| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 489045 = | 72 (0.780) | 4 (0.050) | 4/264 | NT | 5.5% | coding (2510/3363 nt) | mscK | potassium dependent, small conductance mechanosensitive channel |
| ? | NC_000913 | 489063 = | 68 (0.770) | coding (2528/3363 nt) | mscK | potassium dependent, small conductance mechanosensitive channel | |||||
TACCATGTTGCTGATGTTTGCGCTGTTCGGTGTCATGTTCTGGGCAATTTGGTCCGATTTGATCACCGTGTTCAGCTATCTCGACAGCATCACGCTCTGGCATTACAACGGCACTGAAGCTGGCGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGATTATCGCCTCAATGGTGGCCTGGGCGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGACTGAATATGCGCCAGGGCGCGTCGTATGCCATTACTACCATCCTTAACTACATC > NC_000913/488914‑489211 | tACCATGTTGCTGATGTTTGCGCTGTTCGGTGTCATGTTCTGGGCAATTTGGTCCGATTTGATCACCGTGTTCAGCTATCTCGACAGCATCACGCTCTGGCATTACAACGGCACTGAAGCTGGCGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCAt > 1:373779/1‑150 (MQ=255) aCCATGTTGCTGATGTTTGCGCTGTTCGGTGTCATGTTCTGGGCAATTTGGTCCGATTTGATCACCGTGTTCAGCTATCTCGACAGCATCACGCTCTGGCATTACAACGGCACTGAAGCTGGCGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATg > 1:1496880/1‑150 (MQ=255) ccATGTTGCTGATGTTTGCGCTGTTCGGTGTCATGTTCTGGGCAATTTGGTCCGATTTGATCACCGTGTTCAGCTATCTCGACAGCATCACGCTCTGGCATTACAACGGCACTGAAGCTGGCGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATgg < 1:1275021/150‑1 (MQ=255) cATGTTGCTGATGTTTGCGCTGTTCGGTGTCATGTTCTGGGCAATTTGGTCCGATTTGATCACCGTGTTCAGCTATCTCGACAGCATCACGCTCTGGCATTACAACGGCACTGAAGCTGGCGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATggg > 1:945658/1‑150 (MQ=255) aatggcatacgacgcgccctggcgcatattcagtcgcgagagcaccagcacttccagtaaaccaggcaggttgcgaatcaacgcccaggccaccattgaggcgataatcgcaaacaacagactgcccaTGGTGAAAAACGTCACCATggg > 1:1405751‑M1/129‑150 (MQ=255) gTTGCTGATGTTTGCGCTGTTCGGTGTCATGTTCTGGGCAATTTGGTCCGATTTGATCACCGTGTTCAGCTATCTCGACAGCATCACGCTCTGGCATTACAACGGCACTGAAGCTGGCGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAg > 2:331211/1‑150 (MQ=255) aTGTTTGCGCTGTTCGGTGTCATGTTCTGGGCAATTTGGTCCGATTTGATCACCGTGTTCAGCTATCTCGACAGCATCACGCTCTGGCATTACAACGGCACTGAAGCTGGCGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCtgttg < 2:515191/150‑1 (MQ=255) aTGTTTGCGCTGTTCGGTGTCATGTTCTGGGCAATTTGGTCCGATTTGATCACCGTGTTCAGCTATCTCGACAGCATCACGCTCTGGCATTACAACGGCACTGAAGCTGGCGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCtgttg < 2:491998/150‑1 (MQ=255) tGTTTGCGCTGTTCGGTGTCATGTTCTGGGCAATTTGGTCCGATTTGATCACCGTGTTCAGCTATCTCGACAGCATCACGCTCTGGCATTACAACGGCACTGAAGCTGGCGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCtgttgt > 2:1094664/1‑150 (MQ=255) gcgcTGTTCGGTGTCATGTTCTGGGCAATTTGGTCCGATTTGATCACCGTGTTCAGCTATCTCGACATCATCACGCTCTGGCATTACAACGGCACTGAAGCTGGCGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCg < 2:59553/150‑1 (MQ=255) ccctggcgcatattcagtcgcgagagcaccagcacttccagtaaaccaggcaggttgcgaatcaacgcccaggccaccattgaggcgataatcgcaaacaacagactgcccaTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCg > 2:1260767‑M1/113‑150 (MQ=255) ggTGTCATGTTCTGGGCAATTTGGTCCGATTTGATCACCGTGTTCAGCTATCTCGACAGCATCACGCTCTGGCATTACAACGGCACTGAAGCTGGCGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGATTATCGcc < 2:395131/150‑1 (MQ=255) ggTGTCATGTTCTGGGCAATTTGGTCCGATTTGATCACCGTGGTCAGCTATCTCGACAGCATCACGCTCTGGCATTACAACGGCACTGAAGCTGGCGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGATTATCGcc < 1:917981/150‑1 (MQ=255) aTGTTCTGGGCAATTTGGTCCGATTTGATCACCGTGTTCAGCTATCTCGACAGCATCACGCTCTGGCATTACAACGGCACTGAAGCTGGCGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGATTATCGCCTCAAtg > 2:680067/1‑150 (MQ=255) gTTCTGGGCAATTTGGTCCGATTTGATCACCGTGTTCAGCTATCTCGACAGCATCACGCTCTGGCATTACAACGGCACTGAAGCTGGCGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGATTATCGCCTCAAtggt > 2:959991/1‑150 (MQ=255) gTTCTGGGCAATTTGGTCCGATTTGATCACCGTGTTCAGCTATCTCGACAGCATCACGCTCTGGCATTACAACGGCACTGAAGCTGGCGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGATTATCGCCTCAAtggt > 2:1494294/1‑150 (MQ=255) tCTGGGCAATTTGGTCCGATTTGATCACCGTGTTCAGCTATCTCGACAGCATCACGCTCTGGCATTACAACGGCACTGAAGCTGGCGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGATTATCGCCTCAAtggtgg < 1:826949/150‑1 (MQ=255) cTGGGCAATTTGGTCCGATTTGATCACCGTGTTCAGCTATCTCGACAGCATCACGCTCTGGCATTACAACGGCACTGAAGCTGGCGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGATTATCGCCTCAATGGTGGc < 2:141546/150‑1 (MQ=255) tGGGCAATTTGGTCCGATTTGATCACCGTGTTCAGCTATCTCGACAGCATCACGCTCTGGCATTACAACGGCACTGAAGCTGGCGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGATTATCGCCTCAATGGTGGcc > 1:110607/1‑150 (MQ=255) tttGGTCCGATTTGATCACCGTGTTCAGCTATCTCGACAGCATCACGCTCTGGCATTACAACGGCACTGAAGCTGGCGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGATTATCGCCTCAATGGTGGCCTGGGCGt < 2:392807/150‑1 (MQ=255) ttGGTCCGATTTGATCACCGTGTTCAGCTATCTCGACAGCATCACGCTCTGGCATTACAACGGCACTGAAGCTGGCGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGATTATCGCCTCAATGGTGGCCTGGGCGtt < 1:1156825/150‑1 (MQ=255) tGGTCCGATTTGATCACCGTGTTCAGCTATCTCGACAGCATCACGCTCTGGCATTACAACGGCACTGAAGCTGGCGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGATTATCGCCTCAATGGTGGCCTGGGCGTTg > 1:1578965/1‑150 (MQ=255) gTCCGATTTGATCACCGTGTTCAGCTATCTCGACAGCATCACGCTCTGGCATTACAACGGCACTGAAGCTGGCGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGATTATCGCCTCAATGGTGGCCTGGGCGTTGAt > 1:757622/1‑150 (MQ=255) tCCGATTTGATCACCGTGTTCAGCTATCTCGACAGCATCACGCTCTGGCATTACAACGGCACTGAAGCTGGCGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGATTATCGCCTCAATGGTGGCCTGGGCGTTGAtt < 1:1524808/150‑1 (MQ=255) cGATTTGATCACCGTGTTCAGCTATCTCGACAGCATCACGCTCTGGCATTACAACGGCACTGAAGCTGGCGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGATTATCGCCTCAATGGTGGCCTGGGCGTTGATTCg < 1:1396526/150‑1 (MQ=255) cGATTTGATCACCGTGTTCAGCTATCTCGACAGCATCACGCTCTGGCATTACAACGGCACTGAAGCTGGCGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGATTATCGCCTCAATGGTGGCCTGGGCGTTGATTCg < 1:761433/150‑1 (MQ=255) aTTTGATCACCGTGTTCAGCTATCTCGACAGCATCACGCTCTGGCATTACAACGGCACTGAAGCTGGCGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGATTATCGCCTCAATGGTGGCCTGGGCGTTGATTCGCa < 2:470124/150‑1 (MQ=255) ttGATCACCGTGTTCAGCTATCTCGACAGCATCACGCTCTGGCATTACAACGGCACTGAAGCTGGCGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGATTATCGCCTCAATGGTGGCCTGGGCGTTGATTCGCAAc < 1:104088/150‑1 (MQ=255) aTCACCGTGTTCAGCTATCTCGACAGCATCACGCTCTGGCATTACAACGGCACTGAAGCTGGCGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGATTATCGCCTCAATGGTGGCCTGGGCGTTGATTCGCAAcctg > 1:487377/1‑150 (MQ=255) tCACCGTGTTCAGCTATCTCGACAGCATCACGCTCTGGCATTACAACGGCACTGAAGCTGGCGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGATTATCGCCTCAATGGTGGCCTGGGCGTTGATTCGCAAcctgc > 1:388566/1‑150 (MQ=255) aCCGTGTTCAGCTATCTCGACAGCATCACGCTCTGGCATTACAACGGCACTGAAGCTGGCGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGATTATCGCCTCAATGGTGGCCTGGGCGTTGATTCGCAAcctgcct > 1:1594527/1‑150 (MQ=255) aCCGTGTTCAGCTATCTCGACAGCATCACGCTCTGGCATTACAACGGCACTGAAGCTGGCGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGATTATCGCCTCAATGGTGGCCTGGGCGTTGATTCGCAAcctgcct > 2:1372323/1‑150 (MQ=255) gtTCAGCTATCTCGACAGCATCACGCTCTGGCATTACAACGGCACTGAAGCTGGCGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGATTATCGCCTCAATGGTGGCCTGGGCGTTGATTCGCAACCTGCCTGGttt > 1:1228457/1‑150 (MQ=255) ggttgcgaatcaacgcccaggccaccattgaggcgataatcgcaaacaacagactgcccaTGGTGAAAAACGTCACCATGGGc > 2:925372‑M1/61‑83 (MQ=255) 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aaCGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGATTATCGCCTCAATGGTGGCCTGGGCGTTGATTCGCATCCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGACTGAATATGCGCCAGGGCGCGTCGTATGCCATTACTACCATCCtt < 2:1228457/150‑1 (MQ=255) aaCGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGATTATCGCCTCAATGGTGGCCTGGGCGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGACTGAATATGCGCCAGGGCGCGTCGTATGCCATTACTACCATCCtt < 2:110607/150‑1 (MQ=255) ccaTGGGCAGTCTGTTGTTTGCGATTATCGCCTCAATGGTGGCCTGGGCGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGACTGAATATGCGCCAGGGCGCGTCGTATGCCATTACTACCATCCTTAACcaca > 2:125757‑M2/4‑150 (MQ=255) ccaTGGGCAGTCTGTTGTTTGCGATTATCGCCTCAATGGTGGCCTGGGCGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGACTGAATATGCGCCAGGGCGCGTCGTATGCCATTACTACCATCCTTAACTACa < 1:1292146‑M2/147‑1 (MQ=255) ccaTGGGCAGTCTGTTGTTTGCGATTATCGCCTCAATGGTGGCCTGGGCGTTGATTAGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGACTGTATATGCGCCAGGGCGCGTCGTATGCGATTAGTACCATCCTTAACTACa > 1:1399487‑M2/4‑150 (MQ=255) ccaTGGGCAGTCTGTTGTTTGCGATTATCGCCCCAATGGTGGCCTGGGCGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGACTGAATATGCGCCAGGGCGCGTCGTATGCCATTACTACCATCCTTAACTACa > 2:252908‑M2/4‑150 (MQ=255) aTGGGCAGTCTGTTGTTTGCGATTATCGCCTCAATGGTGGCCTGGGCGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGACTGAATATGCGCCAGGGCGCGTCGTATGCCATTACTACCATCCTTAACTACATc < 2:7474‑M2/149‑1 (MQ=255) | TACCATGTTGCTGATGTTTGCGCTGTTCGGTGTCATGTTCTGGGCAATTTGGTCCGATTTGATCACCGTGTTCAGCTATCTCGACAGCATCACGCTCTGGCATTACAACGGCACTGAAGCTGGCGCTGCGGTGGTGAAAAACGTCACCATGGGCAGTCTGTTGTTTGCGATTATCGCCTCAATGGTGGCCTGGGCGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGACTGAATATGCGCCAGGGCGCGTCGTATGCCATTACTACCATCCTTAACTACATC > NC_000913/488914‑489211 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |