| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,883,027 | C→G | 5.9% | intergenic (+30/‑161) | dmlA → / → yeaV | D‑malate/3‑isopropylmalate dehydrogenase (decarboxylating)/putative transporter YeaV |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,883,027 | 0 | C | G | 5.9% | 280.3 / 5.6 | 84 | intergenic (+30/‑161) | dmlA/yeaV | D‑malate/3‑isopropylmalate dehydrogenase (decarboxylating)/putative transporter YeaV |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (42/37); new base G (2/3); total (44/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.65e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.29e-01 | |||||||||||
AACGGTATTCTGGCAGCAATTGAAGAAGTGATTGCTCACGGGCCGAAAACACCTGATATGAAAGGCAATGCCACCACGCCACAGGTTGCCGACGCGATTTGCAAAATTATTTTGCGTTAAGGTCAAACCAGTTTATTTGAACCGCGTCACTGACGCGGTTTTTTTATTCGTTCTTTGCAGTAAATAACCTGCGTCATTTCACCTTTTATTGTTTCCGTTTCGTGTTTTATGGCTTTCCGTATTCTTAATTGTTTAATTTATGTAACATGCAAATTTTGTTACGCGTACGTTAGGTTCCG > NC_000913/1882878‑1883176 | aaCGGTATTCTGGCAGCAATTGAAGAAGTGATTGCTCACGGGCCGAAAACACCTGATATGAAAGGCAATGCCACCACGCCACAGGTTGCCGACGCGATTTGCAAAATTCTTTTGCGTTAAGGTCAAACCAGTTTATTTGAACCGCGTCAc < 2:20253/150‑1 (MQ=255) gggTTTTGTGGCAGCAATTGAAGAATTGATTGCTCACGGGCCGAAAAGACCTGATATGAAAGGCAATGCCACCACGCCACAGGGTGCCGACGCGATTTGCAAAATTATTTTGGGTTAAGGTCAAACCAGTTTATTTGAAGGGCGGCACTg < 2:1001902/149‑1 (MQ=255) ggCAGCAATTGAAGAAGTGATTGCTCACGGGCCGAAAACACCTGATATGAAAGGCAATGCCACCACGCCACAGGTTGCCGACGCGATTTGCAAAATTATTTTGCGTTAAGGTCAAACCAGTTTATTTGAACCGCGTCACTGACGCGGt > 1:1304178/1‑148 (MQ=255) ggCAGCAATTGAAGAAGTGATTGCTCACGGGCCGAAAACACCTGATATGAAAGGCAATGCCACCACGCCACAGGTTGCCGACGCGATTTGCAAAATTATTTTGCGTTAAGGTCAAACCAGTTTATTTGAACCGCGTCACTGACGCGGt < 2:1304178/148‑1 (MQ=255) cagcaATTGAAGAAGTGATTGCTCACGGGCCGAAAACACCTGATATGAAAGGCAATGCCACCACGCCACAGGTTGCCGACGCGATTTGCAAAATTATTTTGCGTTAAGGTCAAACCAGTTTATTTGAACCGCGTCAGTGACGCGGttcaa < 1:91276/150‑4 (MQ=255) tgcaATTGAAGAAGTGATTGCTCACGGGCCGAAAACACCTGATATTAAAGGCAATGCCACCACGCCACAGGTTGCCGACGCGATTTGCAAAATTATTTTGCGTTAAGGTCAAACCAGTTTACTTGAACCGCGTCACTGACGCGGtttttt < 1:1467614/149‑1 (MQ=255) tgcaATTGAAGAAGTGATTGCTCACGGGCCGAAAACACCTGATATGAAAGGCAATGCCACCACGCCACAGGTTGCCGACGCGATTTGCAAAATTATTTTGCGTTAAGGTCAAACCAGTTTAGTTGAACCGCGTCACTGACGCGGtttttt < 1:1473505/149‑1 (MQ=255) agcaATTGACGAAGTGATGGCTCACGGGCCGAAAACACCTGATATGAAAGGCAATGCCACCACGCCACAGGTTGCCGACGCGATTTGCAAAATTATTTTGCGTTAAGGTCAAACCAGTTTATTTGAACCGCGTCACTGACGCGGtttttt < 2:1595479/150‑1 (MQ=255) agcaATTGAAGAAGTGATTGCTCACGGGCCGAAAACACCTGATATGAAAGGCAATGCCACCACGCCACAGGTTGCCGACGCGATTTGCAAAATTATTTTGCGTTAAGGTCAAACCAGTTTATTTGAACCGCGTCACTGACGCGGtttttt < 2:757408/150‑1 (MQ=255) gcaATTGAAGAAGTGATTGCTCACGGGCCGAAAACACCTGATATGAAAGGCAATGCCACCACGCCACAGGTTGCCGACGCGATTTGCAAAATTATTTTGCGTTAAGGTCAAACCAGTTTATTTGAACCGCGTCACTGACGCGGttttttt > 1:1209173/1‑150 (MQ=255) gcaATTGAAGAAGTGATTGCTCACGGGCCGAAAACACCTGATATGAAAGGCAATGCCACCACGCCACAGGTAGCCGACGCGATTTGCAAAATTATTTTGCGTTAAGGTCAAACCAGATTACATGAACCGCGTCACTCAGGCGGgttttta > 2:1473505/1‑149 (MQ=255) gcaATTGAAGAAGTGATTGCTCACGGGCCGAAAACACCTGATATGAAAGGCAATGCCACCACGCCAAAGGTTGCCGACGCGATTTGCAAAATTATTTTGCGTTAATGTAAAACCAGTTTAATTGAACCGCGTCACTGACGCGGttttttt > 2:1467614/1‑150 (MQ=255) aaTTGAAGAAGTGATTGCTCACGGGCCGAAAACACCTGATATGAAACGCAATGCCACCACGCCACAGGTTGCCGACGCGATTTGCAAAATTATTTTGCGTTAAGGTCAAACCAGTTTATTTGAACCGCGTCACTGACGCGGTTTTTTTAt < 2:1605233/150‑1 (MQ=255) 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gATATGAAAGGCAATGCCACCACGCCACAGGTTGCCGACGCGATTTGCAAAATTATTTTGCGTTAAGGTCAAACCAGTTTATTTGAACCGCGTCACTGACGCGGTTTTTTTATTCGTTCTTTGCAGTAAATAACCTGCGTCATTTCACCt > 2:1061049/1‑150 (MQ=255) tatGAAAGGCAATGCCACCACGCCACAGGTTGCCGACGCGATTTCCAAAATTATTTTGCGTTAAGGCCAAACCAGTTTATTTGAACCGCGTCACTGACGCGGTTTTTTTATTCGTTCTTTGCAGTAAATAACCTGCGTCATTTCACCttt < 1:1229329/150‑1 (MQ=255) tGAAAGGCAATGCCACCACGCCACAGGTTGCCGACGCGATTTGCAAAATTATTTTGCGTTAAGGTCAAACCAGTTTATTTGAACCGCGTCACTGACGCGGTTTTTTTATTCGTTCTTTGCAGTAAATAACCTGCGTCATTTCACCTTTTa < 1:705212/150‑1 (MQ=255) gAAAGGCAATGCCACCACGCCACAGGTTGCCGACGCGATTTGCAAAATTATTTTGCGTTAAGGTCAAACCAGTTTATTTGAAGCGCGTCACTGTCGCGGTTTTTTTATTCGTTCTTTGCAGTTAATAACCTGCGTCATTTCACCtttttt < 2:510427/150‑3 (MQ=255) gAAAGGCAATGCCACCACGCCACAGGTTGCCGACGCGATTTGCAAAATTATTTTGCGTTAAGGTCAAACCAGTTTATTTGAACCGCGTCACTGACGCGGTTTTTTTATTCGTTCTTTGCAGTAAATAACCTGCGTCATTTCACCTTTTAt > 2:826004/1‑150 (MQ=255) 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gcgTCACTGACGCGGTTTTTTTATTCGTTCTTTGCAGTAAATAACCTGCGTCATTTCACCTTTTATTGTTTCCGTTTCGTGTTTTATGGCTTTCCGTATTCTTAATTGTTTAATTTATGTAACATGCAAATTTTGTTACGCGTACGTTAg < 1:1061049/150‑1 (MQ=255) tCAGTGACGCGGTTTTTTTATTCGTTCTTTGCAGTAAATAACCTGCGTCATTTCACCTTTTATTGTTTCCGTTTCGTGTTTTATGGCTTTCCGTATTCTTAATTGTTTAATTTATGTAACATGCAAATTTTGTTACGCGTACGTTAGGtt < 2:828003/150‑1 (MQ=255) cTGACGCGGTTTTTTTATTCGTTCTTTGCAGTAAATAACCTGCGTCATTTCACCTTTTATTGTTTCCGTTTCGTGTTTTATGGCTTTCCGTATTCTTAATTGTTTAATTTATGTAACATGCAAATTTTGTTACGCGTACGTTAGGTTccg > 1:1338437/1‑150 (MQ=255) | AACGGTATTCTGGCAGCAATTGAAGAAGTGATTGCTCACGGGCCGAAAACACCTGATATGAAAGGCAATGCCACCACGCCACAGGTTGCCGACGCGATTTGCAAAATTATTTTGCGTTAAGGTCAAACCAGTTTATTTGAACCGCGTCACTGACGCGGTTTTTTTATTCGTTCTTTGCAGTAAATAACCTGCGTCATTTCACCTTTTATTGTTTCCGTTTCGTGTTTTATGGCTTTCCGTATTCTTAATTGTTTAATTTATGTAACATGCAAATTTTGTTACGCGTACGTTAGGTTCCG > NC_000913/1882878‑1883176 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |