| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,946,036 | A→C | 11.9% | intergenic (‑60/+79) | ruvA ← / ← yobI | Holliday junction branch migration complex subunit RuvA/uncharacterized protein YobI |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,946,036 | 0 | A | C | 11.9% | 337.8 / 36.0 | 125 | intergenic (‑60/+79) | ruvA/yobI | Holliday junction branch migration complex subunit RuvA/uncharacterized protein YobI |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (62/48); new base C (8/7); total (70/55) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 | |||||||||||
Only 100 of 130 total aligned reads displayed.
CATATGCACTTCATAGCCTACGCCGCCCACTTCAATTAACACCAGCGGGGGTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACA > NC_000913/1945887‑1946179 | tatGCACTTCATAGCCTACGCCGCCCACTTCAATTAACACCAGCGGGGGTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGgatagata < 1:106490/150‑1 (MQ=255) ttCATAGCCTACGCCGCCCACTTCAATTAACACCAGCGGGGGTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATATCTATCCAGca < 2:735806/150‑2 (MQ=255) tCATAGCCTACGCCGCCCACTTCAATTAACACCAGCGGGGGTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATATCTATCCAGcat < 2:1169684/150‑3 (MQ=255) tCATAGCCTACGCCGCCCACTTCAATTAACACCAGCGGGGGTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATATCTATCCAGcat < 2:469944/150‑3 (MQ=255) cATAGCCTACGCCGCCCACTTCAATTAACACCAGCGGGGGTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATATCTATCCAGcatt < 1:669214/150‑4 (MQ=255) cATAGCCTACGCCGCCCACTTCAATTAACACCAGCGGGGGTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATATCTATCCAGcatt < 2:1521421/150‑4 (MQ=255) cATAGCCTACGCCGCCCACTTCAATTAACACCAGCGGGGGTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATATCTATCCAGcatt < 2:447007/150‑4 (MQ=255) aTAGCCTACGCCGCCCACTACAATTAACACCAGCGGGGGTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAg > 1:924768/1‑150 (MQ=255) tAGCCTACGCCGCCCACTTCAATTAACACCAGCGGGGGTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAgg < 2:197540/150‑1 (MQ=255) gCCTACGCCGCCCACTTCAATTAACACCAGCGGGGGTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGgatagat > 2:713862/1‑136 (MQ=255) gCCTACGCCGCCCACTTCAATTAACACCAGCGGGGGTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGgatagat < 1:713862/136‑1 (MQ=255) gCCTACGCCGCCCACTTCAATTAACACCAGCGGGGGTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGAt < 1:186432/150‑1 (MQ=255) cTACGCCGCCCACTTCAATTAACACCAGCGGGGGTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATga < 1:652583/150‑1 (MQ=255) tACGCCGCCCACTTCAATTAACACCAGCGGGGGTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATgaa > 1:25410/1‑150 (MQ=255) tACGCCGCCCACTTCAATTAACACCAGCGGGGGTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATgaa < 1:192131/150‑1 (MQ=255) aCGCCGCCCACTTCAATTAACACCAGCGGGGGTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATgaag > 2:238329/1‑150 (MQ=255) cgccCACTTCAATTAACACCAGCGGGGGTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTAAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGTGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGaaaa > 1:1394359/1‑150 (MQ=255) gccCACTTCAATTAACACCAGCGGGGGTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAAc > 1:215871/1‑150 (MQ=255) cTTCAATTAACACCAGCGGGGGTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCg < 1:290470/150‑1 (MQ=255) cTTCAATTAACACCAGCGGGGGTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCg > 1:1053248/1‑150 (MQ=255) aaTTAACACCAGCGGGGGTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGgt > 2:439900/1‑150 (MQ=255) aTTAACACCAGCGGGGGTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGgtg < 2:1433517/150‑1 (MQ=255) aaCACCAGCGGGGGTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGtct > 1:321953/1‑150 (MQ=255) cacCAGCGGGGGTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCg < 1:1131199/150‑1 (MQ=255) cAGCGGGGGTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATg < 2:321953/150‑1 (MQ=255) cAGCGGGGGTTGTTTTTCAATGATGATGCCTATGAGTCTGCATATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAAGTTGCGAGGTGTCTCGATg > 2:1590420/1‑150 (MQ=255) cGGGGGTTGTTTTTAAATGATGAAGAATCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATAAAAAAAAGCTGGATAGATATCAAGAGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAAc > 2:497772/1‑150 (MQ=255) gttTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGTATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAAt < 1:439900/150‑1 (MQ=255) ttttCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATgg < 1:1519443/150‑1 (MQ=255) ttCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGca < 1:1541566/150‑1 (MQ=255) cAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGcaca > 1:505077/1‑150 (MQ=255) cAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTCTATGATAAAAAAATGCTGGATGGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGcaaa > 2:713656/1‑148 (MQ=255) aaTGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAg > 1:217479/1‑150 (MQ=255) atgatgatgCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGt > 1:644831/1‑150 (MQ=255) tgatgatgCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGta < 1:545925/150‑1 (MQ=255) gatgCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAAt > 2:325752/1‑150 (MQ=255) atgCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAAtt > 1:1330804/1‑150 (MQ=255) tctGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTc < 1:1545567/150‑1 (MQ=255) gCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACAGGTta < 1:352799/150‑1 (MQ=255) gCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACAGGTta > 1:904690/1‑150 (MQ=255) cTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACAGGTtata > 2:566870/1‑150 (MQ=255) tATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACAGGTTatat > 1:302699/1‑150 (MQ=255) cacaTGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACAGGTTATATTgg < 2:1595118/150‑1 (MQ=255) acaTGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACAGGTTATATTGGa < 2:1053248/150‑1 (MQ=255) caTGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACAGGTTATATTGGaa > 1:1277405/1‑150 (MQ=255) cGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCaaa > 1:924362/1‑150 (MQ=255) tccGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGGACAGTTTAATTTATTATTCAGGTTATATTGTAAGCAATTAtttt < 2:1167289/148‑1 (MQ=255) tGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATAtttt < 1:253887/150‑1 (MQ=255) gCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTa < 2:1439138/150‑1 (MQ=255) aaTGAATCAAAGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAatat > 2:752187/1‑150 (MQ=255) aaTGAATAAAAGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATACAGAGAAGTATGAAGAAAACTTGCCAGGTGTCTCTATGAACTGAAAAATGGCACAGAATAATTTATTCTACAGGTTATATTTTAAGCAAATATTTTAatat > 2:480100/1‑150 (MQ=255) tGAATCAAAGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTa < 2:1475888/150‑1 (MQ=255) tGAATCAAAGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTa < 1:1035068/150‑1 (MQ=255) gAATCAAAGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTAc > 1:1632576/1‑150 (MQ=255) gAATCAAAGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTAc < 2:1394359/150‑1 (MQ=255) aaTCAAAGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACa > 1:1149148/1‑150 (MQ=255) aaTCAAAGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATACATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACAGGTTATATTGGATGCAAATATTTTAATATTACa < 2:924768/150‑1 (MQ=255) aTCAAAGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACat > 2:884855/1‑150 (MQ=255) aTCAAAGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACat > 2:33435/1‑150 (MQ=255) aTCAAAGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACat > 2:533859/1‑150 (MQ=255) aTCAAAGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACat < 2:551848/150‑1 (MQ=255) aTCAAAGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACat > 2:182986/1‑150 (MQ=255) aTCAAAGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACat > 2:1592706/1‑150 (MQ=255) aaaGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTAc > 1:133322/1‑145 (MQ=255) aaGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATATATATCCAGCGAAGGATGAATAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTc < 1:463198/150‑1 (MQ=255) aaGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACAGGt < 1:1520921/115‑1 (MQ=255) aaGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACAGGt > 2:1520921/1‑115 (MQ=255) aaGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTc < 2:644831/150‑1 (MQ=255) tAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTg < 1:948140/150‑1 (MQ=255) aTGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTgaa < 2:215871/150‑1 (MQ=255) tGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTgaag > 1:1001847/1‑150 (MQ=255) tGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTgaag < 1:1441211/150‑1 (MQ=255) tGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTgaag > 1:190286/1‑150 (MQ=255) tGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTgaag > 1:560050/1‑150 (MQ=255) tATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATg > 1:742859/1‑150 (MQ=255) tATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATg < 2:664750/150‑1 (MQ=255) tATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTACGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATg < 2:514829/150‑1 (MQ=255) aTGATAAAAAAATGCTGGATATATATCCAGCGAAGGATTAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATTAACTGAAAAATGGCACACTATAATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATgg < 1:480100/150‑2 (MQ=255) aTGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGc > 1:216894/1‑150 (MQ=255) aTGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGc > 2:1153523/1‑150 (MQ=255) gATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGt < 2:729437/150‑1 (MQ=255) aTAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGta > 1:1588914/1‑150 (MQ=255) aTAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGta > 1:1454928/1‑150 (MQ=255) aTAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTAAGTGAAGAAATGCGta > 2:436321/1‑150 (MQ=255) tAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTgaaga < 1:1312939/141‑1 (MQ=255) tAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTgaaga > 2:1312939/1‑141 (MQ=255) tAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGtaa > 1:166685/1‑150 (MQ=255) tAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGtaa > 1:739706/1‑150 (MQ=255) tAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGtaa > 2:1224099/1‑150 (MQ=255) aaaaaTGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGtaataa > 1:120936/1‑150 (MQ=255) cttcgCTGGATATCTATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATaaaa > 1:759618/5‑150 (MQ=255) cttcgCTGGATATCTATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATaaaa > 1:1209598/5‑150 (MQ=255) cttcgCTGGATATCTATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATaaaa > 1:1125677/5‑150 (MQ=255) cttcgCTGGATATCTATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATaaaa > 1:957359/5‑150 (MQ=255) aaTGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATaaaaa < 2:72497/150‑1 (MQ=255) aTGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAat < 1:525715/150‑1 (MQ=255) gCTGGATATCTATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAatat > 2:1220986/1‑150 (MQ=255) gCTGGATAGATATCCATCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAatat < 2:1226744/150‑1 (MQ=255) cttgatagataTCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATTCGTAATAAAAAtata < 1:1079863/147‑1 (MQ=255) ggATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACa > 1:348413/1‑150 (MQ=255) | CATATGCACTTCATAGCCTACGCCGCCCACTTCAATTAACACCAGCGGGGGTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACAGGTTATATTGGAAGCAAATATTTTAATATTACATATTCAGTGAAGAAATGCGTAATAAAAATATACA > NC_000913/1945887‑1946179 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |