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Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
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aaTTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAACCCTCCCGAGTGCGGAAGGGTTGACGTAATAGAGGTTTCAAAGTCAAAAGTGCGAAAAAACAcc < 2:131483/150‑1 (MQ=255) aaTTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAACCCTCCCGAGTGCGGAAGGGTTGACGTAATAGAGGTTTCAAAGTCAAAAGTGCGAAAAAACAcc < 1:1011043/150‑1 (MQ=255) cTGACCGGTGTACCCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAACCCTCCCGAGTGCGGAAGGGTTGACGTAATAGAGGTTTCAAAGTCAAAAGTGCGAAAAAACACCTATg < 2:1499451/150‑1 (MQ=255) tGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAACCCTCCCGAGTGCGGAAGGGTTGACGTAATAGAGGTTTCAAAGTCAAAAGTGCGAAAAAACACCTATGc > 1:501335/1‑150 (MQ=255) tGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAACCCTCCCGAGTGCGGAAGGGTTGACGTAATAGAGGTTTCAAAGTCAAAAGTGCGAAAAAACACCTATGc > 1:721746/1‑150 (MQ=255) gACCGGTGTAAGGACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAACCCTCCCGAGTGCGGAAGGGTTGACGTAATAGAGGTTTCAAAGTCAAAAGTGCGAAAAAACACCTATGcc > 2:106000/1‑150 (MQ=255) gttatgtAAGCAAGTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAACCCTCCCGAGTGCGGAAGGGTTGACGTAATAGAGGTTTCAAAGTCAAAAGTGCGAAAAAACACCTATGCCAt > 1:293480/5‑150 (MQ=255) cGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAACCCTCCCGAGTGCGGAAGGGTTGACGTAATAGAGGTTTCAAAGTCAAAAGTGCGAAAAAACACCTATGCCATg < 1:1293228/150‑1 (MQ=255) tatgtAAGCAAGTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAACCCTCCCGAGTGCGGAAGGGTTGACGTAATAGAGGTTTCAAAGTCAAAAGTGCGAAAAAACACCTATGCCATgc > 2:91566/3‑150 (MQ=255) tatgtAAGCAAGTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAACCCTCCCGAGTGCGGAAGGCTTGACGTAATAGAGGTTTAAAAGTCAAAAGAGCGAAAAAACACATATGCCATgc > 1:49974/3‑150 (MQ=255) aaGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAACCCTCCCGAGTGCGGAAGGGTTGACGTAATAGAGGTTTCAAAGTCAAAAGTGCGAAAAAACACCTATGCCATGCGCTAt < 2:1184579/150‑1 (MQ=255) aGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAACCCTCCCGAGTGCGGAAGGGTTGACGTAATAGAGGTTTCAAAGTCAAAAGTGCGAAAAAACACCTATGCCATGCGCTATg > 2:1088520/1‑150 (MQ=255) gCACTTGCTTACATAGCAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAACCCTCCCGAGTGCGGAAGGGTTGACGTAATAGAGGTTTCAAAGTCAAAAGTGCGAAAAAACACCTATGCCATGCGCTATGt > 1:1526565/1‑150 (MQ=255) aCTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAACCCTCCCGAGTGCGGAAGGGTTGACGTAATAGAGGTTTCAAAGTCAAAAGTGCGAAAAAACACCTATGCCATGCGCTATGTTg < 2:538708/150‑1 (MQ=255) | CTTCCGACGTGGCTTTCATTTTTGCTCCTGTTGCAAAATAGAAGAGATATTTTGAATTTATTTGTCATTAAACCATCAGGATGCGTGATATGTCATGCGATTTAATGTTCTCCATAATGAGCAAAATTCTGACCGGTGTAAGCACTTGCTTACATAACAATATACAATTGCTCGTTGAAAGAGTGAGCTAAAATCCCTATAACAGTAGAACCCTCCCGAGTGCGGAAGGGTTGACGTAATAGAGGTTTCAAAGTCAAAAGTGCGAAAAAACACCTATGCCATGCGCTATGTTGC > NC_000913/230863‑231156 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |