| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | = 4304585 | 84 (0.910) | 5 (0.060) | 5/254 | NT | 5.9% | intergenic (‑182/+27) | ytcA/yjcS | putative lipoprotein YtcA/alkyl sulfatase |
| ? | NC_000913 | = 4304591 | 81 (0.950) | intergenic (‑188/+21) | ytcA/yjcS | putative lipoprotein YtcA/alkyl sulfatase | |||||
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
GAATATCAATATCCATTGAAGGCGTCAGTATGGCTATTTTCTTGATGAATAAAAATAGCTTTATTCAGCCACCGCATTCATAACTTATATATTTTATTTATTAATTGGCTGTATATATTTTTAAAATAAATACTTTTGGGGGCTTCAGCGCCCCCAAAAGCGAGTGACATTAATTTGGGGTTACGATATTCACCCACAAATCGAAATTATCCAGACAGGCGATAATTTCTTCCAGTTTCGCGCCATTGCCAATAATTTTGGCTTTCTTCGCTTTTACCAGATCCGCCATTTTGGCTT > NC_000913/4304443‑4304739 | gAATATCAATATCCATTGAAGGCGTCAGTATGGCTATTTTCTTGATGAATAAAAATAGCTTTATTCAGCCACCGCATTCATAACTTATATATTTTATTTATTAATTGGCTGTATATATTTTTAAAATAAATACTTTTGGGGGCTTCAGCg > 1:537847‑M2/1‑149 (MQ=255) tcaatatcCATTGAAGGCGTCAGTATGGCTATTTTCTTGATGAATAAAAATAGCTTTATTCAGCCACCGCATTCATAACTTATATATTTTATTTATTAATTGGCTGTATATATTTTTAAAATAAATACTTTTGGGGGCTTCAGCgccccc > 2:753607‑M2/1‑144 (MQ=255) caatatcCATTGAAGGCGTCAGTATGGCTATTTTCTTGATGAATAAAAATAGCTTTATTCAGCCACCGCATTCATAACTTATATATTTTATTTATTAATTGGCTGTATATATTTTTAAAATAAATACTTTTGGGGGCTTCAGCgccccca > 1:459945‑M2/1‑143 (MQ=255) caatatcCATTGAAGGCGTCAGTATGGCTATTTTCTTGATGAATAAAAATAGCTTTATTCAGCCACCGCATTCATAACTTATATATTTTATTTATTAATTGGCTGTATATATTTTTAAAATAAATACTTTTGGGGGCTTCAGCgccccca < 2:470034‑M2/150‑8 (MQ=255) tatcCATTGAAGGCGTCAGTATGGCTATTTTCTTGATGAATAAAAATAGCTTTATTCAGCCACCGCATTCATAACTTATATATTTTATTTATTAATTGGCTGTATATATTTTTAAAATAAATACTTTTGGGGGCTTCAGCgcccccaaaa < 2:244379‑M2/150‑11 (MQ=255) tatcCATTGAAGGCGTCAGTATGGCTATTTTCTTGATGAATAAAAATAGCTTTATTCAGCCACCGCATTCATAACTTATATATTTTATTTATTAATTGGCTGTATATATTTTTAAAATAAATACTTTTGGGGGCTTCAGCgcccccaaaa > 1:130951‑M2/1‑140 (MQ=255) ccATTGAAGGCGTCAGTATGGCTATTTTCTTGATGAATAAAAATAGCTTTATTCAGCCACCGCATTCATAACTTATATATTTTATTTATTAATTGGCTGTATATATTTTTAAAATAAATACTTTTGGGGGCTTCAGCGCCCCCAAAAGCg < 2:672974/150‑1 (MQ=255) ccATTGAAGGCGTCAGTATGGCTATTTTCTTGATGAATAAAAATAGCTTTATTCAGCCACCGCATTCATAACTTATATATTTTATTTATTAATTGGCTGTATATATTTTTAAAATAAATACTTTTGGGGGCTTCAGCGCCCCCAAAAGCg < 2:211055/150‑1 (MQ=255) ccATTGAAGGCGTCAGTATGGCTATTTTCTTGATGAATAAAAATAGCTTTATTCAGCCACCGCATTCATAACTTATATATTTTATTTATTAATTGGCTGTATATATTTTTAAAATAAATACTTTTGGGGGCTTCAGCGCCCCCAAAAGCg < 1:1480391/150‑1 (MQ=255) cATTGAAGGCGTCAGTATGGCTATTTTCTTGATGAATAAAAATAGCTTTATTCAGCCACCGCATTCATAACTTATATATTTTATTTATTAATTGGCTGTATATATTTTTAAAATAAATACTTTTGGGGGCTTCAGCGCCCCCAAAAGCGa > 2:192895/1‑150 (MQ=255) cATTGAAGGCGTCAGTATGGCTATTTTCTTGATGAATAAAAATAGCTTTATTCAGCCACCGCATTCATAACTTATATATTTTATTTATTAATTGGCTGTATATATTTTTAAAATAAATACTTTTGGGGGCTTCAGCGCCCCCAAAAGCGa > 2:326060/1‑150 (MQ=255) gAAGGCGTCAGTATGGCTATTTTCTTGATGAATAAAAATAGCTTTATTCAGCCACCGCATTCATAACTTATATATTTTATTTATTAATTGGCTGTATATATTTTTAAAATAAATACTTTTGGGGGCTTCAGCGCCCCCAAAAGCGAGTGa > 2:1596732/1‑150 (MQ=255) gAAGGCGTCAGTATGGCTATTTTCTTGATGAATAAAAATAGCTTTATTCAGCCACCGCATTCATAACTTATATATTTTATTTATTAATTGGCTGTATATATTTTTAAAATAAATACTTTTGGGGGCTTCAGCGCCCCCAAAAGCGAGTGa > 2:909294/1‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |