| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 177,409 | G→C | 6.4% | S72R (AGC→AGG) ‡ | yadS ← | conserved inner membrane protein YadS |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 177,409 | 0 | G | C | 6.4% | 257.6 / 6.2 | 78 | S72R (AGC→AGG) ‡ | yadS | conserved inner membrane protein YadS |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (40/33); new base C (2/3); total (42/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.57e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.94e-01 | |||||||||||
TACAAACCGCGATTAACGGACCGGCTTCCGCATTAAAGGCTTTATTCACGCCAATGCCGACAAACACCGCCAGACCAACGGCGTCCAGCACCGGCAACATCCATTTTGGTAAGCGTCTTGGCTGGCGCACCAGCACGATGGTCAGCATGCTGGTGACCATTGCAACGACCAGATCGGTGGGATCTTTCACCCAAAATACCGGGCCGTGATCCAGCGCCATGTCGCGAATTGTCCCGCCGCCTACTGCGGTTACCACGCCCAGTACCAGAACACCAAAAGGGTCCATACGCAATT > NC_000913/177261‑177554 | tACAAACCGCGATTAACGGACCGGCTTCCGCATTAAAGGCTTTATTCACGCCAATGCCGACAAACACCGCCAGACCAACGGCGTCCAGCACCGGCAACATCCATTTTGGTAAGCGTCTTGGCTGGCGCACCAGCACGATGGTCAGCATGc > 2:1556355/1‑150 (MQ=255)tACAAACCGCGATTAACGGACCGGCTTCCGCATTAAAGGCTTTATTCACGCCAATGCCGACAAACACCGCCAGACCAACGGCGTCCAGCACCGGCAACATCCATTTTGGTAAGCGTCTTGGCTGGCGCACCAGCACGATGGTCAGCATGc < 1:404640/150‑1 (MQ=255) aaaCCGCGATTAACGGACCGGCTTCCGCATTAAAGGCTTTATTCACGCCATTTTTGATAAAGATAGCCAGACCAACGTCTTCCAGAACATTCTACATGCATTTTGGTAAGGTTGTTGTTTGGATCACCAGCACGATGGTCAGCATGCTgg < 2:652267/150‑1 (MQ=255) aCCGCGATTAACGGACCGGCTTCCGCATTAAAGGCTTTATTCACGCCAATGCCGACAAACACCGCCAGACCAACGGCGTCCAGCACCGGCAACATCCATTTTGGTAAGCGTCTTGGCTGGCGCACCAGCACGATGGTCAGCATGCTGGTg > 1:274152/1‑150 (MQ=255) cgATTAACGGACCGGCTTCCGCATTAAAGGCTTTATTCACGCCAATGCCGACAAACACCGCCAGACCAACGGCGTCCAGCACCGGCAACATCCATTTTGGTAAGCGTCTTGGCTGGCGCACCAGCACGATGGTCAGCATGCTGGTGACCa < 1:755374/150‑1 (MQ=255) cgATTAACGGACCGGCTTCCGCATTAAAGGCTTTATTCACGCCAATGCCGACAAACACCGCCAGACCAACGGCGTCCAGCACCGACAACATCCATTTTGGTAAGCGTCTTGGCTGGCGCACCAGCACGATGGTCAGCATGCTGGTGACCa < 2:1151639/150‑1 (MQ=255) ttAACGGACCGGCTTCCGCATTAAAGGCTTTATTCACGCCAATGCCGACAAACACCGCCAGACCAACGGCGTCCAGCACCGGCAACATCCATTTTGGTAAGCGTCTTGGCTGGCGCACCAGCACGATGGTCACCAGCATGCTGACCAtcg < 1:773950/150‑3 (MQ=255) aaCGGACCGGCTTCCGCATTAAAGGCTTTATTCACGCCAATGCCGACAAACACCGCGAGACCAACGGCGTCCAGCACCGGCAACATCCATTTTGGTAAGCGTCTTGGCTGGCGCACCAGCACGATGGTCACCAGCATGCTGACCAtcgtg < 1:1583263/150‑5 (MQ=255) ggACCGGCTTCCGCATTAAAGGCTTTATTCACGCCAATGCCGACAAACACCGCCAGACCAACGGCGTCCAGCACCGGCAACATCCATTTTGGTAAGCGTCTTGGCTGGCGCACCAGCACGATGGTCAGCATGCTGGTGACCATTGCAACg < 1:1117513/150‑1 (MQ=255) ggACCGGCTTCCGCATTAAAGGCTTTATTCACGCCAATGCCGACAAACACCGCCAGACCAACGGCGTCCAGCACCGGCAACATCCATTTTGGTAAGCGTCTTGGCTGGCGCACCAGCACGATGGTCACCAGCATGCTGACCAtcgtgctg < 1:1594462/150‑8 (MQ=255) ccGGCTTCCGCATTAAAGGCTTTATTCACGCCAATGCCGACAAACACCGCCAGACCAACGGCGTCCAGCACCGGCAACATCCATTTTGGTAAGCGTCTTGGCTGGCGCACCAGCACGATGGTCAGCATGCTGGTGACCATTGCAACGAcc < 1:1544041/150‑1 (MQ=255) ccGGCTTCCGCATTAAAGGCTTTATTCACGCCAATGCCGACAAACACCGCCAGACCAACGGCGTCCAGCACCGGCAACATCCATTTTGGTAAGCGACTTGGCTGGCGCACCAGCACGATCGTCAGCATGCTGGTGACCATTGCAACGAcc > 1:1142404/1‑150 (MQ=255) cGCATTAAAGGCTTTATTCACGCCAATGCCGACAAACACCGCCAGACCAACGGCGTCCAGCACCGGCAACATCCATTTTGGTAAGCGTCTTGGCTGGCGCACCAGCACGATGGTCAGCATGCTGGTGACCATTGCAACGACCAGATCGGt > 1:1196960/1‑150 (MQ=255) ttAAAGGCTTTATTCACGCCAATGCCGACAAACACCGCCAGACCAACGGCGTCCAGCACCGGCAACATCCATTTTGGTAAGCGTCTTGGCTGGCGCACCAGCACGATGGTCAGCATGCTGGTGACCATTGCAACGACCAGATCGGTGGGa < 2:1598775/150‑1 (MQ=255) tAAAGGCTTTATTCACGCCAATGCCGACAAACACCGCCAGACCAACGGCGTCCAGCACCGGCAACATCCATTTTGGTAAGCGTCTTGGCTGGCGCACCAGCACGATGGTCAGCATGCTGGTGACCATTGCAACGACCAGATCGGTGGGAt > 2:1073453/1‑150 (MQ=255) aaaGGCTTTATTCACGCCAATGCCGACAAACACCGCCAGACCAACGGCGTCCAGCACCGGCAACATCCATTTTGGTAAGCGTCTTGGCTGGCGCACCAGCACGATGGTCAGCATGCTGGTGACCATTGCAACGACCAGATCGGTGGGATc < 2:1214081/150‑1 (MQ=255) aaaGGCTTTATTCACGCCAATGCCGACAAACACCGCCAGACCAACGGCGTCCAGCACCGGCAACATCCATTTTGGTAAGCGTCTTGGCTGGCGCACCAGCACGATGGTCAGCATGCTGGTGACCATTGCAACGACCAGATCGGTGGGATc > 2:570892/1‑150 (MQ=255) ggCTTTATTCACGCCAATGCCGACAAACACCGCCAGACCAACGGCGTCCAGCACCGGCAACATCCATTTTGGTAAGCGTCTTGGCTGGCGCACCAGCACGATGGTCAGCATGCTGGTGACCATTGCAACGACCAGATCGGTGGGATCttt > 1:963187/1‑150 (MQ=255) gCTTTATTCACGCCAATGCCGACAAACACCGCCAGACCAACGGCGTCCAGCACCGGCAACATCCATTTTGGTAAGCGTCTTGGCTGGCGCACCAGCACGATGGTCAGCATGCTGGTGACCATTGCAACGACCAGATCGGTGGGATCTTTc > 1:904552/1‑150 (MQ=255) tATTCACGCCAATGCCGACAAACACCGCCAGACCAACGGCGTCCAGCACCGGCAACATCCATTTTGGTAAGCGTCTTGGCTGGCGCACCAGCACGATGGTCAGCATGCTGGTGACCATTGCAACGACCAGATCGGTGGGATCTTTCAccc > 2:801409/1‑150 (MQ=255) aTTCACGCCAATGCCGACAAACACCGCCAGACCAACGGCGTCCAGCACCGGCAACATCCATTTTGGTAAGCGTCTTGGCTGGCGCACCAGCACGATGGTCAGCATGCTGGTGACCATTGCAACGACCAGATCGGTGGGATCTTTCACCCa > 1:887247/1‑150 (MQ=255) aTTCACGCCAATGCCGACAAACACCGCCAGACCAACGGCGTCCAGAACCGGCAACATCCATTTTGGTAAGCGTCTTGGCTGGCGCACCAGCACGATGGTCAGCATGCTGGTGACCATTGCAACGCCCAGATCGGTGGGATCTTTCACCCa > 2:710159/1‑150 (MQ=255) ttCACGCCAATGCCGACAAACACCGCCAGACCAACGGCGTCCAGCACCGGCAACATCCATTTTGGTAAGCGTCTTGGCTGGCGCACCAGCACGATGGTCAGCATGCTGGTGACCATTGCAACGACCAGATCGGTGGGATCTTTCACCCaa > 2:1617941/1‑150 (MQ=255) ccAATGCCGACAAACACCGCCAGACCAACGGCGTCCAGCACCGGCAACATCCATTTTGGTAAGCGGCTTGGCTGGCGCACCAGCACGATGGTCAGCATGCTGGTGACCATTGCAACGACCAGATCGGTGGGATCTTTCACCCAAAATAcc < 2:1068208/150‑1 (MQ=255) aaTGCCGACAAACACCGCCAGACCAACGGCGTCCAGCACCGGCAACATCCATTTTGGTAAGCGTCTTGGCTGGCGCACCAGCACGATGGTCAGCATGCTGGTGACCATTGCAACGACCAGATCGGTGGGATCTTTCACCCAAAATACCgg < 1:1277928/150‑1 (MQ=255) gCCGACAAACACCGCCAGACCAACGGCGTCCAGCACCGGCAACATCCATTTTGGTAAGCGTCTTGGCTGGCGCACCAGCACGATGGTCAGCATGCTGGTGACCATTGCAACGACCAGATCGGTGGGATCTTTCACCCAAAATACCGGGcc < 2:887247/150‑1 (MQ=255) gCCGACAAACACCGCCAGACCAACGGCGTCCAGCACCGGCAACATCCATTTTGGTAAGCGTCTTGGCTGGCGCACCAGCACGATGGTCAGCATGCT‑GTGACCATTGCAACGACCAGATCGGTGGGATCTTTCACCCAAAATACCGGGCCg > 1:36609/1‑150 (MQ=255) ccGACAAACACCGCCAGACCAACGGCGTCCAGCACCGGCAACATCCATTTTGGTAAGCGTCTTGGCTGGCGCACCAGCACGATGGTCAGCATGCTGGTGACCATTGCAACGACCAGATCGGTGGGATCTTTCACCCAAAATACCGGGc < 2:1452308/148‑1 (MQ=255) ccGACAAACACCGCCAGACCAACGGCGTCCAGCACCGGCAACATCCATTTTGGTAAGCGTCTTGGCTGGCGCACCAGCACGATGGTCAGCATGCTGGTGACCATTGCAACGACCAGATCGGTGGGATCTTTCACCCAAAATACCGGGc > 1:1452308/1‑148 (MQ=255) ccGACAAACACCGCCAGACCAACGGCGTCCAGCACCGGCAACATCCATTTTGGTAAGCGTCTTGGCTGGCGCACCAGCACGATGGTCAGCATGCTGGTGACCATTGCAACGACCAGATCGGTGGGATCTTTCACCCAAAATACCGGGCCg > 2:571561/1‑150 (MQ=255) cAAACACCGCCAGACCAACGGCGTCCAGCACCGGCAACATCCATTTTGGTAAGCGTCTTGGCTGGCGCACCAGCACGATGGTCAGCATGCTGGTGACCATTGCAACGACCAGATCGGTGGGATCTTTCACCCAAAATACCGGGCCGTGAt > 2:1233831/1‑150 (MQ=255) aaCACCGCCAGACCAACGGCGTCCAGCACCGGCAACATCCATTTTGGTAAGCGTCTTGGCTGGCGCACCAGCACGATGGTCAGCATGCTGGTGACCATTGCAACGACCAGATCGGTGGGATCTTTCACCCAAAATACCGGGCCGTGATcc > 2:55543/1‑150 (MQ=255) aaCACCGCCAGACCAACGGCGTCCAGCACCGGCAACATCCATTTTGGTAAGCGTCTTCGCTGGCGCACCAGCACGATGGTCAGCATGCTGGTGACCATTGCAACGACCAGATCGGTGGGATCTTTAACCCAAAATACCGGGCCGTGATcc > 1:209508/1‑150 (MQ=255) aaCACCGCCAGACCAACGGCGTCCAGCACCGGCAACATCCAATTTGGTAAGCGTCTTGGCTGGCGCACCAGCACGATGGTCAGCATGCTGGTGACCATTGCAACGACCAGATCGGTGGGATCTTTCACCCAAAATACCGGGCCGTGATcc > 1:942451/1‑150 (MQ=255) cGCCAGACCAACGGCGTCCAGCACCGGCAACATCCATTTTGGTAAGCGTCTTGGCTGGCGCACCAGCACGATGGTCAGCATGCT‑GTGACCATTGCAACGACCAGATCGGTGGGATCTTTCACCCAAAATACCGGGCCGTGATCCAGCGcc < 2:36609/150‑1 (MQ=255) cAACGGCGTCCAGCACCGGCAACATCCATTTTGGTAAGCGTCTTGGCTGGCGCACCAGCACGATGGTCAGCATGCTGGTGACCATTGCAACGACCAGATCGGTGGGATCTTTCACCCAAAATACCGGGCCGTGATCCAGCGCCATGTcgc > 1:918687/1‑150 (MQ=255) tCCAGCACCGGCAACATCCATTTTGGTAAGCGTCTTGGCTGGCGCACCAGCACGATGGTCAGCATGCTGGTGACCATTGCAACGACCAGATCGGTGGGATCTTTCACCCAAAATACCGGGCCGTGATCCAGCGCCATGTCGCGAATTGTc < 1:55543/150‑1 (MQ=255) cAGCACCGGCAACATCCATTTTGGTAAGCGTCTTGGCTGGCGCACCAGCACGATGGTCAGCATGCTGGTGACCATTGCAACGACCAGATCGGTGGGATCTTTCACCCAAAATACCGGGCCGTGATCCAGCGCCATGTCGCGAATTGTccc > 1:877121/1‑150 (MQ=255) aGCACCGGCAACATCCATTTTGGTAAGCGTCTTGGCTGGCCCACCAGCACGATGGTCAGCATGCTGGTGACCATTGCAACGACCAGATCGGTGGGATCTTTCACCCAAAATACCGGGCCGTGATCCAGCGCCATGTCGCGAATTGTCccg > 2:174964/1‑150 (MQ=255) gCACCGGCAACATCCATTTTGGTAAGCGTCTTGGCTGGCGCACCAGCACGATGGTCAGCATGCTGGTGACCATTGCAACGACCAGATCGGTGGGATCt < 2:338358/98‑1 (MQ=255) gCACCGGCAACATCCATTTTGGTAAGCGTCTTGGCTGGCGCACCAGCACGATGGTCAGCATGCTGGTGACCATTGCAACGACCAGATCGGTGGGATCt > 1:338358/1‑98 (MQ=255) cGGCAACATCCATTTTGGTAAGCGTCTTGGCTGGCGCACCAGCACGATGGTCAGCATGCTGGTGACCATTGCAACGACCAGATCGGTGGGATCTTTCACCCAAAATACCGGGCCGTGATCCAGCGCCATGTCGCGAATTGTCCCgccgcc < 1:610020/150‑1 (MQ=255) gCAACATCCATTTTGGTAAGCGTCTTGGCTGGCGCACCAGCACGATGGTCAGCATGCTGGTGACCATTGCAACGACCAGATCGGTGGGATCTTTCACCCAAAATACCGGGCCGTGATCCAGCGCCATGTCGCGAATTGTCCCGCCGCCTa > 1:739387/1‑150 (MQ=255) cATCCATTTTGGTAAGCGTCTTGGCTGGCGCACCAGCACGATGGTCAGCATGCTGGTGACCATTGCAACGACCAGATCGGTGGGATCTTTCACCCAAAATACCGGGCCGTGATCCAGCGCCATGTCGCGAATTGTCCCGCCGCCTACTGc < 1:1590268/150‑1 (MQ=255) aTCCATTTTGGTAAGCGTCTTGGCTGGCGCACCAGCACGATGGTCAGCATGCTGGTGACCATTGCAACGACCAGATCGGTGGGATCTTTCACCCAAAATACCGGGCCGTGATCCAGCGCCATGTCGCGAATTGTCCCGCCGCCTACTGCg > 1:1315162/1‑150 (MQ=255) tCCATTTTGGTAAGCGTCTTGGCTGGCGCACCAGCACGATGGTCAGCATGCTGGTGACCATTGCAACGACCAGATCGGTGGGATCTTTCACCCAAAATACCGGGCCGTGATCCAGCGCCATGTCGCGAATTGTCCCGCCGCCTACTGCgg < 1:570892/150‑1 (MQ=255) aTTTTGGTAAGCGTCTTGGCTGGCGCACCAGCACGATGGTCAGCATGCTGGTGACCATTGCAACGACCAGATCGGTGGGATCTTTCACCCAAAATACCGGGCCGTGATCCAGCGCCATGTCGCGAATTGTCCCGCCGCCTACTGCGGTTa < 1:860651/150‑1 (MQ=255) aTTTTGGTAAGCGTCTTGGCTGGCGCACCAGCACGATGGTCAGCATGCTGGTGACCATTGCAACGACCAGATCGGTGGGATCTTTCACCCAAAATACCGGGCCGTGATCCAGCGCCATGTCGCGAATTGTCCCGCCGCCTACTGCGGTTa < 1:801409/150‑1 (MQ=255) ttttGGTAAGCGTCTTGGCTGGCGCACCAGCACGATGGTCAGCATGCTGGTGACCATTGCAACGACCAGATCGGTGGGATCTTTCACCCAAAATACCGGGCCGTGATCCAGCGCCATGTCGCGAATTGTCCCGCCGCCTACTGCGGTTAc < 1:1014247/150‑1 (MQ=255) gTAAGCGTCTTGGCTGGCGCACCAGCACGATGGTCAGCATGCTGGTGACCATTGCAACGACCAGATCGGTGGGATCTTTCACCCAAAATACCGGGCCGTGATCCAGCGCCATGTCGCGAATTGTCCCGCCGCCTACTGCGGTTACCACGc < 1:830753/150‑1 (MQ=255) tAAGCGTCTTGGCTGGCGCACCAGCACGATGGTCAGCATGCTGGTGACCATTGCAACGACCAGATCGGTGGGATCTTTCACCCAAAATACCGGGCCGTGATCCAGCGCCATGTCGCGAATTGTCCCGCCGCCTACTGCGGTTACCAc < 2:490150/147‑1 (MQ=255) tAAGCGTCTTGGCTGGCGCACCAGCACGATGGTCAGCATGCTGGTGACCATTGCAACGACCAGATCGGTGGGATCTTTCACCCAAAATACCGGGCCGTGATCCAGCGCCATGTCGCGAATTGTCCCGCCGCCTACTGCGGTTACCAc > 1:490150/1‑147 (MQ=255) aaGCGTCTTGGCTGGCGCACCAGCACGATGGTCAGCATGCTGGTGACCATTGCAACGACCAGATCGGTGGGATCTTTCACCCAAAATACCGGGCCGTGATCCAGCGCCATGTCGCGAATTGTCCCGCCGCCTACTGCGGTTACCACGccc < 1:674022/150‑1 (MQ=255) ccatcgtgctggtGCGCCAGCACGATGGTCAGCATGCTGGTGCCCATTGCAACGACCAGATCGGTGGGATCTTTCACCCAAAATACCGGGCCGTGATCCCGCGCCATGTCGCGAATTGTCCCGCCGCCTACTGCGGTTACCACGCCCAGt > 1:1476190/8‑150 (MQ=255) catcgtgctggtGCGCCAGCACGATGGTCAGCATGCTGGTGACCATTGCACAGACCAGATCGGAGGGATCTTTCACCCAAAATCCCGGGCCGTGATACAGCGCCATGTCGCGAATTGTCGCGCCGCCTACTGCGGTTACCACGCCAAGTa > 1:847489/7‑150 (MQ=255) tCTTGGCTGGCGCACCAGCACGATGGTCAGCATGCTGGTGACCATTGCAACGACCAGATCGGTGGGATCTTTCACCCAAAATACCGGGCCGTGATCCAGCGCCATGTCGCGAATTGTCCCGCCGCCTACTGCGGTTACCACGCCCAGTAc < 1:710159/150‑1 (MQ=255) atcgtgctggtGCGCCAGCACGATGGTCAGCATGCTGGTGACCATTGCAACGACCAGATCGGTGGGATCTTTCACCCAAAATACCGGGCCGTGATCCAGCGCCATGTCGCGAATTGTCCCGCCGCCTACTGCGGTTACCACGCCCAGTAc > 1:1046836/6‑150 (MQ=255) tggctggcGCACCAGCACGATGGTCAGCATGCTGGTGACCATTGCAACGACCAGATCGGTGGGATCTTTCACCCAAAATACCGGGCCGTGATCCAGCGCCATGTCGCGAATTGTCCCGCCGCCTACTGCGGTTACCACGCCCAGTACCAg > 1:1274677/1‑150 (MQ=255) tggctggcGCACCAGCACGATGGTCAGCATGCTGGTGACCATTGCAACGACCAGATCGGTGGGATCTTTCACCCAAAATACCGGGCCGTGATCCAGCGCCATGTCGCGAATTGTCCCGCCGCCTACTGCGGTTACCACGCCCAGTACCAg > 1:1283345/1‑150 (MQ=255) tggctggcGCACCAGCACGATGGTCAGCATGCTGGTGACCATTGCAACGACCAGATCGGTGGGATCTTTCACCCAAAATACCGGGCCGTGATCCAGCGCCATGTCGCGAATTGTCCCGCCGCCTACTGCGGTTACCACGCCCAGTACCAg < 1:5026/150‑1 (MQ=255) tggtGCGCCAGCACGATGGTCAGCATGCTGGTGACCATTGCAACGACCAGATCGGTGGGATCTTTCACCCAAAATACCGGGCCGTGATCCAGCGCCATGTCGCGAATTGTCCCGCCGCCTACTGCGGTTACCACGCCCAGTACCAGAaca < 2:1046836/150‑1 (MQ=255) ggcGCACCAGCACGATGGGCAGCATGCTGGTGACCATTGCAACGACCAGATCGGTGGGATCTTTCACCCAAAATACCGGGCCGTGATCCAGCGCCATGTCGCGAATTGTCCCGCCGCCTACTGCGGTTACCACGCCCAGTACCAGAacac < 1:1077514/150‑1 (MQ=255) gcgcACCAGCACGATGGTCAGCATGCTGGTGACCATTGCAACGACCAGATCGGTGGGATCTTTCACCCAAAATACCCGGCCGTGATCCAGCGCCATGTCGCGAATTGTCCCGCCGCCTACTGCGGTTACCACGCCCAGTACCAGAACAcc < 2:1196960/150‑1 (MQ=255) cgcACCAGCACGATGGTCAGCATGCTGGTGACCATTGCAACGACCAGATCGGTGGGATCTTTCACCCAAAATACCGGGCCGTGATCCAGCGCCATGTCGCGAATTGTCCCGCCGGCTACTGCGGTTACCACGCCCAGTACCAGAACACCa < 2:1142404/150‑1 (MQ=255) tcACCAGCATGCTGACCATCGTGCTGGTGACCATTGCAACGACCAGATCGGTGGGATCTTTCACCCAAAATACCGGGCCGTGATCCAGCGCCATGTCGCGAATTGTCCCGCCGCCTACTGCGGTTACCACGCCCAGTACCAGAACACCaa > 1:1519605/2‑150 (MQ=255) cACCAGCATGCTGACCATCGTGCTGGTGACCATTGCAACGACCAGATCGGTGGGATCTTTAACCAAAAATACCGGGCCGTGATCCAGCGCCATGTAGCGAATTGTCCCGCCGCCTACTGCGGTTACCACGCCCAGTACCAGAACACCaaa > 2:1104226/1‑150 (MQ=255) ccAGCACGATGGTCAGCATGCTGGTGACCATTGCAACGACCAGATCGGTGGGATCTTTCACCCAAAATACCGGGCCGTGATCCAGCGCCATGTCGCGAATTGTCCCGCCGCCTACTGCGGTTACCACGCCCAGTACCAGAACACCAAAAg < 1:866906/150‑1 (MQ=255) aGCACGATGGTCAGCATGCTGGTGACCATTGCAACGACCAGATCGGTGGGATCTTTCACCCAAAATACCGGGCCGTGATCCAGCGCCATGTCGCGAATTGTCCCGCCGCCTACTGCGGTTACCACGCCCAGTACCAGAACACCAAAAggg > 2:916037/1‑150 (MQ=255) gcaaTGGTCACCAGCATGCTGACCATTGCAACGACCAGATCGGTGGGATCTTTCACCCAAAATACCGGGCCGTGCTCCAGCGCCATGTCGCGAATTGTCCCGCCGCCTACTGCGGTTACCACGCCCAGTACCAGAACACCAAGAGGGTcc > 2:589747/4‑150 (MQ=255) gcaaTGGTCACCAGCATGCTGACCATTGCAACGACCAGATCGGTGGGATCTTTCACCCAAAATACCGGGCCGTGATCCAGCGCCATGTCGCGAATTGTCCCGCCGCCTACTGCGGTTACCACGCCCAGTACCAGAACACCAAAAGGGTcc > 1:438963/4‑150 (MQ=255) cGATGGTCAGCATGCTGGTGACCATTGCAACGACCAGATCGGTGGGATCTTTCACCCAAAATACCGGGCCGTGATCCAGCGCCATGTCGCGAATTGTCCCGCCTCCTACTGCGGTTACCACGCCCAGTACCAGAACACCAAAAGGGTCCa > 2:1321244/1‑150 (MQ=255) cGATGGTCAGCATGCTGGTGACCATTGCAACGACCAGATCGGTGGGATCTTTCACCCAAAATACCGGGCCGTGATCCAGCGCCATGTCGCGAATTGTCCCGCCGCCTACTGCGGTTACCACGCCCAGTACCAGAACACCAAAAGGGTCCa > 1:544091/1‑150 (MQ=255) cGATGGTCAGCATGCTGGTGACCATTGCAACGACCAGATCGGTGGGATCTTTCACCCAAAATACCGGGCCGTGATCCAGCGCCATGTCGCGAATTGTCCCGCCGCCTACTGCGGTTACCACGCCCAGTACCAGAACACCAAAAGGGTCCa < 2:739387/150‑1 (MQ=255) aTGGTCAGCATGCTGGTGACCATTGCAACGACCAGATCGGTGGGATCTTTCACCCAAAATACCGGGCCGTGATCCAGCGCCATGTCGCGAATTGTCCCGCCGCCTACTGCGGTTACCACGCCCAGTACCAGAACACCAAAAGGGTCCATa < 1:1617941/150‑1 (MQ=255) tGGTCAGCATGCTGGTGACCATTGCAACGACCAGATCGGTGGGATCTTTCACCCAAAATACCGGGCCGTGATCCAGCGCCATGTCGCGAATTGTCCCGCCGCCTACTGCGGTTACCACGCCCAGTACCAGAACCCCAAAAGGGTCCATAc > 2:1601193/1‑150 (MQ=255) gTCAGCATGCTGGTGACCATTGCAACGACCAGATCGGTGGGATCTTTCACCCAAAATACCGGGCCGTGATCCAGCGCCATGTCGCGAATTGTCCCGCCGCCTACTGCGGTTACCACGCCCAGTACCAGAACACCAAAAGGGTCCATACGc > 1:1286597/1‑150 (MQ=255) cAGCATGCTGGTGACCATTTCAACGACCAGATCGGTGGGATCTTTAACACAAAATACCGGGCCGTTATACAGCGCCATGTATCGAATTGTCCCGCCGCCTACTGCGGTTACCACGCCCAGTACAACAACACCAAAAGGGTCAATACGCaa > 2:83159/1‑150 (MQ=255) gCATGCTGGTGACCATTGCAACGACCAGATCGCTGGGATCTTTCACCCAAAATACCGGGCCGTGATCCAGCGCCATGTCGCGAATTGTCCCGCCGCCTACTGCGGTTACCACGCCCAGTACCAGAACACCAAAAGGGTCCATACGCAAtt > 1:887971/1‑150 (MQ=255) | TACAAACCGCGATTAACGGACCGGCTTCCGCATTAAAGGCTTTATTCACGCCAATGCCGACAAACACCGCCAGACCAACGGCGTCCAGCACCGGCAACATCCATTTTGGTAAGCGTCTTGGCTGGCGCACCAGCACGATGGTCAGCATGCTGGTGACCATTGCAACGACCAGATCGGTGGGATCTTTCACCCAAAATACCGGGCCGTGATCCAGCGCCATGTCGCGAATTGTCCCGCCGCCTACTGCGGTTACCACGCCCAGTACCAGAACACCAAAAGGGTCCATACGCAATT > NC_000913/177261‑177554 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |