < 1:829717/150‑1 (MQ=255) tGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGGCTGTGGGTGATTTCAACCGGCAGAAGGAGACAGTCCTTTGCGACAAGTTAACCGCTGGTTCAAAGATCACTACGGAGTGCCCGTCAGAGTCATTCGTTGGGAGCCGGAAACACAACGGGTTATc < 2:643921/150‑1 (MQ=255) gTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGGCTGTGGGTGATTTCAACCGGCAGAAGGAGACAGTCCTTTGCGACAAGTTAACCGCTGGTTCAAAGATCACTACGGAGTGCCCGTCAGAGTCATTCGTTGGGAGCCGGAAACACAACGGGTTATCt < 1:1085196/150‑1 (MQ=255) gTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGGCTGTGGGTGATTTCAACCGGCAGAAGGAGACAGTCCTTTGCGACAAGTTAACCGCTGGTTCAAAGATCACTACGGAGTGCCCGTCAGAGTCATTCGTTGGGAGCCGGAAACACAACGGGTTATCt > 1:1075342/1‑150 (MQ=255) aaCCCACAGCTTTGCAGAGTGGGCTGTGGGTGATTTCAACCGGCAGAAGGAGACAGTCCTTTGCGACAAGTTAACCGCTGGTTCAAAGATCACTACGGAGTGCCCGTCAGAGTCATTCGTTGGGAGCCGGAAACACAACGGGTTATCTAc < 1:679963/150‑1 (MQ=255) | ATTGCTTCTGGTTGTGGAGAAACTAACGCATGAACAGTTTAACAACACACTACCGTCGCTCGCAACTGATTGCGCTTCCTGTACCGGGTGGAAAAGCGAAGGTGGAATATTGCTATGCAGTGAATGTACCAGGTGACAGGGAAATTGTAACCCACAGCTTTGCAGAGTGGGCTGTGGGTGATTTCAACCGGCAGAAGGAGACAGTCCTTTGCGACAAGTTAACCGCTGGTTCAAAGATCACTACGGAGTGCCCGTCAGAGTCATTCGTTGGGAGCCGGAAACACAACGGGTTATCTAC > NC_000913/1203793‑1204090 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |