Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 2,057,595 | T→C | 5.3% | intergenic (+21/+432) | yeeN → / ← asnW | putative transcriptional regulator YeeN/tRNA‑Asn |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 2,057,595 | 0 | T | C | 5.3% | 465.7 / 11.1 | 150 | intergenic (+21/+432) | yeeN/asnW | putative transcriptional regulator YeeN/tRNA‑Asn |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (71/71); new base C (4/4); total (75/75) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.72e-01 |
Only 100 of 152 total aligned reads displayed.
AGAAATGATTGCTCAATCTGAAGTTGAGCTTTCCCCAGAAGATTTAGAAATCTTTGAAGGGCTTGTTGATGCCCTTGAAGATGACGACGATGTACAAAAAGTTTATCATAACGTCGCAAATCTCTAATTATCTTTTAAAGAAATCTGTCTTTACGGCAGATTTCTTTAATCTCATATAATTCTTATAAAAAATATAATATTCAACTCGTCATATTGATTATA‑CCCCCCCGTTCCCAGAGAAATAATATTTATTAAAATTCCAGTTCTTCTTTTTCTGATTACAGAAGGCAAAGTGGC > NC_000913/2057448‑2057744 | aGAAATGATTGCTCAATCTGAAGTTGAGCTTTCCCCAGAAGATTTAGAAATCTTTGAAGGGCTTGTTGATGCCCTTGAAGATGACGACGATGTACAAAAAGTTTATCATAACGTCGCAAATCTCTAATTATCTTTTAAAGAAATCTGTCt > 2:1613103/1‑150 (MQ=255) aTGATTGCTCAATCTGAAGTTGAGCTTTCCCCAGAAGATTTAGAAATCTTTGAAGGGCTTGTTGATGCCCTTGAAGATGACGACGATGTACAAAAAGTTTATCATAACGTCGCAAATCTCTAATTATCTTTTAAAGAAATCTGTCTTTAc < 2:295672/150‑1 (MQ=255) gCTCAATCTGAAGTTGAGCTTTCCCCAGAAGATTTAGAAATCTTTGAAGGGCTTGTTGATGCCCTTGAAGATGACGACGATGTACAAAAAGTTTATCATAACGTCGCAAATCTCTAATTATCTTTTAAAGAAATCTGTCTTTACGGCAGa > 1:1067596/1‑150 (MQ=255) 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AGAAATGATTGCTCAATCTGAAGTTGAGCTTTCCCCAGAAGATTTAGAAATCTTTGAAGGGCTTGTTGATGCCCTTGAAGATGACGACGATGTACAAAAAGTTTATCATAACGTCGCAAATCTCTAATTATCTTTTAAAGAAATCTGTCTTTACGGCAGATTTCTTTAATCTCATATAATTCTTATAAAAAATATAATATTCAACTCGTCATATTGATTATA‑CCCCCCCGTTCCCAGAGAAATAATATTTATTAAAATTCCAGTTCTTCTTTTTCTGATTACAGAAGGCAAAGTGGC > NC_000913/2057448‑2057744 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |