| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | 2042116 = | 94 (1.020) | 12 (0.140) | 9/256 | NT | 13.4% | intergenic (+91/‑252) | zinT/yodB | metal‑binding protein ZinT/putative cytochrome |
| ? | NC_000913 | 2042149 = | 68 (0.800) | intergenic (+124/‑219) | zinT/yodB | metal‑binding protein ZinT/putative cytochrome | |||||
Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
CGTATTATCCATATCAGTTGAGTAGCGAAGAAGTGGTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGA‑CGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTGGTTACAATA > NC_000913/2041967‑2042261 | ttttaataatttgttatttaaaaaattgatagtgcatattgtaaccagccaatataagcaatggcgtgagcacaggtatctttctctgttggccgtattgtgtatggaatccgttattggttaactcaatgcgggttagcttattaatat < 1:313574‑M1/1‑1 (MQ=255)cGTATTATCCATATCAGTTGAGTAGCGAAGAAGTGGTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAagctagct < 1:83567/150‑1 (MQ=255) tttaataatttgttatttaaaaaattgatagtgcatattgtaaccagccaatataagcaatggcgtgagcacaggtatctttctctgttggccgtattgtgtatggaatccgttattggttaactcaatgcgggttagcttattaatata < 2:1028113‑M1/2‑1 (MQ=255) tattatCCATATCTGTTGAGTAGCGAAGAAGTGGTCGAGGAAATGATGTCTCATTTAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAgctagctaa < 1:207465/150‑2 (MQ=255) tattatCCATATCAGTTGAGTAGCGAAGAAGTGGTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTAc < 1:995669/150‑1 (MQ=255) aataatttgttatttaaaaaattgatagtgcatattgtaaccagccaatataagcaatggcgtgagcacaggtatctttctctgttggccgtattgtgtatggaatccgttattggttaactcaatgcgggttagcttattaataTACAg > 1:976728‑M1/146‑150 (MQ=255) tatCCATATCAGTTGAGTAGCGAAGAAGTGGTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGa < 1:314997/150‑1 (MQ=255) tatCCATATCAGTTGAGTAGCGAAGAAGTGGTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGa > 2:240393/1‑150 (MQ=255) atCCATATCAGTTGAGTAGCGAAGAAGTGGTCGAGGAAATGATGTCTCATTTAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACTCAAGCTAGCTACAGac > 1:450811/1‑150 (MQ=255) aattttttatttaaaaaattgatattgcatattgtaaccagccaatataagcaatggcgtgagcacaggtatctttctctgttggccgtattgtgtatggaatccgttattggttaactcaatgcgggttagcttattaataTACAGaca > 1:472725‑M1/143‑150 (MQ=255) aatttgttatttaaaaaattgatagtgcatattgtaaccagccaatataagcaatggcgtgagcacaggtatctttctctgttggccgtattgtgtatggaatccgttattggttaactcaatgcgggttagcttattaataTACAGaca > 1:1445123‑M1/143‑150 (MQ=255) ccATATCAGTTGAGTAGCGAAGAAGTGGTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGacac > 2:1085621/1‑150 (MQ=255) tttgttatttaaaaaattgatagtgcatattgtaaccagccaatataagcaatggcgtgagcacaggtatctttctctgttggccgtattgtgtatggaatccgttattggttaactcaatgcgggttagcttattaataTACAGACACg > 1:1419171‑M1/141‑150 (MQ=255) atatCAGTTGAGTAGCGAAGAAGTGGTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGc < 2:55357/150‑1 (MQ=255) cAGTTGAGTAGCGAAGAAGTGGTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCtcat > 2:1149159/1‑150 (MQ=255) gTTGAGTAGCGAAGAAGTGGTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCtcatca < 1:1083736/150‑1 (MQ=255) gTTGAGTAGCGAAGAAGTGGTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCtcatca < 1:1216042/150‑1 (MQ=255) gTTGAGTAGCGAAGAAGTGGTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCtcatca < 1:1479314/150‑1 (MQ=255) gattAGCGAAGAAGTGGTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTa < 1:208191/147‑1 (MQ=255) aGTAGCGAAGAAGTGGTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTAt < 2:1128614/150‑1 (MQ=255) aGTAGCGAAGAAGTGGTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTAt < 1:509779/150‑1 (MQ=255) gTAGCGAAGAAGTGGTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATg > 2:287246/1‑150 (MQ=255) tAGCGAAGAAGTGGTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGa < 1:341780/150‑1 (MQ=255) 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atagtgcatattgtaaccagccaatataagcaatggcgtgagcacaggtatctttctctgttggccgtattgtgtatggaatccgttattggttaactcaatgcgggttagcttattaataTACAGACACGCTCATCACTATGA‑CGTGTc > 1:630287‑M1/122‑150 (MQ=255) agtgcatattgtaaccagccaatataagcaatggtgtgagcacaggtatctttctctgttggccgtattgtgtatggaatccgttattggttaactcaatgcgggttagcttattaataTACAGACACGCTCATCACTATGA‑CGTGTCTg > 1:541609‑M1/120‑150 (MQ=255) aagTGGTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGA‑CGTGTCTg < 1:84172/150‑1 (MQ=255) aagTGGTCGAGGAAATGATCTCTCATTCAGTATTCTCATGATAAAGACTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCAATCCACAAAAGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACCCGCTCATCACTATGA‑CGTGTATg > 2:368640/1‑150 (MQ=255) tGGTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACG‑TCATAGTGATGAGCGTGTCTGtag < 1:1079178/150‑2 (MQ=255) gcatattgtaaccagccaatataagcaatggcgtgagcacaggtatctttctctgttggccgtattgtgtatggaatccgttattggttaactcaatgcgggttagcttattaataTACAGACACGCTCATCACTATGA‑CGTGTCTGtat > 2:1370981‑M1/117‑150 (MQ=255) ggTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCATCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACTCCACTGAACGCAATCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGA‑CGTGTCTGtata < 2:712422/150‑1 (MQ=255) tCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGA‑CGTGTCTGTATAtt < 1:249242/150‑1 (MQ=255) tCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGA‑CGTGTCTGTATAtt > 2:1286307/1‑150 (MQ=255) gcGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGA‑CGTGTCTGTATAtt < 1:1624068/149‑1 (MQ=255) 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aaaCGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGA‑CGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCt > 2:313574/1‑150 (MQ=255) cacaGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGA‑CGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATAtt > 2:464338/1‑150 (MQ=255) cACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGA‑CGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATAtt < 1:287246/150‑1 (MQ=255) cTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGA‑CGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTgg < 2:1527711/150‑1 (MQ=255) gAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGA‑CGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCAt < 1:220194/93‑1 (MQ=255) gAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGA‑CGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCAt > 2:220194/1‑93 (MQ=255) 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tagctaCAGACACGCTCATCACTATGA‑CGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTGGTTACAata > 1:11553/1‑150 (MQ=255) | CGTATTATCCATATCAGTTGAGTAGCGAAGAAGTGGTCGAGGAAATGATGTCTCATTGAGTATTCTCATGATAACGCCTCGATGCCGCTTTAGTAAGTTATCATAACTGCCACTGGTCCATCCACAAACGCCACTGAACGCAAGCTAGCTACAGACACGCTCATCACTATGA‑CGTGTCTGTATATTAATAAGCTAACCCGCATTGAGTTAACCAATAACGGATTCCATACACAATACGGCCAACAGAGAAAGATACCTGTGCTCACGCCATTGCTTATATTGGCTGGTTACAATA > NC_000913/2041967‑2042261 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |