Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 2,496,612 | 0 | C | T | 5.6% | 333.8 / 6.2 | 106 | intergenic (+47/‑309) | lpxP/ypdK | palmitoleoyl acyltransferase/putative membrane protein YpdK |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (59/41); new base T (2/4); total (61/45) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.98e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.12e-01 |
Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
CAAGATTATCGAGAAAGAGATCATGCGCGCACCGGAGCAGTACCTCTGGATCCACCGTCGCTTTAAAACGCGCCCGGTGGGAGAATCGTCGTTGTACATTTAACAAACTGCTCTTACTCTTTCCCTCCTCAAATCGGCCATAATAACCTCATGGTTTTTATGGCTTTTTTCTTAAGGTTTTTTCCTTCGCTGAATATCTAATTATTACCGTCAGAAATTAAACTGTCGCCGATATGAGACACTTGTAAGTTACTAAAAGTAAATAAGAAAATGCCTCTTGTCTCGTTTCAGTTTTAGGC > NC_000913/2496463‑2496761 | cAAGATTATCGAGAAAGAGATCATGCGCGCACCGGAGCAGTACCTCTGGATCCACCGTCGCTTTAAAACGCGCCCGGTGGGAGAATCGTCGTTGTACATTTAACAAACTGCTCTTACTCTTTCCCTCCTCAAATCGGCCATAATAACCTc > 1:508842/1‑150 (MQ=255) aGATTATCGAGAAAGAGATCATGCGCGCACCGGAGCAGTACCTCTGGATCCACCGTCGCTTTAAAACGCGCCCGGTGGGAGAATCGTCGTTGTACATTTAACAAACTGCTCTTACTCTTTGCCTCCTCAAATCGGCCATAATAACCTCAt > 1:691371/1‑150 (MQ=255) aGATTATCGAGAAAGAGATCATGCGCGCACCGGAGCAGTACCTCTGGATCCACCATCGCTTTAAAACGCGCCCGGTGGGAGAATCGTCGTTGTACATTTAACAAACTGCTCTTACTCTTTCCCTCCTCAAATCGGCCATAATAACCTCAt > 2:1350588/1‑150 (MQ=255) 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agaAAGAGATCATGCGCGCACCGGAGCAGTACCTCTGGATCCACCGTCGCTTTAAAACGCGCCCGGTGGGAGAATCGTCGTTGTACATTTAACAAACTGCTCTTACTCTTTCCCTCCTCAAATCGGCCATAATAACCTCATGGTTTTTAt > 1:1004056/1‑150 (MQ=255) gaAAGAGATCATGCGCGCACCGGAGCAGTACCTCTGGATCCACCGTCGCTTTAAAACGCGCCCGGTGGGAGAATCGTCGTTGTACATTTAACAAACTGCTCTTACTCTTTCCCTCCTCAAATCGGCCATAATAACCTCATGGTTTTTATg > 1:1076209/1‑150 (MQ=255) aaaGAGATCATGCGCGCACCGGAGCAGTACCTCTGGATCCACCGTCGCTTTAAAACGCGCCCGGTGGGAGAATCGTCGTTGTACATTTAACAAACTGCTCTTACTCTTTCCCTCCTCAAATCGGCCATAAAAACCATGAGGTTATTATgg < 1:1072686/150‑1 (MQ=255) agagATCATGCGCGCACCGGAGCAGTACCTCTGGATCCACCGTCGCTTTAAAACGCGCCCGGTGGGAGAATCGTCGTTGTACATTTAACAAACTGCTCTTACTCTTTCCCTCCTCAAATCGGCCATAAAAACCATGAGGTTATTATGGcc < 1:1115926/150‑2 (MQ=255) agagATCATGCGCGCACCGGAGCAGTACCTCTGGATCCACCGTCGCTTTAAAACGCGCCCGGTGGGAGAATCGTCGTTGTACATTTAACAAACTGCTCTTACTCTTTCCCTCCTCAAATCGGCCATAAAAACCATGAGGTTATTATGGcc < 2:169848/150‑2 (MQ=255) 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ataataACCTCATGGTTTTTATGGCTTTTTTCTTAAGGTTTTTTCCTTCGCTGAATATCTAATTATTACCGTCAGAAATTAAACTGTCGCCGATATGAGACACTTGTAAGTTACTAAAAGTAAATAAGAAAATGCCTCTTGTCTCGTTTc < 2:1004056/150‑1 (MQ=255) taataaCCTCATGGTTTTTATGGCTTTTTTCTTAAGGTTTTTTCCTTCGCTGAATATCTAATTATTACCGTCAGAAATTAAACTGTCGCCGATATGAGACACTTGTAAGTTACTAAAAGTAAATAAGAAAATGCCTCTTGTCTCGTTTCa > 1:947975/1‑150 (MQ=255) aataaCCTCATGGTTTTTATGGCTTTTTTCTTAAGGTTTTTTCCTTCGCTGAATATCTAATTATTACCGTCAGAAATTAAACTGTCGCCGATATGAGACACTTGTAAGTTACTAAAAGTAAATAAGGAAATGCCTCTTGTCTCGTTTCAg > 2:1053435/1‑150 (MQ=255) ataaCCTCATGGTTTTTATGGCTTTTTTCTTAAGGTTTTTTCCTTCGCTGAATATCTAATTATTACCGTCAGAAATTAAACTGTCGCCGATATGAGACACTTGTAAGTTACTAAAAGTAAATAAGAAAATGCCTCTTGTCTCGTTTCAGt > 2:1223270/1‑150 (MQ=255) taaCCTCATGGTTTTTATGGCTTTTTTCTTAAGGTTTTTTCCTTCGCTGAATATCTAATTATTACCGTCAGAAATTAAACTGTCGCCGATATGAGACACTTGTAAGTTACTAAAAGTAAATAAGAAAATGCCTCTTGTCTCGTTTCAGtt > 1:701502/1‑150 (MQ=255) 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cATGGTTTTTATGGCTTTTTTCTTAAGGTTTTTTCCTTCGCTGAATATCTAATTATTACCGTCAGAAATTAAACTGTCGCCGATATGAGACACTTGTAAGTTACTAAAAGTAAATAAGAAAATGCCTCTTGTCTCGTTTCAGTTTTAGGc > 2:122600/1‑150 (MQ=255) cATGGTTTTTATGGCTTTTTTCTTAAGGTTTTTTCCTTCGCTGAATATCTAATTATTACCGTCAGAAATTAAACTGTCGCCGATATGAGACACTTGTAAGTTACTAAAAGTAAATAAGAAAATGCCTCTTGTCTCGTTTCAGTTTTAGGc < 2:1391728/150‑1 (MQ=255) | CAAGATTATCGAGAAAGAGATCATGCGCGCACCGGAGCAGTACCTCTGGATCCACCGTCGCTTTAAAACGCGCCCGGTGGGAGAATCGTCGTTGTACATTTAACAAACTGCTCTTACTCTTTCCCTCCTCAAATCGGCCATAATAACCTCATGGTTTTTATGGCTTTTTTCTTAAGGTTTTTTCCTTCGCTGAATATCTAATTATTACCGTCAGAAATTAAACTGTCGCCGATATGAGACACTTGTAAGTTACTAAAAGTAAATAAGAAAATGCCTCTTGTCTCGTTTCAGTTTTAGGC > NC_000913/2496463‑2496761 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |