| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | 3631005 = | 76 (0.860) | coding (1586/1623 nt) | yhiJ | DUF4049 domain‑containing protein YhiJ | |||||
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
GACAAAACGGTATCCATCCTGTTGGATAGCGTTTCACGCCTGTTCAGTTGCAGGAACAGAGCATTCCTTTTTACGTTTTATCAACAGTCTCAACCAGATAGTAACATTAATATTCATGTTGTCTATGGTTCAGAGCTGTAACATTGTGCGCCTTCTAATCAAAGGCATAAGTCCATTTCTGTTTTTTTCATGCTGGTAAGACTTCCAGGGAGTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACGGGCGTTAA > NC_000913/3630839‑3631137 | gggacagttttaggtcttaacgcccgtgacagtaaacatgctggaagaatgttcagcatgcataattgccaaattaaccctggtgcagggcctgagataaccactccctggaagtcttaccagcatgaaaaaaacagaaatggacttatg > 1:1252309‑M1/150‑150 (MQ=255)gggacagttttaggtcttaacgcccgtgacagtaaacatgctggaagaatgttcagcatgcataattgccaaattaaccctggtgcagggcctgagataaccactccctggaagtcttaccagcatgaaaaaaacagaaatggacttatg > 1:1258182‑M1/150‑150 (MQ=255)gACAAAACGGTATCCATCCTGTTGGATAGCGTTTCACGCCTGTTCAGTTGCAGGAACAGAGCATTCCTTTTTACGTTTTATCAACAGTCTCAACCAGATAGTAACATTAATATTCATGTTGTCTATGGTTCAGAGCTGTAACATTGTgcg < 1:290689/150‑1 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aaaaCGGTATCCATCCTGTTGGATAGCGTTTCACGCCTGTTCAGTTGCAGGAACAGAGCATTCCTTTTTACGTTTTATCAACAGTCTCAACCAGATAGTAACATTAATATTCATGTTGTCTATGGTTCAGAGCTGTAACATTGTGCGCCt < 2:334791/150‑1 (MQ=255) cagttttaggtcttaactcccttgacagtaaacatgctggaagaatgttcagcatgcataattgccaaattaaccctggtgcagggcctgagataaccactccctggaagtcttaccagcatgaaaaaaacagaaatggacttatGCCtt > 2:1412505‑M1/146‑150 (MQ=255) aCGGTATCCATCCTGTTGGATAGCGTTTCACGCCTGTTCAGTTGCAGGAACAGAGCATTCCTTTTTACGTTTTATCAACAGTCTCAACCAGATAGTAACATTAATATTCATGTTGTCTATGGTTCAGAGCTGTAACATTGTGCGCCTTCt > 1:1071550/1‑150 (MQ=255) cGGTATCCATCCTGTTGGATAGCGTTTCACGCCTGTTCAGTTGCAGGAACAGAGCATTCCTTTTTACGTTTTATCAACAGTCTCAACCAGATAGTAACATTAATATTCATGTTGTCTATGGTTCAGAGCTGAAACATTGTGCGCCTTCTa < 2:606331/150‑1 (MQ=255) ggTATCCATCCTGTTGGATAGCGTTTCACGCCTGTTCAGTTGCAGGAACAGAGCATTCCTTTTTACGTTTTATCAACAGTCTCAACCAGATAGTAACATTAATATTCATGTTGTCTATGGTTCAGAGCTGTAACATTGTGCGCCTTCTaa < 2:538354/150‑1 (MQ=255) 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tCATGTTGTCTATGGTTCAGAGCTGTAACATTGTGCGCCTTCTAATCAAAGGCATAAGTCCATTTCTGTTTTTTTCATGCTGGTAAGACTTCCAGGGAGTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGa < 1:200417/150‑1 (MQ=255) cTATGGTTCAGAGCTGTAACATTGTGCGCCTTCTAATCAAAGGCATAAGTCCATTTCTGTTTTTTTCATGCTGGTAAGACTTCCAGGGAGTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACAttcttc < 2:619367/150‑1 (MQ=255) tATGGTTCAGAGCTGTAACATTGTGCGCCTTCTAATCAAAGGCATAAGTCCATTTCTGTTTTTTTCATGCTGGTAAGACTTCCAGGGAGTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTcc < 1:277758/150‑1 (MQ=255) tATGGTTCAGAGCTGTAACATTGTGCGCCTTCTAATCAAAGGCATAAGTCCATTTCTGTTTTTTTCATGCTGGTAAGACTTCCAGGGAGTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTcc < 1:1387548/150‑1 (MQ=255) tATGGTTCAGAGCTGTAACATTGTGCGCCTTCTAATCAAAGGCATAAGTCCATTTCTGTTTTTTTCATGCTGGTAAGACTTCCAGGGAGTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTACGCATGCTGAACATTCTTcc < 2:377969/150‑1 (MQ=255) tGGTTCAGAGCTGTAACATTGTGCGCCTTCTAATCAAAGGCATAAGTCCATTTCTGTTTTTTTCATGCTGGTAAGACTTCCAGGGAGTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAg < 2:1306227/150‑1 (MQ=255) ggTTCAGAGCTGTAACATTGTGCGCCTTCTAATCAAAGGCATAAGTCCATTTCTGTTTTTTTCATGCTGGTAAGACTTCCAGGGAGTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGc < 2:354548/150‑1 (MQ=255) cAGAGCTGTAACATTGTGCGCCTTCTAATCAAAGGCATAAGTCCATTTCTGTTTTTTTCATGCTGGTAAGACTTCCAGGGAGTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGt < 1:631175/150‑1 (MQ=255) gagCTGTAACATTGTGCGCCTTCTAATCAAAGGCATAAGTCCATTTCTGTTTTTTTCATGCTGGTAAGACTTCCAGGGAGTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGttt > 1:193142/1‑150 (MQ=255) agCTGTAAGATTGTGCGCCTTCTAATCAAAGGCATAAGTCCATTTCTGTTTTTTTCATGCTGGTAAGACTTCCAGGGAGTGGTTATCTGAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTa < 1:449103/150‑1 (MQ=255) gCTGTAACATTGTGCGCCTTCTAATCAAAGGCATAAGTCCATTTCTGTTTTTTTCATGCTGGTAAGACTTCCAGGGAGTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTAc > 1:1278340/1‑150 (MQ=255) gCTGTAACATTGTGCGCCTTCTAATCAAAGGCATAAGTCCATTTCTGTTTTTTTCATGCTGGTAAGACTTCCAGGGAGTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTAc < 2:1253557/150‑1 (MQ=255) tGTAACATTGTGCGCCTTCTAATCAAAGGCATAAGTCCATTTCTGTTTTTTTCATGCTGGTAAGACTTCCAGGGAGTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTg < 2:907369/150‑1 (MQ=255) gTAACATTGTGCGCCTTCTAATCAAAGGCATAAGTCCATTTCTGTTTTTTTCATGCTGGTAAGACTTCCAGGGAGTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGt > 1:481877/1‑150 (MQ=255) aCATTGTGCGCCTTCTAATCAAAGGCATAAGTCCATTTCTGTTTTTTTCATGCTGGTAAGACTTCCAGGGAGTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCAc < 1:443950/150‑1 (MQ=255) aCATTGTGCGCCTTCTAATCAAAGGCATAAGTCCATTTCTGTTTTTTTCATGCTGGTAAGACTTCCAGGGAGTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCAc > 2:312610/1‑150 (MQ=255) gcgcCTTCTAATCAAAGGCATAAGTCCATTTCTGTTTTTTTCATGCTGGTAAGACTTCCAGGGAGTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACGGGCGtt < 2:1469188/150‑1 (MQ=255) GCCTTCTAATCAAAGGCATAAGTCCATTTCTGTTTTTTTCATGCTGGTAAGACTTCCAGGGAGTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACGGGCGTTaa > 2:1188227‑M1/1‑150 (MQ=255) | GACAAAACGGTATCCATCCTGTTGGATAGCGTTTCACGCCTGTTCAGTTGCAGGAACAGAGCATTCCTTTTTACGTTTTATCAACAGTCTCAACCAGATAGTAACATTAATATTCATGTTGTCTATGGTTCAGAGCTGTAACATTGTGCGCCTTCTAATCAAAGGCATAAGTCCATTTCTGTTTTTTTCATGCTGGTAAGACTTCCAGGGAGTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACGGGCGTTAA > NC_000913/3630839‑3631137 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |