| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,597,707 | T→C | 5.9% | intergenic (‑89/+124) | purC ← / ← bamC | phosphoribosylaminoimidazole‑succinocarboxamide synthase/outer membrane protein assembly factor BamC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,597,707 | 0 | T | C | 5.9% | 366.1 / 9.4 | 119 | intergenic (‑89/+124) | purC/bamC | phosphoribosylaminoimidazole‑succinocarboxamide synthase/outer membrane protein assembly factor BamC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (60/52); new base C (5/2); total (65/54) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.54e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.00e-01 | |||||||||||
Only 100 of 120 total aligned reads displayed.
TTTCCGTGCTGTATACGGTTTTCGCTTTACCACGATACAACTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGTTTGCGTATCATATCAGAAAAAAGGGCCGGATGATTCCAGCCCTGTATTTTTACTTGCTAAACGCAGCCTGGAAG > NC_000913/2597561‑2597855 | ggTATACGGTTTTCGCTTTACCACGATACAACTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGacaaaac < 1:1097617/149‑7 (MQ=255) gTATACGGTTTTCGCTTTACCACGATACAACTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGt > 2:723901/1‑150 (MQ=255) tataCGGTTTTCGCTTTACCACGATACAACTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTc < 2:1257135/150‑1 (MQ=255) ataCGGTTTTCGCTTTACCACGATACAACTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTcc > 1:153987/1‑150 (MQ=255) ataCGGTTTTCGCTTTACCACGATACAACTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTcc < 2:831835/150‑1 (MQ=255) taCGGTTTTCGCTTTACCACGATACAACTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCg > 1:1027058/1‑150 (MQ=255) aCGGTTTTCGCTTTACCACGATACAACTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGa > 2:22813/1‑150 (MQ=255) cGGTTTTCGCTTTACCACGATACAACTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGac > 1:69532/1‑150 (MQ=255) cGGTTTTCGCTTTACCACGATACAACTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGac > 2:739509/1‑150 (MQ=255) cGGTTTTCGCTTTACCACGATACAACTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGac > 2:305025/1‑150 (MQ=255) ggTTTTCGCTTTACCACGATACAACTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGaca < 2:668698/150‑1 (MQ=255) gTTTTCGCTTTACCACGATACAACTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTCTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGacaa > 1:964684/1‑150 (MQ=255) tCGCTTTACCACGATACAACTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGacaaacaa < 2:1616915/150‑1 (MQ=255) gCTTTACCACGATACAACTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAAt > 2:1476015/1‑150 (MQ=255) ttACCACGATACAACTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTc < 2:883918/150‑1 (MQ=255) ccACGATACAACTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTg < 2:472801/150‑1 (MQ=255) cACGATACAACTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGc < 1:1242697/150‑1 (MQ=255) tACAACTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAAtt > 1:1336926/1‑150 (MQ=255) aaCTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTAcc < 1:863095/150‑1 (MQ=255) aaCTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTAcc < 2:300885/150‑1 (MQ=255) aaCTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTAcc > 2:274319/1‑150 (MQ=255) cTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGc > 1:340315/1‑150 (MQ=255) cttgcttTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTaaaa > 2:293937/1‑150 (MQ=255) gcttTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATcg < 1:1617039/150‑1 (MQ=255) cttTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATcgc > 1:1543606/1‑150 (MQ=255) ttttGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATcgcg < 1:886045/150‑1 (MQ=255) tttGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGt > 2:439945/1‑150 (MQ=255) ttGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGtt < 1:706752/150‑1 (MQ=255) gCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGtttt > 2:510885/1‑150 (MQ=255) cTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTg > 1:740781/1‑150 (MQ=255) tttATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGc > 2:1109204/1‑150 (MQ=255) tttATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGc > 1:1621071/1‑150 (MQ=255) ttATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCa < 2:340315/150‑1 (MQ=255) aTCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGa > 2:482473/1‑150 (MQ=255) tCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGAc > 1:973428/1‑150 (MQ=255) aCTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGc > 1:1490321/1‑150 (MQ=255) ccTGGGTGTGAATTATCGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGTTGTGCCGGATGTTTTGTCTGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCTAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGcaca < 2:737512/150‑1 (MQ=255) ccTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGccca > 2:1444452/1‑150 (MQ=255) ccTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGcaca > 2:131587/1‑150 (MQ=255) gtgtGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGttt > 1:486019/1‑150 (MQ=255) tgtgAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGTTTg > 1:330047/1‑150 (MQ=255) tgtgAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGTTTg < 1:723901/150‑1 (MQ=255) gtgAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGTTTGc < 1:351422/150‑1 (MQ=255) tgAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGTTTGCg < 1:743244/150‑1 (MQ=255) tgAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGTTTGCg < 1:131587/150‑1 (MQ=255) gAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGTTTGCGt > 1:453361/1‑150 (MQ=255) gAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGTTTGCGt < 1:1327268/150‑1 (MQ=255) ttAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGTTTGCGtatc < 2:1336926/150‑1 (MQ=255) aaCGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGTTTGCGtatcat > 2:384112/1‑150 (MQ=255) aaCGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGTTTGCGtatcat > 2:1610504/1‑150 (MQ=255) aaCGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGATTGCGtatcat > 2:1072468/1‑150 (MQ=255) aaCGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGAGGCGTGAACGCCTTATCAGAAATACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGATTTCCTGCAGACGCACAAGTTTGCGtataat > 1:139074/1‑150 (MQ=255) cGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGTTTGCGtatcatat < 1:674441/150‑1 (MQ=255) gTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGTTTGCGtatcatatc < 1:274319/150‑1 (MQ=255) gTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGTTTGCGtatcatatc > 2:1108079/1‑150 (MQ=255) ttttAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGTTTGCGtatcatatca > 1:969592/1‑150 (MQ=255) tttAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGTTTGCGTATCATATCAg > 2:65817/1‑150 (MQ=255) aTCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGTTTGCGTATCATATCAGaaaaaa > 2:222359/1‑150 (MQ=255) cTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGTTTGCGTATCATATCAGAAAAAAgg > 1:1035039/1‑150 (MQ=255) ttGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGTTTGCGTATCATATCAGAAAAAAGGGcc < 1:1072468/150‑1 (MQ=255) tGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGTTTGCGTATCATATCAGAAAAAAGGGCCGgat < 1:439945/150‑1 (MQ=255) tCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGACGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGTTTGCGTATCATATCAGAAAAAAGGGCCGgatga > 1:541635/1‑150 (MQ=255) cTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGTTTGCGTATCATATCAGAAAAAAGGGCCGgatgat > 2:815193/1‑150 (MQ=255) cTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGTTTGCGTATCATATCAGAAAAAAGGGCCGgatgat < 1:1476015/150‑1 (MQ=255) cTGGTGTACCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGTTTGCGTATCATATCAGAAAAAAGGGCCGgatgat > 2:892104/1‑150 (MQ=255) tGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGTTTGCGTATCATATCAGAAAAAAGGGCCGGATGAtt > 1:1620572/1‑150 (MQ=255) ggTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGTTTGCGTATCATATCAGAAAAAAGGGCCGGATGATTc > 1:763806/1‑150 (MQ=255) tgtgCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGTTTGCGTATCATATCAGAAAAAAGGGCCGGATGATTCCa > 2:1632858/1‑150 (MQ=255) tgCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGTTTGCGTATCATATCAGAAAAAAGGGCCGGATGATTCCAGc < 1:384112/150‑1 (MQ=255) ccGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGTTTGCGTATCATATCAGAAAAAAGGGCCGGATGATTCCAGccc < 1:192925/150‑1 (MQ=255) ccGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGTTTGCGTATCATATCAGAAAAAAGGGCCGGATGATTCCAGccc < 1:305025/150‑1 (MQ=255) cGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACACACACGTTTGCGTATCATATCAGAAAAAAGGGCCGGATGATTCCAGCCCt < 2:373707/150‑1 (MQ=255) ggATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGTTTGCGTATCATATCAGAAAAAAGGGCCGGATGATTCCAGCCCTg < 2:443392/150‑1 (MQ=255) tcttGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGTTTGCGTATCATATCAGAAAAAAGGGCCGGATGATTCCAGCCCTGTAttt > 1:1539438/3‑150 (MQ=255) tttGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGTTTGCGTATCATATCAGAAAAAAGGGCCGGATGATTCCAGCCCTGTAtttt > 1:532702/1‑150 (MQ=255) agttCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGTTTGCGTATCATATCAGAAAAAAGGGCCGGATGATTCCAGCCCTGTAttttt > 2:1419932/4‑150 (MQ=255) tGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGTTTGCGTATCATATCAGAAAAAAGGGCCGGATGATTCCAGCCCTGTATTTTTa > 2:727634/1‑150 (MQ=255) gttCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGTTTGCGTATCATATCAGAAAAAAGGGCCGGATGATTCCAGccc > 1:1027327/3‑140 (MQ=255) gttCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCCAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGTTTGCGTATCATATCAGAAAAAAGGGCCGGATGATTCCAGccc < 2:1027327/138‑1 (MQ=255) gTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGTTTGCGTATCATATCAGAAAAAAGGGCCGGATGATTCCAGCCCTGTATTTTTAc > 1:192818/1‑150 (MQ=255) gTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGTTTGCGTATCATATCAGAAAAAAGGGCCGGATGATTCCAGCCCTGTATTTTTAc > 2:1005147/1‑150 (MQ=255) tCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGTTTGCGTATCATATCAGAAAAAAGGGCCGGATGATTCCAGCCCTGTATTTTTACt < 1:727495/150‑1 (MQ=255) tCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGTTTGCGTATCATATCAGAAAAAAGGGCCGGATGATTCCAGCCCTGTATTTTTACt < 2:1199039/150‑1 (MQ=255) cGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGTTTGCGTATCATATCAGAAAAAAGGGCCGGATGATTCCAGCCCTGTATTTTTACtt > 2:1295539/1‑150 (MQ=255) ggataaggcgTTCACGCCGCATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGTTTGCGTATCATATCAGAGAAAAGGGCCGGATGATTCCAGCCCTGTATTTTTACTTg > 1:430638/7‑150 (MQ=255) ggataaggcgTTCACGCCGCATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGTTTGCGTATCATATCAGAAAAAAGGGCCGGATGATTCCAGCCCTGTATTTTTACTTg > 2:1403869/7‑150 (MQ=255) ggataaggcgTTCACGCCGCATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGTTTGCGTATCATATCAGAAAAAAGGGCCGGATGATTCCAGCCCTGTATTTTTACTTg > 1:76635/7‑150 (MQ=255) ggATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGTTTGCGTATCATATCAGAAAAAAGGGCCGGATGATTCCAGCCCTGTATTTTTACTTg > 1:480878/1‑150 (MQ=255) gATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGTTTGCGTATCATATCAGAAAAAAGGGCCGGATGATTCCAGCCCTGTATTTTTACTTGc < 2:486019/150‑1 (MQ=255) gATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGTTTGCGTATCATATCAGAAAAAAGGGCCGGATGATTCCAGCCCTGTATTTTTACTTGc < 2:1079100/150‑1 (MQ=255) gATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGTTTGCGTATCATATCAGAAAAAAGGGCCGGATGATTCCAGCCCTGTATTTTTACTTGc < 1:1123327/150‑1 (MQ=255) aTGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGTTTGCGTATCATATCAGAAAAAAGGGCCGGATGATTCCAGCCCTGTATTTTTACTTGCt < 1:1080960/150‑1 (MQ=255) tGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGACTTCCCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGTTTGCGTATCATATCAGAAAAAAGGGCCGGATGATTCCAGCCCTGTATTTTTACTTGCTa < 2:733724/150‑1 (MQ=255) tGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGTCAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGTTTGCGTATCATATCAGAAAAAAGGGCCGGATGATTCCAGCCCTGTATTTTTACTTGCTAAACGCAg < 1:1214840/150‑1 (MQ=255) aaCGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGTTTGCGTATCATATCAGAAAAAAGGGCCGGATGATTCCAGCCCTGTATTTTTACTTGCTAAACGCAGcc < 2:1434451/150‑1 (MQ=255) ccTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGTTTGCGTATCATATCAGAAAAAAGGGCCGGATGATTCCAGCCCTGTATTTTTACTTGCTAAACGCAGCCTGGa > 1:1326866/1‑150 (MQ=255) ccTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGTTTGCGTATCATATCAGAAAAAAGGGCCGGATGATTCCAGCCCTGTATTTTTACTTGCTAAACGCAGCCTGGa > 2:892064/1‑150 (MQ=255) ccTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGATAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGTTTGCGTATCATATCAGAAAAAAGGGCCGGATGATTCCAGCCCTGTATTTTTACTTGCTAAACGCAGCCTGGa > 1:623497/1‑150 (MQ=255) cTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGTTTGCGTATCATATCAGAAAAAAGGGCCGGATGATTCCAGCCCTGTATTTTTACTTGCTAAACGCAGCCTGGaa < 1:1044153/150‑1 (MQ=255) ttATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGTTTGCGTATCATATCAGAAAAAAGGGCCGGATGATTCCAGCCCTGTATTTTTACTTGCTAAACGCAGCCTGGAAg < 1:421427/150‑1 (MQ=255) | TTTCCGTGCTGTATACGGTTTTCGCTTTACCACGATACAACTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGTTTGCGTATCATATCAGAAAAAAGGGCCGGATGATTCCAGCCCTGTATTTTTACTTGCTAAACGCAGCCTGGAAG > NC_000913/2597561‑2597855 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |