| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | = 3615279 | 87 (0.940) | 5 (0.060) | 4/266 | NT | 5.4% | coding (39/945 nt) | nikB | Ni(2(+)) ABC transporter membrane subunit NikB |
| ? | NC_000913 | = 3615302 | 90 (1.010) | coding (62/945 nt) | nikB | Ni(2(+)) ABC transporter membrane subunit NikB | |||||
Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
TGGTATCAAAACCGGAGCTGGGTAACATCCCCTACGCGCCGATCGCCACCGAAATTCCGTTCGAACAGATTAAACCGGTGAAACCTTAATGTTGCGTTACGTATTACGCCGCTTTCTGCTGCTGATCCCGATGGTGCTCGCCGCCTCGGTGATCATTTTTCTGATGCTGCGCCTCGGTACCGGCGACCCGGCGCTCGATTATTTGCGTCTGTCTAACCTGCCGCCGACGCCGGAGATGCTGGCCTCTACCCGCACCATGCTGGGACTGGATCAGCCGCTGTACGTCCAGTACGGCACCT > NC_000913/3615153‑3615451 | tggtATCAAAACCGGAGCTGGGTAACATCCCCTACGCGCCGATCGCCACCGAAATTCCGTTCGAACAGATTAAACCGGTGAAACCTTAATGTTGCGTTACGTATTACGCCGCTTTCTGCTGCTGATCCCGATGGTGCTCGCCGCCTCGGt < 1:1593151/150‑1 (MQ=255) ggtATCAAAACCGGAGCTGGGTAACATCCCCTACGCGCCGATCGCCACCGAAATTCCGTTCGAACAGATTAAACCGGTGAAACCTTAATGTTGCGTTACGTATTACGCCGCTTTCTGCTGCTGATCCCGATGGTGCTCGCCGCCTCGGtc > 1:283957/1‑149 (MQ=255) tATCAAAACCGGAGCTGGGTAACATCCCCTACGCGCCGATCGCCACCGAAATTCCGTTCGAACAGATTAAACCGGTGAAACCTTAATGTTGCGTTACGTATTACGCCGCTTTCTGCTGCTGATCCCGATGGTGCTCGCCGCCTCGGTgat > 2:1170084‑M2/1‑147 (MQ=255) cAAAACCGGAGCTGGGTAACATCCCCTACGCGCCGATCGCCACCGAAATTCCGTTCGAACAGATTAAACCGGTGAAACCTTAATGTTGCGTTACGTATTACGCCGCTTTCTGCTGCTGATCCCGATGGTGCTCGCCGCCTCGGTGATCAt > 1:1478536/1‑150 (MQ=255) cAAAACCGGAGCTGGGTAACATCCCCTACGCGCCGATCGCCACCGAAATTCCGTTCGAACAGATTAAACCGGTGAAACCTTAATGTTGCGTTACGTATTACGCCGCTTTCTGCTGCTGATCCCGATGGTGCTCGCCGCCTCGGTGATCAt > 1:194194/1‑150 (MQ=255) aaaaCCGGAGCTGGGTAACATCCCCTACGCGCCGATCGCCACCGAAATTCCGTTCGAACAGATTAAACCGGTGAAACCTTAATGTTGCGTTACGTATTACGCCGCTTTCTGCTGCTGATCCCGATGGTGCTCGCCGCCTCGGTGATCAtt > 2:59236/1‑150 (MQ=255) aaaaCCGGAGCTGGGTAACATCCCCTACGCGCCGATCGCCACCGAAATTCCGTTCGAACAGATTAAACCGGTGAAACCTTAATGTTGCGTTACGTATTACGCCGCTTTCTGCTGCTGATCCCGATGGTGCTCGCCGCCTCGGTGATCAtt > 1:122723/1‑150 (MQ=255) aCCGGAGCTGGGTAACATCCCCTACGCGCCGATCGCCACCGAAATTCCGTTCGAACAGATTAAACCGGTGAAACCTTAATGTTGCGTTACGTATTACGCCGCTTTCTGCTGCTGATCCCGATGGTGCTCGCCGCCTCGGTGATCAttttt > 2:1576031/1‑150 (MQ=255) cGGAGCTGGGTAACATCCCCTACGCGCCGATCGCCACCGAAATTCCGTTCGAACAGATTAAACCGGTGAAACCTTAATGTTGCGTTACGTATTACGCCGCTTTCTGCTGCTGATCCCGATGGTGCTCGCCGCCTCGGTGATCATTTTTCt < 2:271213/150‑1 (MQ=255) gAGCTGGGTAACATCCCCTACGCGCCGATCGCCACCGAAATTCCGTTCGAACAGATTAAACCGGTGAAACCTTAATGTTGCGTTACGTATTACGCCGCTTTCTGCTGCTGATCCCGATGGTGCTCGCCGCCTCGGTGATCATTTTTCTGa > 2:1112940/1‑150 (MQ=255) gCTGGGTAACATCCCCTACGCGCCGATCGCCACCGAAATTCCGTTCGAACAGATTAAACCGGTGAAACCTTAATGTTGCGTTACGTATTACGCCGCTTTCTGCTGCTGATCCCGATGGTGCTCGCCGCCTCGGTGATCATTTTTCTGAtg < 1:832400/150‑1 (MQ=255) tGGGTAACATCCCCTACGCGCCGATCGCCACCGAAATTCCGTTCGAACAGATTAAACCGGTGAAACCTTAATGTTGCGTTACGTATTACGCCGCTTTCTGCTGCTGATCCCGATGGTGCTCGCCGCCTCGGTGATCATTTTTCTGAtgct > 1:421748/1‑150 (MQ=255) gggTAACATCCCCTACGCGCCGATCGCCACCGAAATTCCGTTCGAACAGATTAAACCGGTGAAACCTTAATGTTGCGTTACGTATTACGCCGCTTTCTGCTGCTGATCCCGATGGTGCTCGCCGCCTCGGTGATCATTTTTCTGAtgctg < 2:1484664/150‑1 (MQ=255) gggTAACATCCCCTACGCGCCGATCGCCACCGAAATTCCGTTCGAACAGATTAAACCGGTGAAACCTTAATGTTGCGTTACGTATTACGCCGCTTTCTGCTGCTGATCCCGATGGTGCTCGCCGCCTCGGTGATCATTTTTCTGAtgctg > 2:667613/1‑150 (MQ=255) ggTAACATCCCCTACGCGCCGATCGCCACCGAAATTCCGTTCGAACAGATTAAACCGGTGAAACCTTAATGTTGCGTTACGTATTACGCCGCTTTCTGCTGCTGATCCCGATGGTGCTCGCCGCCTCGGTGATCATTTTTCTGAtgctgc < 1:1232687/150‑1 (MQ=255) gTAACATCCCCTACGCGCCGATCGCCACCGAAATTCCGTTCGAACAGATTAAACCGGTGAAACCTTAATGTTGCGTTACGTATTACGCCGCTTTCTGCTGCTGATCCCGATGGTGCTCGCCGCCTCGGTGATCATTTTTCTGATGCTgcg > 1:1476136/1‑150 (MQ=255) aCATCCCCTACGCGCCGATCGCCACCGAAATTCCGTTCGAACAGATTAAACCGGTGAAACCTTAATGTTGCGTTACGTATTACGCCGCTTTCTGCTGCTGATCCCGATGGTGCTCGCCGCCTCGGTGATCATTTTTCTGATGCTGCGCCt > 2:931103/1‑150 (MQ=255) cATCCCCTACGCGCCGATCGCCACCGAAATTCCGTTCGAACAGATTAAACCGGTGAAACCTTAATGTTGCGTTACGTATTACGCCGCTTTCTGCTGCTGATCCCGATGGTGCTCGCCGCCTCGGTGATCATTTTTCTGATGCTGCGCCTc < 2:1268788/150‑1 (MQ=255) 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ccGATGGTGCTCGCCGCCTCGGTGATCATTTTTCTGATGCTGCGCCTCGGTACCGGCGACCCGGCGCTCGATTATTTGCGTCTGTCTAACCTGCCGCCGACGCCGGAGATGCTGGCCTCTACCCGCACCATGCTGGGACTGGATCAGCCg > 2:182746/1‑150 (MQ=255) gATGGTGCTCGCCGCCTCGGTGATCATTTTTCTGATGCTGCGCCTCGGTACCGGCGACCCGGCGCTCGATTATTTGCGTCTGTCTAACCTGCCGCCGACGCCGGAGATGCTGGCCTCTACCCGCACCATGCTGGGACTGGATCAGCCGCt > 1:855381/1‑150 (MQ=255) ggTGCTCGCCGCCTCGGTGATCATTTTTCTGATGCTGCGCCTCGGTACCGGCGACCCGGCGCTCGATTATTTGCGTCTGTCTAACCTGCCGCCGACGCCGGAGATGCTGGCCTCTACCCGCACCATGCTGGGACTGGATCAGCCGCTGTa < 1:1343508/150‑1 (MQ=255) ggTGCTCGCCGCCTCGGTGATCATTTTTCTGATGCTGCGCCTCGGTACCGGCGACCCGGCGCTCGATTATTTGCGTCTGTCTAACCTGCCGCCGACGCCGGAGATGCTGGCCTCTACCCGCACCATGCTGGGACTGGATCAGCCGCTGTa < 2:744360/150‑1 (MQ=255) tGCTCGCCGCCTCGGTGATCATTTTTCTGATGCTGCGCCTCGGTACCGGCGACCCGGCGCTCGATTATTTGCGTCTGTCTAACCTGCCGCCGACGCCGGAGATGCTGGCCTCTACCCGCACCATGCTGGGACTGGATCAGCCGCTGTACg < 1:160185/150‑1 (MQ=255) 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tCGCCGCCTCGGTGATCATTTTTCTGATGCTGCGCCTCGGTACCGGCGACCCGGCGCTCGATTATTTGCGTCTGTCTAACCTGCCGCCGACGCCGGAGATGCTGGCCTCTACCCGCACCATGCTGGGACTGGATCAGCCGCTGTACGTcc < 1:1286378/150‑1 (MQ=255) cgccgcCTCGGTGATCATTTTTCTGATGCTGCGCCTCGGTACCGGCGACCCGGCGCTCGATTATTTGCGTCTGTCTAACCTGCCGCCGACGCCGGAGATGCTGGCCTCTACCCGCACCATGCTGGGACTGGATCAGCCGCTGTACGTCCa > 1:1128874/1‑150 (MQ=255) cgccgcCTCGGTGATCATTTTTCTGATGCTGCGCCTCGGTACCGGCGACCCGGCGCTCGATTATTTGCGTCTGTCTAACCTGCCGCCGACGCCGGAGATGCTGGCCTCTACCCGCACCATGCTGGGACTGGATCAGCCGCTGTACGTCCa > 2:1010474/1‑150 (MQ=255) cgccgcCTCGGTGATCATTTTTCTGATGCTGCGCCTCGGTACCGGCGACCCGGCGCTCGATTATTTGCGTCTGTCTAACCTGCCGCCGACGCCGGAGATGCTGGCCTCTACCCGCACCATGCTGGGACTGGATCAGCCGCTGTACGTCCa < 2:1128874/150‑1 (MQ=255) ccgccTCGGTgatcagcagcagaaagcggcgtaatacgtaacgcaacattaaggtttcaccggtttaatctgttcgaacggaatttcggtggcgatcggcgcgtaggggatgttacccagctccggttttgataccaccatcattgagat > 1:501373‑M2/1‑10 (MQ=255) gccTCGGTGATCATTTTTCTGATGCTGCGCCTCGGTACCGGCGACCCGGCGCTCGATTATTTGCGTCTGTCTAACCTGCCGCCGACGCCGGAGATGCTGGCCTCTACCCGCACCATGCTGGGACTGGATCAGCCGCTGTACGTCCAGTAc < 2:799677/150‑1 (MQ=255) tCGGTGATCATTTTTCTGATGCTGCGCCTCGGTACCGGCGACCCGGCGCTCGATTATTTGCGTCTGTCTAACCTGCCGCCGACGCCGGAGATGCTGGCCTCTACCCGCACCATGCTGGGACTGGATCAGCCGCTGTACGTCCAGTACGGc < 1:1628494/150‑1 (MQ=255) tCGGTGATCATTTTTCTGATCCTGCGCCTCGGTACCGGCCACCCGGCGCTCGATTATTTGTGTCTGTCTAACCTGCCGCCCACGCCGGAGATGCTGGCCTCTACCCGCACCATGCTGGGACTGGATCAGCCGCTGTACGTCCAGTACGGc > 2:1212093/1‑150 (MQ=255) gTGATCATTTTTCTGATGCTGCGCCTCGGTACCGGCGACCCGGCGCTCGATTATTTGCGTCTGTCTAACCTGCCGCCGACGCCGGAGATGCTGGCCTCTACCCGCACCATGCTGGGACTGGATCAGCCGCTGTACGTCCAGTACGGCAcc < 2:385837/150‑1 (MQ=255) gTGATCATTTTTCTGATGCTGCGCCTCGGTACCGGCGACCCGGCGCTCGATTATTCGCGTCTGTCTAACCTGCCGCCGACGCCGGAGATGCTGGCCTCTACCCGCACCATGCTGGGACTGGATCAGCCGCTGTACGTCCAGTACGGCAcc > 1:341728/1‑150 (MQ=255) tGATCATTTTTCTGATGCTGCGCCTCGGTACCGGCGACCCGGCGCTCGATTATTTGCGTCTGTCTAACCTGCCGCCGACGCCGGAGATGCTGGCCTCTACCCGCACCATGCTGGGACTGGATCAGCCGCCGTACGTCCAGTACGGCACCt < 2:1576818/150‑1 (MQ=255) | TGGTATCAAAACCGGAGCTGGGTAACATCCCCTACGCGCCGATCGCCACCGAAATTCCGTTCGAACAGATTAAACCGGTGAAACCTTAATGTTGCGTTACGTATTACGCCGCTTTCTGCTGCTGATCCCGATGGTGCTCGCCGCCTCGGTGATCATTTTTCTGATGCTGCGCCTCGGTACCGGCGACCCGGCGCTCGATTATTTGCGTCTGTCTAACCTGCCGCCGACGCCGGAGATGCTGGCCTCTACCCGCACCATGCTGGGACTGGATCAGCCGCTGTACGTCCAGTACGGCACCT > NC_000913/3615153‑3615451 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |