New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 2435278 = | 77 (0.830) | 4 (0.050) | 4/266 | NT | 5.2% | coding (359/813 nt) | truA | tRNA pseudouridine(38‑40) synthase |
? | NC_000913 | 2435305 = | 73 (0.820) | coding (332/813 nt) | truA | tRNA pseudouridine(38‑40) synthase |
GGCACTGCACCGCACGGAACGAGGTGAAATCATTCTCGCCCAGCAAGCATTGCGCAGCCCGATGCATCCGTTCAGCGTCCAGCGGTTCGTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTAGATGATGTAGCGATAACGGCGAGCCGTGGCGCTAAATCGGGCATGAAAATCATCAGGTACAGTTTTAACCCAACGCACAGCGATGTCACCAGGTAAATTCGCATTTACGCCCAAGGTCCACGCCGCGTCTTTGCGCAGCGCGGTTGTTTCGAAATGC > NC_000913/2435129‑2435427 | ggggtacacggtaccgggcaggttgtgcatttcgaaacaaccgcgctgcgcaaagacgcggcgtggaccttgggcgtaaatgcgaatttacctggtgacatcgctgtgcgttgggttaaaactgtacctgatgattttcatgcccgattt > 1:1033591‑M1/150‑150 (MQ=255) ggggtacacggtaccgggcaggttgtgcatttcgaaacaaccgcgctgcgcaaagacgcggcgtggaccttgggcgtaaatgcgaatttacctggtgacatcgctgtgcgttgggttaaaactgtacctgatgattttcatgcccgattt > 1:1027916‑M1/150‑150 (MQ=255) ggggtacacggtaccgggcaggttgtgcatttcgaaacaaccgcgctgcgcaaagacgcggcgtggaccttgggcgtaaatgcgaatttacctggtgacatcgctgtgcgttgggttaaaactgtacctgatgattttcatgcccgattt > 1:1504158‑M1/150‑150 (MQ=255) ggCACTGCACCGCACGGAACGAGGTGAAATCATTCTCGCCCAGCAAGCATTGCGCAGCCCGATGCATCCGTTCAGCGTCCAGCGGTTCGTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTAGATGATGt > 2:607736/1‑150 (MQ=255) gggtacacggtaccgggcaggttgtgcatttcgaaacaaccgcgctgcgcaaagacgcggcgtggaccttgggcgtaaatgcgaatttacctggtgacatcgctgtgcgttgggttaaaactgtacctgatgattttcatgcccgattTa > 1:1073896‑M1/149‑150 (MQ=255) cACTGCACCGCACGGAACGAGGTGAAATCATTCTCGCCCAGCAAGCATTGCGCAGCCCGATGCATCCGTTCAGCGTCCAGCGGTTCGTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTAGATGATGTAg > 1:524965/1‑150 (MQ=255) cACTGCACCGCACGGAACGAGGTGAAATCATTCTCGCCCAGCAAGCATTGCGCAGCCCGATGCATCCGTTCAGCGTCCAGCGGTTCGTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTAGATGATGTAg > 2:532882/1‑150 (MQ=255) cACTGCACCGCACGGAACGAGGTGAAATCATTCTCGCCCAGCAAGCATTGCGCAGCCCGATGCATCCGTTCAGCGTCCAGCGGTTCGTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTAGATGATGTAg > 1:646059/1‑150 (MQ=255) aCTGCACCGCACGGAACGAGGTGAAATCATTCTCGCCCAGCAAGCATTGCGCAGCCCGATGCATCCGTTCAGCGTCCAGCGGTTCGTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTAGATGATGTAGc > 1:336791/1‑150 (MQ=255) aCTGCACCGCACGGAACGAGGTGAAATCATTCTCGCCCAGCAAGCATTGCGCAGCCCGATGCATCCGTTCAGCGTCCAGCGGTTCGTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTAGATGATGTAGc < 1:532882/150‑1 (MQ=255) tacacggtaccgggcaggttgtgcatttcgaaacaaccgcgctgcgcaaagacgcggcgtggaccttgggcgtaaatgcgaatttacctggtgacatcgctgtgcgttgggttaaaactgtacctgatgattttcatgcccgattTAGCg > 2:1545300‑M1/146‑150 (MQ=255) tGCACCGCACGGAACGAGGTGAAATCATTCTCGCCCAGCAAGCATTGCGCAGCCCGATGCATCCGTTCAGCGTCCAGCGGTTCGTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTAGATGATGTAGCGa < 1:1348302/150‑1 (MQ=255) aCCGCACGGAACGAGGTGAAATCATTCTCGCCCAGCAAGCATTGCGCAGCCCGATGCATCCGTTCAGCGTCCAGCGGTTCGTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTAGATGATGTAGCGATaa > 2:504655/1‑150 (MQ=255) gCACGGAACGAGGTGAAATCATTCTCGCCCAGCAAGCATTGCGCAGCCCGATGCATCCGTTCAGCGTCCAGCGGTTCGTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTAGATGATGTAGCGATAACgg > 2:818429/1‑150 (MQ=255) gAGGTGAAATCATTCTCGCCCAGCAAGCATTGCGCAGCCCGATGCATCCGTTCAGCGTCCAGCGGTTCGTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTAGATGATGTAGCGATAACGGCGAGCCGTg < 2:1579347/150‑1 (MQ=255) ggTGAAATCATTCTCGCCCAGCAAGCATTGCGCAGCCCGATGCATCCGTTCAGCGTCCAGCGGTTCGTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTAGATGATGTAGCGATAACGGCGAGCCGTGgc < 2:231420/150‑1 (MQ=255) ggTGAAATCATTCTCGCCCAGCAAGCATTGCGCAGCCCGATGCATCCGTTCAGCGTCCAGCGGTTCGTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTAGATGATGTAGCGATAACGGCGAGCCGTGgc > 1:1601058/1‑150 (MQ=255) gTGAAATCATTCTCGCCCAGCAAGCATTGCGCAGCCCGATGCATCCGTTCAGCGTCCAGCGGTTCGTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTAGATGATGTAGCGATAACGGCGAGCCGTGgcg < 2:924146/150‑1 (MQ=255) 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aaTCATTCTCGCCCAGCAAGCATTGCGCAGCCCGATGCATCCGTTCAGCGTCCAGCGGTTCGTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCCCAGCCGATGATTGTAGATGATGTAGTGATAACGGCGAGCCGTGGCGCTaa > 1:325816/1‑150 (MQ=255) ttCTCCCCCAGCAAGCATTGCGCAGCCCGATGCATCCGTTCAGCGTCCAGCGGTTCGTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGCCGCAGCCGATGATTGTAGATGATTTATCGATAACGGCGAGCCGTGGCGCTAAATCgg < 2:345637/150‑1 (MQ=255) tctcGCCCAGCAAGCATTGCGCAGCCCGATGCATCCGTTCAGCGTCCAGCGGTTCGTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTAGATGATGTAGCGATAACGGCGAGCCGTGGCGCTAAATCggg < 1:443691/150‑1 (MQ=255) gCCCAGCAAGCATTGCGCAGCCCGATGCATCCGTTCAGCGTCCAGCGGTTCGTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTAGATGATGTAGCGATAACGGCGAGCCGTGGCGCTAAATCGGGCATg > 1:219468/1‑150 (MQ=255) ccAGCAAGCATTGCGCAGCCCGATGCATCCGTTCAGCGTCCAGCGGTTCGTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTAGATGATGTAGCGATAACGGCGAGCCGTGGCGCTAAATCGGGCATGaa > 2:1209782/1‑150 (MQ=255) accgcgctgcgcaaagacgcggcgtggaccttgggcgtaaatgcgaatttacctggtgacatcgctgtgcgttgggttaaaactgtacctgatgattttcatgcccgattTAGCGATAACGGCGAGCCGTGGCGCTAAATCGGGc < 1:594624‑M1/35‑1 (MQ=255) accgcgctgcgcaaagacgcggcgtggaccttgggcgtaaatgcgaatttacctggtgacatcgctgtgcgttgggttaaaactgtacctgatgattttcatgcccgattTAGCGATAACGGCGAGCCGTGGCGCTAAATCGGGc > 2:594624‑M1/111‑145 (MQ=255) caagcaTTGCGCAGCCCGATGCATCCGTTCAGCGTCCAGCGGTTCGTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCTCAGCCGATGATTGTAGATGATGTAGCGATAACGGCGAGCCGTGGCGCTAAATCGGGCATGAAAatc < 2:931307/150‑1 (MQ=255) gcaTTGCGCAGCCCGATGCATCCGTTCAGCGTCCAGCGGTTCGTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTAGATGATGTAGCGATAACGGCGAGCCGTGGCGCTAAATCGGGCATGAAAatcatc > 1:181606/1‑150 (MQ=255) gcaTTGCGCAGCCCGATGCATCCGTTCAGCGTCCAGCGGTTCGTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTAGATGATGTAGCGATAACGGCGAGCCGTGGCGCTAAATCGGGCATGAAAatcatc < 1:573490/150‑1 (MQ=255) 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ccgccgGGCGCAGCCGATGATTGTAGATGATGTAGCGATAACGGCGAGCCGTGGCGCTAAATCGGGCATGAAAATCATCAGGTACAGTTTTAACCCAACGCACAGCGATGTCACCAGGTAAATTCGCATTTACGCCCAAGGTCCAcgccg > 2:1111381/1‑150 (MQ=255) gccgGGCGCAGCCGATGATTGTAGATGATGTAGCGATAACGGCGAGCCGTGGCGCTAAATCGGGCATGAAAATCATCAGGTACAGTTTTAACCCAACGCACAGCGATGTCACCAGGTAAATTCGCATTTACGCCCAAGGTCCACGCcgcg > 2:507734/1‑150 (MQ=255) ggCGCAGCCGATGATTGTAGATGATGTAGCGATAACGGCGAGCCGTGGCGCTAAATCGGGCATGAAAATCATCAGGTACAGTTTTAACCCAACGCACAGCGATGTCACCAGGTAAATTCGCATTTACGCCCAAGGTCCACGCCGCGTCtt < 1:1209782/150‑1 (MQ=255) aGCCGATGATTGTAGATGATGTAGCGATAACGGCGAGCCGTGGCGCTAAATCGGGCATGAAAATCATCAGGTACAGTTTTAACCCAACGCACAGCGATGTCACCAGGTAAATTCGCATTTACGCCCAAGGTCCACGCCGCGTCTTTgcgc < 2:1361058/150‑1 (MQ=255) gCCGATGATTGTAGATGATGTAGCGATAACGGCGAGCCGTGGCGCTAAATCGGGCATGAAAATCATCAGGTACAGTTTTAACCCAACGCACAGCGATGTCACCAGGTAAATTCGCATTTACGCCCAAGGTCCACGCCGCGTCTTTGCGCa > 1:815786/1‑150 (MQ=255) gCCGATGATTGTAGATGATGTAGCGATAACGGCGAGCCGTGGCGCTAAATCGGGCATGAAAATCATCAGGTACAGTTTTAACCCAACGCACAGCGATGTCACCAGGTAAATTCGCATTTACGCCCAAGGTCCACGCCGCGTCTTTGCGCa < 1:579276/150‑1 (MQ=255) gCCGATGATTGTAGATGATGTAGCGATAACGGCGAGCCGTGGCGCTAAATCGGGCATGAAAATCATCAGGTACAGTTTTAACCCAACGCACAGCGATGTCACCAGGTAAATTCGCATTTACGCCCAAGGTCCACGCCGCGTCTTTGCGCa > 2:1350631/1‑150 (MQ=255) atgatTGTAGATGATGTAGCGATAACGGCGAGCCGTGGCGCTAAATCGGGCATGAAAATCATCAGGTACAGTTTTAACCCAACGCACAGCGATGTCACCAGGTAAATTCGCATTTACGCCCAAGGTCCACGCCGCGTCTTTGCGCAgcgc < 1:1121537/150‑1 (MQ=255) atgatgTAGCGATAACGGCGAGCCGTGGCGCTAAATCGGGCATGAAAATCATCAGGTACAGTTTTAACCCAACGCACAGCGATGTCACCAGGTAAATTCGCATTTACGCCCAAGGTCCACGCCGCGTCTTTGCGCAGCGCGGTTGTTTCg < 1:946118/150‑1 (MQ=255) tgatgTAGCGATAACGGCGAGCCGTGGCGCTAAATCGGGCATGAAAATCATCAGGTACAGTTTTAACCCAACGCACAGCGATGTCACCAGGTAAATTCGCATTTACGCCCAAGGTCCACGCCGCGTCTTTGCGCAGCGCGGTTGTTTCGa < 2:468114/150‑1 (MQ=255) atgTAGCGATAACGGCGAGCCGTGGCGCTAAATCGGGCATGAAAATCATCAGGTACAGTTTTAACCCAACGCACAGCGATGTCACCAGGTAAATTCGCATTTACGCCCAAGGTCCACGCCGCGTCTTTGCGCAGCGCGGTTGTTTCGaaa < 1:1446437/150‑1 (MQ=255) tgTAGCGATAACGGCGAGCCGTGGCGCTAAATCGGGCATGAAAATCATCAGGTACAGTTTTAACCCAACGCACAGCGATGTCACCAGGTAAATTCGCATTTACGCCCAAGGTCCACGCCGCGTCTTTGCGCAGCGCGGTTGTTTCGAAAt < 1:874584/150‑1 (MQ=255) tgTAGCGATAACGGCGAGCCGTGGCGCTAAATCGGGCATGAAAATCATCAGGTACAGTTTTAACCCAACGCACAGCGATGTCACCAGGTAAATTCGCATTTACGCCCAAGGTCCACGCCGCGTCTTTGCGCAGCGCGGTTGTTTCGAAAt < 2:251934/150‑1 (MQ=255) TAGCGATAACGGCGCGCCCTGGCGCTAAATCGGGCATGAAAATCATCAGGTACAGTTTTAACCCAACGCACAGCGATGTCACCAGGTAAATTCGCATTTACGCCCAAGGTCCACGCCGCGTCTTTGCGCAGCGCGGTTGTTTCGAAATGc < 2:827357‑M1/150‑1 (MQ=255) TAGCGATAACGGCGAGCCGTGGCGCTAAATCGGGCATGAAAATCATCAGGTACAGTTTTAACCCAACGCACAGCGATGTCACCAGGTAAATTCGCATTTACGCCCAAGGTCCACGCCGCGTCTTTGCGCAGCGCGGTTGTTTCGAAATGc > 1:857572‑M1/1‑150 (MQ=255) | GGCACTGCACCGCACGGAACGAGGTGAAATCATTCTCGCCCAGCAAGCATTGCGCAGCCCGATGCATCCGTTCAGCGTCCAGCGGTTCGTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTAGATGATGTAGCGATAACGGCGAGCCGTGGCGCTAAATCGGGCATGAAAATCATCAGGTACAGTTTTAACCCAACGCACAGCGATGTCACCAGGTAAATTCGCATTTACGCCCAAGGTCCACGCCGCGTCTTTGCGCAGCGCGGTTGTTTCGAAATGC > NC_000913/2435129‑2435427 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |