New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 4067707 = | 84 (0.910) | 6 (0.070) | 4/258 | NT | 7.6% | coding (1570/2037 nt) | yihQ | sulfoquinovosidase |
? | NC_000913 | 4067734 = | 68 (0.790) | coding (1543/2037 nt) | yihQ | sulfoquinovosidase |
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
TTTCAGGTAAGGTTTCAGGGTGGTGAAGACGGTGGTCATACGGGCGAAATGGGCGATGGTTTCTGCGTCGCCGTCAAACTGCCAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGTCGAGACTCCAGTCGACG > NC_000913/4067558‑4067855 | tttCAGGTAAGGTTTCAGGGTGGTGAAGACGGTGGTCATACGGGCGAAATGGGCGATGGTTTCTGCGTCGCCGTCAAACTGCCAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCa > 1:993489/1‑150 (MQ=255) tCAGGTAAGGTTTCAGGGTGGTGAAGACGGTGGTCATACGGGCGAAATGGGCGATGGTTTCTGCGTCGCCGTCAAACTGCCAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAgc > 1:1541479/1‑150 (MQ=255) ccatgatgtgggcgggcgaccagaacgtcgactggagtctcgacgatggcctggcgtcggttgtcccggcggcgctgtcgctggcaatgaccggacatggcctgcaccacagcgacattggcggttacaccaccctgtttgagatgaAgc < 1:1108854‑M1/3‑1 (MQ=255) atgatgtgggcgggcgaccagaacgtcgactggagtctcgacgatggcctggcgtcggttgtcccggcggcgctgtcgctggcaatgaccggacatggcctgcaccacagcgacattggcggttacaccaccctgtttgagatgaAgcgc > 1:1523992‑M1/146‑150 (MQ=255) atgatgtgggcgggcgaccagaacgtcgactggagtctcgacgatggcctggcgtcggttgtcccggcggcgctgtcgctggcaatgaccggacatggcctgcaccacagcgacattggcggttacaccaccctgtttgagatgaAgcgc < 2:938991‑M1/5‑1 (MQ=255) aGGTAAGGTTTCAGGGTGGTGAAGACGGTGGTCATACGGGCGAAATGGGCGATGGTTTCTGCGTCGCCGTCAAACTGCCAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAgcgc < 2:354437/150‑1 (MQ=255) tgatgtgggcgggcgaccagaacgtcgactggagtctcgacgatggcctggcgtcggttgtcccggcggcgctgtcgctggcaatgaccggacatggcctgcaccacagcgacattggcggttacaccaccctgtttgagatgaAGCgca > 2:790164‑M1/145‑150 (MQ=255) ggTAAGGTTTCAGGGTGGTGAAGACGGTGGTCATACGGGCGAAATGGGCGATGGTTTCTGCGTCGCCGTCAAACTGCCAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCgca > 2:1431039/1‑150 (MQ=255) ggTAAGGTTTCAGGGTGGTGAAGACGGTGGTCATACGGGCGAAATGGGCGATGGTTTCTGCGTCGCCGTCAAACTGCCAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCgca < 2:497060/150‑1 (MQ=255) ggTAAGGGTTCAGGGTGGTGAAGACGGTGGTCATACGGGCGAAATGGGCGATGGTTTCTGCGTCGCCGTCAAACTGCCAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCgca < 2:707134/150‑1 (MQ=255) tAAGGTTTCAGGGTGGTGAAGACGGTGGTCATACGGGCGAAATGGGCGATGGTTTCTGCGTCGCCGTCAAACTGCCAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCgcagc < 2:1043476/150‑1 (MQ=255) tgtgggcgggcgaccagaacgtcgactggagtctcgacgatggcctggcgtcggttgtcccggcggcgctgtcgctggcaatgaccggacatggcctgcaccacagcgacattggcggttacaccaccctgtttgagatgaAGCgcagca < 2:988459‑M1/9‑1 (MQ=255) tgtgggcgggcgaccagaacgtcgactggagtctcgacgatggcctggcgtcggttgtcccggcggcgctgtcgctggcaatgaccggacatggcctgcaccacagcgacattggcggttacaccaccctgtttgagatgaAGCgcagca < 2:1299087‑M1/9‑1 (MQ=255) gTTTCAGGTTGGTGAAGACGGTGCTCATACGGGCGAAATTGGCGATGGTTTCTGCGTCGCCGTCAATCTGCCAGTTGTCGCAAGGACTGTTACCTTAGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGCCGCTTAAATAGCACCATCgaagcatca > 2:731838/1‑150 (MQ=255) tttCAGGGTGGTGAAGACGGTGGTCATACGGGCGAAATGGGCGATGGTTTCTGCGTCGCCGTCAAACTGCCAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGcagcagcag < 1:908207/150‑1 (MQ=255) ggtggtGAAGACGGTGGTCATACGGGCGAAATGGGCGATGGTTTCTGCGTCGCCGTCAAACTGCCAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCATGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCttt > 1:1578119/1‑150 (MQ=255) gtggtgAAGACGGTGGTCATACGGGCGAAATGGGCGATGGTTTCTGCGTCGCCGTCAAACTGCCAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTtg > 2:244925/1‑150 (MQ=255) gtggtgAAGACGGTGGTCATACGGGCGAAATGGGCGATGGTTTCTGCGTCGCCGTCAAACTGCCAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTtg > 1:1029515/1‑150 (MQ=255) 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tACGGGCGAAATGGGCGATGGTTTCTGCGTCGCCGTCAAACTGCCAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACa > 1:1082633/1‑150 (MQ=255) gggCGAAATGGGCGATGGTTTCTGCGTCGCCGTCAAACTGCCAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAggg < 2:970760/150‑1 (MQ=255) gCGAAATGGGCGATGGTTTCTGCGTCGCCGTCAAACTGCCAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGggtg < 2:401279/150‑1 (MQ=255) cGAAATGGGCGATGGTTTCTGCGTTGCCGTCAAACTGCCAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGggtgg < 1:1296249/150‑1 (MQ=255) cGAAATGGGCGATGGTTTCTGCGTCGCCGTCAAACTGCCAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGggtgg < 2:430238/150‑1 (MQ=255) 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gACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCg < 2:644266/150‑1 (MQ=255) gTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGTGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAg > 2:74157/1‑150 (MQ=255) gTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAg > 2:1087897/1‑150 (MQ=255) gTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAg < 2:1144545/150‑1 (MQ=255) cgcATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAAcc > 1:1107390/1‑150 (MQ=255) tcatcGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACg < 1:1076796/150‑1 (MQ=255) atcGGCGTGAAGGCGCTTAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACTGGGTTGTGTTACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGcc < 2:1564349/150‑1 (MQ=255) atcGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGcc > 2:1241785/1‑150 (MQ=255) cGGCGTGAAGGCTCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGGGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAg < 1:656860/150‑1 (MQ=255) cGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAg < 1:651470/150‑1 (MQ=255) gCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGc < 2:218286/150‑1 (MQ=255) tGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCAt > 2:29271/1‑150 (MQ=255) aGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCAtcgt > 2:159076/1‑150 (MQ=255) aGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCAtcgt > 1:285441/1‑150 (MQ=255) gcgcTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCAtcgtcg < 2:1529299/150‑1 (MQ=255) gcTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTGATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGTCgag < 1:731838/150‑1 (MQ=255) gcTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGTCgag < 1:1095481/150‑1 (MQ=255) gAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGTCGAGACt > 2:700756/1‑150 (MQ=255) aaTCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGTCGAGACTcc < 1:1379119/150‑1 (MQ=255) aaTCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGTCGAGACTcc > 2:1182765/1‑150 (MQ=255) aTCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGTCGAGACTCCa > 2:1582000/1‑150 (MQ=255) aTCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGACCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGTCGAGACTCCa > 1:152679/1‑150 (MQ=255) cACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGTCGAGACTCCAGTCg < 1:605712/150‑1 (MQ=255) cACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGTCGAGACTCCAGTCg < 1:535021/150‑1 (MQ=255) cAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGTCGAGACTCCAGTCGACg < 2:1578702/150‑1 (MQ=255) | TTTCAGGTAAGGTTTCAGGGTGGTGAAGACGGTGGTCATACGGGCGAAATGGGCGATGGTTTCTGCGTCGCCGTCAAACTGCCAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGTCGAGACTCCAGTCGACG > NC_000913/4067558‑4067855 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |