| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
GTTTTCTTTCCGCTAACCAGACGCTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCATGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTACTTAATCTTAACCAGCGTACCGTCAGCAGCATTATGACGTCGCGCCACGATATTGAGCATATCGATCTCAACGCGCCGGAAGAAGAAATCCGCCAGTTGCTGGAGCGAAATCAGCATACGCG > NC_000913/2138611‑2138905 | gTTTTCTTTCCGCTAACCAGACGCTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCATGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAgg > 2:1226587/1‑150 (MQ=255) gtttcAGCTAAGCATACGCTTGGCGAGCGGACTACAGAAGCGGTAATGCGGCTGGTTAGCGTGCAAAAAGAATATGCGGAAGTGGACGCGGATACCGCGTCCATGCTGGTGGATCATGGTAACGAGGAGATCTTTAATGGGGAGGAAcgg < 2:600195/149‑1 (MQ=255) ccGCTAACCAGACGCTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCATGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGgcgga < 2:1483720‑M2/150‑6 (MQ=255) 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aaCCAGACGCTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGACTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCATGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCcgttcctgcggattaaa < 1:840554‑M1/150‑18 (MQ=255) aCCAGACGCTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCATGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCcgttcctgcggattaaag < 2:1584913‑M1/150‑19 (MQ=255) aCCAGACGCTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCATGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTg < 1:1558454/150‑1 (MQ=255) aCCAGACGCTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCATGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTg < 1:1223246/150‑1 (MQ=255) ccAGACGCTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCATGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCcgttcctgcggattaaaga < 2:1089148‑M1/150‑20 (MQ=255) aGACGCTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCATGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGc > 1:426762/1‑150 (MQ=255) gACGCTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCATGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCg > 2:925015/1‑150 (MQ=255) cGCTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGAGCATGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCggg < 1:1222443/150‑1 (MQ=255) gCTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCATGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGt > 1:301923/1‑150 (MQ=255) cTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCATGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTa < 2:445061/150‑1 (MQ=255) 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tCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTACTTAATCTTAACCAGCGTACCGTCAGCAGCATTATGACGTCGCGCCACGATATTGAGCATATCGATCTCAACGCGCCGGAAGAAGAAATCCGCCAGTTGCTGGAGCGAAATc > 1:393835/1‑150 (MQ=255) tCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTACTTAATCTTAACCAGCGTACCGTCAGCAGCATTATGACGTCGCGCCACGATATTGAGCATATCGATCTCAACGCGCCGGAAGAAGAAATCCGCCAGTTGCTGGAGCGAAATc > 1:606559/1‑150 (MQ=255) cTTTAATCCGCAGGAACGgcggattaaagatctgctggttaccatgatccaccagcatggacgcggtttcggcgtccagttccgcatcttctttttgcccgctaagcaggcgcattaccgcttcggtagtccgctggcgcagcgtctggt < 2:1584913‑M2/150‑133 (MQ=255) cTTTAATCCGCAGGAACGgcggattaaagatctgctggttaccatgatccaccagcatggacgcggtttcggcg < 2:293869‑M2/74‑57 (MQ=255) cTTTAATCCGCAGGAACGgcggattaaagatctgctggttaccatgatccaccagcatggacgcggtttcggcg > 1:293869‑M2/1‑18 (MQ=255) tttAATCCGCAGGAACGgcggattaaagatctgctggttaccatgatccaccagcatggacgcggtttcggcgtccagttccgcatcttctttttgcccgctaagcaggcgcattaccgcttcggtagtccgctggcgcagcgtctggtt < 1:1551419‑M2/150‑134 (MQ=255) tttAATCCGCAGGAACGgcggattaaagatctgctggttaccatgatccaccagcatggacgcggtttcggcgtccagttccgcatcttctttttgcccgctaagcaggcgcattaccgcttcggtagtccgctggcgcagcgtctggtt < 1:163369‑M2/150‑134 (MQ=255) tttAATCCGCAGGAACGgcggattaaagatctgctggttaccatgatccaccagcatggacgcggtttcggcgtccagttccgcatcttctttttgcccgctaagcaggcgcattaccgcttcggtagtccgctggcgcagcgtctggtt < 1:153782‑M2/150‑134 (MQ=255) tttAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTACTTAATCTTAACCAGCGTACCGTCAGCAGCATTATGACGTCGCGCCACGATATTGAGCATATCGATCTCAACGCGCCGGAAGAAGAAATCCGCCAGTTGCTGGAGCGAAATCAg > 1:1372683/1‑150 (MQ=255) ttAATCCGCAGGAACGgcggattaaagatctgctggttaccatgatccaccagcatggacgcggtttcggcgtccagttccgcatcttctttttgcccgctaagcaggcgcattaccgcttcggtagtccgctggcgcagcgtctggtta < 1:1608320‑M2/150‑135 (MQ=255) tAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTACTTAATCTTAACCAGCGTACCGTCAGCAGCATTATGACGTCGCGCCACGATATTGAGCATATCGATCTCAACGCGCCGGAAGAAGAAATCCGCCAGTTGCTGGAGCGAAATCAGCa > 1:1434733/1‑150 (MQ=255) tCCGCcgttcctgcggattaaagatctgctggttaccatgatccaccagcatggacgcggtttcggcgtccagttccgcatcttctttttgcccgctaagcaggcgcattaccgcttcggtagtccgctggcgcagcgtctggttagcgg < 2:1483720‑M1/150‑146 (MQ=255) cGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTACTTAATCTTAACCAGCGTACCGTCAGCAGCATTATGACGTCGCGCCACGATATTGAGCATATCGATCTCAACGCGCCGGAAGAAGAAATCCGCCAGTTGCTGGAGCGAAATCAGCATAcgc > 2:733720/1‑150 (MQ=255) gCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTACTTAATCTTAACCAGCGTACCGTCAGCAGCATTATGACGTCGCGCCACGATATTGAGCATATCGATCTCAACGCGCCGGAAGAAGAAATCCGCCAGTTGCTGGAGCGAAATCAGCATAcgcg > 1:84642/1‑150 (MQ=255) gCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTACTTAATCTTAACCAGCGTACCGTCAGCAGCATTATGACGTCGCGCCACGATATTGAGCATATCGATCTCAACGCGCCGGAAGAAGAAATCCGCCAGTTGCTGGAGCGAAATCAGCATAcgcg < 1:1466863/150‑1 (MQ=255) | GTTTTCTTTCCGCTAACCAGACGCTGCGCCAGCGGACTACCGAAGCGGTAATGCGCCTGCTTAGCGGGCAAAAAGAAGATGCGGAACTGGACGCCGAAACCGCGTCCATGCTGGTGGATCATGGTAACCAGCAGATCTTTAATCCGCAGGAACGGCGGATGATTGAGCGGGTACTTAATCTTAACCAGCGTACCGTCAGCAGCATTATGACGTCGCGCCACGATATTGAGCATATCGATCTCAACGCGCCGGAAGAAGAAATCCGCCAGTTGCTGGAGCGAAATCAGCATACGCG > NC_000913/2138611‑2138905 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |