| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 2,267,743 | C→G | 8.2% | intergenic (+32/‑86) | yeiQ → / → yeiR | putative dehydrogenase, NAD‑dependent/zinc‑binding GTPase YeiR |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,267,743 | 0 | C | G | 8.2% | 313.2 / 15.3 | 97 | intergenic (+32/‑86) | yeiQ/yeiR | putative dehydrogenase, NAD‑dependent/zinc‑binding GTPase YeiR |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (43/46); new base G (4/4); total (47/50) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.31e-01 | |||||||||||
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
AGTTTTCGGTGATGATCTGCCAGATAACCCGCATTTTGTGCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAATTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATC > NC_000913/2267594‑2267892 | aGTTTTCGGTGATGATCTGCCAGATAACCCGCATTTTGTGCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAATTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCAc < 1:1582413/150‑1 (MQ=255) gTTTTCGGTGATGATCTGCCAGATAACCCGCATTTTGTGCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAATTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCAcc > 1:583286/1‑150 (MQ=255) tttCGGTGATGATCTGCCAGATAACCCGCATTTTGTGCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAATTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCtt < 1:1563443/150‑1 (MQ=255) 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2:951693/1‑150 (MQ=255) ttAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGaaa > 1:460937/1‑150 (MQ=255) ggagaGCGGACGAAGGTGAGCTTCATCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGaaa > 1:1618018/5‑150 (MQ=255) tAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGTAGCGGGaaaa > 2:1614398/1‑150 (MQ=255) gagaGCGGACGAAGGTGAGCTTCATCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGaaaa > 1:893564/4‑150 (MQ=255) aGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGaaaa > 2:1086808/1‑147 (MQ=255) aGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGaaaa < 1:1086808/147‑1 (MQ=255) aGCGGACGAAGGTGAGCTTCATCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGGGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCa > 2:356778/1‑150 (MQ=255) gCGGACGAAGGTGAGCTTCATCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCAc > 1:48589/1‑150 (MQ=255) taTGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATTACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTc < 2:583286/149‑1 (MQ=255) aaGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGAtt > 2:150018/1‑150 (MQ=255) 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ccTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATc > 1:591835/1‑150 (MQ=255) | AGTTTTCGGTGATGATCTGCCAGATAACCCGCATTTTGTGCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAATTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATC > NC_000913/2267594‑2267892 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |