| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 944904 = | 91 (0.990) | 10 (0.120) | 9/260 | NT | 10.7% | intergenic (+8/+27) | dmsC/ycaC | dimethyl sulfoxide reductase subunit C/putative hydrolase |
| ? | NC_000913 | 944926 = | 82 (0.940) | intergenic (+30/+5) | dmsC/ycaC | dimethyl sulfoxide reductase subunit C/putative hydrolase | |||||
Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
TATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTCGCGGCGTATTCTATGGTTTGCATATGACCGTGGGGATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATAACTGGTCATCAAATTACGATAATCAGGAATGTGGTTAGAGAACAACGTCGCCAGTCCTTCAATATCATTACGCCAGTCGCGATGCAGCTCGCACGCCACGCCGAACCATGTCATCAAT > NC_000913/944777‑945075 | cgtgcgagctgcatcgcgactggcgtaatgatattgaaggactggcgacgttgttctctaaccacattcctgattatcgtaatttgatgaccagttatgacacgttaacgaagcagaaataaaagagAACCGGGGTTTCGGCCCCGGTtc > 2:477914‑M1/128‑150 (MQ=255) gcgagctgcatcgcgactggcgtaatgatattgaaggactggcgacgttgttctctaaccacattcctgattatcgtaatttgatgaccagttatgacacgttaacgaagcagaaataaaagagAACCGGGGTTTCGGCCCCGGTTctct > 1:461332‑M1/125‑150 (MQ=255) gcgagctgcatcgcgactggcgtaatgatattgaaggactggcgacgttgttctctaaccacattcctgattatcgtaatttgatgaccagttatgacacgttaacgaagcagaaataaaagagAACCGGGGTTTCGGCCCCGGTTctct > 2:117377‑M1/125‑150 (MQ=255) agctgcatcgcgactggcgtaatgatattgaaggactggcgacgttgttctctaaccacattcctgattatcgtaatttgatgaccagttatgacacgttaacgaagcagaaataaaagagAACCGGGGTTTCGGCCCCGGTTCTCtttt > 2:1128638‑M1/122‑150 (MQ=255) gCGGTTCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTCGCGGCGTATTCTATGGTTTGCATATGACCGTGGGGATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTAtt < 2:1190853/150‑1 (MQ=255) ggTTCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTCGCGGCGTATTCTATGGTTTGCATATGACCGTGGGGATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTc > 2:762797/1‑150 (MQ=255) ttCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGGCGCGGCGTATTCTATGGTTTGCATATGACCGTGGGGATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTg < 2:1007710/150‑1 (MQ=255) tcgcgacgggcgtaatgatattgaaggactggcgacgttgttctctaaccacattcctgattatcgtaatttgatgaccagttatgacacgttaacgaagcagaaataaaagagAACCGGGGTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTg > 1:1190957‑M1/115‑150 (MQ=255) cGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTCGCGGCGTATTCTATGGTTTGCATATGACCGTGGGGATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCtt > 1:678312/1‑150 (MQ=255) aCTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTCGCGGCGTATTCTATGGTTTGCATATGACCGTGGGGATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGtt > 2:792980/1‑150 (MQ=255) ggcgtaatgatattgaaggactggcgacgttgttctctaaccacattcctgattatcgtaatttgatgaccagttatgacacgttaacgaagcagaaataaaagagaaccggggccgaaaccccggttGTCTTTTATTTCTGCTTCGTTa > 1:824952‑M2/129‑150 (MQ=255) ttCTGTATCATTCATTCTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTCGCGGCGTATTCTATGGTTTGCATATGACCGTGGGGATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGCCCCGGGTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAAc > 2:484721/1‑150 (MQ=255) gTATCATTCATTCTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTCGCGGCGTATTCTATGGTTTGCATATGACCGTGGGTATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACgtg > 1:141234/1‑149 (MQ=255) 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attcattcTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTCGCGGCGTATTCTATGGTTTGCATATGACCGTGGGGATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATaa > 2:69977/1‑150 (MQ=255) ttcattcTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTCGCGGCGTATTCTATGGTTTGCATATGACCGTGGGGATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATAAc > 1:1280116/1‑150 (MQ=255) tcattcTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTCGCGGCGTATTCTATGGTTTGCATATGACCGTGGGGATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATAACt > 2:1492289/1‑150 (MQ=255) tcattcTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTCGCGGCGTATTCCATGGTTTGCATATGACCGTGGGGATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATAACt < 1:1290586/150‑1 (MQ=255) cattcTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTCGCGGCGTATTCTATGGTTTGCATATGACCGTGGGGATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTaa < 1:1625639/137‑1 (MQ=255) 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attcTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTCGCGGCGTATTCTATGGTTTGCATATGACCGTGGGGATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATAACTgg < 1:327394/150‑1 (MQ=255) aaggactggcgacgttgttctctaaccacattcctgattatcgtaatttgatgaccagttatgacacgttaacgaagcagaaataaaagagAACCGGGGTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATAACTgg > 2:1500656‑M1/92‑150 (MQ=255) ttcTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTCGCGGCGTATTCTATGGTTTGCATATGACCGTGGGGATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATAACTGGt < 1:257357/150‑1 (MQ=255) tcTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTCGCGGCGTATTCTATGGTTTGCATATGACCGTGGGGATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATAACTGGtc < 2:804475/150‑1 (MQ=255) gactggcgacgttgttctctaaccacattcctgattatcgtaatttgatgaccagttatgacacgttaacgaagcagaaataaaagagAACCGGGGTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCt > 2:1223636‑M1/89‑126 (MQ=255) gactggcgacgttgttctctaaccacattcctgattatcgtaatttgatgaccagttatgacacgttaacgaagcagaaataaaagagAACCGGGGTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCt < 1:1223636‑M1/38‑1 (MQ=255) cTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTCGCGGCGTATTCTATGGTTTGCATATGACCGTGGGGATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATAACTGGtca > 1:381854/1‑150 (MQ=255) cTGCGTCTGGCAGGGGAATTACTCGGTCGCGGCGTATTCCCCGGTTTGCATATGACCGTGGGGATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGCGGTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATAACTGGtca < 2:872762/150‑1 (MQ=255) gCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTCGCGGCGTATTCTATGGTTTGCATATGACCGTGGGGATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATAACTGGtcatc < 2:385119/150‑1 (MQ=255) cTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTCGCGGCGTATTCTATGGTTTGCATATGACCGTGGGGATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATAACTGGtcatca > 2:239797/1‑150 (MQ=255) tGGCAGGGGAATTAATCGGTCGCGGCGTATTCTATGGTTTGCATATGACCGTGGGGATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATAACTGGTCATCAAAtt < 1:379504/150‑1 (MQ=255) 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ccGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGCCCCGGTTCTCTTGTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATAACTGGTCATCAAATTACGATAATCAGGAATGTGGTTAGAGAACAACGTCGCCAGTCCTTCAATATCATTACGCCa > 2:754045/1‑150 (MQ=255) gCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATAACTGGTCATCAAATTACGATAATCAGGAATGTGGTTAGAGAACAACGTCGCCAGTCCTTCAATATCATTACGCCAGTcgc > 1:19561/1‑150 (MQ=255) agcagaaataaaagagaaccggggccgaaaccccggttCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATAACTGGTCATCAAATTACGATAATCAGGAATGTGGTTAGAGAACAACGTCGCCAGTc < 1:1223636‑M2/88‑1 (MQ=255) agcagaaataaaagagaaccggggccgaaaccccggttCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATAACTGGTCATCAAATTACGATAATCAGGAATGTGGTTAGAGAACAACGTCGCCAGTc > 2:1223636‑M2/39‑126 (MQ=255) cAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATAACTGGTCATCAAATTACGATAATCAGGAATGTGGTTAGAGAACAACGTCGCCAGTCCTTCAat < 2:716683/132‑1 (MQ=255) cAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATAACTGGTCATCAAATTACGATAATCAGGAATGTGGTTAGAGAACAACGTCGCCAGTCCTTCAATATCATTACGCCAGTcgcg < 2:763023/150‑1 (MQ=255) cagaaataaaagagaaccggggccgaaaccccggttCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATAACTGGTCATCAAATTACGATAATCAGGAATGTGGTTAGAGAACAACGTCGCCAGTCCTTCAATATCATTACGCCCGTCGCGa > 1:1190957‑M2/37‑150 (MQ=255) gCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATAACTGGTCATCAAATTACGATAATCAGGAATGTGGTTAGAGAACAACGTCGCCAGTCCTTCAATATCATTACGcc > 2:250549/1‑140 (MQ=255) gCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATAACTGGTCATCAAATTACGATAATCAGGAATGTGGTTAGAGAACAACGTCGCCAGTCCTTCAATATCATTACGcc < 1:250549/140‑1 (MQ=255) cTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATAACTGGTCATCAAATTACGATAATCAGGAATGTGGTTAGAGAACAACGTCGCCAGTCCTTCAATATCATTACGCCAGTCGCGATGc < 1:1399155/150‑1 (MQ=255) aaaagagaaccggggccgaaaccccggttCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATAACTGGTCATCAAATTACGATAATCAGGAATGTGGTTAGAGAACAACGTCGCCAGTCCTTCAATATCATTACGCCAGTCGCGATGCAGCt > 2:1128638‑M2/30‑150 (MQ=255) cATAACAACCGGGGTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATAACTGGTCATCAAATTACGATAATCAGGAATGTGGTTAGAGAACAACGTCGCCAGTCCTTCAATATCATTACGCCAGTCGCGATGCAGCTc < 1:855024/150‑1 (MQ=255) aTAACAACCGGGGTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATAACTGGTCATCAAATTACGATAATCAGGAATGTGGTTAGAGAACAACGTCGCCAGTCCTTCAATATCATTACGCCAGTCGCGATGCAGCTCg > 1:92825/1‑150 (MQ=255) agagaaccggggccgaaaccccggttCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATAACTGGTCATCAAATTACGATAATCAGGAATGTGGTTAGAGAACAACGTCGCCAGTCCTTCAATATCATTACGCCAGTCGCGATGCAGCTCGc > 1:461332‑M2/27‑150 (MQ=255) agagaaccggggccgaaaccccggttCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATAACTGGTCATCAAATTACGATAATCAGGAATGTGGTTAGAGAACAACGTCGCCAGTCCTTCAATATCATTACGCCAGTCGCGATGCAGCTCGc > 2:117377‑M2/27‑150 (MQ=255) gaaccggggccgaaaccccggttCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATAACTGGTCATCAAATTACGATAATCAGGAATGTGGTTAGAGAACAACGTCGCCAGTCCTTCAATATCATTACGCCAGTCGCGATGCAGCTCGcacg > 2:477914‑M2/24‑150 (MQ=255) caacCGGGGTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATAACTGGTCATCAAATTACGATAATCAGGAATGTGGTTAGAGAACAACGTCGCCAGTCCTTCAATATCATTACGCCAGTCGCGATGCAGCTCGcacg > 2:516300/1‑150 (MQ=255) caacCGGGGTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATAACTGGTCATCAAATTACGATAATCAGGAATGTGGTTAGAGAACAACGTCGCCAGTCCTTCAATATCATTACGCCAGTCGCGATGCAGCTCGcacg > 2:754915/1‑150 (MQ=255) GGGGTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATAACTGGTCATCAAATTACGATAATCAGGAATGTGGTTAGAGAACAACGTCGCCAGTCCTTCAat < 1:860958‑M1/113‑1 (MQ=255) GGGGTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATAACTGGTCATCAAATTACGATAATCAGGAATGTGGTTAGAGAACAACGTCGCCAGTCCTTCAat > 2:860958‑M1/1‑113 (MQ=255) GGTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATAACTGGTCATCAAATTACGATAATCAGGAATGTGGTTTGAGAACAACGTCGCCAGTCCTTCAATATCATTACGCCAGTCGCGATGCAGCTCGCacgccccgcc < 2:22607‑M1/150‑1 (MQ=255) GTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATAACTGGTCATCAAATTACGATAATCAGGAATGTGGTTAGAGAACAACGTCGCCAGTCCTTCAATATCATTACGCCAGTCGCGATGCAGCTCGCACGCCACGCCg < 1:498208‑M1/150‑1 (MQ=255) ttCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATAACTGGTCATCAAATTACGATAATCAGGAATGTGGTTAGAGAACAACGTCGCCAGTCCTTCAATATCATTACGCCAGTCGCGATGCAGCTCGCACGCCACGCCGaa < 1:1388131/150‑1 (MQ=255) ccccggttCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATAACTGGTCATCAAATTACGATAATCAGGAATGTGGTTAGAGAACAACGTCGCCAGTCCTTCAATATCATTACGCCAGTCGCGATGCAGCTCGCACGCCACGCCGAACCATg < 1:1221276‑M2/142‑1 (MQ=255) ccggttCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATAACTGGTCATCAAATTACGATAATCAGGAATGTGGTTAGAGAACAACGTCGCCAGTCCTTCAATATCATTACGCCAGTCGCGATGCAGCTCGCACGCCACGCCGAACCATGtc < 2:39448‑M2/144‑1 (MQ=255) gttCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATAACTGGTCATCAAATTACGATAATCAGGAATGTGGTTAGAGAACAACGTCGCCAGTCCTTCAATATCATTACGCCAGTCGCGATGCAGCTCGCACGCCACGCCGAACCATGtcatc < 2:1426974‑M2/147‑1 (MQ=255) | TATCAGCCTGCGGTTCCGCTACTTTCTGTATCATTCATTCTGCTTCTGGCAGGGGAATTAATCGGTCGCGGCGTATTCTATGGTTTGCATATGACCGTGGGGATGGCCGTCGCAAGCTAATCATAACAACCGGGGTTTCGGCCCCGGTTCTCTTTTATTTCTGCTTCGTTAACGTGTCATAACTGGTCATCAAATTACGATAATCAGGAATGTGGTTAGAGAACAACGTCGCCAGTCCTTCAATATCATTACGCCAGTCGCGATGCAGCTCGCACGCCACGCCGAACCATGTCATCAAT > NC_000913/944777‑945075 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |