| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 2,496,614 | 0 | T | A | 5.5% | 343.4 / 5.9 | 108 | intergenic (+49/‑307) | lpxP/ypdK | palmitoleoyl acyltransferase/putative membrane protein YpdK |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (58/44); new base A (2/4); total (60/48) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.03e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 | |||||||||||
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
AGATTATCGAGAAAGAGATCATGCGCGCACCGGAGCAGTACCTCTGGATCCACCGTCGCTTTAAAACGCGCCCGGTGGGAGAATCGTCGTTGTACATTTAACAAACTGCTCTTACTCTTTCCCTCCTCAAATCGGCCATAATAACCTCATGGTTTTTATGGCTTTTTTCTTAAGGTTTTTTCCTTCGCTGAATATCTAATTATTACCGTCAGAAATTAAACTGTCGCCGATATGAGACACTTGTAAGTTACTAAAAGTAAATAAGAAAATGCCTCTTGTCTCGTTTCAGTTTTAGGCG > NC_000913/2496465‑2496762 | aGATTATCGAGAAAGAGATCATGCGCGCACCGGAGCAGTACCTCTGGATCCACCGTCGCTTTAAAACGCGCCCGGTGGGAGAATCGTCGTTGTACATTTAACAAACTGCTCTTACTCTTTGCCTCCTCAAATCGGCCATAATAACCTCAt > 1:691371/1‑150 (MQ=255)aGATTATCGAGAAAGAGATCATGCGCGCACCGGAGCAGTACCTCTGGATCCACCATCGCTTTAAAACGCGCCCGGTGGGAGAATCGTCGTTGTACATTTAACAAACTGCTCTTACTCTTTCCCTCCTCAAATCGGCCATAATAACCTCAt > 2:1350588/1‑150 (MQ=255) ttATCGAGAAAGAGATCATGCGCGCACCGGAGCAGTACCTCTGGATCCACCGTCGCTTTAAAACGCGCCCGGTGGGAGAATCGTCGTTGTACATTTAACAAACTGCTCTTACTCTTTCCCTCCTCAAATCGGCCATAATAACCTCATGGt > 1:952059/1‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |