| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 4037399 = | NA (NA) | 8 (0.090) | 3/272 | NT | 7.6% | intergenic (+64/‑120) | alaT/rrlA | tRNA‑Ala/23S ribosomal RNA |
| ? | NC_000913 | 4168481 = | 99 (1.070) | intergenic (+34/‑160) | gltT/rrlB | tRNA‑Glu/23S ribosomal RNA | |||||
Only 100 of 143 total aligned reads displayed.
ACACGAAAATATCACGCAACGCGTGATAAGCAATTTTCGTGTCCCCTTCGTCTAGAGGCCCAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACAGGGGTTCGAATCCCCTAGGGGACGCCACTTGCTGGTTTGTGAGTGAAAGTCGCCGACCTTAATATCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAGAGTTGTTCGTGAGTCTCTCAAATTTTCGCAACACGATGATGAATCGAAAGAAACATCT > NC_000913/4168332‑4168629 | atccaccgtgtacgcttagtcgcttaacctcacaacccgaagatgtttctttcgattcatcatcgtgttgcgaaaatttgagagactcacgaacaactttcgttgttcagtgtttcaattttcagcttgatccagatttttaaagagcaa > 2:1424305‑M2/150‑150 (MQ=255) tccaccgtgtacgcttagtcgcttaacctcacaacccgaagatgtttctttcgattcatcatcgtgttgcgaaaatttgagagactcacgaacaactttcgttgttcagtgtttcaattttcagcttgatccagatttttaaagagcaaa < 2:842630‑M2/2‑1 (MQ=255) cacgaaaattgcttatcacgcgttgcgtgatattttcgtgtCCCCTTCGTCTAGAGGCCCAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACAGGGGTTCGAATCCCCTAGGGGACGCCACTTGCTGGTTTGTGAGTGAAAGTCGCCGACCTTaa > 1:343360‑M2/42‑150 (MQ=255) CACGAAAATATCACGCAACGCGTGATAAGCAATTTTCGTGTCCCCTTCGTCTAGAGGCCCAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACAGGGGTTCGAATCCCCTAGGGGACGCCACTTGCTGGTTTGTGAGTGAAAGTCGCCGACCTTaa < 2:1308565‑M1/150‑1 (MQ=255) CACGAAAATATCACGCAACGCGTGATAAGCAATTTTCGTGTCCCCTTCGTCTAGAGGCCCAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACAGGGGTTCGAATCCCCTAGGGGACGACACTTGCGGGTTTGTGAGTGAAAGTCGACGACCTTaa < 2:1442876‑M1/150‑1 (MQ=255) ccaccgtgtacgcttagtcgcttaacctcacaacccgaagatgtttctttcgattcatcatcgtgttgcgaaaatttgagagactcacgaacaactttcgttgttcattgtttcaattttcagcatgatcgagatttttatagagcaAat > 2:463194‑M2/148‑150 (MQ=255) ACGAAAATATCACGCAACGCGTGATAAGCAATTTTCGTGTCCCCTTCGTCTAGAGGCCCAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACAGGGGTTCGAATCCCCTAGGGGACGCCACTTGCTGGTTTGTGAGTGAAAGTCGCCGACCTTAat > 2:521916‑M1/1‑150 (MQ=255) caccgtgtacgcttagtcgcttaacctcacaacccgaagatgtttctttcgattcatcatcgtgttgcgaaaatttgagagactcacgaacaactttcgttgttcagtgtttcaattttcagcttgatccagatttttaaagagcaAata < 1:120289‑M2/4‑1 (MQ=255) caacgtgtacgcttagtcgcttaacctcacaacacgaagatgtttctttcgattcatcatcgtgttgcgaaaatttgagagactcacgaacaactttcgttgttcagtgtttcaattttcagcttgatccagatttttaaagagcaAata > 2:815577‑M2/147‑150 (MQ=255) caacgggtaagcttagtcgcttaacctcacaacccgaagatgtttctttcgattcatcatcgtgttgcgaaaatttgagagactcacgaacaactttcgttgttcagtgtttcaattttcagcttgatccagatttttaaagagcaAata < 2:1603542‑M2/4‑1 (MQ=255) CGAAAATATCACGCAACGCGTGATAAGCAATTTTCGTGTCCCCTTCGTCTAGAGGCCCAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACAGGGGTTCGAATCCCCTAGGGGACGCCACTTGCTGGTTTGTGAGTGAAAGTCGCCGACCTTAata < 2:575332‑M1/150‑1 (MQ=255) CGAAAATATCACGCAACGCGTGATAAGCAATTTTCGTGTCCCCTTCGTCTAGAGGCCCAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACAGGGGTTCGAATCCCCTAGGGGACGCCACTTGCTGGTTTGTGAGTGAAAGTCGCCGACCTTAata < 1:1596969‑M1/150‑1 (MQ=255) GAAAATATCACGCAACGCGTGATAAGCAATTTTCGTGTCCCCTTCGTCTAGAGGCCCAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACAGGGGTTCGAATCCCCTAGGGGACGCCACTTGCTGGTTTGTGAGTGAAAGTCGCCGACCTTAatat < 1:1036199‑M1/150‑1 (MQ=255) ccgtgtacgcttagtcgcttaacctcacaacccgaagatgtttctttcgattcatcatcgtgttgcgaaaatttgagagactcacgaacaactttcgttgttcagtgtttcaattttcagcttgctccagatttttaaagagcaAATAtc > 1:1480255‑M2/145‑150 (MQ=255) ccgtgtacgcttagtcgcttaacctcacaacccgaagatgtttctttcgattcatcatcgtgttgcgaaaatttgagagactcacgaacaactttcgttgttcagtgtttcaattttcagcttgatccagatttttaaagagcaAATAtc < 1:135002‑M2/6‑1 (MQ=255) ccgtgtacgcttagtcgcttaacctcacaacccgaagatgtttctttcgattcatcatcgtgttgcgaaaatttgagagactcacgaacaactttcgttgttcagtgtttcaattttcagcttgatccagatttttaaagagcaAATAtc < 1:177555‑M2/6‑1 (MQ=255) gtgtacgcttagtcgcttaacctcacaacccgaagatgtttctttcgattcatcatcgtgttgcgaaaatttgagagactcacgaacaactttcgttgttcagtgtttcaattttcagcttgatccagatttttaaagagcaAATAtctc < 2:1320137‑M2/8‑1 (MQ=255) gtgtacgcttagtcgcttaacctcacaacccgaagatgtttctttcgattcatcatcgtgttgcgaaaatttgagagactcacgaacaactttcgttgttcagtgtttcaattttcagcttgacccagatttttaaagagcaAATAtctc < 2:853020‑M2/8‑1 (MQ=255) ATATCACGCAACGCGTGATAAGCAATTTTCGTGTCCCCTTCGTCTAGAGGCCCAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACAGGGGTTCGAATCCCCTAGGGGACGCCACTTGCTGGTTTGTGAGTGAAAGTCGCCGACCTTAATATCTCa < 1:280580‑M1/150‑1 (MQ=255) gtacgcttagtcgcttaacctcacaacccgaagatgtttctttcgattcatcatcgtgttgcgaaaatttgagagactcacgaacaactttcgttgttcagtgtttcaattttcagcttgatccagatttttaaagagcaAATATCTCaa > 2:1546442‑M2/141‑150 (MQ=255) gtacgcttagtcgcttaacctcacaacccgaagatgtttctttcgattcatcatcgtgttgcgaaaatttgagagactcacgaacaactttcgttgttcagtgtttcaattttcagcttgatccagatttttaaagagcaAATATCTCaa < 2:1566194‑M2/10‑1 (MQ=255) atCACGCGTTGCGTGATAAGCAATTTTCGTGTCCCCTTCGTCTAGAGGCCCAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACAGGGGTTCGAATCCCCTAGGGGACGCCACTTGCTGGTTTGTGAGTGAAAGTCGCCGACCTTAATATCTCaaa > 1:772447/1‑150 (MQ=12) cACGCAACGCGTGATAAGCAATTTTCGTGTCCCCTTCGTCTAGAGGCCCAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACAGGGGTTCGAATCCCCTAGGGGACGCCACTTGCTGGTTTGTGAGTGAAAGTCGCCGACCTTAATATCTCAAAAc < 2:1253228/150‑1 (MQ=32) cGCAACGCGTGATAAGCAATTTTCGTGTCCCCTTCGTCTAGAGGCCCAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACAGGGGTTCGAATCCCCTAGGGGACGCCACTTGCTGGTTTGTGAGTGAAAGTCGCCGACCTTAATATCTCAAAACTc < 1:64729/150‑1 (MQ=33) cGCAACGCGTGATAAGCAATTTTCGTGTCCCCTTCGTCTAGAGGCCCAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACAGGGGTTCGAATCCCCTAGGGGACGCCACTTGCTGGTTTGTGAGTGAAAGTCGCCGACCTTAATATCTCAAAACTc > 2:1448673/1‑150 (MQ=33) gCAACGCGTGATAAGCAATTTTCGTGTCCCCTTCGTCTAGAGGCCCAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACAGGGGTTCGAATCCCCTAGGGGACGCCACTTGCTGGTTTGTGAGTGAAAGTCGCCGACCTTAATATCTCAAAACTCa < 1:1055002/150‑1 (MQ=34) cgcgTGATAAGCAATTTTCGTGTCCCCTTCGTCTAGAGGCCCAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACAGGGGTTCGAATCCCCTAGGGGCCGCCACTTGCTGGTTTGTGAGTGAAAGTCGCCGACCTTAATATCTCAAAACTCATCtt > 2:1221222/1‑150 (MQ=38) tGATAAGCAATTTTCGTGTCCCCTTCGTCTAGAGGCCCAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACAGGGGTTCGAATCCCCTAGGGGACGCCACTTGCTGGTTTGTGAGTGAAAGTCGCCGACCTTAATATCTCAAAACTCATCTTCggg < 1:1029514/150‑1 (MQ=40) cAATTTTCGTGTCCCCTTCGTCTAGAGGCCCAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACAGGGGTTCGAATCCCCTAGGGGACGCCACTTGCTGGTTTGTGAGTGAAAGTCGCCGACCTTAATATCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGtt < 2:548377/150‑1 (MQ=255) cAATTTTCGTGTCCCCTTCGTCTAGAGGCCCAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACAGGGGTTCGAATCCCCTAGGGGACGCCACTTGCTGGTTTGTGAGTGAAAGTCGCCGACCTTAATATCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGtt > 1:201352/1‑150 (MQ=255) cAATTTTCGTGTCCCCTTCGTCTAGAGGCCCAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACAGGGGTTCGAATCCCCTAGGGGACGCCACTTGCTGGTTTGTGAGTGAAAGTCGCCGACCTTAATATCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGtt < 1:1578530/150‑1 (MQ=255) tttcgtgtCCCCTTCGTCTAGAGGCCCAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACAGGGGTTCGAATCCCCTAGGGGACGCCACTTGCTGGTTTGTGAGTGAAAGTCGCCGACCTTAATATCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTgag < 2:772447‑M2/142‑1 (MQ=255) cgaagatgtttctttcgattcatcatcgtgttgcgaaaatttgagagactcacgaacaactttcgttgttcagtgtttcaattttcagcttgatccagatttttaaagagcaAATATCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGata < 1:183181‑M2/38‑1 (MQ=255) tgtCCCCTTCGTCTAGAGGCCCAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACAGGGGTTCGAATCCCCTAGGGGACGCCACTTGCTGGTTTGTGAGTGAAAGTCGCCGACCTTAATATCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATAtt < 2:653643‑M2/147‑1 (MQ=255) tgtCCCCTTCGTCTAGAGGCCCAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACAGGGGTTCGAATCCCCTAGGGGACGCCACTTGCTGGTTTGTGAGTGAAAGTCGCCGACCTTAATATCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATAtt < 1:1477552‑M2/147‑1 (MQ=255) gtCCCCTTCGTCTAGAGGCCCAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACAGGGGTTCGAATCCCCTAGGGGACGCCACTTGCTGGTTTGTGAGTGAAAGTCGCCGACCTTAATATCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATAttt > 1:692196‑M2/3‑150 (MQ=255) gatgtttctttcgattcatcatcgtgttgcgaaaatttgagagactcacgaacaactctcgttgttcagtgtttcaattttcagcttgatccagatttttaaagagcaAATATCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTg < 1:986615‑M2/42‑1 (MQ=255) ccccTTCGTCTAGAGGCCCAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACAGGGGTTCGAATCCCCTAGGGGACGCCACTTGCTGGTTTGTGAGTGAAAGTCGCCGACCTTAATATCTCAAAACTCAACTTCGGGTGATGTTTGAGATAttagg > 1:256261/1‑147 (MQ=255) ccTTCGTCTAGAGGCCCAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACAGGGGTTCGAATCCCCTAGGGGACGCCACTTGCTGGTTTGTGAGTGAAAGTCGCCGACCTTAATATCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGctg > 2:301804/1‑149 (MQ=37) cTTCGTCTAGAGGCCCAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACAGGGGTTCGAATCCCCTAGGGGACGCCACTTGCTGGTTTGTGAGTGAAAGTCGCCGACCTTAATATCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGctct < 2:343360/150‑1 (MQ=37) ttCGTCTAGAGGCCCAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACAGGGGTTCGAATCCCCTAGGGGACGCCACTTGCTGGTTTGTGAGTGAAAGTCGCCGACCTTAATATCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCtt < 1:1307909/150‑1 (MQ=37) tCGTCTCGAGGCCCAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACAGGGGTTCGAATCCCCTAGGGGACGCCACTTGCTGGTTTGTGAGTGAAAGTCGCCGACATTAATATCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCttt < 2:932169/150‑1 (MQ=255) cggcTAGCGGCCCAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACATGGGTTCGTATCCCCTAGGGGACGCCACTTGCTGGTTTGTGAGTGTAAGTCGCCGACCTTAATATCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTa < 2:971761/147‑1 (MQ=11) 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ccTTAATATCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAGAGTTGTTCGTGAGTCTCTCAAATTTTCGCAACACGATGATGAATCGAAAGAAACa < 2:1558610/150‑1 (MQ=32) tAATATCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAGAGTTGTTCGTGAGTCTCTCAAATTTTCGCAACACGATGATGAATCGAAAGAAACATCt > 1:1542996/1‑150 (MQ=32) | ACACGAAAATATCACGCAACGCGTGATAAGCAATTTTCGTGTCCCCTTCGTCTAGAGGCCCAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACAGGGGTTCGAATCCCCTAGGGGACGCCACTTGCTGGTTTGTGAGTGAAAGTCGCCGACCTTAATATCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAGAGTTGTTCGTGAGTCTCTCAAATTTTCGCAACACGATGATGAATCGAAAGAAACATCT > NC_000913/4168332‑4168629 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |