| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | = 3218100 | 84 (0.910) | 6 (0.070) | 5/264 | NT | 6.8% | coding (977/1521 nt) | aer | aerotaxis sensor receptor, flavoprotein |
| ? | NC_000913 | = 3218127 | 84 (0.950) | coding (950/1521 nt) | aer | aerotaxis sensor receptor, flavoprotein | |||||
Only 100 of 113 total aligned reads displayed.
CTTCCACCGCCGCATTCAGGGCCAGAATATTGGTCTGAAACGCAATATCGTTAATCAGCGAAGTAATGGTGCCAATGCGCTGGGTACTGTCGGCGATATCGTCCATTGTCTTGATCACCGTGGTCATCGCCTCCCCACCCTGCACTGCCGCATTACTGGCAGTGATTGACAGTTTATCGGCAGCCGACGCCGTGGCAGAGTTCTGTTTCACCGACGCCGCCATTTGGTTCATGGTCGCCACCGTTTGCTGAACGTTATCAACTGTCTGCTGGGTATGTTCGTTCAGTTCATCGGTGCCT > NC_000913/3217951‑3218249 | cTTCCACCGCCGCATTCAGGGCCAGAATATTGGTCTGAAACGCAATATCGTTAATCAGCGAAGTAATGGTGCCAATGCGCTGGGTACTGTCGGCGATATCGTCCATTGTCTTGATCACCGTGGTCATCGCCTCCCCACCCTGCACTGCCG < 2:1113939‑M1/150‑1 (MQ=255) tCCACCGCCGCATTCAGGGCCAGAATATTGGTCTGAAACGCAATATCGTTAATCAGCGAAGTAATGGTGCCAATGCGCTGGGTACTGTCGGCGATATCGTCCATTGTCTTGATCACCGTGGTCATCGCCTCCCCACCCTGCACTGCCGCa > 1:592516/1‑150 (MQ=255) cACCGCCGCATTCAGGGCCAGAATATTGGTCTGAAACGCAATATCGTTAATCAGCGAAGTAATGGTGCCAATGCGCTGGGTACTGTCGGCGATATCGTCCATTGTCTTGATCACCGTGGTCATCGCCTCCCCACCCTGCACTGCCGCAtt > 2:986132/1‑150 (MQ=255) cACCGCCGCATTCAGGGCCAGAATATTGGTCTGAAACGCAATATCGTTAATCAGCGAAGTAATGGTGCCAATGCGCTGGGTACTGTCGGCGATATCGTCCATTGTCTTGATCACCGTGGTCATCGCCTCCCCACCCTGCACTGCCGCAtt < 2:1128292/150‑1 (MQ=255) ccgccgCATTCAGGGCCAGAATATTGGTCTGAAACGCAATATCGTTAATCAGCGAAGTAATGGTGCCAATGCGCTGGGTACTGTCGGCGATATCGTCCATTGTCTTGATCACCGTGGTCATCGCCTCCCCACCCTGCACTGCCGCATTAc > 1:637716/1‑150 (MQ=255) gccgcATTCAGGGCCAGAATATTGGTCTGAAACGCAATATCGTTAATCAGCGAAGTAATGGTGCCAATGCGCTGGGTACTGTCGGCGATATCGTCCATTGTCTTGATCACCGTGGTCATCGCCTCCCCACCCTGCACTGCCGCATTACTg > 2:483016/1‑150 (MQ=255) gccgcATTCAGGGCCAGAATATTGGTCTGAAACGCAATATCGTTAATCAGCGAAGTAATGGTGCCAATGCGCTGGGTACTGTCGGCGATATCGTCCATTGTCTTGATCACCGTGGTCATCGCCTCCCCACCCTGCACTGCCGCATTACTg < 1:124108/150‑1 (MQ=255) ggcgaacAGGGCCAGAATATTGGTCTGAAACGCAATATCGTTAATCAGCGAAGTAATGGTGCCAATGCGCTGGGTACTGTCGGCGATATCGTCCATTGTCTTGATCACCGTGGTCATCGCCTCCCCACCCTGCACTGCCGCATTACTGGc < 1:176849/144‑1 (MQ=255) gcATTCAGGGCCAGAATATTGGTCTGAAACGCAATATCGTTAATCAGCGAAGTAATGGTGCCAATGCGCTGGGTACTGTCGGCGATATCGTCCATTGTCTTGATCACCGTGGTCATCGCCTCCCCACCCTGCACTGCCGCATTACTGGCa < 1:919740/150‑1 (MQ=255) gcATTCAGGGCCAGAATATTGGTCTGAAACGCAATATCGTTAATCAGCGAAGTAATGGTGCCAATGCGCTGGGTACTGTCGGCGATATCGTCCATTGTCTTGATCACCGTGGTCATCGCCTCCCCACCCTGCACTGCCGCAGTACTGGCa > 1:693548/1‑150 (MQ=255) aTTCAGGGCCAGAATATTGGTCTGAAACGCAATATCGTTAATCAGCGAAGTAATGGTGCCAATGCGCTGGGTACTGTCGGCGATATCGTCCATTGTCTTGATCACCGTGGTCATCGCCTCCCCACCCTGCACTGCCGCATTACTGGCAGt > 1:70275/1‑150 (MQ=255) cAGGGCCAGAATATTGGTCTGAAACGCAATATCGTTAATCAGCGAAGTAATGGTGCCAATGCGCTGGGTACTGTCGGCGATATCGTCCATTGTCTTGATCACCGTGGTCATCGCCTCCCCACCCTGCACTGCCGCATTACTGGCAGTGAt > 2:1362663/1‑150 (MQ=255) aGGGCCAGAATATTGGTCTGAAACGCAATATCGTTAATCAGCGAAGTAATGGTGCCAATGCGCTGGGTACTGTCGGCGATATCGTCCATTGTCTTGATCACCGTGGTCATCGCCTCCCCACCCTGCACTGCCGCATTACTGGCAGTGAtt < 1:1122902/150‑1 (MQ=255) 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ttGGTCTGAAACGCAATATCGTTAATCAGCGAAGTAATGGTGCCAATGCGCTGGGTACTGTCGGCGATATCGTCCATTGTCTTGATCACCGTGGTCATCGCCTCCCCACCCTGCACTGCCGCATTACTGGCAGTGATTGACAGTTTATcg < 2:1131941‑M2/150‑3 (MQ=255) ggTCTGAAACGCAATATCGTTAATCAGCGAAGTAATGGTGCCAATGCGGTTGGTAATGTCGGCGATATCGTCCATTGTCTTGTTCACCTTGGTCATCGCGTCTCGACCGTTCACTTCTGCATTAGTTGCAGTGATTGACAGTTTTTCGGc < 2:1291663/150‑1 (MQ=255) gTCTGAAACGCAATATCGTTAATCAGCGAAGTAATGGTGCCAATGCGCTGGGTACTGTCGGCGATATAGTCCATTGTCTTGATCACCGTGGTCATAGCCTCCCCACCCTGCACTGCCGCATTACTGGCAGTGATTGACAGTTTATcggca < 1:1221632‑M2/150‑6 (MQ=255) tCTGAAACGCAATATCGTTAATCAGCGAAGTAATGGTGCCAATGCGCTGGGTACTGTCGGCGATATCGTCCATTGTCTTGATCACCGTGGTCATCGCCTCCCCACCCTGCACTGCCGataaactgtcaatcactgccagtaatgcggcag < 1:1179331‑M1/150‑34 (MQ=255) aaaCGCAATATCGTTAATCAGCGAAGTAATGGTGCCAATGCGCTGGGTACTGTCGGCGATATCGTCCATTGTCTTGATCACCGTGGTCATCGCCTCCCCACCCTGCACTGCCGataaactgtcaatcactgccagtaatgcggcagtgca < 1:15825‑M1/150‑38 (MQ=255) 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cccTGCACTGCCGCATTACTGGCAGTGATTGACAGTTTATCGGCAGCCGACGCCGTGGCAGAGTTCTGTTTCACCGACGCCGCCATTTGGTTCATGGTCGCCACCGTTTGCTGAACGTTATCAACTGTCTGCTGGGTATGTTCgttcagt > 2:1425294/1‑150 (MQ=255) cccTGCACTGCCGCATTACTGGCAGTGATTGACAGTTTATCGGCAGCCGACGCCGTGGCAGAGTTCTGTTTCACCGACGCCGCCATTTGGTTCATGGTCGCCACCGTTTGCTGAACGTTATCAACTGTCTGCTGGGTATGTTCgttcagt < 1:1288950/150‑1 (MQ=255) ccTGCACTGCCGCATTACTGGCAGTGATTGACAGTTTATcggcagtgcagggtggggaggcgatgaccacggtgagcaagacaatggacgatatcgccgacagtacccagcgcattggcaccattacttcgctgattaacgaaattgcgt < 2:272305‑M2/150‑112 (MQ=255) tGCACTGCCGCATTACTGGCAGTGATTGACAGTTTATcggcagtgcagggtggggaggcgatgaccacggtgatcaagacaatggacgatatcgccgacagtacccagcgcattggcaccattacttcgctgattaacgatattgcgttt < 1:15825‑M2/150‑114 (MQ=255) cTGCCGCATTACTGGCAGTGATTGACAGTTTATcggcagtgcagggtggggaggcgatgaccacggtgatcaagacaatggacgatatcgccgacagtacccagcgcattggcaccattacttcgctgattaacgatattgcgtttcaga < 1:1184944‑M2/150‑118 (MQ=255) cTGCCGCATTACTGGCAGTGATTGACAGTTTATcggcagtgcagggtggggaggcgatgaccacggtgatcaagacaatggacgatatcgccgacagtacccagcgcattggcaccattacttcgctgattaacgatattgcgtttcaga < 1:1179331‑M2/150‑118 (MQ=255) cTGCCGCATTACTGGCAGTGATTGACAGTTTATCGGCAGCCGACGCCGTGGCAGAGTTCTGTTTCACCGACGCCGCCATTTGGTTCATGGTCGCCACCGTTTGCTGAACGTTATCAACTGTCTGCTGGGTATGTTCGTTCAGTTCATCgg > 2:1067253/1‑150 (MQ=255) tGCCGataaactgtcaatcactgccagtaatgcggcagtgcagggtggggaggctatgaccacggtgatcaagacaatggactatatcgccgacagtacccagcgcattggcaccattacttcgctgattaacgatattgcgtttcagac < 1:1221632‑M1/150‑146 (MQ=255) tGCCGataaactgtcaatcactgccagtaatgcggcagtgcagggtggggaggcgatgaccacggtgatcaagacaatggacgatatcgccgacagtacccagcgcattggcaccattacttcgctgattaacgatattgcgtttcagac > 1:230517‑M1/1‑5 (MQ=255) gCCGataaactgtcaatcactgccagtaatgcggcagtgcagggtggggaggcgatgaccacggtgatcaagacaatggacgatatcgccgacagtacccagcgcattggcaccattacttcgctgattaacgatattgcgtttcagacc > 1:1278887‑M1/1‑4 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |