| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 2,493,563 | 0 | T | A | 5.3% | 451.1 / 9.3 | 142 | intergenic (‑309/+204) | frc/yfdX | formyl‑CoA transferase/protein YfdX |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (64/70); new base A (4/4); total (68/74) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.68e-01 | |||||||||||
Only 100 of 144 total aligned reads displayed.
CTGCATGGTAAGTAGTGAGGACGAAAAGAAGAATATGATAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACCACAACCTGTCGTATTGTGGTCATAAA > NC_000913/2493418‑2493711 | gCATGGTAAGTAGTGAGGACGAAAAGAAGAATATGATAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCg > 2:1002254/1‑150 (MQ=255) cATGGTAAGTAGTGAGGACGAAAAGAAGAATATGATAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGt > 2:449564/1‑150 (MQ=255) tGGTAAGTAGTGAGGACGAAAAGAAGAATATGATAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTCTTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTAc < 2:1433280/150‑1 (MQ=255) 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ggtACGCTTTAAAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGAGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACCACAACCTGTCGTATtg > 2:1431458/3‑150 (MQ=255) ttACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACCACAACCTGTCGTATtgt < 2:887423/150‑1 (MQ=255) tACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACCACAACCTGTCGTATtgtg > 2:1608310/1‑150 (MQ=255) aCGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATg > 1:1254487/1‑91 (MQ=255) aCGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATg < 2:1254487/91‑1 (MQ=255) cGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACCACAACCTGTCGTATTGTGGt < 2:1006613/150‑1 (MQ=255) cGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACCACAACCTGTCGTATTGTGGt < 1:1092425/150‑1 (MQ=255) gCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACCACAACCTGTCGTATTGTGGta > 2:1593809/1‑149 (MQ=255) gCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACCACAACCTGTCGTATTGTGGTc < 2:230264/150‑1 (MQ=255) cTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACCACAACCTGTCGTATTGTGGTCa < 1:1182126/150‑1 (MQ=255) ttttAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACCACAACCTGTCGTATTGTGGTCATa > 1:435068/1‑150 (MQ=255) ttAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACCACAACCTGTCGTATTGTGGTCATaaa > 1:162033/1‑150 (MQ=255) | CTGCATGGTAAGTAGTGAGGACGAAAAGAAGAATATGATAAATATTGATTCGTGGTAATCAGAGAGAGTCGCGACATTTGTGATGTTATTCTTACAACTGTAAGAAGCGCCGGTGATTTACAAGCAAGGGTATGATTACGCTTTTTAAAGCGTACCATAAAACATAACATAATAAATGATTTGTGATGACACGGGATTATTGCGGTTTACTTTGAGGAATATAAAATGCGAGTTTATAGCACCGCGAGCGCCAAATAATTTTATGACCACAACCTGTCGTATTGTGGTCATAAA > NC_000913/2493418‑2493711 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |