| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,672,640 | G→T | 6.6% | Q198H (CAG→CAT) ‡ | hcaD → | putative 3‑phenylpropionate/cinnamate dioxygenase ferredoxin reductase subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,672,640 | 0 | G | T | 6.6% | 252.5 / 4.9 | 75 | Q198H (CAG→CAT) ‡ | hcaD | putative 3‑phenylpropionate/cinnamate dioxygenase ferredoxin reductase subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (27/43); new base T (3/2); total (30/45) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.83e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.83e-01 | |||||||||||
ATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCAGGCTGATGTGGTGATTTACGGTATTGGTATCAGCGCCAACGAGCAACTGGCTCGCG > NC_000913/2672491‑2672788 | aTTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACcagcag < 1:159672/150‑1 (MQ=255) ggTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGgt > 2:451982/1‑150 (MQ=255) gCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGtgtg < 2:1233099/150‑1 (MQ=255) ggAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGCACACCAGCCTGCTGgtggcgc < 1:1605392/150‑5 (MQ=255) ggAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTgcgc > 1:672694/1‑150 (MQ=255) gAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGCACACCAGCCTGCTGgtggcgct < 2:575073/150‑6 (MQ=255) gAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCa < 1:1089851/150‑1 (MQ=255) cTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTc < 1:359745/150‑1 (MQ=255) tATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCt < 2:973369/150‑1 (MQ=255) tATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCt < 2:918803/150‑1 (MQ=255) ttGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGc < 1:480350/150‑1 (MQ=255) ggTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTc < 1:912388/150‑1 (MQ=255) ggTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTc < 2:1606443/150‑1 (MQ=255) ggTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTc < 1:1550969/150‑1 (MQ=255) cTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGTCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTg < 2:1619313/150‑1 (MQ=255) cTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTg < 1:1277808/150‑1 (MQ=255) gCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGTTTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCATGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGaa > 2:246686/1‑150 (MQ=255) ccAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAAc < 2:672694/150‑1 (MQ=255) cAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGGGACATTGATTGAACTTGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACa < 2:1176801/150‑1 (MQ=255) gcgcCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACAtg < 2:1592864/150‑1 (MQ=255) aCGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTc < 2:159858/150‑1 (MQ=255) cagATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACTCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGa < 1:235939/150‑1 (MQ=255) cagATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGa < 2:181780/150‑1 (MQ=255) cagATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGa < 2:565833/150‑1 (MQ=255) tAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGt > 1:503391/1‑150 (MQ=255) tAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGt < 1:947935/150‑1 (MQ=255) tAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGt < 1:73417/150‑1 (MQ=255) aGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGtgt < 2:131252/150‑3 (MQ=255) cAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGa > 1:1405308/1‑150 (MQ=255) gATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCt > 2:134365/1‑150 (MQ=255) tttGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCATGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTg < 1:246686/149‑1 (MQ=255) gAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCaa < 2:634985/150‑1 (MQ=255) aaCTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTg > 1:576018/1‑108 (MQ=255) aaCTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTg < 2:576018/108‑1 (MQ=255) aaCTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCaaa > 1:964054/1‑150 (MQ=255) aCTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAg > 1:222422/1‑150 (MQ=255) aCTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAg > 2:1566785/1‑150 (MQ=255) ggcggcAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTgg > 1:439231/1‑150 (MQ=255) gcggcAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTggg < 2:998799/150‑1 (MQ=255) cggcAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTgggg > 2:944403/1‑150 (MQ=255) cggcAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTgggg < 1:505614/150‑1 (MQ=255) cggcAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTgggg < 2:1186699/150‑1 (MQ=255) ggcAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGa < 1:906405/150‑1 (MQ=255) ggcAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGa > 1:708275/1‑150 (MQ=255) aCCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACg < 1:187810/150‑1 (MQ=255) ccGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGa < 2:432160/129‑1 (MQ=255) ccGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGa > 1:432160/1‑129 (MQ=255) ccGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGc > 2:1492945/1‑150 (MQ=255) tGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCAgg > 2:75186/1‑150 (MQ=255) tGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCAgg > 2:387294/1‑150 (MQ=255) gggCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCAGGc < 1:734635/150‑1 (MQ=255) gCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCAGGCTg < 1:451982/150‑1 (MQ=255) ccGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCAGGCTGa < 1:1352688/150‑1 (MQ=255) tAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCAGGCTGAtgt > 2:1336190/1‑150 (MQ=255) tGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCAGGCTGATgtggt > 1:1194778/1‑150 (MQ=255) gCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAGGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCAGGCTGATgtgctg < 2:193194/150‑1 (MQ=255) gCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCAGGCTGATgtggtg > 1:1619192/1‑150 (MQ=255) caccacCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCAGGCTGATGTGGTGa < 2:1096979/150‑1 (MQ=255) cGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCAGGCTGATGTGGTGATTTACg < 1:1566785/150‑1 (MQ=255) cccGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCAGGCTGATGTGGTGATTTACGGt < 1:134365/150‑1 (MQ=255) tGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCAGGCTGATGTGGTGATTTACGGTATTg > 2:105839/1‑150 (MQ=255) aaCGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCAGGCTGATGTGGTGATTTACGGTATTGGTa < 1:1305559/150‑1 (MQ=255) aaCGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTAAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCAGGCTGATGTGGTGATTTACGGTATTGGTa < 2:684548/150‑1 (MQ=255) cGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCAGGCTGATGTGGTGATTTACGGTATTGGTATc < 2:1619192/150‑1 (MQ=255) cTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCAGGCTGATGTGGTGATTTACGGTATTGGTATCAg > 2:504690/1‑150 (MQ=255) tCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCAGGCTGATGTGGTGATTTACGGTATTGGTATCAgcgc > 2:1500872/1‑150 (MQ=255) tCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCAGGCTGATGTGGTGATTTACGGTATTGGTATCAgcgc > 1:360673/1‑150 (MQ=255) cTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCAGGCTGATGTGGTGATTTACGGTATTGGTATCAGCGcc < 1:105839/150‑1 (MQ=255) ttttACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCAGGCTGATGTGGTGATTTACGGTATTGGTATCAGCGCCa < 2:503391/150‑1 (MQ=255) ttttACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCAGGCTGATGTGGTGATTTACGGTATTGGTATCAGCGCCa < 1:778491/150‑1 (MQ=255) tttACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCAGGCTGATGTGGTGATTTACGGTATTGGTATCAGCGCCaa > 2:251812/1‑150 (MQ=255) cAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCAGGCTGATGTGGTGATTTACGGTATTGGTATCAGCGCCAACGAg > 1:391244/1‑150 (MQ=255) cgcacaccaGCCTGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCAGGCTGATGTGGTGATTTACGGTATTGGTATCAGCGCCAACGAGCa > 2:952526/5‑150 (MQ=255) cgcacaccaGCCTGCTGGTG‑GCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCAGGCTGATGTGGTGATTTACGGTATTGGTATCAGCGCCAACGAGCaa > 1:1419102/5‑150 (MQ=255) cgc‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCAGGCTGATGTGGTGATTTACGGTATTGGTATCAGCGCCAACGAGCaa > 1:481293/1‑150 (MQ=255) cacaccaGCCTGCTGGTG‑GCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCAGGCTGATGTGGTGATTTACGGTATTGGTATCAGCGCCAACGAGCAACt > 2:380400/3‑150 (MQ=255) agGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCAGGCTGATGTGGTGATTTACGGTATTGGTATCAGCGCCAACGAGCAACTGGCTcgcg > 1:912323/1‑150 (MQ=255) | ATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTGATTGAACTGGCGGCAACCGTCATGGGCCGTAATGCACCACCGCCCGTGCAACGCTATCTTTTACAGCGC‑CACCAGCAGGCTGGTGTGCGCATTCTGCTCAATAATGCCATTGAACATGTGGTCGATGGTGAAAAAGTAGAACTGACGCTGCAAAGTGGGGAAACGCTTCAGGCTGATGTGGTGATTTACGGTATTGGTATCAGCGCCAACGAGCAACTGGCTCGCG > NC_000913/2672491‑2672788 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |