| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 312,306 | A→T | 6.4% | I65I (ATA→ATT) | ykgL → | uncharacterized protein YkgL |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 312,306 | 0 | A | T | 6.4% | 420.4 / 11.5 | 135 | I65I (ATA→ATT) | ykgL | uncharacterized protein YkgL |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (63/63); new base T (7/2); total (70/65) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.68e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 147 total aligned reads displayed.
TCTAAAAGAGGGTTGATGCCAGCATACAGGGGCGAAGCTGGTCAACAAGTCAACATTAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGCCTTAAAACGTGGATTAGATTTACAAATCACATATAGCCGTCCTTTTCGCTTC > NC_000913/312157‑312455 | tCTAAAAGAGGGTTGATGCCAGCATACAGGGGCGAAGCTGGTCAACAAGTCAACATTAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTtata < 2:1177258/150‑1 (MQ=255)tCTAAAAGAGGGTTGATGCCAGCATACAGGGGCGAAGCTGGTCAACAAGTCAACATTAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTtata < 2:418096/150‑1 (MQ=255) aaaaGAGGGTTGATGCCAGCATACAGGGGCGAAGCTGGTCAACAAGTCAACATTAAGATAATGTAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAac < 2:571000/150‑1 (MQ=255) aaaaGAGGGTTGATGCCAGCATACAGGGGCGAAGCTGGTCAACAAGTCAACATTAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAac < 1:487411/150‑1 (MQ=255) aaaaGAGGGTTGATGCCAGCATACAGCGTCGAAGCTGGTCAACAAGTCAACATTAAGATAATGGAATATTCGGATAGAAACGTCAGCAAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAAAATAACCCAAGGAAAATTAATCTTGGTGTAATAAac > 2:1377826/1‑150 (MQ=255) agagGGTTGATGCCAGCATACAGGGGCGAAGCTGGTCAACAAGTCAACATTAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACATGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAacaca < 2:830181/150‑1 (MQ=255) agGGTTGATGCCAGCATACAGGGGCGAAGCTGGTCAACAAGTCAACATTAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACAcc > 2:1609310/1‑150 (MQ=255) agGGTTGATGCCAGCATACAGGGGCGAAGCTGGTCAACAAGTCAACATTAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACAcc < 2:809055/150‑1 (MQ=255) gggTTGATGCCAGCATACAGGGGCGAAGCTGGTCAACAAGTCAACATTAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTGATGTTGGTGTTATAAACACACCa < 1:265298/150‑1 (MQ=255) gggTTGATGCCAGCATACAGGGGCGAAGCTGGTCAACAAGTCAACATTAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCa > 1:1240777/1‑150 (MQ=255) gggTTGATGCCAGCATACAGGCGCGAAGCTGGTCAACAAGTCAACATTAAGATAAAGGAATATTCGGAGAGAAACCTCAGCCAGTTTGCCTAAAAAGAACAGGAAGAATAAAACACCAGTAAAATTAATATAGGTGTTATAAACacaaca > 2:690734/1‑150 (MQ=255) ttGATGCCAGCATACAGGGGCGAAGCTGGTCAACAAGTCAACATTAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACa < 1:106530/150‑1 (MQ=255) gATGCCAGCATACAGGGGCGAAGCTGGTCAACAAGTCAACATTAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACAtt > 2:163703/1‑150 (MQ=255) gATGCCAGCATACAGGGGCGAAGCTGGTCAACAAGTCAACATTAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTGTTTATAACACCAACAtt < 1:1116438/150‑1 (MQ=255) aTGCCAGCATACAGGGGCGAAGCTGGTCAACAAGTCAACATTAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTa > 2:487183/1‑150 (MQ=255) tGCCAGCATACAGGGGCGAAGCTGGTCAACAAGTCAACATTAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTaa > 2:528304/1‑150 (MQ=255) ccAGAATACAGGGGCGAAGCTGGTCAACGAGTCAACATTAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAAtg < 1:763143/150‑2 (MQ=255) ccAGAATACAGGGGCGAAGCTGGTCAACGAGTCAACATTAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAAtg > 2:763143/1‑149 (MQ=255) aTACAGGGGCGAAGCTGGTCAACAAGTCAACATTAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATc < 1:860770/150‑1 (MQ=255) aCAGGGGCGAAGCTGGTCAACAAGTCAACATTAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCCGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGACCTg < 2:852911/150‑1 (MQ=255) aCAGGGGCGAAGCTGGTCAACAAGTCAACATTAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTg > 1:215026/1‑150 (MQ=255) aCAGGGGCGAAGCTGGTCAACAAGTCAACATTAAGATAATGGAATATTAGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGACTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATCTTGTTGTTATAAACACACCAAAATTAATACGATATg > 2:1313612/1‑150 (MQ=255) gggCGAAGCTGGTCAACAAGTCAACATTAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGatta > 1:987329/1‑150 (MQ=255) ggCGAAGCTGGTCAACAAGTCAACATTAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACAAACATTAATCCGATCTGattat > 2:1601005/1‑150 (MQ=255) cGAAGCTGGTCAACAAGTCAACATTAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGAttatta > 2:861559/1‑150 (MQ=255) aGCTGGTCAACAAGTCAACATTAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATc < 1:1418707/150‑1 (MQ=255) gCTGGTCAACAAGTCAACATTAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAATCACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCa < 2:1279891/150‑1 (MQ=255) gCTGGTCAACAAGTCAACATTAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTTATCCGATCTGATTATTAATCa > 2:1548828/1‑150 (MQ=255) tGGTCAACAAGTCAACATTAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGa > 2:111603/1‑150 (MQ=255) ggTCAACAAGTCAACATTAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACCCACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGAc > 2:1024117/1‑150 (MQ=255) aGTCAACATTAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCg > 1:1579711/1‑150 (MQ=255) tCAACATTAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGtt > 2:1577926/1‑150 (MQ=255) cATTAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACTAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATc > 2:217185/1‑150 (MQ=255) cATTAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATc > 2:299651/1‑150 (MQ=255) cATTAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATc > 2:1496080/1‑150 (MQ=255) aTTAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCAGATCTGATTATTAATCAGACAAATATAGTTAAtac > 2:741921/1‑148 (MQ=255) tAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGt > 1:1419580/1‑150 (MQ=255) aaGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTc < 1:1004649/150‑1 (MQ=255) aGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCg > 2:175766/1‑150 (MQ=255) aGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTAATAATCAGatcgg < 2:196756/134‑5 (MQ=255) aGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTAATAATCAGatcgg > 1:196756/1‑130 (MQ=255) aTAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGaa > 2:318007/1‑150 (MQ=255) tAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAAt > 2:248948/1‑150 (MQ=255) aTGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAAttt > 1:787480/1‑150 (MQ=255) aTGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAAttt > 2:347734/1‑150 (MQ=255) ggAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTg > 2:1194524/1‑150 (MQ=255) ggAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTg > 2:460060/1‑150 (MQ=255) gAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGa > 2:1444773/1‑150 (MQ=255) atatTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAAt < 1:841071/150‑1 (MQ=255) cGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACg > 1:1014865/1‑150 (MQ=255) cGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACg > 1:247086/1‑150 (MQ=255) gagagaAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGaa < 2:764939/142‑1 (MQ=255) gagaAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGtttt > 2:662191/1‑150 (MQ=255) agaAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAACCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGttttt > 2:94851/1‑150 (MQ=255) gaAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGtttttt < 1:994362/150‑1 (MQ=255) gaAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGtttttt < 1:747703/150‑1 (MQ=255) aaCGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACTTTTTTTCt > 2:1417258/1‑150 (MQ=255) aCGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCtt < 1:469491/150‑1 (MQ=255) aGGCAGTTGGCCTCATATGAACAGTAAGAATATTTCGCCATGAAAATTAATGTTGGTGTTATTAACACACCAAAATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGATTTTTGAATCAACTTTTTTTCTTACGAc < 2:93671/150‑1 (MQ=255) ggCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGAcc > 2:1213585/1‑150 (MQ=255) ggCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGAcc > 2:1246195/1‑150 (MQ=255) ggCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCG‑TAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGAccc < 2:466043/150‑1 (MQ=255) gCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGAccc < 2:1225081/150‑1 (MQ=255) gTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGa > 1:44638/1‑150 (MQ=255) tGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAAc < 1:945859/150‑1 (MQ=255) ggCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACg < 1:831622/150‑1 (MQ=255) aaaTGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGCCTTa < 1:163703/150‑1 (MQ=255) aCAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGCCTTAAAACGt < 2:1499427/150‑1 (MQ=255) cAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGCCTTAAAACGTg < 2:1332258/150‑1 (MQ=255) aGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGCCTTAAAACGTgg < 1:329118/150‑1 (MQ=255) ggAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGCCTTAAAACGTGGa > 1:532162/1‑150 (MQ=255) ggAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGCCTTAAAACGTGGa > 2:73436/1‑150 (MQ=255) aagaaTATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAACCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGCCTTAAAACGTGGAtt < 1:94851/150‑1 (MQ=255) aaTATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAACCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGCCTTAAAACGTGGATTAGa < 2:400631/150‑1 (MQ=255) tatatCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGCCTTAAAACGTGGATTAGAtt < 2:1579711/150‑1 (MQ=255) tatatCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGCCTTAAAACGTGGATTAGAtt < 1:289953/150‑1 (MQ=255) tatatCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGCCTTAAAACGTGGATTAGAtt < 2:247086/150‑1 (MQ=255) tatCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTAACGACCCTGAACGGCCTTAAAACGTGGAGTAGATTTa > 2:1552660/1‑150 (MQ=255) atCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGCCTTAAAACGTGGATTAGATTTAc < 1:1373775/150‑1 (MQ=255) tCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGCCTTAAAACGTGGATTAGATTTACa < 1:1020502/150‑1 (MQ=255) ccccAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACCGACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAAGCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGCCTTAAAACGTGGATTAGATTTACaa > 1:1342293/1‑150 (MQ=255) cccAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGCCTTAAAACGTGGATTAGATTTACaaa < 1:487183/150‑1 (MQ=255) cccAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGCCTTAAAACGTGGATTAGATTTACaaa < 1:1254322/150‑1 (MQ=255) cAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACAAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGCCTTAAAAAGTGGATTAGATTTACAAATc > 2:365842/1‑150 (MQ=255) aGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTTAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGCCTTAAAACGTGGATTAGATTTACAAATca < 1:1619844/150‑1 (MQ=255) ggAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGCCTTAAAACGTGGATTAGATTTACAAATcac < 1:690734/150‑1 (MQ=255) ggAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGCCTTAAAACGTGGATTAGATTTACAAATcac > 1:1155421/1‑150 (MQ=255) gAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGTCAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGCCTTAAAACGTGGATTAGATTTACAATTctca > 1:1182242/1‑150 (MQ=255) ggaTTAATGTTGGTGTGTTTATAACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGCCTTAAAACGTGGATTAGATTTACAAATCACata > 2:218264/3‑150 (MQ=39) gaTTAATGTTGGTGTGTTTATAACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGCCTTAAAACGTGGATTAGATTTACAAATCACatat > 1:1444958/2‑150 (MQ=39) gaTTAATGTTGGTGTGTTTATAACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGCCTTAAAACGTGGATTAGATTTACAAATCACatat > 1:1161951/2‑150 (MQ=39) aaTTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGCCTTAAAACGTGGATTAGATTTACAAATCACatat > 1:195101/1‑150 (MQ=255) ttAATGTTGGTGTGTTTATAACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGCCTTAAAACGTGGATTAGATTTACAAATCACATATAg > 2:1435452/1‑150 (MQ=255) tGTTGGTGTGTTTATAACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGCCTTAAAACGTGGATTAGATTTACAAATCACATATAGCCGt > 1:424055/1‑150 (MQ=255) gtTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGCCTTAAAACGTGGATTAGATTTACAAATCACATATAGCCGTCCTTTTc < 1:1577926/150‑1 (MQ=255) tataAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACTTATTTTCTTACGACCCTGAACGGCCGTAAAGCGTGGATTAGATTTACAAATCTCATATAGCCGTCCTTTTCgg > 1:224357/1‑149 (MQ=255) tataAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGCCTTAAAACGTGGATTAGATTTACAAATCACATATAGCCGTCCTTTTCGc < 2:1082890/150‑1 (MQ=255) ataAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGCCTTAAAACGTGGATTAGATTTACAAATCACATATAGCCGTCCTTTTCGCt < 1:318007/150‑1 (MQ=255) taAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGCCTTAAAACGTGGATTAGATTTACAAATCACATATAGCCGTCCTTTTCGCtt < 1:1275340/150‑1 (MQ=255) aaaCACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGCCTTAAAACGTGGATTAGATTTACAAATCACATATAGCCGTCCTTTTCGCTTc < 1:248948/150‑1 (MQ=255) | TCTAAAAGAGGGTTGATGCCAGCATACAGGGGCGAAGCTGGTCAACAAGTCAACATTAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGCCTTAAAACGTGGATTAGATTTACAAATCACATATAGCCGTCCTTTTCGCTTC > NC_000913/312157‑312455 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |