New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 3844365 | 77 (0.830) | 5 (0.060) | 4/262 | NT | 6.4% | coding (402/1767 nt) | adeD | adenine deaminase |
? | NC_000913 | = 3844391 | 74 (0.850) | coding (428/1767 nt) | adeD | adenine deaminase |
TGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTACCCGCCCTGGAAGGCTGCGATGTTAACGGTGCCAGTTTTACCCTTGAACAGATGCTCGCCTGGCGGGACCATCCGCAGGTTACCGGCCTTGCAGAAATGATGGACTACCCTGGCGTA > NC_000913/3844242‑3844539 | tGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACaggcaaggca > 1:243531/1‑150 (MQ=255) gAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAa < 2:87903‑M2/150‑2 (MQ=255) gAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAa < 1:764658‑M2/150‑2 (MQ=255) aTCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAaaa < 2:1179522‑M2/150‑4 (MQ=255) aTCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAaaa < 1:530662‑M2/150‑4 (MQ=255) aTCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAaaa < 2:361791‑M2/150‑4 (MQ=255) aTCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAaaa < 1:1515617‑M2/150‑4 (MQ=255) ccAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGCCCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTGAAGGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTCCCCGCTGTGCAGACCGggcaagggaagccc > 2:271203/1‑146 (MQ=255) cAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAaaacca > 1:471684‑M2/1‑144 (MQ=255) cAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAaaacca < 2:826533‑M2/150‑7 (MQ=255) cAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAaaacca > 1:1534180‑M2/1‑144 (MQ=255) gatgaCGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACtt > 2:739620/1‑150 (MQ=255) tgaCGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGCAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTAc > 2:1347436/1‑150 (MQ=255) tgaCGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTAc < 1:443758/150‑1 (MQ=255) gaCGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACa < 1:595232/150‑1 (MQ=255) aCGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAg < 2:783435/150‑1 (MQ=255) cGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAgg < 2:530662/150‑1 (MQ=255) cccgTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCAAGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAACCCGGAATCGCCTCGTTTCCCCGCTGTCCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTAACAgcta > 2:456112/4‑147 (MQ=255) 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tGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAaaaccaggcgaatccggcatcgcccatcacgttgacgatttcatgagggtcgcaaataacggtcgtcaggccgcgcggcagggtagcggtttcaaaagtgaccggcgtcatcatgctg < 2:1205665‑M2/150‑119 (MQ=255) ggTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAaaaccaggcgaatccggcttcgcccatcacgttgacgatttcatgagggtcgcaaataacggtcgtcaggccgcgcggcagggtagcggtttcaaaagtgaccggcgtcatcatgctgg < 2:795278‑M2/150‑120 (MQ=255) gTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTACCCGCCCTGGAAGGCTGCGATGTTAACGGTGCCAGTTTTACCCTTGAACAGATGCTCGCCTGGCGGGACCATCCGCAGGTTACCGGCCt < 2:1515617/150‑1 (MQ=255) ttGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTACCCGCCCTGGAAGGCTGCGATGTTAACGGTGCCAGTTTTACCCTTGAACAGATGCTCGCCTGGCGGGACCATCCGCAGGTTACCGGCCttt < 1:929355/150‑2 (MQ=255) tGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAaaaccaggcgaatccggcttcgcccatcacgttgacgatttcatgagggtcgcaaataacggtcgtcaggccgcgcggcagggtagcggtttcaaaagtgaccggcgtcatcatgctggattc < 2:379309‑M2/150‑124 (MQ=255) tGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTACCCGCCCTGGAAGGCTGCGATGTTAACGGTGCCAGTTTTACCCTTGAACAGATGCTCGCCTGGCGGGACCATCCGCAGGTTACCGGCCTTGc < 1:306800/150‑1 (MQ=255) tGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTACCCGCCCTGGAAGGCTGCGATGTTAACGGTGCCAGTTTTACCCTTGAACAGATGCTCGCCTGGCGGGACCATCCGCAGGTTACCGGCCTTGc < 1:289913/150‑1 (MQ=255) gCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTACCCGCCCTGGAAGGCTGCGATGTTAACGGTGCCAGTTTTACCCTTGAACAGATGCTCGCCTGGCGGGACCATCCGCAGGTTACCGGCCTTGCa > 1:52137/1‑150 (MQ=255) cccGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTACCCGCCCTGGAAGGCTGCGATGTTAACGGTGCCAGTTTTACCCTTGAACAGATGCTCGCCTGGCGGGACCATCCGCAGGTTACCGGCCTTGCAg > 1:35578/1‑150 (MQ=255) gtgCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTACCCGCCCTGGAAGGCTGCGATGTTAACGGTGCCAGTTTTACCCTTGAACAGATGCTCGCCTGGCGGGACCATCCGCAGGTTACCGGCCTTGCAGAAatga > 2:1078302/1‑150 (MQ=255) gCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTACCCGCCCTGGAAGGCTGCGATGTTAACGGTGCCAGTTTTACCCTTGAACAGATGCTCGCCTGGCGGGACCATCCGCAGGTTACCGGCCTTGCAGAAatgatg > 1:1328906/1‑150 (MQ=255) gCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTACCCGCCCTGGAAGGCTGCGATGTTAACGGTGCCAGTTTTACCCTTGAACAGATGCTCGCCTGGCGGGACCATCCGCAGGTTACCGGCCTTGCAGAAatgatg < 2:596306/150‑1 (MQ=255) gCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTACCCGCCCTGGAAGGCTGCGATGTTAACGGTGCCAGTTTTACCCTTGAACAGATGCTCGCCTGGCGGGACCATCCGCAGGTTACCGGCCTTGCAGAAatgatg < 1:702063/150‑1 (MQ=255) gCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTACCCGCCCTGGAAGGCCGCGATGTTAACGGTGCCAGTTTTACCCTTGAACAGATGCTCGCCTGGCGGGACCATCCGCAGGTTACCGGCCTTGCAGAAatgatg < 2:1487993/150‑1 (MQ=255) cGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTACCCGCCCTGGAAGGCTGCGATGTTAACGGTGCCAGTTTTACCCTTGAACAGATGCTCGCCTGGCGGGACCATCCGCAGGTTACCGGCCTTGCAGAAATGATGGa > 2:676126/1‑150 (MQ=255) cGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTACCCGCCCTGGAAGGCTGCGATGTTAACGGTGCCAGTTTTACCCTTGAACAGATGCTCGCCTGGCGGGACCATCCGCAGGTTACCGGCCTTGCAGAAATGATGGa > 1:689000/1‑150 (MQ=255) ggcaaggcaaAACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTACCCGCCCTGGAAGGCTGCGATGTTAACGGTGCCAGTTTTACCCTTGAACAGATGCTCGCCTGGCGGGACCATCCGCAGGTTACCGGCCTTGCAGAAATGATGGACTAccc > 2:942939/1‑150 (MQ=255) ggcaaggcaaAACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTACCCGCCCTGGAAGGCTGCGATGTTAACGGTGCCAGTTTTACCCTTGAAAAGATGCTCGCCTGGCGGGACCATCCGCAGGTTACCGGCCTTGCAGAAATGATGGACTAccc > 1:807245/1‑150 (MQ=255) caaggcaaAACCAGTACTTACCGGTCAGCTCTTGGGTACCCGCCCTGGAAGGCTGGGATGGTAACGGTGCCAGTTTTACCCTTGATCAGATGCTCGCCTGGCGGGACCATCCGCAGGTTACCGGCCTTGCAGAAATGATGGACTACCCTg < 2:870067/150‑1 (MQ=255) ggcaaAACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTACCCGCCCTGGAAGGCTGCGATGTTAACGGTGCCAGTTTTACCCTTGAACAGATGCTCGCCTGGCGGGACCATCCGCAGGTTACCGGCCTTGCAGAAATGATGGACTACCCTGGCg > 1:157661/1‑150 (MQ=255) ggcaaAACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTACCCGCCCTGGAAGGCTGCGATGTTAACGGTGCCAGTTTTACCCTTGAACAGATGCTCGCCTGGCGGGACCATCCGCAGGTTACCGGCCTTGCAGAAATGATGGACTACCCTGGCg < 2:388565/150‑1 (MQ=255) ggcaaAACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTACCCGCCCTGGAAGGCTGCGATGTTAACGGTGCCAGTTTTACCCTTGAACAGATGCTCGCCTGGCGGGACCATCCGCAGGTTACCGGCCTCGCAGAAATGATGGACTACCCTGGCg < 2:1297263/150‑1 (MQ=255) gcaaAACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTACCCGCCCTGGAAGGCTGCGATGTTAACGGTGCCAGTTTTACCCTTGAACAGATGCTCGCCTGGCGGGACCATCCGCAGGTTACCGGCCTTGCAGAAATGATGGACTACCCTGGCGt < 1:1571481/150‑1 (MQ=255) caaAACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTACCCGCCCTGGAAGGCTGCGATGTTAACGGTGCCAGTTTTACCCTTGAACAGATGCTCGCCTGGCGGGACCATCCGCAGGTTACCGGCCTTGCAGAAATGATGGACTACCCTGGCGTa > 1:349251/1‑150 (MQ=255) | TGAATCCAGCATGATGACGCCGGTCACTTTTGAAACCGCTACCCTGCCGCGCGGCCTGACGACCGTTATTTGCGACCCTCATGAAATCGTCAACGTGATGGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTACCCGCCCTGGAAGGCTGCGATGTTAACGGTGCCAGTTTTACCCTTGAACAGATGCTCGCCTGGCGGGACCATCCGCAGGTTACCGGCCTTGCAGAAATGATGGACTACCCTGGCGTA > NC_000913/3844242‑3844539 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |