| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 3636691 = | 84 (0.910) | 6 (0.070) | 6/264 | NT | 7.2% | coding (720/1203 nt) | yhiN | putative oxidoreductase YhiN |
| ? | NC_000913 | 3636718 = | 74 (0.840) | coding (693/1203 nt) | yhiN | putative oxidoreductase YhiN | |||||
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
CGCTTCGGTAGATGAACCGCCAGTGTGTTTTTCAGGCTTTGATTCGGATGTGCGTTACGCTGCTCATTCAGGAAGGTTTCGAGGTCCACATCCGGTAGCAGATTGATGCTGACAAATTCCCCCGGTTGCCAGTAGCTTGAAATCTGCAACACCGCCGGTCCAGACAAGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACC > NC_000913/3636542‑3636838 | tcaacgtgctgccgacccgcgcgggtctggtgccattcactctgcataaaccgttgctcgaagagttacaggtgctggcgggcgtggcggtgccttccgtgattaccgctgaaaacggcaccgttttccgtgagaacttactcttcaccc > 2:642201‑M1/150‑150 (MQ=255)cGCTTCGGTAGATGAACCGCCAGTGTGTTTTTCAGGCTTTGATTCGGATGTGCGTTACGCTGCTCATTCAGGAAGGTTTCGAGGTCCACATCCGGTAGCAGATTGATGCTGACAAATTCCCCCGGTTGCCAGTAGCTTGAAATCTGCAac < 2:720478/150‑1 (MQ=255) gCTTCGGTAGATGAACAGCCAGTGTGTTTTTCAGGCTTTGATTCGGATGTGCGTTACGCTGCTCATTCATGAAGGTTTCGAGGTCCACATCCTGTAGCAGATTGATGCTGACAAATTCCCCCGGTTGCCAGTAGCTTGAAATCTGCAaca > 1:1307228/1‑150 (MQ=255) caacgtgctgccgacccgcgcgggtctggtgccattcactctgcataaaccgttgctcgaagagttacaggttctggcgggcgtggcggtgccttccgtgattaccgctgaaaacggcaccgttttccgtgagaacttactcttcaccca < 2:1227410‑M1/2‑1 (MQ=255) caacgtgctgccgacccgcgcgggtctggtgccattcactctgcataaaccgttgctcgaagagttacaggtgctggcgggcgtggcggtgccttccgtgattaccgctgaaaacggcaccgttttccgtgagaacttactcttcaccca < 1:1591379‑M1/2‑1 (MQ=255) ttCGGTAGATGAACCGCCAGTGTGTTTTTCAGGCTTTGATTCGGATGTGCGTTACGCTGCTCATTCAGGAAGGTTTCGAGGTCCACATCCGGTAGCAGATTGATGCTGACAAATTCCCCCGGATGCCAGTAGCTTGAAATCTGCAACAcc > 2:342798/1‑150 (MQ=255) ggTAGATGAACCGCCAGTGTGTTTTTCAGGCTTTGATTCGGATGTGCGTTACGCTGCTCATTCAGGAAGGTTTCGAGGTCCACATCCGGTAGCAGATTGATGCTGACAAATTCCCCCGGTTGCCAGTAGCTTGAAATCTGCAACAccgcc < 2:110677/150‑1 (MQ=255) gTAGATGAACCGCCAGTGTGTTTTTCAGGCTTTGATTCGGATGTGCGTTACGCTGCTCATTCAGGAAGGTTTCGAGGTCCACATCCGGTAGCAGATTGATGCTGACAAATTCCCCCGGTTGCCAGTAGCTTGAAATCTGCAACAccgccg > 1:1109158/1‑150 (MQ=255) aGATGAACCGCCAGTGTGTTTTTCAGGCTTTGATTCGGATGTGCGTTACGCTGCTCATTCAGGAAGGTTTCGAGGTCCACATCCGGTAGCAGATTGATGCTGACAAATTCCCCCGGTTGCCAGTAGCTTGAAATCTGCAACACCGCCGGt > 2:832203/1‑150 (MQ=255) aGATGAACCGCCAGTGTGTTTTTCAGGCTTTGATTCGGATGTGCGTTACGCTGCTCATTCAGGAAGGTTTCGAGGTCCACATCCGGTAGCAGATTGATGCTGACAAATTCCCCCGGTTGCCAGTAGCTTGAAATCTGCAACACCGCCGGt > 2:897389/1‑150 (MQ=255) tGAACCGCCAGTGTGTTTTTCAGGCTTTGATTCGGATGTGCGTTACGCTGCTCATTCAGGAAGGTTTCGAGGTCCACATCCGGTAGCAGATTGATGCTGACAAATTCCCCCGGTTGCCAGTAGCTTGAAATCTGCAACACCGCCGGTCCa > 1:715631/1‑150 (MQ=255) gAACCGCCAGTGTGTTTTTCAGGCTTTGATTCGGATGTGCGTTACGCTGCTCATTCAGGAAGGTTTCGAGGTCCACATCCGGTAGCAGATTGATGCTGACAAATTCCCCCGGTTGCCAGTAGCTTGAAATCTGCAACACCGCCGGTCCAg < 2:1629519/150‑1 (MQ=255) aCCGCCAGTGTGTTTTTCAGGCTTTGATTCGGATGTGCGTTACGCTGCTCATTCAGGAAGGTTTCGAGGTCCACATCCGGTAGCAGATTGATGCTGACAAATTCCCCCGGTTGCCAGTAGCTTGAAATCTGCAACACCGCCGGTCCAGAc > 2:1133653/1‑150 (MQ=255) 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ggTTGCCAGTAGCTTGAAATCTGCAACACCGCCGGTCCAGACAAGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAAc < 1:703215/150‑1 (MQ=255) ggTTGCCAGTAGCTTGAAATCTGCAACACCGCCGGTCCAGACAAGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAAc < 2:1545431/150‑1 (MQ=255) ccAGTAGCTTGAAATCTGCAACACCGCCGGTCCAGACAAGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGttt < 2:565678/150‑1 (MQ=255) ccAGTAGCTTGAAATCTGCAACACCGCCGGTCCAGACAAGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGttt < 2:375074/150‑1 (MQ=255) tGAAATCTGCAACACCGCCGGTCCAGACAAGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGt < 1:403856/150‑1 (MQ=255) 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tGCAACACCGCCGGTCCAGACAAGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGc > 2:718135/1‑150 (MQ=255) tGCAACACCGCCGGTCCAGACAAGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGc > 2:752963/1‑150 (MQ=255) gCAACACCGCCGGTCCAGACAAGCCGAGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTCTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCa > 2:209664/1‑150 (MQ=255) cAACACCGCCGGTCCAGACAAGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCAc < 1:1047060/150‑1 (MQ=255) aaCACCGCCGGTCCAGACAAGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCCGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCAcc < 2:546571/150‑1 (MQ=255) | CGCTTCGGTAGATGAACCGCCAGTGTGTTTTTCAGGCTTTGATTCGGATGTGCGTTACGCTGCTCATTCAGGAAGGTTTCGAGGTCCACATCCGGTAGCAGATTGATGCTGACAAATTCCCCCGGTTGCCAGTAGCTTGAAATCTGCAACACCGCCGGTCCAGACAAGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACC > NC_000913/3636542‑3636838 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |