New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 1425331 | 74 (0.800) | 6 (0.070) | 5/264 | NT | 7.5% | intergenic (+92/‑46) | trkG/ynaK | Rac prophage; K(+) transporter TrkG/Rac prophage; ParB‑like nuclease domain‑containing protein YnaK |
? | NC_000913 | = 1425343 | 77 (0.870) | intergenic (+104/‑34) | trkG/ynaK | Rac prophage; K(+) transporter TrkG/Rac prophage; ParB‑like nuclease domain‑containing protein YnaK |
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
CGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGGTTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCAAGGCTGTATGAGCGAGAAATTAAAGATAGTCTATCGCCCATTACAAGAATTGTCACCGTATGCGCACAACGCCAGGACGCACAGTACTGAGCAGGTGGCACAACTGGTA > NC_000913/1425183‑1425478 | cGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGGTTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGt > 2:9149/1‑150 (MQ=255) cTTTAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGTTTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGc < 1:1593535/150‑1 (MQ=255) cTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGGTTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGc > 1:1499809/1‑150 (MQ=255) ttGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGGTTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATATTTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCa > 2:111644/1‑150 (MQ=255) aTTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGGTTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGgc < 1:1124505/150‑1 (MQ=255) tCCTGTTATTATATTGTTTTCAGGTTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGctg > 2:757625‑M2/1‑147 (MQ=255) ccTGTTATTATATTGTTTTCAGGTTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGctgg > 2:606339‑M2/1‑146 (MQ=255) ccTGTTATTATATTGTTTTCAGGTTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGctgg > 1:934394‑M2/1‑146 (MQ=255) cTGTTATTATATTGTTTTCAGGTTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGcagccagtgctactggg < 2:440080‑M1/150‑18 (MQ=255) cTGTTATTATATTGTTTTCAGGTTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGctggg < 2:766293‑M2/150‑6 (MQ=255) cTGTTATTATATTGTTTTCAGGTTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCGGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGcagccagtgctactggg < 2:1619152‑M1/150‑18 (MQ=255) tattatATTGTTTTCAGGTTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGctggg < 2:239433‑M2/146‑6 (MQ=255) tattatATTGTTTTCAGGTTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGctggg > 1:239433‑M2/1‑141 (MQ=255) ttatTGTTTTCAGGTTTTTTTTGGCTGTCCTAATATATTGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTGACTCATTGATCCAATACCTAACTTTAACAGCAACACCTCGGTCACCAGTAGCAATGGCTGCTGTGGTGCGttt < 2:100104/149‑1 (MQ=255) atatTGTTTTCAGGTTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGttt > 2:431925/1‑150 (MQ=255) tatTGTTTTCAGGTTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGtttt > 1:748885/1‑150 (MQ=255) atTGTTTTCAGGTTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGcagccagtgctactggggacggaggtg < 1:1126927‑M1/150‑28 (MQ=255) atTGTTTTCAGGTTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTa > 2:1451294/1‑150 (MQ=255) ttGTTTTCAGGTTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTAt < 2:73961/150‑1 (MQ=255) gTTTTCAGGTTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTc < 2:1217697/150‑1 (MQ=255) ttttCAGGTTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCa < 1:1451294/150‑1 (MQ=255) ttCAGGTTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGAGTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATa < 1:1079287/150‑1 (MQ=255) tCAGGTTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGcagccagtgctactggggacggaggtgttgctgg < 2:587127‑M1/150‑35 (MQ=255) cAGGTTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTg < 1:1182904/135‑1 (MQ=255) cAGGTTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTg > 2:1182904/1‑135 (MQ=255) ggTTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGc > 1:830768/1‑150 (MQ=255) ggTTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGc > 1:258448/1‑150 (MQ=255) tttGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATATTTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCAAGGCTg < 1:111644/150‑1 (MQ=255) 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ccAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGctggggacggaggtgttgctggtaaagttaggtattggatcaatgagtgagtcaacataatattaaactcacaattataaatcagccatatattaggagcgccaaaaaaaacctga < 2:587127‑M2/150‑117 (MQ=255) cAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCAAGGCTGTATGAGCGAGAAATTAAAGATAGTCTATCGCCCATTACAAGAATTGTCACCGTATGCGCACAACGCCAGGACGCACAGTACTGAg < 1:805043/150‑1 (MQ=255) aGCCACCCCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCAAGGCTGTATGAGCGAGAAATTAAAGATAGTCTATCGCCCAGTAAAACAATTGTCACCGTATGCGCACACCGCCCGGACGCACCGTACTGAGc > 2:714108/1‑150 (MQ=255) gCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCAAGGCTGTATGAGCGAGAAATTAAAGATAGTCTATCGCCCATTACAAGAATTGTCACCg > 1:104490/1‑115 (MQ=255) gCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCAAGGCTGTATGAGCGAGAAATTAAAGATAGTCTATCGCCCATTACAAGAATTGTCACCg < 2:104490/115‑1 (MQ=255) gCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCAAGGCTGTATGAGCGAGAAATTAAAGATAGTCTATCGCCCATTACAAGAATTGTCACCGTATGCGCACAACGCCAGGACGCACAGTACTGAGCa > 2:173456/1‑150 (MQ=255) acacCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCAAGGCTGTATGAGCGAGAAATTAAAGATAGTCTATCGCCCATTACAAGAATTGTCACCGTATGCGCACAACGCCAGGACGCACAGTACTGAGCAGGt > 1:382802/1‑150 (MQ=255) cacCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGctggggacggaggtgttgctggtaaagttaggtattggatcaatgagtgagtcaacataatattaaactcacaattataaatcagccatatattaggagcgccaaaaaaaacctgaaaacaat < 1:1126927‑M2/150‑124 (MQ=255) acCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCAAGGCTGTATGAGCGAGAAATTAAAGATAGTCTATCGCCCATTACAAGAATTGTCACCGTATGCGCACAACGCCAGGACGCACAGTACTGAGCAGGTgg > 1:914063/1‑150 (MQ=255) ccTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCAAGGCTGTATGAGCGAGAAATTAAAGATAGTCTATCGCCCATTACAAGAATTGTCACCGTATGCGCACAACGCCAGGACGCACAGTACTGAGCAGGTGGc < 1:1086174/150‑1 (MQ=255) ccccAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCAAGGCTGTATGAGCGAGAAATTAAAGATAGTCTATCGCCCATTACAAGAATTGTCACCGTATGCGCACAACGCCAGGACGCACAGTACTGAGCAGGTGGCACAACTg > 1:868206/1‑150 (MQ=255) cccAGcagccagtgctactggggacggaggtgttgctggtaaagttaggtattggatcaatgagtgagtcaacataatattaaactcacaattataaatcagccatatattaggagcgccaaaaaaaacctgaaaacaatataataacag < 2:766293‑M1/150‑146 (MQ=255) cccAGcagccagtgctactggggacggaggtgttgctggtaaagttaggtattggatcaatgagtgagtcaacataatattaaactcacaattataaatcagccatatattaggagcgccaaaaaaaacctgaaaacaatataata > 1:239433‑M1/1‑5 (MQ=255) cccAGcagccagtgctactggggacggaggtgttgctggtaaagttaggtattggatcaatgagtgagtcaacataatattaaactcacaattataaatcagccatatattaggagcgccaaaaaaaacctgaaaacaatataata < 2:239433‑M1/146‑142 (MQ=255) cccAGTAGCACTGGCTGctggggacggaggtgttgctggtaaagttaggtattggatcaatgagtgagtcaacataatattaaactcacaattataaatccgccatatattaggagcgccaaaaaaaacctgaaaacaatataataacag < 2:1619152‑M2/150‑134 (MQ=255) cccAGTAGCACTGGCTGctggggacggaggtgttgctggtaaagttaggtattggatcaatgagtgagtcaacataatattaaactcacaattataaatcagccatatattaggagcgccaaaaaaaacctgaaaacaatataataacag < 2:440080‑M2/150‑134 (MQ=255) ccAGcagccagtgctactggggacggaggtgttgctggtaaagttaggtattggatcaatgagtgagtcaacataatattaaactcacaattataaatcagccatatattaggagcgccaaaaaaaacctgaaaacaatataataacagg > 2:606339‑M1/1‑4 (MQ=255) ccAGcagccagtgctactggggacggaggtgttgctggtaaagttaggtattggatcaatgagtgagtcaacataatattaaactcacaattataaatcagccatatattaggagcgccaaaaaaaacctgaaaacaatataataacagg > 1:934394‑M1/1‑4 (MQ=255) cagcagccagtgctactggggacggaggtgttgctggtaaagttaggtattggatcaatgagtgagtcaacataatattaaactcacaattataaatcagccatatattaggagcgccaaaaaaaacctgaaaacaatataataacagga > 2:757625‑M1/1‑3 (MQ=255) gTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCAAGGCTGTATGAGCGAGAAATTAAAGATAGTCTATCGCCCATTACAAGAATTGTCACCGTATGCGCACAACGCCAGGACGcaca > 1:1174090/1‑122 (MQ=255) gTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCAAGGCTGTATGAGCGAGAAATTAAAGATAGTCTATCGCCCATTACAAGAATTGTCACCGTATGCGCACAACGCCAGGACGcaca < 2:1174090/122‑1 (MQ=255) | CGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGGTTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCAAGGCTGTATGAGCGAGAAATTAAAGATAGTCTATCGCCCATTACAAGAATTGTCACCGTATGCGCACAACGCCAGGACGCACAGTACTGAGCAGGTGGCACAACTGGTA > NC_000913/1425183‑1425478 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |