New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_000913 | 568576 = | 3365 (38.160) | coding (262/333 nt) | emrE | multidrug/betaine/choline efflux transporter EmrE |
Only 100 of 5690 total aligned reads displayed.
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aggctcatataaatataagagcctccatattttagtcgtttagaaacaaattattttaatgtggtgtgcttcgtgacaataaattaataatcaacacaccggcacaaatcaacatcatgcctataatGGCTGGACCTGCCAGCCATtata > 2:968767‑M1/128‑150 (MQ=255) gtgCATCATTCTGGTTATTAGCTCAGACGCTGGCTTATATTCCTACAGGGATTGCTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCa > 1:277252/1‑150 (MQ=255) gtgCATCATTCTGGTTATTAGCTCAGACGCTGGCTTATATTCCTACAGGGATTGCTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCa < 1:554720/150‑1 (MQ=255) gCATCATTCTGGTTATTAGCTCAGACGCTGGCTTATATTCCTACAGGGATTGCTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCatg < 2:936908/150‑1 (MQ=255) atTCTGGTTATTAGCTCAGACGCTGGCTTATATTCCTACAGGGATTGCTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGtt < 1:487329/150‑1 (MQ=255) 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cGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTTCTAAACGACTAAAATATGGAGGCTCTTATATTTATATGAGCCTCGttt < 2:1106747/150‑1 (MQ=255) GCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTTCTAAACGACTAAAATATGGAGGCTCTTATATTTATATGAGCCTCGTTTTa < 2:484359‑M1/150‑1 (MQ=255) GCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTTCTAAACGACTAAAATATGGAGGCTCTTATATTTATATGAGCCTCGTTTTa > 1:458639‑M1/1‑150 (MQ=255) gcaggtccagccATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTTCTAAACGACTAAAATATGGAGGCTCTTATATTTATATGAGCCTCGTTTTATGCt > 1:813720‑M2/13‑150 (MQ=255) ccTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTTCTAAACGACTAAAATATGGAGGCTCTTATATTTATATGAGCCTCGTTTTATGCttt > 2:742947/1‑150 (MQ=255) cTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTTCTAAACGACTAAAATATGGAGGCTCttatattta < 1:64562/127‑1 (MQ=255) atgacagccATTATAGTCATGATGTTGATTTTTACAGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTTTTTCAAAAAGACTAAAATATGTAGGCTAATATATTTATATGATACACGTTTTATGCtttt > 2:1240032‑M2/10‑150 (MQ=255) tGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTTCTAAACGACTAAAATATGGAGGCTCTTATATTTATATGAGCCTCGTTTTATGCttttt > 1:1341138/1‑150 (MQ=255) tGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTTCTAAACGACTAAAATATGGAGGCTCTTATATTTATATGAGCCTCGTTTTATGCttttt < 1:358449/150‑1 (MQ=255) gccagccaTTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTTCTAAACGACTAAAATATGGAGGCTCTTATATTTATATGAGCCTCGTTTTATGCTTTTTg > 1:333678/1‑150 (MQ=255) gccagccaTTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTTCTAAACGACTAAAATATGGAGGCTCTTATATTTATATGAGCCTCGTTTTATGCTTTTTg > 2:812778/1‑150 (MQ=255) ccagccATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTTCTAAACGACTAAAATATGGAGGCTCTTATATTTATATGAGCCTCGTTTTATGCTTTTTGt > 1:249822‑M2/7‑150 (MQ=255) gccATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTTACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTTCTAAACGACTAAAATATGGAGGCTCTTATATTTATATGAGCCTCGTTTTATGCTTTTTGTTaa < 1:885356‑M2/147‑1 (MQ=255) ccATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTTCTAAACGACTAAAATATGGAGGCTCTTATATTTATATGAGCCTCGTTTTATGCTTTTTGtt < 2:1549483‑M2/145‑1 (MQ=255) cATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTTCTAAACGACTAAAATATGGAGGCTCTTATATTTATATGAGCCTCGTTTTATGc < 1:1590676‑M2/137‑1 (MQ=255) cATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGGTTCTAAACGACTAAAATATGGAGGCTCTTATATTTATATGAGCCTCGTTTTATGCTTTTTGTTAATg < 2:876034‑M2/149‑1 (MQ=255) cATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACAACATTAAAATAATTTGTTTCTAAACGACTAAAATATGGAGGCTCTTATATTTATATGAGCCTCGTTTTATGCTTTTTGTTAATg < 2:70553‑M2/149‑1 (MQ=255) | TTTGTTATTGTGCATCATTCTGGTTATTAGCTCAGACGCTGGCTTATATTCCTACAGGGATTGCTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTTCTAAACGACTAAAATATGGAGGCTCTTATATTTATATGAGCCTCGTTTTATGCTTTTTGTTAATGT > NC_000913/568427‑568725 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |