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Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
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gCGGGTCGCATGACCGCCAGCGTTGCGGGCGatgcgacccgctttagtgccggagatggtggctttgccccgctatcggctcctttattccgctatcaccagcagcttaaacagcagctcgacccttgcggcgtgtttaaccccggtcgc < 2:741681‑M2/150‑120 (MQ=255) gCGGGTCGCATGACCGCCAGCGTTGCGGGCGATGCGATGGATTTGATTGTCCTCGGCTGTCGATTTCAGCCAGCGTAACGCCCCGCCCCAGTCGATCAGTTGCTCGCCGGGTAAATCCATCATCGGCGCATCACTGGGTAATGAAATgcg > 2:482766/1‑150 (MQ=255) gggTCGCATGACCGCCAGCGTTGCGGGCGatgcgacccgctttagtgccggagatggtggctttgccccgctatcggctcctttattccgctatcaccagcagcttaaacagcagctcgacccttgcggcgtgtttaaccccggtcgcat < 1:559994‑M2/150‑122 (MQ=255) gggTCGCATGACCGCCAGCGTTGCGGGCGatgcgacccgctttagtgccggagatggtggctttgccccgctatcggctcctttattccgctatcaccagcagcttaaacagcagctcgacccttgcggcgtgtttaac < 2:641738‑M2/139‑111 (MQ=255) gggTCGCATGACCGCCAGCGTTGCGGGCGatgcgacccgctttagtgccggagatggtggctttgccccgctatcggctcctttattccgctatcaccagcagcttaaacagcagctcgacccttgcggcgtgtttaac > 1:641738‑M2/1‑29 (MQ=255) gggTCGCATGACCGCCAGCGTTGCGGGCGATGCGATGGATTTGATTGTCCTCGGCTGTCGATTTCAGCCAGCATAACGCCCCGCCCCAGTCAATCAGTTGCTCGCCGGGTAAATCCATCATCGGCGCATCACTGGGTAATGAAATGCGcc < 1:1099099/150‑1 (MQ=255) gTCGCATGACCGCCAGCGTTGCGGGCGatgcgacccgctttagtgccggagatggtggctttgccccgctatcggctcctttattccgctatcaccagcagcttaaacagcagctcgacccttgcggcgtgtttaaccccggtcgcatgt < 1:1294806‑M2/150‑124 (MQ=255) tCGCATGACCGCCAGCGTTGCGGGCGgtcatgcgacccgcttaagtgacggagatggtgtctttgccccgctatcggctcctttattcctctatcaccagcagcttaaacagcagctcgacccttgcggcgtgtttaacccccgtagcat < 2:1438854‑M2/150‑125 (MQ=255) cGCATGACCGCCAGCGTTGCGGGCGATGCGATGGATTTGATTGTCCTCGGCTGTCGATTTCAGCCAGCGTAACGCCCCGCCCCAGTCGATCAGTTGCTCGCCGGGTAAATCCATCATCGGCGCATCACTGGGTAATGAAATGCGCCATaa < 1:646953/150‑1 (MQ=255) gCATGACCGCCAGCGTTGCGGGCGatgcgacccgctttagtgccggagatggtggctttgccccgctatcggctcctttattccgctatcaccagcagcttaaacagcagctagacccttgcggcgtgtttaaccccggtcgcttgtacc < 2:471039‑M2/150‑127 (MQ=255) gCATGACCGCCAGCGTTGCGGGCGATGCGATGGATTTGATTGTCCTCGGCTGTCGATTTCAGCCAGCGTAACGCCCCGCCCCAGTCGATCAGTTGCTCGCCGGGTAAATCCATCATCGGCGCATCACTGGGTAATGAAATGCGCCATAAg > 1:1162003/1‑150 (MQ=255) cATcgcccgcaacgctggcggtcatgcgacccgctttagtgccggagatggtggctttgccccgctatcggctcctttattccgctatcaccagcagcttaaacagcagctcgacccttgcggcgtgtttaaccccggtcgcatgtacgc > 1:1289111‑M1/1‑3 (MQ=255) cATGACCGCCAGCGTTGCGGGCGATGCGATGGATTTGATTGTCCTCGGCTGTCGATTTCAGCCAGCGTAACGCCCCGCCCCAGTCGATCAGTTGCTCGCCGGGTAAATCCATCATCGGCGCATCACTGGGTAATGAAATGCGCCATAAgg > 1:230445/1‑150 (MQ=255) cATGACCGCCAGCGTTGCGGGCGATGCGATGGATTTGATTGTCCTCGGCTGTCGATTTCAGCCAGCGTAACGCCCCGCCCCAGTCGATCAGTTGCTCGCCGGGTAAATCCATCATCGGCGCATCACTGGGTAATGAAATGCGCCATAAgg > 1:1159816/1‑150 (MQ=255) aTGACCGCCAGTGTTGCGGGCGATGCGATGGATTTGATTGTCCTCGGCTGTCGATTTCAGCCAGCGTAACGCCCCGCCCCAGTCGATCAGTTGCTCGCCGGGTAAATCCATCATCGGCGCATCACTGGGTAATGAAATGCGCCATAAGGt > 2:684515/1‑150 (MQ=255) aTGACCGCCAGCGTTGCGGGCGATGCGATGGATTTGATTGTCCTCGGCTGTCGATTTCAGCCAGCGTAACGCCCCGCCCCAGTCGATCAGTTGCTCGCCGGGTAAATCCATCATCGGCGCATCACTGGGTAATGAAATGCGCCATAAGGt > 1:221866/1‑150 (MQ=255) tcgcccgcaacgctggcggtcatgcgacccgctttagtgccggagatggtggctttgccccgctatcggctcctttattccgctatcaccagcagcttaaacagcagctcgacccttgcggcgtgtttaaccccggtcgcatgtacgcgg < 2:367453‑M1/150‑150 (MQ=255) | CATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACACGCCGCAAGGGTCGAGCTGCTGTTTAAGCTGCTGGTGATAGCGGAATAAAGGAGCCGATAGCGGGGCAAAGCCACCATCTCCGGCACTAAAGCGGGTCGCATGACCGCCAGCGTTGCGGGCGATGCGATGGATTTGATTGTCCTCGGCTGTCGATTTCAGCCAGCGTAACGCCCCGCCCCAGTCGATCAGTTGCTCGCCGGGTAAATCCATCATCGGCGCATCACTGGGTAATGAAATGCGCCATAAGGTA > NC_000913/3125457‑3125755 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |