New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 2930257 = | 78 (0.850) | 6 (0.070) | 5/266 | NT | 7.5% | coding (682/1368 nt) | sdaB | L‑serine deaminase II |
? | NC_000913 | 2930309 = | 72 (0.810) | coding (734/1368 nt) | sdaB | L‑serine deaminase II |
GAGCTGGCGCTGCACAGCAAAGAAGAGCTGGAACAGCACCTGGCGAACGTCTGGGAAGTCATGCGCGGCGGTATTGAGCGCGGTATTTCCACCGAAGGCGTGTTGCCTGGCAAACTGCGCGTTCCACGCCGTGCTGCGGCACTACGCCGGATGCTGGTCAGCCAGGATAAAACCACCACTGACCCGATGGCGGTTGTTGACTGGATCAACATGTTTGCACTGGCAGTGAACGAAGAGAACGCTGCTGGCGGTCGCGTGGTGACTGCGCCGACTAACGGTGCGTGCGGGATTATCCCGG > NC_000913/2930161‑2930458 | cagcgttctcttcgttcactgccattgcaaacatgttgagccagtctacaaccgccatcgggtcagtggtggttttatgctggctgaccagcatccGGCGTGTTGCCTGGCAAACTGCGCGTTCCACGCCGTGCTGCGGCACTACGCCgg > 2:615271‑M1/97‑150 (MQ=255) agcgttctcttcgttcactgccagtgcaaacatgttgatccagtcaacaaccgccatcgggtcagtggtggttttatcctggctgaccagcatccGGCGTGTTGCCTGGCAAACTGCGCGTTCCACGCCGTGCTGCGGCACTACGCCGGa > 2:477850‑M1/96‑150 (MQ=255) aGCTGGCGCTGCACAGCAAAGAAGAGCTGGAACAGCACCTGGCGAACGTCTGGGAAGTCATGCGCGGCGGTATTGAGCGCGGTATTTCCACCGAAGGCGTGTTGCCTGGCAAACTGCGCGTTCCACGCCGTGCTGCGGCACTACGCCGGa < 2:1517173/150‑1 (MQ=255) gcgttctcttcgttcactgccagtgcaaacatgttgatccagtcaacaaccgccatcgggtcagtggtggttttatcctggctgaccagcatccGGCGTGTTGCCTGGCAAACTGCGCGTTCCACGCCGTGCTGCGGCACTACGCCGGAt > 2:136773‑M1/95‑150 (MQ=255) gCTGGCGCTGCACAGCAAAGAAGAGCTGGAACAGCACCTGGCGAACGTCTGGGAAGTCATGCGCGGCGGTATTGAGCGCGGTATTTCCACCGAAGGCGTGTTGCCTGGCAAACTGCGCGTTCCACGCCGTGCTGCGGCACTACGCCGGAt < 2:1556465/150‑1 (MQ=255) cTGGCGCTGCACAGCAAAGAAGAGCTGGAACAGCACCTGGCGAACGTCTGGGAAGTCATGCGCGGCGGTATTGAGCGCGGTATTTCCACCGAAGGCGTGTTGCCTGGCAAACTGCGCGTTCCACGCCGTGCTGCGGCACTACGCCGGATg < 2:1451222/150‑1 (MQ=255) gggCGCTGCACAGCAAAGAAGAGCTGGAACAGCACCTGGCGAACGTCTGGGAAGTCATGCGCGGCGGTATTGAGCGCGGTATTTCCACCGAAGGCGTGTTGCCTGGCAAACTGCGCGTTCCACGCCGTGCTGCGGCACTACGCCGGATGc < 2:663662/149‑1 (MQ=255) ttctcttcgttcactgccagtgcaaacatgttgatccagtcaacaaccgccatcgggtcagtggtggttttatcctggctgaccagcatccGGCGTGTTGCCTGGCAAACTGCGCGTTCCACGCCGTGCTGCGGCACTACGCCGGATGCt > 2:268859‑M1/92‑150 (MQ=255) cgcTGCACAGCAAAGAAGAGCTGGAACAGCACCTGGCGAACGTCTGGGAAGTCATGCGCGGCGGTATTGAGCGCGGTATTTCCACCGAAGGCGTGTTGCCTGGCAAACTGCGCGTTCCACGCCGTGCTGCGGCACTACGCCGGATGCTgg < 1:419292/150‑1 (MQ=255) gCACAGCAAAGAAGAGCTGGAACAGCACCTGGCGAACGTCTGGGAAGTCATGCGCGGCGGTATTGAGCGCGGTATTTCCACCGAAGGCGTGTTGCCTGGCAAACTGCGCGTTCCACGCCGTGCTGCGGCACTACGCCGGATGCTGGTCAg > 2:450842/1‑150 (MQ=255) cacaGCAAAGAAGAGCTGGAACAGCACCTGGCGAACGTCTGGGAAGTCATGCGCGGCGGTATTGAGCGCGGTATTTCCACCGAAGGCGTGTTGCCTGGCAAACTGCGCGTTCCACGCCGTGCTGCGGCACTACGCCGGATGCTGGTCAGc < 2:351612/150‑1 (MQ=255) cacaGCAAAGAAGAGCTGGAACAGCACCTGGCGAACGTCTGGGAAGTCATGCGCGGCGGTATTGAGCGCGGTATTTCCACCGAAGGCGTGTTGCCTGGCAAACTGCGCGTTCCACGCCGTGCTGCGGCACTACGCCGGATGCTGGTCAGc > 2:916832/1‑150 (MQ=255) cAAAGAAGATCTGGAACAGCACCTGGCGTACGTCTGGGAAGTCTTGCGCGGCGGTATTGAGCTCGGTATTTCCACCGAAGGCTTGTTGCCTGGCAAACTGCGCGTTCCACGCCGTGCTGCGGCACTACGCCGGATGCTGGTCAGCCAGGa < 2:1125834/150‑1 (MQ=255) aagaagAGCTGGAACAGCACCTGGCGAACGTCTGGGAAGTCATGCGCGGCGGTATTGAGCGCGGTATTTCCACCGAAGGCGTGTTGCCTGGCAAACTGCGCGTTCCACGCCGTGCTGCGGCACTACGCCGGATGCTGGTCAGCCAGGATa > 1:1301567/1‑150 (MQ=255) aagaagAGCTGGAACAGCACCTGGCGAACGTCTGGGAAGTCATGCGCGGCGGTATTGAGCGCGGTATTTCCACCGAAGGCGTGTTGCCTGGCAAACTGCGCGTTCCACGCCGTGCTGCGGCACTACGCCGGATGCTGGTCAGCCAGGATa < 1:1127654/150‑1 (MQ=255) aagaagAGCTGGAACAGCACCTGGCGAACGTCTGGGAAGTCATGCGCGGCGGTATTGAGCGCGGTATTTCCACCGAAGGCGTGTTGCCTGGCAAACTGCGCGTTCCACGCCGTGCTGCGGCACTACGCCGGATGCTGGTCAGCCAGGATa > 1:180712/1‑150 (MQ=255) aagaGCTGGAACAGCACCTGGCGAACGTCTGGGAAGTCATGCGCGGCGGTATTGAGCGCGGTATTTCCACCGAAGGCGTGTTGCCTGGCAAACTGCGCGTTCCACGCCGTGCTGCGGCACTACGCCGGATGCTGGTCAGCCAGGATaaaa > 1:1334307/1‑150 (MQ=255) agagCTGGAACAGCACCTGGCGAACGTCTGGGAAGTCATGCGCGGCGGTATTGAGCGCGGTATTTCCACCGAAGGCGTGTTGCCTGGCAAACTGCGCGTTCCACGCCGTGCTGCGGCACTACGCCGGATGCTGGTCAGCCAGGATAAAac < 2:305911/150‑1 (MQ=255) 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gCACCTGGAGAACGTCTGGGAAGTCATGCGCGGCGGTATTGAGCGCGGTATTTCCACAGAAGGCGTGTTGCCTGGCAAACTGCGCGTTCCACGCCGTGCTGCGGCACTACGCCGGATGCTGGTCAGCCAGGATAAAACCACCACTGAccc > 2:605072/1‑150 (MQ=255) aCCTGGCGAACGTCTGGGAAGTCATGCGCGGCGGTATTGAGCGCGGTATTTCCACCGAAGGCGTGTTGCCTGGCAAACTGCGCGTTCCACGCCGTGCTGCGGCACTACGCCGGATGCTGGTCAGCCAGGATAAAACCACCACTGACCCGa > 2:1482351/1‑150 (MQ=255) tGGCGAACGTCTGGGAAGTCATGCGCGGCGGTATTGAGCGCGGTATTTCCACCGAAGGCGTGTTGCCTGGCAAACTGCGCGTTCCACGCCGTGCTGCGGCACTACGCCGGATGCTGGTCAGCCAGGATAAAACCACCACTGACCCGATgg < 2:48143/150‑1 (MQ=255) tGGCGAACGTCTGGGAAGTCATGCGCGGCGGTATTGAGCGCGGTATTTCCACCGAAGGCGTGTTGCCTGGCAAACTGCGCGTTCCACGCCGTGCTGCGGCACTACGCCGGATGCTGGTCAGCCAGGATAAAACCACCACTGACCCGATgg < 1:1364503/150‑1 (MQ=255) ggCGAACGTCTGGGAAGTCATGCGCGGCGGTATTGAGCGCGGTATTTCCACCGAAGGCGTGTTGCCTGGCAAACTGCGCGTTCCACGCCGTGCTGCGGCACTACGCCGGATGCTGGTCAGCCAGGATAAAACCACCACTGACCCGATGGc > 1:928831/1‑150 (MQ=255) cggaCGTCTGGGAAGTCATGCGCGGCGGTATTGAGCGCGGTATTTCCACCGAAGGCGTGTTGCCTGGCAAACTGCGCGTTCCACGCCGTGCTGCGGCACTACGCCGGATGCTGGTCAGCCAGGATAAAACCACCACTGACCCGATGGCgg > 1:655847/4‑150 (MQ=255) cGAACGTCTGGGAAGTCATGCGCGGCGGTATTGAGCGCGGTATTTCCACCGAAGGCGTGTTGCCTGGCAAACTGCGCGTTCCACGCCGTGCTGCGGCACTACGCCGGATGCTGGTCAGCCAGGATAAAACCACCACTGACCCGATGGCgg < 2:693443/150‑1 (MQ=255) gAACGTCTGGGAAGTCATGCGCGGCGGTATTGAGCGCGGTATTTCCACCGAAGGCGTGTTGCCTGGCAAACTGCGCGTTCCACGCCGTGCTGCGGCTCTACGCCGGATGCTGGTCAGCCAGGATAAAACCACCACTGACCCGATGGCGgt < 2:875687/150‑1 (MQ=255) gAACGTCTGGGAAGTCATGCGCGGCGGTATTGAGCGCGGTATTTCCACCGAAGGCGTGTTGCCTGGCAAACTGCGCGTTCCACGCCGTGCTGCGGCACTACGCCGGATGCTGGTCAGCCAGGATAAAACCACCACTGACCCGATGGCGgt < 1:570836/150‑1 (MQ=255) aCGTCTGGGACGTCATGCGCGGCGGTATTGAGCGCGGTATTTCCACCGAAGGCGTGTTGCCTGGCAAACTGCGCGTTCCACGCCGTGCTGCGGCACTACGCCGGATGCTGGTCAGCCAGGATAAAACCACCACTGACCCGATGGCGgttg < 2:1611779/150‑1 (MQ=255) 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aCTGCGCGTTCCACGCCGTGCTGCGGCACTACGCCGGATGCTGGTCAGCCAGGATAAAACCACCACTGACCCGATGGCGGTTGTTGACTGGATCAACATGTTTGCACTGGCAGTGAACGAAGAGAACgctgc < 1:922694/132‑1 (MQ=255) cgTTCCACGCCGTGCTGCGGCACTACGCCGGATGCTGGTCAGCCAGGATAAAACCACCACTGACCCGATGGCGGTTGTTGACTGGATCAACATGTTTGCACTGGCAGTGAACGAAGAGAACGCTGCTGGCGGTCGCGTGGTGACTGCGcc < 2:1301567/150‑1 (MQ=255) gTTCCACGCCGTGCTGCGGCACTACGCCGGATGCTGGTCAGCCAGGATAAAACCACCACTGACCCGATGGCGGTTGTTGACTGGATCAACATGTTTGCACTGGCAGTGAACGAAGAGAACGCTGCTGGCGGTCGCGTGGTGACTGCGCCg > 1:1184186/1‑150 (MQ=255) tCCACGCCGTGCTGCGGCACTACGCCGGATGCTGGTCAGCCAGGATAAAACCACCACTGACCCGATGGCGGTTGTTGACTGGATCAACATGTTTGCACTGGCAGTGAACGAAGAGAACGCTGCTGGCGGTCGCGTGGTGACTGCGCCGAc < 2:928831/150‑1 (MQ=255) ccACGCCGTGCTGCGGCACTACGGCGGATGCTGGTCAGCCAGGATAAAACCACCACTGACCCGATGGCGGTTGTTGACTGGATCAACATGTTTGCACTGGCAGTGAACGAAGAGAACGCTGCTGGCGGTCGCGTGGTGACTGCGCCGACt < 1:75987/150‑1 (MQ=255) ccACGCCGTGCTGCGGCACTACGCCGGATGCTGGTCAGCCAGGATAAAACCACCACTGACCCGATGGCGGTTGTTGACTGGATCAACATGTTTGCACTGGCAGTGAACGAAGAGAACGCTGCTGGCGGTCGCGTGGTGACTGCGCCGACt > 1:741631/1‑150 (MQ=255) tgcGGCACTACGCCGGATGCTGGTCAGCCAGGATAAAACCACCACTGACCCGATGGCGGTTGTTGACTGGATCAACATGTTTGCACTGGCAGTGTACGAAGAGAACGCTGCTGGCGGTCGCGTGGTGACTGCGCCGACTAACGgtgcgtg < 2:606593/150‑1 (MQ=255) tgcGGCACTACGCCGGATGCTGGTCAGCCAGGATAAAACCACCACTGACCCGATGGCGGTTGTTGACTGGATCAACATGTTTGCACTGGCAGTGAACGAAGAGAACGCTGCTGGCGGTCGCGTGGTGACTGCGCCGACTAACGgtgcgtg < 1:1321474/150‑1 (MQ=255) tgcGGCACTACGCCGGATGCTGGTCAGCCAGGATAAAACCACCACTGACCCGATGGCGGTTGTTGACTGGATCAACATGTTTGCACTGGCAGTGAACGAAGAGAACGCTGCTGGCGGTCGCGTGGTGACTGCGCCGACTAACGgtgcgtg > 1:608881/1‑150 (MQ=255) gcGGCACTACGCCGGATGCTGGTCAGCCAGGATAAAACCACCACTGACCCGATGGCGGTTGTTGACTGGATCAACATGTTTGCACTGGCAGTGAACGAAGAGAACGCTGCTGGCGGTCGCGTGGTGACTGCGCCGACTAACGgtgcgtgc > 1:871843/1‑150 (MQ=255) cGGCACTACGCCGGATGCTGGTCAGCCAGGATAAAACCACCACTGACCCGATGGCGGTTGTTGACTGGATCAACATGTTTGCACTGGCAGTGAACGAAGAGAACGCTGCTGGCGGTCGCGTGGTGACTGCGCCGACTAACGGtgcgtgcg < 2:1334307/150‑1 (MQ=255) ggCACTACGCCGGATGCTGGTCAGCCAGGATAAAACCACCACTGACCCGATGGCGGTTGTTGACTGGATCAACATGTTTGCACTGGCAGTGAACGAAGAGAACGCTGCTGGCGGTCGCGTGGTGACTGCGCCGACTAACGGTGCGTGCgg < 2:373781/150‑1 (MQ=255) gcaacacgccGGATGCTGGTCAGCCAGGATAAAACCACCACTGACCCGATGGCGGTTGTTGACTGGATCAACATGTTTGCACTGGCAGTGAACGAAGAGAACGCTGCTGGCGGTCGCGTGGTGACTGCGCCGACTAACGGTGCGTGCggg < 1:268859‑M2/140‑1 (MQ=255) acgccGGATGCTGGTCAGCCAGGATAAAACCACCACTGACCCGATGGCGGTTGTTGACTGGATCAACATGTTTGCACTGGCAGTGAACGAAGAGAACGCTGCTGGCGGTCGCGTGGTGACTGCGCCGACTAACGGTGCGTGCGGGATTAt > 1:353376‑M2/6‑150 (MQ=255) acgccGGATGCTGGTCAGCCAGGATAAAACCACCACTGACCCGATGGCGGTTGTTGACTGGATCAACATGTTTGCACTGGCAGTGAACGAAGAGAACGCTGCTGGCGGTCGCGTGGTGACTGCGCCGACTAACGGTGCGTGCGGGATTAt > 2:993223‑M2/6‑150 (MQ=255) ggATGCTGGTCAGCCAGGATAAAACCACCACTGACCCGATGGCGGTTGTTGACTGGATCAACATGTTTGCACTGGCAGTGAACGAAGAGAACGCTGCTGGCGGTCGCGTGGTGACTGCGCCGACTAACGGTGCGTGCGGGATTATCCCgg > 1:431203/1‑150 (MQ=255) | GAGCTGGCGCTGCACAGCAAAGAAGAGCTGGAACAGCACCTGGCGAACGTCTGGGAAGTCATGCGCGGCGGTATTGAGCGCGGTATTTCCACCGAAGGCGTGTTGCCTGGCAAACTGCGCGTTCCACGCCGTGCTGCGGCACTACGCCGGATGCTGGTCAGCCAGGATAAAACCACCACTGACCCGATGGCGGTTGTTGACTGGATCAACATGTTTGCACTGGCAGTGAACGAAGAGAACGCTGCTGGCGGTCGCGTGGTGACTGCGCCGACTAACGGTGCGTGCGGGATTATCCCGG > NC_000913/2930161‑2930458 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |