| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3719794 = | 99 (1.070) | 9 (0.100) | 8/258 | NT | 9.1% | intergenic (+26/‑255) | yiaG/cspA | putative DNA‑binding transcriptional regulator YiaG/cold shock protein CspA |
| ? | NC_000913 | 3719816 = | 88 (1.020) | intergenic (+48/‑233) | yiaG/cspA | putative DNA‑binding transcriptional regulator YiaG/cold shock protein CspA | |||||
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
GGGCGTATCAGTCGCCATGGTAAAGGAATGGGAATCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAGACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGCTTAATGCACATCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGCAGTGTAGTAAGGCAAGTCCCTTCAA > NC_000913/3719645‑3719941 | gcgCGTATCAGTCCCCATCGTAAAGGCATGCGAATCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAGACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTa < 1:323141/148‑1 (MQ=255) ggCGTATCAGTCGCCATGGTAAAGGAATGGGAATCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAGACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTAc < 1:67686/150‑1 (MQ=255) cgaggggtatcaacgataactcttgaagggacttgccttactacactgctttaatggtctgtacgtcaaaccgttgatgtgcattaagccacgcattggcgggtgatgcaacaattatttttcatatttatgattaatcggttggaaaAc > 2:516652‑M1/149‑150 (MQ=255) gTATCAGTCGCCATGGTAAAGGAATGGGAATCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAGACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGt < 2:287027/150‑1 (MQ=255) ggtatcaacgataactcttgaagggacttgccttactacactgctttaatggtctgtacgtcaaaccgttgatgtgcattaagccacgcattggcgggtgatgcaacaattatttttcatatttatgattaatcggttggaaaACGGTcc > 1:1466706‑M1/144‑150 (MQ=255) ggtatcaacgataactcttgaagggacttgccttactacactgctttaatggtctgtacgtcaaaccgttgatgtgcattaagccacgcattggcgggtgatgcaacaattatttttcatatttatgattaatcggttggaaaACGGTcc > 2:1396871‑M1/144‑150 (MQ=255) tCAGTCGCCATGGTAAAGGAATGGGAATCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAGACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCt < 2:480789/150‑1 (MQ=255) tCAGTCGCCATGGTAAAGGAATGGGAATCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAGACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCt > 1:794930/1‑150 (MQ=255) tatcaacgataactcttgaagggacttgccttactacactgctttaatggtctgtacgtcaaaccgttgatgtgcattaagccacgcattggcgggtgatgcaacaattatttttcatatttatgattaatcggttggaaaACGGTCCtg > 1:24484‑M1/142‑150 (MQ=255) cAGTCGCCATGGTAAAGGAATGGGAATCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAGACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCtg > 2:1577216/1‑150 (MQ=255) aGTCGCCATGGTAAAGGAATGGGAATCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAGACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCtga < 2:41107/150‑1 (MQ=255) gTCGCCATGGTAAAGGAATGGGAATCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTCGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAGACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCtgat < 1:1078084/150‑1 (MQ=255) aacgataactcttgaagggacttgccttactacactgctttaatggtctgtacgtcaaaccgttgatgtgcattaagccacgcattggcgggtgatgcaacaattatttttcatatttatgattaatcggttggaaaACGGTCCtgatga < 1:1432587‑M1/13‑1 (MQ=255) cgataactcttgaagggacttgccttactacactgctttaatggtctgtacgtcaaaccgttgatgtgcattaagccacgcattggcgggtgatgcaacaattatttttcatatttatgattaatcggttggaaaACGGTCCTGATGACa < 2:693522‑M1/15‑1 (MQ=255) aTGGTAAAGGAATGGGAATCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGTCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAGACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAgg < 2:291234/150‑1 (MQ=255) gTAAAGGAATGGGAATCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAGACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGAcc > 1:961899/1‑150 (MQ=255) aaaGGAATGGGAATCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAGACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGTCATCAGGACCGt < 2:1136244/150‑1 (MQ=255) ttgaagggactttccttactacaatgctttaattgtctgtacgtcaaaccgttgatgtgcattaagccacgcattggcgggtgatgcaacaattatttttcatatttatgattaatcggttggaaaACGGTCCTGATGACAGGACCGttt > 2:1463673‑M1/127‑150 (MQ=255) aGGAATGGGAATCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAGACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGttt > 2:233972/1‑150 (MQ=255) aaTGGGAATCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAGACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTcc < 2:796777/150‑1 (MQ=255) aTGGGAATCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAGACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCa > 1:1177865/1‑150 (MQ=255) gggacttgccttactacactgctttaatggtctgtacgtcaaaccgttgatgtgcattaagccacgcattggcgggtgatgcaacaattatttttcatatttatgattaatcggttggaaaACg > 2:835810‑M1/122‑124 (MQ=255) gggacttgccttactacactgctttaatggtctgtacgtcaaaccgttgatgtgcattaagccacgcattggcgggtgatgcaacaattatttttcatatttatgattaatcggttggaaaACg < 1:841386‑M1/3‑1 (MQ=255) ggacttgccttactacactgctttaatggtctgtacgtcaaaccgttgatgtgcattaagccacgcattggcgggtgatgcaacaattatttttcatatttatgattaatcggttggaaaACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAAc > 1:821328‑M1/121‑150 (MQ=255) ggAATCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAGACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAAcc > 2:306434/1‑150 (MQ=255) ccAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAGACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTa < 2:954975/150‑1 (MQ=255) cAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAGACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTaa < 1:1070561/150‑1 (MQ=255) cAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAGACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTaa > 1:1444180/1‑150 (MQ=255) cAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAGACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTaa > 2:962355/1‑150 (MQ=255) aCGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAGACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCa < 1:1389986/150‑1 (MQ=255) gcgTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGCTGCCCTTGATTCAAGCCACCCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAGACTTTTATCCACTTTATTGCCGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATa < 2:739700/150‑1 (MQ=255) cgTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAGACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATaa > 1:767391/1‑150 (MQ=255) tGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAGACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAat > 1:1231748/1‑150 (MQ=255) cactgctttaatggtctgtacgtcaaaccgttgatgtgcattaagccacgcattggcgggtgatgcaacaattatttttcatatttatgattaatcggttggaaaACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAat > 2:1432587‑M1/106‑150 (MQ=255) gAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAGACTTTTATCCCCTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAata < 2:663245/150‑1 (MQ=255) gAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAGACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAata < 1:248518/150‑1 (MQ=255) aGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAGACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATg > 1:1137832/1‑150 (MQ=255) ctttaatggtctgtacgtcaaaccgttgatgtgcattaagccacgcattggcgggtgatgcaacaattatttttcatatttatgattaatcggttggaaaACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGaa < 1:438159‑M1/50‑1 (MQ=255) cTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAGACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGaaa > 1:882909/1‑150 (MQ=255) taatggtctgtacgtcaaaccgttgatgtgcattaagccacgcattggcgggtgatgcaacaattatttttcatatttatgattaatcggttggaaaACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGaaaaa > 2:438159‑M1/98‑150 (MQ=255) tCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAGACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGaaaaa < 2:1253849/150‑1 (MQ=255) gTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAGACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAaataat < 2:1093598/150‑1 (MQ=255) gCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAGACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAAttg < 1:306434/150‑1 (MQ=255) gCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAGACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAAttg < 1:826818/150‑1 (MQ=255) 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gtaagCAGTTGATGGAATAGACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGCTTAATGCACATCAACGGTTTGa > 1:927726/1‑150 (MQ=255) taagCAGTTGATGGAATAGACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGCTTAATGCACATCAACGGTTTGAc < 1:962355/150‑1 (MQ=255) cAGTTGATGGAATAGACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGCTTAATGCACATCAACGGTTTGACGTAc < 2:997346/150‑1 (MQ=255) aGTTGATGGAAAAGAATTTTATCAACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGAATAACCCGCCAATGCGTGGCTTAATGAACATAAACCGTATGACGTACa > 2:909382/1‑150 (MQ=255) ttGATGGAATAGACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGCTTAATGCACATCAACGGTTTGACGTACAGa < 2:767391/150‑1 (MQ=255) tGATGGAATAGACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGCTTAATGCACATCAACGGTTTGACGTACAGAc > 2:133585/1‑150 (MQ=255) ggAATAGACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGCTTAATGCACATCAACGGTTTGACGTACAGACCAtt < 2:1402121/150‑1 (MQ=255) tAGACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGCTTAATGCACATCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAg < 2:1306205/150‑1 (MQ=255) aGACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGCTTAATGCACATCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGc < 1:1555742/150‑1 (MQ=255) aGACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGCTTAATGCACATCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGc < 2:659369/150‑1 (MQ=255) aGACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGATGCATCACCCGCCAATGCGTTGCTTAATGCACATCAAGGGTTTGAAGTAGAGAACATTAAAgg < 2:108660/150‑2 (MQ=255) cTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGCTTAATGCACATCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGCAgt > 1:73572/1‑150 (MQ=255) cTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGCTTAATGCACATCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGCAgt > 1:939906/1‑150 (MQ=255) tCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGCTTAATGCACATCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGCAGTgtagta > 1:237829/1‑150 (MQ=255) ccACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGCTTAATGCACATCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGCAGTGTAGTaa > 1:438640/1‑150 (MQ=255) cTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGCTTAATGCACATCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGCAGTGTAGTAAGGc < 2:1137832/150‑1 (MQ=255) cTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGCTTAATGCACATCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGCAGTGTAGTAAGGc > 2:1324621/1‑150 (MQ=255) aTTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGCTTAATGCACATCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGCAGTGTAGTAAGGCAAGt > 2:1295660/1‑150 (MQ=255) ttGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGCTTAATGCACATCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGCAGTGTAGTAAGGCAAGTc < 1:1422908/150‑1 (MQ=255) tGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGCTTAATGCACATCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGCAGTGTAGTAAGGCAAGTcc > 1:350740/1‑150 (MQ=255) gCTGTTTACTGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGCTTAATGCACATCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGCAGTGTAGTAAGGCAAGTccc < 2:1163107/150‑1 (MQ=255) gCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGCTTAATGCACATCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGCAGTGTAGTAAGGCAAGTccc > 2:1241649/1‑150 (MQ=255) cTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGCTTAATGCACATCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGCAGTGTAGTAAGGCAAGTCCCt > 2:370956/1‑150 (MQ=255) gTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGCTTAATGCACATCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGCAGTGTAGTAAGGCAAGTCCCTTc < 2:794930/150‑1 (MQ=255) gTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGCTTAATGCACATCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGCAGTGTAGTAAGGCAAGTCCCTTc < 2:73572/150‑1 (MQ=255) | GGGCGTATCAGTCGCCATGGTAAAGGAATGGGAATCCAGACGCGTGAAGCCTTCAAGTGCCGAACTAAAATTGATGCGTTTGATTCAAGCCAACCCGGCATTAAGTAAGCAGTTGATGGAATAGACTTTTATCCACTTTATTGCTGTTTACGGTCCTGATGACAGGACCGTTTTCCAACCGATTAATCATAAATATGAAAAATAATTGTTGCATCACCCGCCAATGCGTGGCTTAATGCACATCAACGGTTTGACGTACAGACCATTAAAGCAGTGTAGTAAGGCAAGTCCCTTCAA > NC_000913/3719645‑3719941 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |